Practica 8 Expresiones Regulares

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Procesadores de texto &

Expresiones regulares
+
PROCESADORES DE TEXTO
Todos los archivos en las computadoras consisten

de una secuencia lineal de nmeros binarios.
Los procesadores de texto son un tipo especial de

archivo binario, donde los nmeros corresponden a
caracteres legibles por el humano, tales como
dgitos, letras, signos de puntuacin, espacios en
blanco, tabulaciones, y fin de lneas.
+
PROCESADORES DE TEXTO
Notepad++
Notepad
NoteTab
TextEdit
Komodo Edit
Text Wrangler (mac)
etc.
+
Expresiones Regulares
Son formas flexibles de bsqueda y reemplazo de
textos.
Herramientas que estn incorporadas en:

- Editores de textos.
- Lenguajes de programacin.
- Sistemas de bsqueda en Internet.
Las expresiones regulares hacen uso de COMODINES.
Los COMODINES incrementan la utilidad de una

herramienta de bsqueda y reemplazo cuando el texto
que se quiere modificar es variable.
+
Expresiones Regulares - ejercicio
1. Crea un nuevo documento en Notepad++
2. Tipea:
Agalma elegans
3. Selecciona Find en el men Search
4. Selecciona la opcin normal
5. Tipea
Find: galma
Replace: .
RESULTADO:
+
1. Crea un nuevo documento en Notepad++
2. Tipea:
Agalma elegans
3. Selecciona Find en el men Search
4. Selecciona la opcin normal
5. Tipea
Find: galma
Replace: .
RESULTADO: A. elegans
+
1. Tipea
Agalma elegans
Frillagalma vityazi
Cordagalma tottoni
2. Tipea
Find: galma
Replace: .
RESULTADO:
+
1. Tipea
Agalma elegans
Frillagalma vityazi
Cordagalma tottoni
2. Tipea
Find: galma
Replace: .
RESULTADO:
A. elegans
Frilla. vityazi
Corda. tottoni
+
1. Tipea
Agalma elegans
Frillagalma vityazi
Cordagalma tottoni
2. Tipea
Find: galma
Replace: .
RESULTADO:
A. elegans
Frilla. vityazi
Corda. tottoni (no es el resultado esperado)
+
\w indica cualquier letra (A-z), dgitos (0-9) y _
1. Tipea
+40 46N +014 15E
+21 17N -157 52W
2. Selecciona la opcin regular expressions
3. Eliminar E, N y W (todas las letras)
Find: \w
Replace: (nada)
RESULTADO:
+
1. Tipea
+40 46N +014 15E
+21 17N -157 52W
Find: \w
Replace: (nada)
RESULTADO:
++
+
+
1. Tipea
+40 46N +014 15E
+21 17N -157 52W
Find: \w
Replace: (nada)
RESULTADO:
++
+ (no es el resultado esperado)
+
4. Retorna al principio
+40 46N +014 15E
+21 17N -157 52W
5. Toma ventaja de la observacin que las letras que se

desean borrar siempre estn despus del (apstrofo)
Find: \w
Replace:
RESULTADO:
+
4. Retorna al principio
+40 46N +014 15E
+21 17N -157 52W
5. Toma ventaja de la observacin que las letras que se

desean borrar siempre estn despus del (apstrofo)
Find: \w
Replace:
RESULTADO:
+40 46 +014 15
+21 17 -157 52
+
( ) captura de textos
1. Tipea
5to
3ro
2do
2. Solo queremos quedarnos con el nmero y eliminar las dos letras

siguientes
Find: (\w)(\w)(\w)
Replace: \1\2
RESULTADO:
5t
3r
2d
+
1. Tipea
5to
3ro
2do
2. Solo queremos quedarnos con el nmero y eliminar las dos letras

siguientes
Find: \w\w\w
Replace: \w\w
RESULTADO:
5t
3r
2d (no es el resultado esperado)
+
3. Retorna al inicio
5to
3ro
2do
4. Podemos capturar el primer carcter con los parntesis

Find: (\w)\w\w
Replace: \1
RESULTADO:
5
3
2
+
5. Retorna al inicio
5to
3ro
2do
6. Agrega el trmino Posicin: antes del nmero

Find: (\w)\w\w
Replace: Posicin: \1
RESULTADO:
Posicin: 5
Posicin: 3
Posicin: 2
+
+ El signo + despus de un carcter indica que el
trmino debe coincidir una o ms veces en
sucesin.
Por ejemplo, el trmino \w+ puede representar un solo

carcter, como la letra a, o muchos caracteres,
como el nmero 123
+
+ El signo + despus de un carcter indica que el trmino debe
coincidir una o ms veces en sucesin.
Retornando al primer ejemplo:

Agalma elegans
Frillagalma vityazi
Cordagalma tottoni
La combinacin de ( ) y + permite capturar palabras
independientemente
Find: (\w)\w+ (\w+) o (\w)(\w+) (\w+)
Replace: \1. \2 \1. \3
RESULTADO:
A. elegans
F. vityazi
C. tottoni
+
\ Obviar caracteres o remover el significado especial de los
signos de puntuacin.
1. Tipear:
Physalis peruviana (Linnaeus)
2. Emplear el carcter \ para eliminar los parntesis
Find: (\w)\w+ (\w+) \((\w)\w+\)
Replace: \1. \2 \3.
RESULTADO:
P. peruviana L.
+
Expresiones Regulares - comodines
Trmino Significado
\w Carcter para palabras, incluye letras,

nmeros y el guin bajo.
\t Caracter de tabulaciones.
\s Un espacio en blanco, incluye espacios, tabs, y
fin de linas.
\r \a Fin de lnea
\d Un dgito, de 0-9
.
+
-reformateando datos moleculares
+
Por ejemplo, para reducir los nombres o ttulos de las

secuencias.
+
Por ejemplo, para reducir los nombres o ttulos de las
secuencias.
>CAA58790.i= GFP [Aequorea victoria]

