- Tipos de ARN
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Hay varios tipos y formas de ARN. Por ejemplo, el ARN mensajero (ARNm)
lleva la informacin desde el ADN al ribosoma en el citoplasma donde realiza la
sntesis de protena real (traduccin).
ARN ribosmico
Esto ayuda al ARNm y el ARN de transferencia a unirse para formar la cadena
polipeptdica.
ARNs reguladores
Estos RNAs sirven para regular el proceso de la expresin gnica. MicroRNAs
(miRNA; 21-22 nt) por ejemplo son encontrados en eucariotas y actuar a travs
de ARN de interferencia (ARNi). Estos miRNA y enzimas pueden descomponer
ARNm que es complementario a la miRNA. Esto puede bloquear el ARNm de
ser traducido, o aceleran su degradacin.
Por otro lado pequeos RNAs de interferencia (siRNA; 20-25 nt) a menudo son
producidos por la degradacin del ARN viral, tambin hay fuentes endgenas
de ARNsi. Actan similares a miRNA. Un ARNm puede contener elementos
reguladores, como riboswitches, en la 5' UTR o 3' UTR; Estos elementos cis
reguladores regulan la actividad de ese mRNA.
ARN bicatenario
Estos son llamados dsARN donde el ARN tiene dos hebras complementarias,
similares al ADN encontrado en todas las clulas. dsARN constituye el material
gentico de algunos virus (virus de ARN bicatenario).
15.-
16.-
El ARN ribosomal (ARNr) constituye, junto con varias protenas, los ribosomas. El ribosoma es
la parte esencial de traduccin del ARN. Los ribosomas de procariotas y eucariotas son
ligeramente diferentes. Ambos estn compuestos por dos subunidades, pero los de procariotas
son ms pequeos, denomnndose 70s, frente a los eucariotas que se denominan 80s (estas
cifras corresponden a medidas de centrifugacin).
Ribosomas
En el caso del ribosoma procariota, sus dos subunidades son, una grande 50s y una pequea
30s. La subunidad 50s est compuesta por un ARNr 23s, un ARNr 5s y 31 protenas distintas,
denominadas protenas L. La subuniad 30s est compuesta por un ARNr 16s y 21 protenas
distintas, denominadas protenas S.
En el caso del ribosoma eucariota, posee una subunidad grande 60s y una subunidad pequea
40s. La subunidad 60s est compuesta por un ARNr 28s, un ARNr 5,8s y un ARNr 5s, adems
de 49 protenas distintas. Y la subunidad 40s est ocmpuesta por un ARNr 18s y 33 protenas
distintas.
Para que se mantengan unidos, debe tener una concentracin mnima de magnesio. Si la
concentracin de Mg2+ baja de 1mM, se disociarn las dos subunidades.
Cada tipo de ARNr tendr una conformacin. Alternan zonas de bases apareadas con bases
desapareadas. La concentracin de pases apareadas supondr, aproxiamadamente, el 70%.
ARNr
Las protenas de los ribosomas tienen carcter bsico, siendo ricas en cargas positivas. Pero
el ribosoma tiene, en su totalidad, carga elctrica negativa, debido sobre todo a las cargas
negativas de los grupos fosfato del ARN.
Una vez se han constituido las subunidades (a partir de sus elementos) se unen por
reconocimiento especfico. Este reconocimiento y unin tiene lugar de forma expontanea.
En el caso de clulas eucariotas podemos encontrar, adems de los ribosomas del citoplasma,
ribosomas en las mitocondrias y cloroplastos. Son ms pequeos que los citoplasmticos y se
parecen bastante a los ribosomas procariticos (constituyendo una prueba del origen procariota
de las mitocondrias y cloroplastos).
Todos los ARNr son expresiones finales de genes. Expresiones que, posteriormente, no son
traducidas (es decir, se transcribe el gen, pero no se traduce). Esto va a generar un problema
respecto a la velocidad de sntesis. Cuando se duplica la clula, debe duplicar sus ribosomas y
una clula puede tener de ocho a diez millones de ribosomas. Si solo tuviese un gen
determinado de cada tipo de ARNr, sintetizar una cantidad grande de ARN para producir
muchos ribosomas supondra demasiado tiempo. Normalmente, las clulas tienen ejemplares
repetidos de los genes del ARNr (tambin sucede con los ARNt). En el caso de los ARNm, no
se necesitan tener tambin genes estructurales de los ribosomas repetidos de esta forma(los
genes que, una vez traducidos, dan lugar a las protenas del ribosoma), ya que un solo ARNm
puede traducirse muchas veces, incluso millones de veces. Es decir, un solo ARNm puede dar
lugar a varios millones de polipptidos. Por eso estos genes no suelen venir repetidos. En
cambio, si que vendrn repetidos los genes de las histonas.
El ARNr se forma a partir de precursores ms grandes, que despus son cortados (maduracin
postranscripcional). Veremos el proceso en eucariotas.
Las protenas ribosomales se tienen que sintetizar en el citoplasma. Una vez se ha traducido el
ARNm las protenas vuelven al ncleo y es en el ncleo donde se unen al resto de
componentes.
Los cuatro tipos de ARNr van a ser codificados por dos genes. Uno de ellos es el gen
encargado del ARNr 5s. Se encuentra en diversos cromosomas (como ya indicamos, hay
varias copias) y forma parte del nucleolo. Es transcrito por al ARN pol III.
ARNr 5s
Otro gen va a dar lugar a un ARN 45s. Hay varias copias, separadas por espaciadores. Al
complejo de los genes ARN 45s se le denomina organizador nucleolar, ya que a partir de ellos
se formar el nucleolo. Estos genes son transcritos por la ARN polimerasa I. Se generan copias
de un ARN 45s que contiene en su interior los ARNr 18s, 5,8s y 28s. Estos tres se separan por
la accin de exonucleasas, que eliminan lo que les sobra por los extremos y endocucleasas
que eliminan las partes interiores del ARN 45s que separa los tres fragmentos. Por metiliacin
del OH de ciertas ribosas se marca la parte del ARN 45s que debe ser degradado por las
endonucleasas y exonucleasas.
El ARNr 18s, junto con las protenas S, formarn la subunidad pequea. El ARNr 5,8 s, junto
con el ARN 28s, el ARN 5s y las protenas L formarn la subunidad grande.
Todo esto va a un tiempo, es decir, todo el proceso tiene lugar a la vez. Las protenas van al
nucleolo, que es el lugar donde tienen lugar todos estos procesos.
Fabricacin de ribosomas
En los procariotas, hay tres tipos de ARN: el 16s, el 23s y el 5s. Los tres se forman a partir de
un precursor ms largo, ARNr 30s. En mitad del precursor encontraremos en algunos casos
una o dos secuencias que codifica para el ARNt.
ARNr en procariotas
En ciertos caos hay que eliminar intones (scplicing o corte y empalme). En vez de eliminar
intrones propiamente dichos, se eliminan los trozos del medio de ARN que tendran que estar
juntos. Se sabe que los ARNr de algunos procariotas y eucariotas unicelulares eliminan
intrones por un proceso de autosplicing o autoemplame, en el cual no intervienen enzimas que
catalicen el proceso. Este descubrimeinto fue una prueba que demostraba qu ciertos ARN
posean actividad autoenzimtica.
