Plan de cours

Facult des arts et des sciences

Dpartement de sciences biologiques

Sigle du cours et
BIO3721 Trimestre Hiver 2014
section
Titre du cours cologie Microbienne
Crdits 3
Thorie : Mardi, 9h30-12h15
Horaire Date : 7 janvier au 15 avril 2014
Salle : D-544

Professeur Dan Nguyen

Local D-544 (PMV)
Courriel dan.nguyen@umontreal.ca
Tlphone 514-343-6111 poste 3188 Tlcopieur (514) 343-2293

Politique sur la dure des examens :

Un temps de battement de 15 minutes est ncessaire afin de permettre aux tudiants de dposer leur copie dexamen et de
librer la salle. Ex : examen dune dure de 1h45 ou de 2h45

VALUATION

Examens Pondration Date Dure Salle

Intra 45% 25 fvrier 2014 2h45 D-544

Final 35% 29 avril 2014 2h45 D-544
Participation APP 20% 11 mars au 15 avril 3h par sance dterminer

Lexamen intra comportera des questions choix multiples et des questions court dveloppement. Lexam en fina
comportera 2 questions dveloppement long et intgrera les notions vues durant les cours les APP. Les questions vous
seront transmises une semaine avant lexamen via StudiUM. La participation sera value sur: le nombre et la pertinence
des interventions lors des APP et la qualit des rsums de lectures (5 articles pour chaque APP) et des schmas
intgrateurs. Jusqu 5% de la note finale pourront tre retranchs pour une mauvaise qualit du franais crit dans les
rapports et examens.

** La prsence aux APP est obligatoire. Une absence injustifie sera sanctionne par une note de zro en participation pour
lAPP correspondant.

BUT DU COURS
Le but du cours est de dvelopper votre intrt et vos connaissances sur: 1) Le rle primordial des microorganismes dans le
fonctionnement des grands cycles biogochimiques (notamment Carbone, Azote) et 2) les facteurs qui influencent leur
abondance et leurs activits mtaboliques. Laccent sera mis sur les milieux aquatiques.

OBJECTIFS GNRAUX DAPPRENTISSAGE

la fin du cours, vous devriez possder les connaissances suivantes: 1) Comprendre le rle des bactries et dautres
microorganismes lchelle de lcosystme ; 2) Identifier les diffrents facteurs qui contrlent labondance, la production et
le mtabolisme des microorganismes en milieux naturels; 3) Lier la physiologie des microorganismes, les facteurs qui les
contrlent et limpact sur lcosystme ; 4) Identifier les liens entre certains facteurs environnementaux et lcologie de
microorganismes pathognes et 5) Synthtiser toute linformation pertinente en explorant la littrature scientifique.
 SYLLABUS GNRAL

Date Activits
7 janvier Prsentation du cours
14 janvier Cours 1
21 janvier Cours 2
28 janvier Cours 3 Contenu du cours
4 fvrier Cours 4
1. Introduction lcologie microbienne
11 fvrier Cours 5
18 fvrier Cours 6 : Rvision/Questions 2. Mtabolisme des bactries, facteurs de contrle et
25 fvrier Examen intra rseau microbien en cologie aquatique
4 mars Semaine de Relche 3. Cycle du carbone et rle des bactries
11 mars APP1 : Problmatique 4. Cycle de lazote et rle des bactries
18 mars Travail indpendant APP1 5. cologie des infections bactrienne
25 mars APP1 : Retour
1 avril APP2 : Problmatique
8 avril Travail indpendant APP2
15 avril APP2 : Retour
29 avril Examen final

RFRENCES ET DOCUMENTATION

Processes in Microbial Ecology. 2012. David L. Kirchman, Oxford University Press.

Microbial Ecology of the Oceans. 2008. David L Kirchman (ed), John Wiley & Sons Inc.
Microbe. 2005. Moselio Schaecter, John L. Ingraham and Frederick C. Neidhardt, ASM Press.
e
Brock, Biologie des microorganismes 11 dition. 2007. Michael Madigan, John Martinko, Pearson Education France.
Respiration in Aquatic Ecosystems. 2005. Paul A. del Giorgio et Peters le B. Williams(eds), Oxford University Press.
Les rfrences dautres livres et de plusieurs articles scientifiques sont donnes dans les notes de cours.

Bibliothque PC-Biologie

Guide en Sciences biologiques (point de dpart, ressources utiles, astuces)

http://guides.bib.umontreal.ca/disciplines/6--Sciences-biologiques
Recherche dans le catalogue Atrium (livres, thses UdeM, audiovisuel, titres de revues)
http://atrium.umontreal.ca/
Recherche dans les bases de donnes (articles scientifiques, statistiques, thses, etc.)
http://www.bib.umontreal.ca/Maestro

PLAGIAT
Nous vous invitons consulter le rglement disciplinaire de lUniversit sur le site suivant :
http://www.fas.umontreal.ca/plagiat/