Anda di halaman 1dari 4

Abstrak

Deteksi, identifikasi dan klasifikasi ragi telah mengalami perubahan besar dalam dekade terakhir dan
setengah berikut penerapan urutan gen analisis dan perbandingan genom. Pengembangan database
(barcode) dari urutan DNA dengan mudah ditentukan dari domain 1 dan 2 (D1 / D2) dari gen subunit
rRNA besar nuklir dan dari ITS sekarang memungkinkan banyak laboratorium untuk mengidentifikasi
spesies cepat dan akurat, sehingga menggantikan melelahkan dan sering tidak akurat tes fenotipe
sebelumnya digunakan. analisis filogenetik dari urutan gen telah mengakibatkan revisi utama dari
sistematika ragi menghasilkan redefinisi hampir semua genera. pemahaman baru tentang hubungan
spesies telah mendorong perubahan aturan untuk penamaan dan mengklasifikasikan ragi dan jamur
lainnya, dan aturan-aturan baru yang disajikan dalam Kode Internasional baru-baru ini dilaksanakan dari
Nomenklatur untuk ganggang, jamur, dan tanaman (Melbourne Code). Penggunaan metode molekuler
untuk identifikasi spesies dan dampak perubahan Kode klasifikasi akan dibahas, terutama dalam konteks
makanan dan minuman pembusukan ragi.

Abstrak
Insulin-seperti gen hormon kelenjar androgenic (IAG) adalah regulator seks khusus dinyatakan dalam
krustasea laki-laki, mengendalikan diferensiasi seksual laki-laki, spermatogenesis dan strategi
reproduksi. Penelitian kami sebelumnya dilaporkan kloning dan karakterisasi udang Macrobrachium
nipponense IAG (MnIAG). Dalam studi ini, kami lanjut mengidentifikasi wilayah MnIAG 5'-mengapit
2214-bp, dan dianalisis faktor transkripsi yang situs dan aktivitas transkripsi yang mengikat. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa ada dua urutan potensial promotor inti, tiga kotak TATA dan satu kotak
CAAT yang ada di MnIAG 5'-mengapit wilayah serta banyak potensi situs faktor transkripsi yang
mengikat, seperti SRY, Sox-5, gata-1, dll Terutama, aktivitas transkripsi lemah di wilayah ini, dan daerah
peraturan negatif ditemukan pada -604~-231 bp. Selain itu, kami membangun M. perpustakaan ragi
nipponense dan protein diidentifikasi berinteraksi dengan protein MnIAG oleh ragi dua uji hibridisasi.
Ragi screening dua hibrida menghasilkan sepuluh klon positif, yang lima yang dijelaskan oleh database
NCBI, yaitu panas sengatan protein 21, NADH dehidrogenase, protein zinc finger, beta-N-asetil dan
protein hipotetis. Identifikasi MnIAG wilayah peraturan diduga dan protein yang berinteraksi dengan
IAG akan memfasilitasi pemahaman kita tentang peran regulasi MnIAG dan memberikan dasar untuk
wawasan yang mendalam mekanisme diferensiasi udang seks dan jalur sinyal transduksi.