19.- De este modo, las secuencias reguladoras del ADN quedan accesibles. Las histonas
tambin pueden modificarse por metilacin, ribosilacin o fosforilacin; an no se conoce
en detalles cules son los mecanismos precisos con los que estn modificaciones influyen
en la regulacin gentica.
Las histonas se combinan en el ncleo de la clula con largas hebras de ADN, que
contienen los genes, para formar la cromatina, el material que constituye los
cromosomas. No hace mucho que todava se supona que esas protenas pequeas
no intervenan en la regulacin de los genes y tenan la misin exclusiva de servir
de material de empaquetamiento celular. Venan a ser una suerte de "bobinas"
dotadas de carga positiva, a cuyo alrededor se enrollaran las hebras de ADN
cargadas negativamente para as poder encajar en el interior del diminuto ncleo
celular.
Ciclo celular
Las clulas de los distintos organismos pasan durante su vida por distintos perodos, cada
uno de ellos caracterstico y claramente diferenciado.
Cada tipo celular cumple con sus funciones especficas durante la mayor parte de su vida,
creciendo gracias a la asimilacin de materiales provenientes de su ambiente y con ellos
sintetiza nuevas molculas por medio de complejos procesos regulados por su material
gentico.
Cuando una clula aumenta hasta llegar a un determinado tamao, su eficiencia metablica se
torna crtica, entonces se divide. En los organismos pluricelulares, se produce un crecimiento
a partir de una clula (huevo o cigoto) como as tambin se aumenta la masa tisular y se
reparan los tejidos lesionados o desgastados, por aumento del nmero de clulas.
Las nuevas clulas originadas en esta divisin poseen una estructura y funcin similares a las
clulas progenitoras, o bien derivadas de ellas.
En parte son similares porque cada clula nueva, recibe aproximadamente la mitad de
organoides y citoplasma de la clula madre, pero en trminos de capacidades estructurales
y funcionales lo importante es que cada clula hija, reciba una rplica exacta del material
gentico de la clula madre.
Durante la vida celular, las clulas pasan por un ciclo regular de crecimiento y divisin. A esta
secuencia de fases se la denomina ciclo celular y en general consta de un perodo donde
ocurre un importante crecimiento y aumento de la cantidad de organoides (interfase) y un
perodo de divisin celular (mitosis o meiosis).
La interfase involucra perodos donde la clula realiza los procesos vitales propios de su
funcin. Durante ella, se producen tambin fenmenos a nivel nuclear imprescindibles para la
divisin posterior. Cronolgicamente podemos dividir la interfase en tres etapas G 1, S y G2.
Haciendo un esquema del ciclo celular, el tiempo en que transcurre cada una de las etapas se
representa en la Fig. 12.2.
Es necesario sealar que existen excepciones a este ciclo, ya que no en todas las clulas los
perodos tienen la misma duracin. Incluso si consideramos una poblacin celular homognea
(clulas del mismo tipo), existen variaciones particulares. Siempre que se habla de tiempos
determinados, se hace considerando los promedios de cada tipo celular.
Tambin existen clulas que dejan de dividirse por largos perodos o bien permanentemente.
Por ejemplo, las neuronas permanecen luego de la maduracin del tejido nervioso en una etapa
especial denominada G0, donde las clulas entraran como alternativa a G1. En la actualidad
es frecuente referirse a este tipo de clulas como "no cclicas" o detenidas en G 1, ya que no
es seguro que las clulas que no se dividen pasen por un solo estado.
ETAPAS Y CARACTERSTICAS
Como ya se mencion, una clula tipo pasa a lo largo de su vida por etapas (G1, S y G2) antes
de dividirse. Las caractersticas ms relevantes de cada una de las mismas son:
Etapa G1: Esta etapa que sucede a la divisin celular es la ms variable en duracin. Las
clulas hijas recientemente originadas presentan una gran actividad metablica
producindose un aumento acelerado del tamao celular. Los organoides de la clula
precursora han sido repartidos de manera ms o menos equitativa entre las clulas hijas,
deben entonces aumentar de tamao y tambin en nmero para mantener las caractersticas
de su tipo celular. Se sintetizan as ribosomas y microtbulos a partir de las protenas y otras
molculas que la conforman. Los organoides del sistema de endomembranas, aumentan
considerablemente de tamao, ya que ambas clulas hijas han recibido parte de estos
organoides. Sin embargo, pueden ser sintetizados de nuevo en caso de no existir precursores.
Esto no ocurre con mitocondrias y cloroplastos que se originan por divisin de estas
estructuras preexistentes. Como se recordar ambos organoides contienen ADN y ribosomas
que les permite dividirse de forma relativamente independiente del ncleo celular.
Todos los procesos de sntesis de nuevos organoides o aumento de tamao de los existentes,
son regulados mediante activacin de complejos enzimticos en un momento determinado.
En este perodo se observa, a su vez, una gran sntesis de ARNm como as tambin ARNt y
ARNr. Estos cidos sern utilizados para la sntesis de protenas estructurales, para la
construccin y o aumento de los organoides, como as tambin la produccin de enzimas
necesarias para dicha sntesis. Cabe destacar que durante este perodo tambin se sintetizan
las enzimas que sern utilizadas en la etapa siguiente, es decir en la duplicacin del ADN,
como as tambin molculas precursoras de los cidos nucleicos.
Cuando las clulas dejan de crecer (si se agotan los nutrientes o por inhibicin por contacto)
lo hacen en G1. Esto implica que tambin se sintetizan las sustancias que estimulan o inhiben
distintas fases del ciclo celular.
Etapa G2: En esta fase, ya con el ADN duplicado, la clula ensambla las estructuras
necesarias para la separacin de las clulas hijas durante la divisin celular y la citocinesis
(separacin del citoplasma).
El sistema de control del ciclo celular es un dispositivo bioqumico compuesto por un conjunto
de protenas reguladoras interactivas: las ciclinas y las quinasas dependientes de
ciclinas que inducen y coordinan los procesos bsicos del ciclo, como la duplicacin de ADN y
la divisin celular, a los que denominamos procesos subordinados.
Durante un ciclo tpico, el sistema de control est regulado por factores de retraso que
pueden frenar el ciclo en puntos determinados denominados puntos de control. En estos
puntos, las seales de retroalimentacin que contienen informacin sobre los procesos
subordinados pueden detener momentneamente el avance del ciclo, evitando el inicio del
proceso siguiente antes que el precedente haya terminado. Sobre dichos factores tambin
actan seales del entorno como puede ser una hormona o un factor de crecimiento.
Una analoga que puede ayudarnos a comprender este mecanismo es comparar al sistema de
control del ciclo celular con el funcionamiento de una lavadora automtica (1. Alberts y col -
pg929-930), el programador de la lavadora slo avanza a travs de los diferentes pasos del
ciclo de lavado (etapas del ciclo celular), si recibe determinadas seales. Adentro de la
lavadora hay sensores que miden el nivel de agua o jabn que ingresan. Estos sensores envan
seales que pueden provocar el retraso o la interrupcin del ciclo de lavado. De igual manera
en la clula, las seales generadas en los procesos subordinados (por ej. la sntesis de ADN)
o por el entorno, detienen el ciclo.
El pasaje de una clula a travs del ciclo es controlado por protenas citoplasmticas. Los
principales reguladores del ciclo en clulas animales son:
CDK de G1 (Cdk2)
Las CDK se activan slo cuando se unen a las ciclinas para formar complejos, por lo que
requieren un nivel umbral para desencadenar la transicin a la fase siguiente del ciclo celular.
