4.

Los aminocidos son cidos orgnicos, que se combinan para formar protenas. La
estructura bsica de un aminocido esta compuesta por un carbono central (alfa), unido a
un grupo carboxilo (COOH), un grupo amino (NH2), un hidrgeno y una cadena lateral R,
que es la que distingue un aminocido de otro.
Si el aminocido se encuentra en solucin acuosa y pH 7, los grupos carboxilo y amino se
ionizarn, es decir, el hidrgeno del grupo carboxilo pasa al grupo amino, y como
consecuencia se formar un dipolo en la molcula.

Como ya dijimos, los aminocidos se diferencian unos de otros por su cadena lateral R.
Segn los componentes de esta cadena, podemos clasificar los aminocidos de la
siguiente manera:
Aminocidos alifticos
La cadena lateral de estos aminocidos es hidrofbica, por eso tienden a ubicarse en el
interior de las protenas globulares, al encontrarse en solucin acuosa.
Glicina (Gly; G):. Tiene como cadena lateral slo un tomo de hidrgeno. Es el
aminocido ms simple de todos.

Alanina (Ala; A): En su cadena lateral encontramos un grupo metilo.

Valina (Val; V): Es ms hidrofbica que las anteriores, dada su cadena lateral
hidrocarbonada ms larga y ramificada.

Leucina (Leu; L): parecida a la anterior, con un grupo metilo ms.

Isoleucina (Ile; I): Se diferencia de la leucina por la posicin de uno de los grupos metilo..
 Prolina (Pro; P): su cadena lateral se une al carbono central y adems al grupo amino,
formando un anillo.

Aminocidos aromticos
En la cadena lateral de estos aminocidos encontramos un anillo aromtico. Esta es la
razn de que sean altamente hidrofbicos.
Fenilalanina (Phe; F): su cadena lateral est compuesta por un grupo metilo y un anillo
bencnico en el extremo.

Tirosina (Tyr; Y): igual que la anterior pero con un grupo hidroxilo al final, lo que lo
confiere cierta hidrofilia.

Triptfano (Trp; W): observamos un anillo indol entre el anillo bencnico y el grupo
metilo. Altamente hidrofbico.

Aminocidos sulfurados
Cistena (Cys; C): en su cadena lateral encontramos un grupo sulfhidrilo (-SH). Este
grupo es muy reactivo y forma puentes de hidgeno y enlaces disulfuro (S-S; enlace
covalente)

En la imagen de arriba observamos dos cistenas unidas por enlace disulfuro, el

aminocido resultante es llamado cistina.
Metionina (Met; M): Todos los procesos de transcripcin de protenas comienzan con
este aminocido. Su grupo sulfhidrilo no es tan reactivo como en los aminocidos
anteriores.
Aminocidos hidrfilos
En este grupo podemos encontrar tres subgrupos: aminocidos cidos, bsicos y neutros.
Aminocidos cidos: son muy polares y gracias al grupo cido que podemos encontrar en
su cadena lateral, tienen carga negativa a pH neutro.
cido asprtico (Asp; D): tambin llamado aspartato, porque a pH fisiolgico se
encuentra disociado, ya que el grupo carboxilo pierde el hidrgeno.

cido glutmico (Glu; E): tambin conocido con el nombre de glutamato, por la misma
razn que el anterior.

Aminocidos bsicos: en sus cadenas laterales encontramos grupos amino, que se

cargarn positivamente a pH neutro.
Lisina (Lys; K): Su cadena lateral es larga. Aunque podra parecer una cadena
hidrofbica, la polaridad est dada por el grupo amino terminal.

Arginina (Arg; R): contiene la cadena lateral ms larga de todas, con un grupo guanidino
en el extremo.

Aminocidos neutros: no encontramos grupos amino ni grupos carboxilo en su cadena R,

por lo tanto no tienen carga a pH neutro. Sin embargo son polares, y pueden formar
puentes de hidrgeno.
Serina (Ser; S): Tiene un grupo OH al final de su cadena R.

Treonina (Thr; T): Tambin tiene un Grupo OH en su cadena R.

Glutamina (Gln; Q): tiene un grupo amino y un carbonilo en el extremo de su cadena.