Abstrak
Telah baru-baru ini menemukan bahwa distribusi, habitat, dan keragaman genetik alami ragi
astaxanthin-memproduksi (yaitu Phaffia rhodozyma, sinonim Xanthophyllomyces dendrorhous) jauh
lebih besar dari yang diperkirakan sebelumnya. P. rhodozyma adalah biotechnologically dimanfaatkan
karena kemampuannya untuk menghasilkan astaxanthin karotenoid pigmen dan dengan demikian,
digunakan sebagai sumber alami pigmen ini untuk budidaya. P. rhodozyma juga mampu mensintesis
ampuh UVB tabir surya mycosporine-glutaminol-glukosida (MGG). Oleh karena itu, studi lingkungan
lebih lanjut diperlukan untuk menjelaskan aspek ekologi dan mendeteksi strain baru yang potensial
untuk produksi astaxanthin dan MGG. Namun, memperoleh isolat baru P. rhodozyma dan spesies terkait
tidak selalu mudah karena kelimpahan rendah dan adanya ragi simpatrik dan berpigmen lainnya. Dalam
karya ini kami melaporkan keberhasilan pengembangan primer spesies-spesifik yang memiliki
kemampuan untuk dengan cepat dan akurat mendeteksi isolat yang mewakili semua garis keturunan
yang dikenal dari genus Phaffia (termasuk spesies baru dari genus) dan tidak termasuk taksa terkait erat.
Untuk tujuan ini, primer dari 20 nukleotida (disebut PHR) dirancang untuk digunakan dalam kombinasi
dengan primer universal ITS3 dan NL4 dalam amplifikasi multipleks. Metode yang diusulkan memiliki
sensitivitas dan spesifisitas yang diperlukan untuk deteksi tepat isolat baru, dan karena itu merupakan
alat penting untuk pencarian lingkungan untuk novel ragi astaxanthin-memproduksi.

Abstrak
Laser desorpsi / ionisasi teknik matriks-dibantu waktu-of-flight spektrometri massa dikenal sebagai
MALDI-TOF MS adalah alat yang digunakan untuk identifikasi patogen klinis dengan menghasilkan
spektrum protein yang unik untuk spesies tertentu. Dalam penelitian ini kami menilai identifikasi isolat
khamir klinis oleh MALDI-TOF MS di sebuah rumah sakit universitas dari Argentina dan dibandingkan
dua prosedur untuk ekstraksi protein: metode cepat dan prosedur berdasarkan rekomendasi pabrikan.
Prosedur ekstraksi protein singkat diterapkan di 100 isolat dan tingkat identifikasi yang benar di genus
dan spesies tingkat adalah 98,0%. Selain itu, kami menganalisis 201 isolat, sebelumnya diidentifikasi
dengan metode konvensional, menggunakan metodologi yang direkomendasikan oleh produsen dan
ada 95,38% kebetulan di identifikasi pada tingkat spesies. MALDI TOF MS menunjukkan untuk menjadi
alat cepat, sederhana dan dapat diandalkan untuk identifikasi ragi.

Levaduras; MALDI-TOF MS; Identificacin


Kata kunci
Ragi; MALDI-TOF MS; Identifikasi

5 - identifikasi ragi dan karakterisasi


M. Hutzler, J. Koob, R. Riedl, H. Schneiderbanger, K. Mueller-Auffermann, F. Jacob
Abstrak
identifikasi ragi dan karakterisasi mempunyai arti penting untuk kualitas ragi ketegangan dan
kemurnian, dan karenanya untuk produk akhir. Bab ini menjelaskan spesies pembuatan bir ragi yang
berbeda dan identifikasi serta metode diferensiasi. strain ragi dijelaskan dari perspektif teknologi
fermentasi. spesifikasi kualitas ragi Universal sedang didefinisikan. metode beragam untuk menentukan
konsentrasi sel, viabilitas, vitalitas, parameter fermentasi utama, fermentasi oleh-produk, parameter
secara online diukur, dan nilai-nilai mikrobiologi dijelaskan dan dibahas. Informasi dari bab ini dapat
diterapkan untuk mengoptimalkan penggunaan strain pembuatan bir ragi tertentu, serta kualitas dan
proses mereka kontrol.