Fig. 12.4 -Generalizacin del sistema de control del ciclo celular en eucariotas
Fig. 12. 5 - Ciclinas y CDK en un ciclo celular de vertebrados
Un nuevo participante entra al ciclo, el complejo promotor de la mitosis, FPM, formado por
las ciclinas mitticas ms las quinasas dependientes de ciclinas de M (Cdk1). ste inicia el
ensamblado del huso mittico, la desintegracin de la envoltura nuclear y la condensacin de
los cromosomas, al inducir la fosforilacin de diferentes sustratos como las lminas
nucleares, conduciendo a la clula a la metafase.
A esta altura del ciclo, el FPM activa el complejo promotor de la Anafase, APC, que permite
la separacin de las cromtides hermanas y su migracin a los polos (anafase). As se completa
la mitosis, se destruyen las ciclinas de fase M y se activan las ciclinas de G1 para el prximo
ciclo celular.
Durante el ciclo celular, la clula pasa al menos tres puntos de control (checkpoints):
Fig. 12.7 - Puntos de Control e Ingreso de la informacin Reguladora al Sistema de Control del Ciclo
Celular
Como hemos mencionado en los prrafos precedentes, tanto en el punto de control G1 como
G2 se verifica la integridad del ADN. Ante la presencia de ADN daado se genera una seal
que retrasa la entrada en fase M. El mecanismo depende de una protena llamada p53, que se
acumula en la clula en respuesta a las alteraciones de ADN, deteniendo el sistema de control
en G1 y por lo tanto impidiendo la posterior entrada en mitosis. El gen p53 es uno de los genes
supresores de tumores ms conocidos, que no slo detiene el ciclo (arresto celular), sino
tambin participa en la apoptosis (muerte celular programada) forzando a las clulas al
suicidio cuando el dao en el ADN es irreparable.
Las clulas que presentan los dos alelos del gen p53 mutados, tendrn protena p53 no
activa y por lo tanto continuarn dividindose a pesar del dao en su genoma, por lo tanto
desarrollarncncer. Las mutaciones del gen p53 presenta una alta incidencia en la mayora
de los cnceres humanos.
Cuando el ADN presenta un dao "limitado", aumentan los niveles de protena p53. Dicha
protena activa la transcripcin del gen p21, que codifica a la protena p21. Esta ltima
protena ejerce su efecto inhibidor unindose al complejo ciclina-Cdk2 y deteniendo el ciclo.
Cuando el ADN es reparado, la protena p53 se libera del promotor del gen p21, provocando
el descenso en los niveles de p21. Esto permite restaurar la actividad del complejo ciclina-
Cdk2.
ONCOGENES Y CNCER
Los genes supresores de tumores, codifican para productos celulares que inhiben la
proliferacin celular. Para impedir el efecto protector que ejercen sobre el genoma, se
requiere la mutacin de sus dos alelos.
Los genes conocidos como protooncogenes codifican protenas que estimulan la divisin
celular, por ejemplo, factores del crecimiento o receptores de factores del crecimiento.
La mutacin de uno de los dos alelos que codifican para un protooncogen, lo transforma en
un oncogen capaz de originar productos celulares que estimulan la divisin celular de forma
incontrolada conduciendo al cncer, con alteracin de los mecanismos de control del ciclo
celular.
Aunque los principios generales de la duplicacin o replicacin del ADN son sencillos y
pueden considerarse como consecuencia directa de su estructura, el proceso requiere una
maquinaria compleja que contiene una gran cantidad de enzimas y protenas que actan en
conjunto.
Fig. 12.9 - La duplicacin del ADN se produce previo desenrollamiento de las dos cadenas
de la doble hlice, usando cada una como molde para sintetizar las nuevas cadenas.
Los cromosomas eucariontes tienen una gran cantidad de ADN, el cual se halla contenido en
dos molculas lineales, una para cada cromtide. Si estas molculas se replicasen a partir
de un sitio nico de origen, la etapa S de la Interfase sera extremadamente larga. Las
clulas eucariontes resuelven este problema disponiendo de mltiples sitios de origen de la
replicacin en cada cromosoma. En ellos, el ADN presenta secuencias especiales de
nucletidos. Adems todos los orgenes tienen en comn secuencias conservadas de
aproximadamente doce pares de nucletidos, llamados ARS (autonomus replication
secuence).
Fig. 12.10 - La replicacin siempre comienza en los sitios de origen en cada cromosoma. En
ellos el ADN presenta secuencias especiales de nucletidos
En cada cromosoma, las dos cadenas del ADN se encuentran arrolladas una a la otra como
los hilos de una soga. Si tratamos de separarlas, la soga debe apretarse ms en las vueltas
restantes o girar. Algo similar ocurre en el ADN, cuando las cadenas complementarias se
separan para iniciar la duplicacin. En ese momento aumenta la tensin torsional en el
sector no duplicado de la doble hlice.
Fig. 12. 11 - Separacin progresiva de las dos cadenas de ADN a nivel de la horquilla de
replicacin y su posible consecuencia biolgica.
A medida que la enzima helicasa abre la doble hlice, dos enzimas complementarias:
la topoisomerasa I y la topoisomerasa II o girasa, van disminuyendo la tensin torsional
acumulada por el superenrollamiento en el sector no replicado de la doble hlice.
La topoisomerasa I primero corta una de las cadenas del ADN, luego la cadena cortada
gira una vuelta en torno a su propio eje y finalmente vuelve a unir los extremos cortados.
La topoisomerasa II corta las dos cadenas, las cuales luego de girar una vuelta alrededor
del eje de la doble hlice, restablecen sus uniones.
Ambas enzimas utilizan energa del ATP y se comportan como nucleasas (cortando las
cadenas de ADN) y luego como ligasas (restableciendo las uniones fosfodister).
Las topoisomerasas I y II se diferencian no slo porque la primera corta una de las cadenas
y la segunda corta las dos, sino tambin porque la topoisomerasa I realiza
desenrollamientos de corto alcance y la girasa abarca una extensin de ADN bastante
mayor.
Fig. 12.12 - Efecto hipottico de la topoisomerasa II para evitar el superenrollamiento que se
produce en el ADN como consecuencia de la separacin progresiva de sus cadenas.
Al abrirse la doble hlice se forma una burbuja de replicacin, cuyo tamao aumenta a
medida que avanza la separacin de las dos cadenas del ADN, fenmeno que se produce en
ambos extremos de la burbuja en forma simultnea. Se establece de este modo, en cada
uno de los extremos, una estructura en forma de Y, a la que llamamos horquilla de
replicacin, cuyos brazos representan a las cadenas ya separadas de ADN y el tronco la
doble hlice en vas de separacin. As cada burbuja tiene dos horquillas de replicacin que
a partir de un punto de origen comn avanzan en direcciones opuestas. Las horquillas
desaparecen cuando se van integrando a las burbujas contiguas. Las horquillas que recorren
los telmeros desaparecen cuando se separa el ltimo par de nucletidos.
El segmento de ADN que se sintetiza a partir de un origen de replicacin (con sus dos
horquillas), lo llamamos replicn. De este modo la replicacin del ADN termina cuando se
ensamblan los sucesivos replicones. Esto permite que el ADN se sintetice en un tiempo
bastante breve para el ciclo de vida de una clula.