>(CAA58790).i= GFP [(Aequorea) victoria]
(\w+).+ \[(\w).+
Find: (\w+).+\[(\w+).+
Replace: \1_\2
RESULTADO:
>CAA58790_Aequorea
+
>gi|576528|gb|L37519.1|POTPPINHB Solanum
tuberosum proteinase inhibitor II mRNA, complete cds
AACACGTGGGGGCAGTACTAATTATTATCCAGCATGGCTGTTCACAAGGAAGTTAATTTCGTTGCTTACC
TACTAATTGTTCTTGGATTATTGGTACTTGTAAGCGCGATGGAGCATGTTGATGCGAAGGCTTGCACTTT
AGAATGTGGTAATCTTGGGTTTGGGATATGCCCACGTTCAGAAGGAAGTCCGGAAAATCGCATATGCACC
AACTGTTGTGCAGGTTATAAAGGTTGCAATTATTATAGTGCAAATGGGGCTTTCATTTGTGAAGGAGAAT
CTGACCCAAAAAAACCAAAAGCATGCCCCCGAAATTGCGATCCACATATTGCCTACTCAAAGTGTCCCCG
TTCAGAAGGAAAATCGCTAATTTATCCCACCGGATGTACCACATGCTGCACAGGGTACAAGGGTTGCTAC
TATTTCGGTAAAAATGGCAAGTTTGTATGTGAAGGAGAGAGTGATGAGCCCAAGGCAAATATGTACCCTG
CAATGTGACCCTAGACTTGTCCATCTTCTGGATTGGCCAACTTAATTAATGTATGAAATAAAAGGATGCA
CACATAGTGACTGCTAATCACTATAATGTGGGCATCAAAGTTGTGTGTTATGTGTAATTACTAGTTATC
TGAATTAAAAGGGAAGGGTCATCATTTTTCTTTTCT
+
>gi|576528|gb|L37519.1|POTPPINHB Solanum
tuberosum proteinase inhibitor II mRNA, complete cds
AACACGTGGGGGCAGTACTAATTATTATCCAGCATGGCTGTTCACAAGGAAGTTAATTTCGTTGCTTACC
TACTAATTGTTCTTGGATTATTGGTACTTGTAAGCGCGATGGAGCATGTTGATGCGAAGGCTTGCACTTT
AGAATGTGGTAATCTTGGGTTTGGGATATGCCCACGTTCAGAAGGAAGTCCGGAAAATCGCATATGCACC
AACTGTTGTGCAGGTTATAAAGGTTGCAATTATTATAGTGCAAATGGGGCTTTCATTTGTGAAGGAGAAT
CTGACCCAAAAAAACCAAAAGCATGCCCCCGAAATTGCGATCCACATATTGCCTACTCAAAGTGTCCCCG
TTCAGAAGGAAAATCGCTAATTTATCCCACCGGATGTACCACATGCTGCACAGGGTACAAGGGTTGCTAC
TATTTCGGTAAAAATGGCAAGTTTGTATGTGAAGGAGAGAGTGATGAGCCCAAGGCAAATATGTACCCTG
CAATGTGACCCTAGACTTGTCCATCTTCTGGATTGGCCAACTTAATTAATGTATGAAATAAAAGGATGCA
CACATAGTGACTGCTAATCACTATAATGTGGGCATCAAAGTTGTGTGTTATGTGTAATTACTAGTTATC
TGAATTAAAAGGGAAGGGTCATCATTTTTCTTTTCT
Find: \w\w\|\d+\|\w+\|\w\d+\.\d\|\w+ (\w+) (\w+).+

Replace: \1\_\2
+
+
+ Manipulacin de archivos: expresiones
regulares
Expresiones regulares son patrones usados para
igualar archivos y textos.
txt - iguala todos los archivos con txt al final
ls *txt
ls /gpfs/data/user/*txt

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Todos los archivos en las computadoras consisten

Los procesadores de texto son un tipo especial de

Herramientas que estn incorporadas en:

Las expresiones regulares hacen uso de COMODINES.

Los COMODINES incrementan la utilidad de una

3. Selecciona Find en el men Search

4. Selecciona la opcin normal

3. Selecciona Find en el men Search

4. Selecciona la opcin normal

5. Toma ventaja de la observacin que las letras que se

5. Toma ventaja de la observacin que las letras que se

2. Solo queremos quedarnos con el nmero y eliminar las dos letras

2. Solo queremos quedarnos con el nmero y eliminar las dos letras

4. Podemos capturar el primer carcter con los parntesis

6. Agrega el trmino Posicin: antes del nmero

Por ejemplo, el trmino \w+ puede representar un solo

Retornando al primer ejemplo:

\w Carcter para palabras, incluye letras,

Por ejemplo, para reducir los nombres o ttulos de las

>CAA58790.i= GFP [Aequorea victoria]

Find: \w\w\|\d+\|\w+\|\w\d+\.\d\|\w+ (\w+) (\w+).+

txt - iguala todos los archivos con txt al final

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