III.

INTRODUCCIN AL METABOLISMO

1. Generalidades
2. Termodinmica de los compuestos fosforilados
3. Termodinmica de los sistemas vivos
CMO OBTIENEN LAS CLULAS LA ENERGA Y EL PODER
REDUCTOR A PARTIR DE SU ENTORNO?

CMO SINTETIZAN LAS CLULAS LOS COMPUESTOS

FUNDAMENTALES DE SUS MACROMOLCULAS Y CMO SE
SINTETIZAN POSTERIORMENTE LAS PROPIAS MACROMOLCULAS?

Stryer et al. 2003

 QU ES EL
METABOLISMO?
 Metabolismo
Proceso mediante el cual los seres vivos adquieren y utilizan
la energa libre que requieren para realizar sus funciones

Es una actividad celular muy coordinada en la que muchos

sistemas multienzimticos cooperan para:
(1) Obtener energa qumica a partir de la captacin de la
energa solar o degradando nutrientes ricos en energa
obtenidos del ambiente
(2) Convertir molculas nutrientes en las molculas
caractersticas de la propia clula
(3) Polimerizar los precursores monomricos en
macromolculas protenas, c. nucleicos, lpidos, carbohidratos
(4) Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones
celulares especializadas
Nelson y Cox, 2005
LOS ORGANISMOS VIVOS SE DIVIDEN EN DOS GRUPOS SEGN LA
FORMA QUMICA A TRAVS DE LA QUE OBTIENEN CARBONO
DEL MEDIO

Quimitrofos (hetertrofos) Fottrofos (auttrofos)

EL CARBONO, OXGENO Y AGUA SE CICLAN CONSTANTEMENTE ENTRE
LOS MUNDOS HETEROTRFICOS Y AUTOTRFICO, CON LA ENERGA
SOLAR COMO FUERZA MOTRIZ DE ESTE PROCESO GLOBAL

Obtienen su
energa de la
Obtienen degradacin de
su energa nutrientes
de la luz orgnicos
solar producidos por
los auttrofos

Autotrfos
Hetertrofos
fotosintticos

Nelson y Cox, 2005

 Metabolismo
Es la suma de todas las transformaciones qumicas que se
producen en una clula u organismo, a travs de una serie de
reacciones catalizadas enzimticamente que constituyen las
rutas metablicas
CARACTERSTICAS

CADA PASO = CAMBIO QUMICO ESPECFICO

(Eliminacin, transferencia o adicin de un tomo o grupo funcional)

PRECURSOR INTERMEDIARIOS PRODUCTO

(METABOLITOS)
Donde la serie de reacciones qumicas se encuentran interrelacionadas
y acopladas y que tienen por objeto producir compuestos necesarios
para la vida celular

Stryer et al. 2003

 CATABOLISMO.- Conjunto de reacciones que
convierten molculas (como si fueran
combustibles) en energa utilizable (producen
energa)
Vas catablicas: son de tipo degradativo.
Qumicamente son procesos oxidativos.
Suelen producir energa
METABOLISMO

ANABOLISMO.-Conjunto de reacciones que requieren

energa para producir molculas complejas
Vas anablicas: son rutas de biosntesis.
Qumicamente son procesos reductores.
Requieren un aporte de energa externo.
 M C
A E A
N T T
A A A
B B
B
O O
O L
L
I L I
S I S
M S M
O M O
O

ENERGA
 ANABOLISMO

REGULACION
METABLICA
ENERGA
CATABOLISMO
 REGULACIN

DEL

METABOLISMO

CANTIDAD ACTIVIDAD
CATALTICA

DISPONIBILIDAD
(RECAMBIO, LOCALIZACIN)
 Caractersticas de las vas metablicas
Una va metablica est formada por una serie de reacciones en una
secuencia especfica que en su conjunto es termodinmicamente
favorable
Sin embargo, algunas de estas reacciones de la va pueden requerir
energa y otras liberarla
Las vas pueden estar compartamentalizadas celularmente (organelos,
citosol, membranales)
Las reacciones van a estar mediadas por enzimas, por eso, van a ser
especficas
Las vas metablicas pueden ser regulables. No todas las reacciones
de la va pueden regularse.
Esta regulacin puede darse por disponibilidad del sustrato, por
mecanismos de regulacin enzimtica (alosterismo, fosforilacin,
retroalimentacin, sntesis de la enzima misma, etc.), por factores
termodinmicos
En su conjunto, las vas metablicas son reversibles PERO TIENEN
POR LO MENOS UN PASO IRREVERSIBLE (PASO LIMITANTE)
LAS REACCIONES DE UNA VA METABLICA SE PUEDEN
VER SEGN SUS CARACTERSTICAS TERMODINMICAS.