Fig. 12. 14 - Esquema que muestra dos replicones contiguos y los puntos donde se origina la
replicacin (flechas). Puede observarse el carcter bidireccional de la replicacin y los
sectores donde el ADN se sintetiza en forma continua y discontinua.
Una de las caractersticas de las ADN-polimerasas es que slo pueden actuar en direccin
5 3, por agregado de nucletidos en el extremo 3 de las cadenas nuevas. Como vimos,
a medida que se separan las cadenas progenitoras en la horquilla de replicacin, una
presenta sus nucletidos en direccin 5 3 y la otra en direccin 3 5. De manera
que la primera al ser copiada debera formar una cadena hija en sentido 3 5, algo que
las polimerasas no pueden hacer.
Por lo expuesto, podemos decir que la sntesis del ADN es un proceso bidireccional, no slo
porque se produce en dos direcciones divergentes a partir de una misma burbuja de
replicacin, sino tambin porque las cadenas de la doble hlice son sintetizadas en
direcciones opuestas.
5. MODELO SEMICONSERVATIVO
Como las nuevas hlices de ADN estn formadas por una cadena original (preexistente) que
sirvi de molde y una cadena nueva (recin sintetizada) decimos que el mecanismo de
replicacin es semiconservativo.
Para iniciar la sntesis de las cadenas complementarias se requiere adems del ADN molde
un cebador o primer , que consiste en una pequea cadena de ARN de unos diez nucletidos
de largo. La sntesis del cebador es catalizada por una enzima llamada ARN-primasa y. el
cebador queda unido al ADN temporariamente. Una vez sintetizado el cebador la sntesis
contina si la ADN-polimerasa tiene disponibles suficientes desoxirribonucletidos
trifosfatados (dATP, dGTP, dCCP y dTTP). stos se agregan en la cadena nueva de acuerdo
a la secuencia de nucletidos de la cadena que sirve de molde.
Como vimos la cadena continua requiere un solo cebador que se forma a comienzo de la
replicacin, en cambio la cadena discontinua necesita muchos cebadores, uno para cada
fragmento de Okazaki. La enzima responsable de la sntesis discontinua es la ADN-
polimerasa . Cabe sealar que las ADN-polimerasas son sostendas por un anillo proteico
llamado PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen) mientras realiza el deslizamiento por la
cadena de ADN
Fig. 12.16 - Doble hlice de ADN desenrrollndose. Cada cadena servir de molde para la
sntesis de cadenas nuevas
Fig. 12.17 - La energa para el proceso de replicacin la proveen los mismos
desoxirribonucletidos trifosfatados, con la hidrlisis de los ltimos dos grupos fosfato-
Fig. 12. 18 - Unin del aro de PCNA a la ADN polimerasa
Los fragmentos de Okazaki alcanzan una longitud de 200 nucletidos. Una vez completa la
sntesis de un fragmento ambas enzimas se liberan y vuelven juntas hacia el ngulo de la
horquilla de replicacin, dejando atrs los 200 nucletidos del segmento que acaban de
sintetizar y otros tantos del ADN molde que se usar para copiar el prximo fragmento de
Okazaki.
La discontinuidad de la sntesis hace que la hebra mal orientada crezca ms lentamente que
la otra, que lo hace en forma continua, por esta razn se les asign el nombre de cadena
rezagada ycadena adelantada respectivamente.
Replicacin de la heterocromatina
Sntesis de histonas
Hemos sealado que el ADN se replica en forma semiconservativa, es decir que las cadenas
de la doble hlice progenitora, al separarse para su replicacin, se comparten por igual en
ambos cromosomas hijos. En cambio no se sabe como se segregan las histonas. Es posible
que al cabo de la replicacin sean heredadas totalmente por uno de los cromosomas hijos,
en este caso el otro cromosoma hijo debe procurarse de la totalidad de histonas nuevas.
Replicacin en Procariontes
Muchas de las caractersticas esenciales de la duplicacin del ADN son universales, aunque
existen algunas diferencias entre procariontes y eucariontes debido a que su material
gentico est organizado de manera distinta.
En las bacterias casi todo el ADN se encuentra formando una cadena circular, en cambio en
los eucariontes cada cromosoma no duplicado contiene una cadena lineal asociada a una gran
cantidad de protenas y algo de ARN.
Exonucleasa en sentido 3 5
Poli. I y Poli. III
20.-
3.- cido
Desoxirribonucleico o ADN
o DNA
A.- ESTRUCTURA.
Est formado por la unin de muchos desoxirribonucletidos. La mayora de
las molculas de ADN poseen dos cadenas antiparalelas ( una 5-3y la otra
3-5) unidas entre s mediante las bases nitrogenadas, por medio de puentes
de hidrgeno.
- Collar de perlas
- Fibra cromatnica
- Bucles radiales
- Cromosoma.
Estn formados por una sola cadena, a excepcin del ARN bicatenario de los
reovirus.
- Se sintetiza en el nucleolo.
- Posee una masa molecular de 45 S, que actua como recursor de parte del
ARNr, concretamente de los ARNr 28 S (de la subunidad mayor), los
ARNr 5,8 S (de la subunidad mayor) y los ARNr 18 S (de la subunidad menor)
ARNu
Sus principales caractersticas son:
cido desoxirribonucleico
DNA redirige aqu. Para otras acepciones, vase DNA (desambiguacin).
El cido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un cido nucleico que contiene las
instrucciones genticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos
los organismos vivos y algunos virus, y es responsable de su transmisin hereditaria. La
funcin principal de la molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo
de informacin para construir otros componentes de las clulas, como las protenas y las
molculas de ARN. Los segmentos de ADN que llevan esta informacin gentica son
llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos estructurales o toman
parte en la regulacin del uso de esta informacin gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos, es decir,
un polinucletido. Un polmero es un compuesto formado por muchas unidades simples
conectadas entre s, como si fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN,
cada vagn es un nucletido, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar
(la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede
ser adeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG) y un grupo fosfato que acta como
enganche de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de otro
es, entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando
solo la secuencia de sus bases. La disposicin secuencial de estas cuatro bases a lo largo
de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es
la que codifica la informacin gentica: por ejemplo, una secuencia de ADN puede
ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta como una doble
cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por unas conexiones
denominadas puentes de hidrgeno.1
Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular,
debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucletidos, ms cortos y con unas
unidades diferentes, llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactamente del ADN
mediante un proceso denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo celular,
las molculas de ARN pueden salir al citoplasma para su utilizacin posterior. La informacin
contenida en el ARN se interpreta usando el cdigo gentico, que especifica la secuencia
de los aminocidos de las protenas, segn una correspondencia de un triplete de
nucletidos (codn) para cada aminocido. Esto es, la informacin gentica (esencialmente:
qu protenas se van a producir en cada momento del ciclo de vida de una clula) se halla
codificada en las secuencias de nucletidos del ADN y debe traducirse para poder funcionar.
Tal traduccin se realiza usando el cdigo gentico a modo de diccionario. El diccionario
"secuencia de nucletido-secuencia de aminocidos" permite el ensamblado de largas
cadenas de aminocidos (las protenas) en el citoplasma de la clula. Por ejemplo, en el
caso de la secuencia de ADN indicada antes (ATGCTAGCATCG...), la
ARN polimerasa utilizara como molde la cadena complementaria de dicha secuencia de
ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para transcribir una molcula de ARNm que se
leera AUG-CUA-GAU-CGC-...; el ARNm resultante, utilizando el cdigo gentico, se
traducira como la secuencia de aminocidos metionina-leucina-cido asprtico-arginina-...
Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, fsica y funcional de la
herencia se denominan genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra
que se encarga de definir cundo y dnde deben expresarse. La informacin contenida en
los genes (gentica) se emplea para generar ARN y protenas, que son los componentes
bsicos de las clulas, los "ladrillos" que se utilizan para la construccin de los orgnulos u
organelos celulares, entre otras funciones.
Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que,
durante el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los organismos
eucariotas (por ejemplo, animales, plantas y hongos) almacenan la mayor parte de su ADN
dentro del ncleo celular y una mnima parte en elementos celulares llamados mitocondrias,
y en los plastos y los centros organizadores de microtbulos o centrolos, en caso de
tenerlos; los organismos procariotas (bacterias y arqueas) lo almacenan en el citoplasma de
la clula y, por ltimo, los virus ADN lo hacen en el interior de la cpside de naturaleza
proteica. Existen multitud de protenas, como por ejemplo las histonas y los factores de
transcripcin, que se unen al ADN dotndolo de una estructura tridimensional determinada
y regulando su expresin. Los factores de transcripcin reconocen secuencias reguladoras
del ADN y especifican la pauta de transcripcin de los genes. El material gentico completo
de una dotacin cromosmica se denomina genoma y, con pequeas variaciones, es
caracterstico de cada especie.
ndice
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1Historia de la gentica
2Propiedades fsicas y qumicas
o 2.1Componentes
o 2.2Apareamiento de bases
2.2.1Otros tipos de pares de bases
o 2.3Estructura
2.3.1Estructuras en doble hlice
2.3.2Estructuras en cudruplex
o 2.4Hendiduras mayor y menor
o 2.5Sentido y antisentido
o 2.6Superenrollamiento
3Modificaciones qumicas
o 3.1Modificaciones de bases del ADN
o 3.2Dao del ADN
4Funciones biolgicas
o 4.1Genes y genoma
4.1.1El ADN codificante
4.1.2El ADN no codificante
o 4.2Transcripcin y traduccin
o 4.3Replicacin del ADN
4.3.1Hiptesis sobre la duplicacin del ADN
5Interacciones ADN-protena
o 5.1Protenas que unen ADN
5.1.1Interacciones inespecficas
5.1.2Interacciones especficas
o 5.2Enzimas que modifican el ADN
5.2.1Nucleasas y ligasas
5.2.2Topoisomerasas y helicasas
5.2.3Polimerasas
6Recombinacin gentica
7Evolucin del metabolismo de ADN
8Tcnicas comunes
o 8.1Tecnologa del ADN recombinante
o 8.2Secuenciacin
o 8.3Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR)
o 8.4Southern blot
o 8.5Chips de ADN
9Aplicaciones
o 9.1Ingeniera gentica
o 9.2Medicina forense
o 9.3Bioinformtica
o 9.4Nanotecnologa de ADN
o 9.5Historia, antropologa y paleontologa
10Vase tambin
11Referencias
o 11.1Notas
o 11.2Bibliografa
12Enlaces externos
Historia de la gentica[editar]
Artculo principal: Historia de la gentica
El ADN lo aisl por primera vez, durante el invierno de 1869, el mdico suizo Friedrich
Miescher mientras trabajaba en la Universidad de Tubinga. Miescher realizaba
experimentos acerca de la composicin qumica del pus de vendas quirrgicas desechadas
cuando not un precipitado de una sustancia desconocida que caracteriz qumicamente
ms tarde.23 Lo llam nuclena, debido a que lo haba extrado a partir de ncleos celulares.4
Se necesitaron casi 70 aos de investigacin para poder identificar los componentes y
la estructura de los cidos nucleicos.
En 1919 Phoebus Levene identific que un nucletido est formado por una base
nitrogenada, un azcar y un fosfato.5 Levene sugiri que el ADN generaba una estructura
con forma de solenoide (muelle) con unidades de nucletidos unidos a travs de los grupos
fosfato. En 1930 Levene y su maestro Albrecht Kossel probaron que la nuclena de Miescher
es un cido desoxirribonucleico (ADN) formado por cuatro bases nitrogenadas
(citosina (C), timina (T), adenina (A) y guanina (G), el azcar desoxirribosa y un grupo
fosfato, y que, en su estructura bsica, el nucletido est compuesto por un azcar unido a
la base y al fosfato.6 Sin embargo, Levene pensaba que la cadena era corta y que las bases
se repetan en un orden fijo. En 1937 William Astbury produjo el primer patrn de difraccin
de rayos X que mostraba que el ADN tena una estructura regular.7
La funcin biolgica del ADN comenz a dilucidarse en 1928, con una serie bsica de
experimentos de la gentica moderna realizados por Frederick Griffith, quien estaba
trabajando con cepas lisas (S) o rugosas (R) de la bacteria Pneumococcus (causante
de la neumona), segn la presencia (S) o no (R) de una cpsula azucarada, que es la que
confiere virulencia (vase tambin experimento de Griffith). La inyeccin de neumococos S
vivos en ratones produce la muerte de stos, y Griffith observ que, si inyectaba ratones con
neumococos R vivos o con neumococos S muertos por calor, los ratones no moran. Sin
embargo, si inyectaba a la vez neumococos R vivos y neumococos S muertos, los ratones
moran, y en su sangre se podan aislar neumococos S vivos. Como las bacterias muertas
no pudieron haberse multiplicado dentro del ratn, Griffith razon que deba producirse algn
tipo de cambio o transformacin de un tipo bacteriano a otro por medio de una transferencia
de alguna sustancia activa, que denomin principio transformante. Esta sustancia
proporcionaba la capacidad a los neumococos R de producir una cpsula azucarada y
transformarse as en virulentas. En los siguientes 15 aos, estos experimentos iniciales se
replicaron mezclando distintos tipos de cepas bacterianas muertas por el calor con otras
vivas, tanto en ratones (in vivo) como en tubos de ensayo (in vitro).8 La bsqueda del factor
transformante que era capaz de hacer virulentas a cepas que inicialmente no lo eran
continu hasta 1944, ao en el cual Oswald Avery, Colin MacLeod y Maclyn
McCarty realizaron un experimento hoy clsico. Estos investigadores extrajeron la fraccin
activa (el factor transformante) y, mediante anlisis qumicos, enzimticos y serolgicos,
observaron que no contena protenas, ni lpidos no ligados, ni polisacridos activos, sino
que estaba constituido principalmente por "una forma viscosa de cido desoxirribonucleico
altamente polimerizado", es decir, ADN. El ADN extrado de las cepas bacterianas S muertas
por el calor lo mezclaron "in vitro" con cepas R vivas: el resultado fue que se formaron
colonias bacterianas S, por lo que se concluy inequvocamente que el factor o principio
transformante era el ADN.9
A pesar de que la identificacin del ADN como principio transformante an tard varios aos
en ser universalmente aceptada, este descubrimiento fue decisivo en el conocimiento de la
base molecular de la herencia, y constituye el nacimiento de la gentica molecular.
Finalmente, el papel exclusivo del ADN en la heredabilidad fue confirmado en 1952mediante
los experimentos de Alfred Hershey y Martha Chase, en los cuales comprobaron que el fago
T2 transmita su informacin gentica en su ADN, pero no en su protena 10 (vase
tambin experimento de Hershey y Chase).