Kata kunci
Pembuatan bir; cerevisiae; Karakterisasi; Penanaman; Ragi budaya; Diferensiasi; Fermentasi; Identifikasi;
Pematangan; Non-Saccharomyces; Pastorianus; POF; Saccharomyces; spesifikasi; Ketegangan;
Kelangsungan hidup; Daya hidup; Ragi
Abstrak
Dalam penelitian ini kami mengevaluasi MALDI-TOF MS dan FilmArray metode untuk identifikasi cepat
ragi dari kultur darah positif. FilmArray benar diidentifikasi 20/22 spesies ragi, sementara MALDI-TOF MS
diidentifikasi 9/22. FilmArray adalah sistem identifikasi yang dapat diandalkan dan cepat untuk
identifikasi langsung dari ragi dari kultur darah positif.
Kata kunci
infeksi aliran darah; MALDI-TOF MS; FilmArray; candidemia; identifikasi ragi

Abstrak
Beberapa studi telah menunjukkan bahwa produk daging kalengan mungkin terkontaminasi dengan
elemen jamur, bakteri dan logam bahkan berat yang mungkin terjadi selama proses pengangkutan,
penyimpanan dan penanganan. Kami melakukan penelitian ini untuk menentukan jamur, mikroba dan
logam berat isi daging kalengan di Arab Saudi. Dari 13 sampel daging kalengan dipelajari, Aspergillus dan
Penicillium ditemukan di lebih dari 70% dari total sampel. Urutan spesies Penicillium yang diisolasi dari
sampel daging yang dihasilkan pohon filogenetik yang menunjukkan bahwa isolat dipelajari berkerumun
di empat kelompok. Tidak ada kontaminasi bakteri tercatat di semua sampel. Sembilan dari 13 sampel
memiliki konsentrasi zat besi di atas batas yang diperbolehkan. Semua sampel memiliki seng dan
tembaga tingkat di bawah batas maksimum yang diizinkan. Empat sampel memiliki kadar kadmium di
atas tingkat maksimum yang diizinkan. Semua sampel memiliki kadar timbal di atas tingkat maksimum
yang diizinkan. Hasil ini menunjukkan bahwa unsur-unsur jamur dan tingkat yang lebih tinggi dari logam
berat seperti timbal dan kadmium dapat ditemukan dalam produk daging kalengan. Hal ini dapat
menimbulkan sebagai bahaya nyata bagi konsumen, karena produk daging kalengan yang mudah
diakses dan nyaman di Arab Saudi.

Abstrak
masyarakat jamur culturable diselidiki dalam inti sedimen bawah permukaan laut diperoleh di tiga lokasi
berbeda di Suruga Bay. sampel inti sedimen diperiksa di lima kedalaman yang berbeda, yaitu 3 m, 12 m,
21 m, 31 m dan 40 m di bawah dasar laut (mbsf) di setiap lokasi. Meskipun terjadinya dan keragaman
jamur culturable di sedimen bawah permukaan muncul sangat rendah, jamur yang berhasil dibiakkan
dari 5 dari 15 sampel, termasuk sampel yang diambil dari 40 m di bawah dasar laut. spesies jamur yang
paling sering terdeteksi adalah Aspergillus spp. diikuti oleh Pichia dan Cadophora. Dua kemungkinan
baru spp. milik Ascomycota filum juga diisolasi.

Meskipun keberadaan jamur di lingkungan bawah permukaan mendalam telah diusulkan dalam
beberapa laporan terbaru, telah ada hanya informasi terbatas yang tersedia menggambarkan identifikasi
dan keragaman jamur culturable dari sedimen bawah permukaan dalam. Hasil kami memberikan bukti
lebih lanjut untuk mendukung bahwa jamur bertahan dalam biosphere bawah permukaan laut dalam.
Juga, ia menyarankan bahwa biosphere bawah permukaan laut dapat menjadi sumber daya jamur baru.
Penyelidikan lebih lanjut di berbudaya jamur bawah permukaan mendalam akan memberikan
pemahaman yang lebih baik dari ekologi dan fisiologi jamur extremotolerant dan potensi mereka untuk
aplikasi bioteknologi.
Kata kunci
Aspergillus spp .; Dalam biosfer; sedimen laut dalam; lingkungan yang ekstrim; jamur; Di bawah
permukaan