Las reacciones termodinmicamente pueden ser:

G GRANDE Y NEGATIVA La reaccin transcurre en el

sentido (EXERGNICAS)

G=0 EL SISTEMA ESTA EN

EQUILIBRIO

G GRANDE Y POSITIVA La reaccin transcurre en el

sentido opuesto
(ENDERGNICAS)
LAS REACCIONES CERCANAS AL EQUILIBRIO

G CERCANO A 0

- SON REVERSIBLES
- Las enzimas que las catalizan tienen una actividad muy
alta y por tanto la actividad de la enzima no es un factor
limitante de la va.
- Son reacciones fcilmente reversibles y su actividad
depende de la relacin de [sustrato] y [producto].
La direccionalidad va a depender de cambios de
[sustrato] y [producto].
- LAS REACCIONES CERCANAS AL EQUILIBRIO, POCAS
VECES REGULAN EL FLUJO DE LA VA METABLICA
LAS REACCIONES ALEJADAS DEL EQUILIBRIO

G GRANDES Y NEGATIVOS

- SON IRREVERSIBLES
- Son poco sensibles a la variacin de [sustrato] y [producto]
- Las enzimas suelen ser alostricas

- LAS REACCIONES ALEJANAS DEL EQUILIBRIO SON LAS

QUE MAYORMENTE REGULAN UNA VA METABLICA
 TIPOS DE REACCIONES QUMICAS DEL METABOLISMO

TIPO DE REACCIN DESCRIPCIN

Oxidacin-reduccin Transferencia de electrones

Formacin de enlaces con Formacin de enlaces covalentes (ej. C-C)

requerimiento de hidrlisis de
ATP
Isomerizacin Reorganizacin de tomos para formar
ismeros
Transferencia de grupos Transferencia de un grupo funcional de
una molcula a otra
Hidrlisis Rompimiento de enlaces con intervencin
del agua
Adicin o eliminacin de grupos Poner grupos funcionales a dobles enlaces
funcionales o eliminacin para formar dobles enlaces
MOLCULAS FUNDAMENTALES
EN LAS REACCIONES METABLICAS
Cuatro molculas fundamentales
en las reacciones metablicas

Donador de energa

Almacenador de
Poder reductor

Acarreador de
grupos acilo
La hidrlisis de ATP o de un compuesto fosforilado es una reaccin
comn para obtener energa.

LA VARIACIN DE ENERGA LIBRE EN LA HIDRLISIS DEL ATP ES GRANDE Y

NEGATIVA
FUNDAMENTO QUMICO DE LA ELEVADA VARIACIN DE ENRGA LIBRE
ASOCIADA A LA HIDRLISIS DE ATP

1) La hidrlisis disminuye
la repulsin de carga

2) El producto (Pi)
est estabilizado por la
formacin de un
hbrido de resonancia

3) El producto se ioniza
inmediatamente
Otros compuestos
fosforilados que
transfieren su
fosfato en
reacciones
celulares que
requieren energa
Otros compuestos
fosforilados que
transfieren su
fosfato en
reacciones
celulares que
requieren energa
TIOESTER
ESTABILIDAD POR
TAUTOMERIZACIN

ESTABILIDAD POR
RESONANCIA
ESTABILIDAD POR
RESONANCIA
EN LAS REACCIONES DE HIDRLISIS CON VARIACIONES
DE ENERGA LIBRE ESTNDAR GRANDES Y NEGATIVAS
los
PRODUCTOS SON MS ESTABLES QUE LOS REACTIVOS

1) La tensin de enlace en los reactivos debida a repulsin

electrosttica queda liberada por la separacin de carga
(ATP)

2) Los productos se estabilizan por ionizacin

3) Los productos se estabilizan por isomerizacin

4) Estabilidad por resonancia

 ENERGAS LIBRES ESTNDAR DE HIDRLISIS DE ALGUNOS
COMPUESTOS FOSFORILADOS Y DEL ACETIL-CoA (un tioster)
La hidrlisis de ATP o de un compuesto fosforilado es una reaccin
comn para obtener energa.
Esta reaccin se acopla energticamente a otra reaccin que la requiera

A B Reaccin exergnica

C D Reaccin exergnica
 LAS VARIACIONES DE ENERGA LIBRE ESTNDAR
SON ADITIVAS

Este principio explica por qu una reaccin termodinmicamente

desfavorable (endergnica) puede ser impulsada en el sentido directo
acoplndola a una reaccin muy exergnica a travs de un
intermediario comn.
FLUJO DE GRUPOS FOSFORILO
 REGULACIN DE UNA VA METABLICA

ENFOQUE TRADICIONAL VS. TEORA DEL CONTROL METABLICO

ENFOQUE TRADICIONAL TEORA DEL CONTROL METABLICO

Una va tiene uno o muy pocos
pasos regulacin, que se llaman
pasos limitantes o
No hay una enzima que sea la
responsable de regular el flujo de la va
El flujo de una va est controlado por
varias enzimas de las reacciones
que integran la va

Las enzimas limitantes o reguladoras Cada una tiene una contribucin que
se han propuesto con base en depende de la concentracin de
mediciones in vitro, muy alejadas de intermediarios
las condiciones fisiolgicas como
[intermediarios], efectores alostricos, Se basa en la medicin exptl. de una va
etc. perturbando una enzima especfica y
viendo como se comporta el flujo de la va
(concentraciones de los otros metabolitos)
todos estos datos se tratan matemtica-
mente y por eso es cuantitativa