En cuanto a la caracterizacin qumica de la molcula, Chargaff realiz en 1940 algunos
experimentos que le sirvieron para establecer las proporciones de las bases nitrogenadas
en el ADN. Descubri que las proporciones de purinas eran idnticas a las de pirimidinas, la
equimolecularidad de las bases ([A]=[T], [G]=[C]) y el hecho de que la cantidad de G+C
en una determinada molcula de ADN no siempre es igual a la cantidad de A+T y puede
variar desde el 36 hasta el 70 por ciento del contenido total.6 Con toda esta informacin y
junto con los datos de difraccin de rayos X proporcionados por Rosalind Franklin, James
Watson y Francis Crick propusieron en 1953 el modelo de la doble hlice de ADN para
representar la estructura tridimensional del polmero.11 En una serie de cinco artculos en el
mismo nmero de Nature se public la evidencia experimental que apoyaba el modelo de
Watson y Crick.12 De stos, el artculo de Franklin y Raymond Gosling fue la primera
publicacin con datos de difraccin de rayos X que apoyaba el modelo de Watson y Crick,13
14 y en ese mismo nmero de Nature tambin apareca un artculo sobre la estructura del
Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante puentes de hidrgeno,
que aparecen como lneas punteadas.
El ADN es un largo polmero formado por unidades repetitivas, los nucletidos.1819 Una
doble cadena de ADN mide de 22 a 26 angstroms (2,2 a 2,6 nanmetros) de ancho, y una
unidad (un nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de largo.20 Aunque cada unidad individual que
se repite es muy pequea, los polmeros de ADN pueden ser molculas enormes que
contienen millones de nucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo,
el cromosoma nmero 1, tiene aproximadamente 220 millones de pares de bases.21
En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual, sino como
una pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas de ADN se enroscan
sobre s mismas formando una especie de escalera de caracol, denominada doble hlice.
El modelo de estructura en doble hlice fue propuesto en 1953 por James Watson y Francis
Crick (el artculo Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic
Acid fue publicado el 25 de abril de 1953 en Nature), despus de obtener una imagen de
la estructura de doble hlice gracias a la refraccin por rayos X hecha por Rosalind
Franklin.22 El xito de este modelo radicaba en su consistencia con las propiedades fsicas
y qumicas del ADN. El estudio mostraba, adems, que la complementariedad de
bases poda ser relevante en su replicacin, y tambin la importancia de la secuencia de
bases como portadora de informacin gentica.232425 Cada unidad que se repite, el
nucletido, contiene un segmento de la estructura de soporte (azcar + fosfato), que
mantiene la cadena unida, y una base, que interacciona con la otra cadena de ADN en la
hlice. En general, una base ligada a un azcar se denomina nuclesido y una base ligada
a un azcar y a uno o ms grupos fosfatos recibe el nombre de nucletido.
Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el polmero
resultante se denomina polinucletido.26
Componentes[editar]
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est formada por
unidades alternas de grupos fosfato y azcar (desoxirribosa).27 El azcar en el ADN es una
pentosa, concretamente, la desoxirribosa.
cido fosfrico:
Enlace fosfodister. El grupo fosfato(PO43-) une el carbono 5' del azcar de un nuclesido con
el carbono 3' del siguiente.
Su frmula qumica es H3PO4. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos de cido
fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de los cidos nucleicos solo
aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.
Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa,
que forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C 5H10O4.
Una de las principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el
ARN la 2-desoxirribosa del ADN es reemplazada por una pentosa alternativa,
la ribosa.25
Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que
forman enlaces fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3, tres prima) y
quinto (5, cinco prima) de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin
de enlaces asimtricos implica que cada hebra de ADN tiene una direccin. En
una doble hlice, la direccin de los nucletidos en una hebra (3 5) es opuesta a
la direccin en la otra hebra (5 3). Esta organizacin de las hebras de ADN se
denomina antiparalela; son cadenas paralelas, pero con direcciones opuestas. De la
misma manera, los extremos asimtricos de las hebras de ADN se
denominan extremo 5 (cinco prima) y extremo 3 (tres prima), respectivamente.
Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son
la adenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de estas
cuatro bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para
formar el nucletido completo (base-azcar-fosfato). Las bases son compuestos
heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos de nitrgeno, y, dentro de las
bases mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases
pricas o purinas (adenina y guanina), derivadas de la purina y formadas por dos
anillos unidos entre s, y las bases pirimidnicas o bases
pirimdicas o pirimidinas (citosina y timina), derivadas de la pirimidina y con un solo
anillo.25 En los cidos nucleicos existe una quinta base pirimidnica,
denominada uracilo (U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en el ARN y
difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se
encuentra habitualmente en el ADN, solo aparece raramente como un producto
residual de la degradacin de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa.
Timina:
En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado pirimidnico con
un grupo oxo en las posiciones 2 y 4, y un grupo metil en la posicin 5. Forma
el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina, ya que solo aparece en el ADN) y
el nucletido timidilato o timidina monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina siempre
se empareja con la adenina de la cadena complementaria mediante 2 puentes de
hidrgeno, T=A. Su frmula qumica es C5H6N2O2 y su nomenclatura 2, 4-dioxo, 5-
metilpirimidina.
Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina.
Citosina:
En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado pirimidnico, con
un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en posicin 2. Forma
el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y el nucletido citidilato o
(desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN, CMP en el ARN). La citosina siempre
se empareja en el ADN con la guanina de la cadena complementaria mediante un
triple enlace, CG. Su frmula qumica es C4H5N3O y su nomenclatura 2-oxo, 4
aminopirimidina. Su masa molecular es de 111,10 unidades de masa atmica. La
citosina se descubri en 1894, al aislarla del tejido del timo de carnero.
Adenina: 6-aminopurina.
Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la purina con
un grupo amino en la posicin 6. Forma el nuclesido adenosina(desoxiadenosina
en el ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi)adenosina monofosfato (dAMP, AMP).
En el ADN siempre se empareja con la timina de la cadena complementaria
mediante 2 puentes de hidrgeno, A=T. Su frmula qumica es C5H5N5 y su
nomenclatura 6-aminopurina. La adenina, junto con la timina, fue descubierta en
1885 por el mdico alemn Albrecht Kossel.
Guanina:
En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un
grupo oxo en la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido
(desoxi)guanosina y el nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato
(dGMP, GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina de la
cadena complementaria mediante tres enlaces de hidrgeno, GC. Su frmula
qumica es C5H5N5O y su nomenclatura 6-oxo, 2-aminopurina.
Tambin existen otras bases nitrogenadas (las
llamadas bases nitrogenadas minoritarias), derivadas
de forma natural o sinttica de alguna otra base
mayoritaria. Lo son por ejemplo la hipoxantina,
relativamente abundante en el tRNA, o la cafena, ambas
derivadas de la adenina; otras, como el aciclovir, derivadas
de la guanina, son anlogos sintticos usados en terapia
antiviral; otras, como una de las derivadas del uracilo, son
antitumorales.
Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas
que les confieren unas propiedades determinadas. Una
caracterstica importante es su carcter aromtico,
consecuencia de la presencia en el anillo de dobles
enlaces en posicin conjugada. Ello les confiere la
capacidad de absorber luz en la
zona ultravioleta del espectro en torno a los 260 nm, lo
cual puede aprovecharse para determinar el coeficiente de
extincin del ADN y hallar la concentracin existente de los
cidos nucleicos. Otra de sus caractersticas es que
presentan tautomera o isomera de grupos funcionales,
debido a que un tomo de hidrgeno unido a otro tomo
puede migrar a una posicin vecina; en las bases
nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras:
tautomera lactama-lactima, donde el hidrgeno migra del
nitrgeno al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y
viceversa (forma lactima), y tautomera imina-
amina primaria, donde el hidrgeno puede estar formando
el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno
adyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar
tautomera amina-imina, la timina y el uracilo muestran
tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citosina
pueden presentar ambas. Por otro lado, y aunque se trate
de molculas apolares, las bases nitrogenadas presentan
suficiente carcter polar como para establecer puentes de
hidrgeno, ya que tienen tomos
muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) que presentan
carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno con carga
parcial positiva, de manera que se forman dipolos que
permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Se estima que el genoma humano haploide tiene
alrededor de 3000 millones de pares de bases. Para indicar
el tamao de las molculas de ADN se indica el nmero de
pares de bases, y como derivados hay dos unidades de
medida muy utilizadas, la kilobase (kb), que equivale a
1000 pares de bases, y la megabase (Mb), que equivale a
un milln de pares de bases.
Apareamiento de bases[editar]
Vase tambin: Par de bases
Un par de bases CG con tres puentes de hidrgeno.
Modificaciones
qumicas[editar]
Modificaciones de bases
del ADN[editar]
Vase tambin: Metilacin
La expresin de los genes est
influenciada por la forma en la que el ADN est empaquetado en cromosomas, en una
estructura denominada cromatina. Las modificaciones de bases pueden estar implicadas en
el empaquetamiento del ADN: las regiones que presentan una expresin gnica baja o nula
normalmente contienen niveles altos de metilacin de las bases citosina. Por ejemplo, la
metilacin de citosina produce 5-metil-citosina, que es importante para la inactivacin
del cromosoma X.61 El nivel medio de metilacin vara entre organismos: el
gusano Caenorhabditis elegans carece de metilacin de citosina, mientras que
los vertebrados presentan un nivel alto hasta 1 % de su ADN contiene 5-metil-citosina.62
A pesar de la importancia de la 5-metil-citosina, sta puede desaminarse para generar una
base timina. Las citosinas metiladas son por tanto particularmente sensibles a mutaciones.63
Otras modificaciones de bases incluyen la metilacin de adenina en bacterias y
la glicosilacin de uracilo para producir la "base-J" en kinetoplastos.6465
Dao del ADN[editar]
Vase tambin: Mutacin
Funciones
biolgicas[editar]
Las funciones biolgicas del ADN
incluyen el almacenamiento de informacin (genes y genoma), la codificacin de protenas
(transcripcin y traduccin) y su autoduplicacin (replicacin del ADN) para asegurar la
transmisin de la informacin a las clulas hijas durante la divisin celular.
Genes y genoma[editar]
Vanse tambin: Ncleo
celular, Cromatina, Cromosoma y Genoma.
El ADN se puede considerar
como un almacn cuyo contenido es la informacin (mensaje) necesaria para construir y
sostener el organismo en el que reside, la cual se transmite de generacin en generacin.
El conjunto de informacin que cumple esta funcin en un organismo dado se
denomina genoma, y el ADN que lo constituye, ADN genmico.
El ADN genmico (que se
organiza en molculas de cromatina que a su vez se ensamblan en cromosomas) se
encuentra en el ncleo celular de los eucariotas, adems de pequeas cantidades en
las mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el ADN se encuentra en un cuerpo de forma
irregular denominado nucleoide.76
El ADN codificante[editar]
Semiconservativa: Segn el
experimento de Meselson-Stahl, cada hebra sirve de molde para que se forme una hebra
nueva, mediante la complentariedad de bases, quedando al final dos dobles hlices
formadas por una hebra antigua (molde) y una nueva hebra (copia).
Conservativa: Tras la
duplicacin quedaran las dos hebras antiguas juntas y, por otro lado, las dos hebras nuevas
formando una doble hlice.
Dispersiva: Segn esta
hiptesis, las hebras resultantes estaran formadas por fragmentos en doble hlice ADN
antiguo y ADN recin sintetizado.
Interacciones ADN-
protena[editar]
Todas las funciones del ADN
dependen de sus interacciones con protenas. Estas interacciones pueden ser inespecficas,
o bien la protena puede unirse de forma especfica a una nica secuencia de ADN. Tambin
pueden unirse enzimas, entre las cuales son particularmente importantes las polimerasas,
que copian las secuencia de bases del ADN durante la transcripcin y la replicacin.
Protenas que unen
ADN[editar]
Interacciones
inespecficas[editar]
Interaccin de ADN
con histonas (en blanco, arriba). Los aminocidos bsicos de estas protenas (abajo a la
izquierda, en azul) se unen a los grupos cidos de los fosfatos del ADN (abajo a la derecha, en
rojo).
Las protenas estructurales que
se unen al ADN son ejemplos bien conocidos de interacciones inespecficas ADN-protenas.
En los cromosomas, el ADN se encuentra formando complejos con protenas estructurales.
Estas protenas organizan el ADN en una estructura compacta denominada cromatina.
En eucariotas esta estructura implica la unin del ADN a un complejo formado por pequeas
protenas bsicas denominadas histonas, mientras que en procariotas estn involucradas
una gran variedad de protenas.8283 Las histonas forman un complejo de forma cilndrica
denominado nucleosoma, en torno al cual se enrollan casi dos vueltas de ADN de doble
hlice. Estas interacciones inespecficas quedan determinadas por la existencia de residuos
bsicos en las histonas, que forman enlaces inicos con el esqueleto de azcar-fosfato del
ADN y, por tanto, son en gran parte independientes de la secuencia de bases.84 Estos
aminocidos bsicos experimentan modificaciones qumicas
de metilacin, fosforilacin y acetilacin,85 que alteran la fuerza de la interaccin entre el
ADN y las histonas, haciendo al ADN ms o menos accesible a los factores de
transcripcin y por tanto modificando la tasa de transcripcin.86
Otras protenas que se unen a
ADN de manera inespecfica en la cromatina incluyen las protenas del grupo de alta
movilidad (HMG, High Mobility Group) que se unen a ADN plegado o distorsionado.87 Estas
protenas son importantes durante el plegamiento de los nucleosomas, organizndolos en
estructuras ms complejas para constituir los cromosomas88 durante el proceso
de condensacin cromosmica. Se ha propuesto que en este proceso tambin intervendran
otras protenas, formando una especie de "andamio" sobre el cual se organiza la cromatina;
los principales componentes de esta estructura seran la enzima topoisomerasa II
(topoIIalpha) y la condensina13S.89 Sin embargo, el papel estructural de la topoIIalpha en
la organizacin de los cromosomas an es discutido, ya que otros grupos argumentan que
esta enzima se intercambia rpidamente tanto en los brazos cromosmicos como en
los cinetocoros durante la mitosis.90
Interacciones
especficas[editar]
Un grupo bien definido de
protenas que unen ADN es el
conformado por las protenas que
se unen especficamente a ADN
monocatenario o ADN de hebra
sencilla (ssDNA). En humanos,
la protena A de replicacin es la
mejor conocida de su familia y
acta en procesos en los que la
doble hlice se separa, como
la replicacin del ADN,
la recombinacin o la reparacin
del ADN.91 Estas protenas
parecen estabilizar el ADN
monocatenario, protegindolo
para evitar que forme estructuras
de tallo-lazo (stem-loop) o que
sea degradado por nucleasas.
