Anda di halaman 1dari 1

Nama : Muhammad Fikri AL Habib

NIM : D14150004
Resum Journal

Pemindaian seluruh genom untuk mendeteksi lokus sifat kuantitatif yang terkait
dengan komposisi protein susu dalam 3 breed sapi perah Prancis

Penelitian ini menggunakan analisis genom secara luas untuk mendeteksi lokus sifat
kuantitatif (QTL) yang mempengaruhi komposisi protein susu. Analisis ini menggunakan
spektrometri infra merah pada jenis sapi Montbliarde (MO), Normande (NO), dan Holstein
(HO ) pada Ternak sapi perah di Perancis. Keenam protein susu utama (-lactalbumin, -
lactoglobulin, dan S1- , S2- , -, dan k-kasein) dinyatakan dalam gram per 100 g susu (%
susu) atau sebagai gram per 100 g protein (% protein) diperkirakan sebanyak 848.068 sampel
susu di uji per harinya dari 156.660 ekor sapi. Genotip dilakukan pada 2.773 MO, 2.673 NO,
dan 2.208 HJ sapi dengan menggunakan Illumina BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San
Diego, CA).
Uji rekaman individu per hari disesuaikan efek lingkungan dan kemudian dirata-ratakan
per ekor untuk menentukan fenotip yang dianalisis. Deteksi karakteristik lokus - lokus
dilakukan dalam setiap jenis dengan menggunakan pendekatan hubungan disequilibrium dan
pendekatan keterkaitan. Sebanyak 39 genom didistribusikan pada 20 dari 29 Bos
taurusautosom (BTA) secara bermakna dikaitkan dengan komposisi protein susu pada tingkat
signifikansi genom dalam setidaknya 1 dari 3 keturunan. 9 QTL yang paling signifikan
ditempatkan di BTA2 (133 Mbp), BTA6 (38, 47, dan 87 Mbp), BTA11 (103 Mbp), BTA14
(1,8 Mbp), BTA20 (32 dan 58 Mbp), dan BTA29 (8 Mbp ). QTL BTA6 (87 Mbp), BTA11,
dan BTA20 (58 Mbp) QTL ditemukan pada semua 3 breed, dan mereka memiliki efek yang
sangat signifikan terhadap kasein, -laktoglobulin, dan -laktalbumin, yang dinyatakan sebagai
persentase protein, masing-masing.
Masing-masing QTL ini menjelaskan antara 13% (BTA14) dan 51% (BTA11) varian
genetik dari sifat tersebut. Banyak daerah QTL lainnya juga diidentifikasi dalam setidaknya
satu jenis. Mereka berada di 14 kromosom tambahan (1, 3, 4, 5, 7, 15, 17, 19, 21, 22, 24, 25,
26, dan 27), dan mereka menjelaskan 2 sampai 8% varian genetik dari 1 atau lebih karakteristik
komposisi protein. Analisis konkordansi, dilakukan antara status QTL dan polimorfisme
turunan dari 13 ekor sapi jantan, mengungkapkan polimorfisme sebab-akibat yang diketahui
sebelumnya diLGB (BTA11) dan GHR (BTA20 pada 32 Mbp) dan mengecualikan beberapa
mutasi yang telah dijelaskan sebelumnya. Hasil ini merupakan langkah pertama dalam
mengidentifikasi mutasi kausal dan menggunakan prediksi mid-inframerah yang dikumpulkan
secara rutin dalam program seleksi genomik di masa depan untuk memperbaiki komposisi
protein susu sapi.

Anda mungkin juga menyukai