Propiedades Fsicas
Son compuestos inicos que forman slidos cristalinos solubles en agua, debido a
su carga inica son poco solubles en benceno y ter.
Presentan isomera espacial ptica: Los aminocidos al igual que los glcidos
presentan isomera geomtrica debido a la presencia de carbonos asimtricos.
Tambin se denomina con la letra D y L , de acuerdo a la ubicacin del grupo
amino. Si el grupo amino est a la derecha, es D aminocido y si est a la
izquierda es un L aminocido.

Propiedades Qumicas
Auto-neutralizacin: el grupo cido (carboxilo) y el grupo bsico (amino) presente
en los aminocidos reaccionan entre s formando iones hbridos (que presentan las
dos cargas), denominadas Zwitteriones.

8. Factores Ambientales
Las enzimas se utilizan en otras muchas otras industrias, incluyendo textil, del
papel y los fabricantes de cuero. Los expertos afirman que los tratamientos
qumicos agresivos utilizados en la produccin de estas industrias pueden
presentar riesgos potenciales para empleados. Siempre que sea posible, el uso
de enzimas es una alternativa preferida en la facilitacin de un ambiente de
trabajo ms saludable. Adems, el Departamento de Agricultura de los Estados
Unidos informa que el uso de enzimas comerciales para producir etanol de
grano puede reducir las emisiones de gases de efecto invernadero asociadas a
la fabricacin de etanol.

9. suelo

Las enzimas son protenas cuyo papel es catalizar las reacciones qumicas en los siste-
mas vivos, actan sobre sustratos especficos transformndolos en productos necesa-
rios paralos ciclos biolgicos. Los organismos y las plantas liberan enzimas al suelo por
secrecin y por lisis celular despus de su muerte; un bajo porcentaje de estas prote-
nas quedan inmovilizadas y estabilizadas en interaccin con los diferentes componen-
tes de la fase slida del suelo, como las arcillas, molculas orgnicas y complejos rga-
nominerales (Joinville et al.,2004). Dependiendo del material, la interaccin se da por
mecanismos que incluyen: microencapsulacin, enlaces transversales, formacin de co-
polmeros, adsorcin, entrapamiento, intercambio inico y enlaces covalentes (Dick y
Tabatabai, 1992). Solo un bajo porcentaje de las enzimas que abandonan las clulas
se encuentran estabilizadas, ya que se liberan a un ambiente inhspito donde pueden
ser sometidas a desnaturalizacin no biolgica, adsorcin, inactivacin o degradacin
por proteasas. Al igual que en los otros sistemas vivos, la velocidad de la reaccin cata-
lizada por una enzima es dependiente del pH, de la fuerza inica, de la temperatura
yde la presencia o ausencia de inhibidores (Burns, 1982; Sarkar et al.,1989). Las enzi-
mas proceden de clulas proliferantes, latentes, o restos de ellas. La mayor produccin
de enzimas extracelulares se le atribuye a microorganismos por su gran biomasa, su alta
actividad metablica y su corto ciclo de vida, en contraste con otros organismos que

tambin las pueden liberar como las plantas y los animales (Dick y Tabatabai, 1992).
Las fuentes y estado de las enzimas en el suelo se resumen en la figura 1. En el suelo
se ha detectado la actividad de hidrolasas, transferasas, oxidorreductasas y liasas que
estn directamente relacionadas con los ciclos del C, N, P y S.
Figura 1. Fuente y estado de las enzimas en el suelo. (i) Enzimas intercelulares, (ii)
Enzimas peri-
plasmticas, (iii) Enzimas unidas a la superficie exterior de las membranas celulares,
(iv) Enzimas
liberadas durante el crecimiento y la divisin, (v) Enzimas dentro de clulas latentes
(esporas,
quistes, semillas, endosporas), (vi) Enzimas unidas a clulas muertas y detritos, (vii)
Enzimas libe-
radas de clulas intactas o de clulas lisadas, (viii) Enzimas temporalmente asociadas a
complejos
enzimasustrato, (ix) Enzimas adsorbidas en la superficie de minerales arcillosos, (x)
Enzimas for-
mando complejos con coloides hmicos.