El factor de transcripcin
represor del fago lambda unido a
su ADN diana mediante un
motivo hlice-giro-hlice (helix-
turn-helix).92
La enzima de
restriccin EcoRV (verde) formando
un complejo con su ADN diana.97
Enzimas que modifican el
ADN[editar]
Nucleasas y ligasas[editar]
Las nucleasas son enzimas que
cortan las hebras de ADN
mediante la catlisis de
la hidrlisis de los enlaces
fosfodister. Las nucleasas que
hidrolizan nucletidos a partir de
los extremos de las hebras de
ADN se
denominan exonucleasas,
mientras que
las endonucleasas cortan en el
interior de las hebras. Las
nucleasas que se utilizan con
mayor frecuencia en biologa
molecular son las enzimas de
restriccin, endonucleasas que
cortan el ADN por determinadas
secuencias especficas. Por
ejemplo, la enzima EcoRV, que
se muestra a la izquierda,
reconoce la secuencia de 6 bases
5-GAT|ATC-3, y hace un corte
en ambas hebras en la lnea
vertical indicada, generando dos
molculas de ADN con los
extremos romos. Otras enzimas
de restriccin generan sin
embargo extremos cohesivos, ya
que cortan de forma diferente las
dos hebras de ADN. En la
naturaleza, estas enzimas
protegen a las bacterias contra
las infecciones de fagos, al digerir
el ADN de dicho fago cuando
entra a travs de la pared
bacteriana, actuando como un
mecanismo de defensa.98
En biotecnologa, estas
nucleasas especficas de la
secuencias de ADN se utilizan
en ingeniera
gentica para clonar fragmentos
de ADN y en la tcnica de huella
gentica.
Las enzimas denominadas ADN
ligasas pueden reunir hebras de
ADN cortadas o rotas.99 Las
ligasas son particularmente
importantes en la replicacin de
la hebra que sufre replicacin
discontinua en el ADN, ya que
unen los fragmentos cortos de
ADN generados en la horquilla de
replicacin para formar una copia
completa del molde de ADN.
Tambin se utilizan en
la reparacin del ADN y en
procesos de recombinacin
gentica.99
Topoisomerasas y
helicasas[editar]
Las topoisomerasas son enzimas
que poseen a la vez actividad
nucleasa y ligasa. Estas
protenas varan la cantidad
de ADN superenrollado. Algunas
de estas enzimas funcionan
cortando la hlice de ADN y
permitiendo que una seccin rote,
de manera que reducen el grado
de superenrollamiento. Una vez
hecho esto, la enzima vuelve a
unir los fragmentos de ADN.59
Otros tipos de enzimas son
capaces de cortar una hlice de
ADN y luego pasar la segunda
hebra de ADN a travs de la
rotura, antes de reunir las
hlices.100 Las topoisomerasas
son necesarias para muchos
procesos en los que interviene el
ADN, como la replicacin del
ADN y la transcripcin.60
Las helicasas son unas protenas
que pertenecen al grupo de
los motores moleculares. Utilizan
energa qumica almacenada en
los nuclesidos trifosfatos,
fundamentalmente ATP, para
romper puentes de hidrgeno
entre bases y separar la doble
hlice de ADN en hebras
simples.101 Estas enzimas son
esenciales para la mayora de los
procesos en los que las enzimas
necesitan acceder a las bases del
ADN.
Polimerasas[editar]
Las polimerasas son enzimas qu
e sintetizan cadenas de
nucletidos a partir de
nuclesidos trifosfatos. La
secuencia de sus productos son
copias de cadenas de
polinucletidos existentes, que se
denominan moldes. Estas
enzimas funcionan aadiendo
nucletidos al grupo hidroxilo en
3' del nucletido previo en una
hebra de ADN. En consecuencia,
todas las polimerasas funcionan
en direccin 5 --> 3.102 En
los sitios activos de estas
enzimas, el nuclesido trifosfato
que se incorpora aparea su base
con la correspondiente en el
molde: esto permite que la
polimerasa sintentice de forma
precisa la hebra complementaria
al molde.
Las polimerasas se clasifican de
acuerdo al tipo de molde que
utilizan:
La transcripcin se lleva a
cabo por una ARN
polimerasa dependiente de
ADN que copia la secuencia
de una de las hebras de ADN
en ARN. Para empezar a
transcribir un gen, la ARN
polimerasa se une a una
secuencia del ADN
denominada promotor, y
separa las hebras del ADN.
Entonces copia la secuencia
del gen en un transcrito
de ARN mensajero hasta que
alcanza una regin de ADN
denominada terminador,
donde se detiene y se separa
del ADN. Como ocurre con
las ADN polimerasas
dependientes de ADN en
humanos, la ARN polimerasa
II (la enzima que transcribe la
mayora de los genes del
genoma humano) funciona
como un gran complejo
multiproteico que contiene
mltiples subunidades
reguladoras y accesorias.106
Recombinacin
gentica[editar]
Estructura de un intermedio
en unin de Holliday en
la recombinacin gentica. Las
cuatro hebras de ADN separadas
estn coloreadas en rojo, azul,
verde y amarillo.107
Artculo principal: Recombinacin
gentica
Evolucin del
metabolismo de
ADN[editar]
Vase tambin: Hiptesis del
mundo de ARN
El ADN contiene la informacin
gentica que permite a la mayora
de los organismos vivientes
funcionar, crecer y reproducirse.
Sin embargo, no est claro
durante cunto tiempo ha ejercido
esta funcin en los ~3000
millones de aos de la historia de
la vida, ya que se ha propuesto
que las formas de vida ms
tempranas podran haber
utilizado ARN como material
gentico.114115 El ARN podra
haber funcionado como la parte
central de un metabolismo
primigenio, ya que puede
transmitir informacin gentica y
simultneamente actuar
como catalizador formando parte
de las ribozimas.116 Este
antiguo Mundo de ARN donde los
cidos nucleicos funcionaran
como catalizadores y como
almacenes de informacin
gentica podra haber influido en
la evolucin del cdigo
gentico actual, basado en
cuatro nucletidos. Esto se
debera a que el nmero de bases
nicas en un organismo es un
compromiso entre un nmero
pequeo de bases (lo que
aumentara la precisin de la
replicacin) y un nmero grande
de bases (que a su vez
aumentara la eficiencia cataltica
de las ribozimas).117
Desafortunadamente, no se
cuenta con evidencia directa de
los sistemas genticos
ancestrales porque la
recuperacin del ADN a partir de
la mayor parte de los fsiles es
imposible. Esto se debe a que el
ADN es capaz de sobrevivir en el
medio ambiente durante menos
de un milln de aos, y luego
empieza a degradarse
lentamente en fragmentos de
menor tamao en solucin.118
Algunas investigaciones
pretenden que se ha obtenido
ADN ms antiguo, por ejemplo un
informe sobre el aislamiento de
una bacteria viable a partir de un
cristal salino de 250 millones de
aos de antigedad,119 pero estos
datos son controvertidos.120121
Sin embargo, pueden utilizarse
herramientas de evolucin
molecular para inferir los
genomas de organismos
ancestrales a partir de
organismos contemporneos.122
123 En muchos casos, estas