TRANSKRIPSI PADA EUKARIOT

Struktur gen
Gen-gen pada eukariot bersifat monosistronik, artinya satu transkrip yang dihasilkan hanya
mengkode satu macam produk ekspresi. Pada eukariot tidak dikenal namanya operon karena satu
gen structural dikendalikan oleh satu promoter. Secara umum hampir sama sama prokariot yaitu adanya
promotor, bagian struktural dan terminator. Bagian yang membedakan adalah pada bagian struktural gen. Bagian
struktural/coding region pada eukariot ada bagian intron dan ekson. Intron (intervening sequences)
merupakan sekuens yang tidak mengkode asam amino. Bagian ini akan dibuang saat RNA processing.
Ekson merupakan sekuen yang dikode menjadi asam amino

Mekanisme Transkripsi Pada Eukariot

RNA polimerase pada eukariot bermacam-macam yaitu RNA polimerase I (mentranskrip gen
kelas I yaitu gen rRNA kecuali 5S rRNA), RNA Polimerase II (mensintesis mRNA dan small
nulear RNA/snRNA yang diperlukan pada saat RNA splicing) dan RNA polymerase III
(mentranskrip gen kelas III yaitu tRNA, 5S rRNA). Pada bab ini hanya dijelaskan RNA
polimerase II karena terlibat pada transkripsi semua sel
 Berbeda dengan prokariot, RNA polymerase eukariot tidak menempel secara langsung pada
DNA di daerah promoter namun melalui perantaraan protein-protein lain disebut faktor
transkripsi/transcription factor (TF). TF ada 2 macam yaitu ada yang umum dan ada yang
khusus. TF umum berfungsi mengarahkan RNA polymerase ke promoter. TF umum meiputi
TFIIA, B, D, E, F, H, J ( transcription factors regulating RNA pol II). Penempelan RNA polymerase
[ada promoter oleh daktor transkripsi umum hanya menghasilkan transkripsi pada aras dasar (basal level).
Pengaturan yang lebih spesifik dilakukan oleh FT yang khusus untuk suatu gen. Promoter eukariot sangat
beragam dan sulit untuk dikarakterisasi. Basal promoter elements dikenal dengan TATA-box dan
CCAAT-box, dinamakan berdasarkan sekuen motifnya (Gambar 11). TATA-box berada pada 20
sampai 30 basa upstream dari transcriptional start site dan ini sama dengan sekuen pada prokariot atau
Pribnow-box (sekuen konsensusnya adalah TATAAA, TATAT/AAT/A, dimana T/A menandakan
basa yang mungkin ditemukan pada posisi tersebut). TFIID adalah faktor transkripsi pertama
yang secara langsung berikatan dengan TATA box dan penempelan ini mengarahkan faktor
transkripsi lainnya dan RNA polymerase II untuk mengenali promoter. TFIID sebenarnya
merupakan kompleks protein yang terdiri dari protein pengikat kotak TATA (TATA-box binding
protein, TBP) dan TAF (TBP-associated factors). CCAAT-box terdapat pada posisi -100. CCAAT-
box diketahui mengikat protein FT CCAAT-binding transcription factor (CTF) dan CCAAT-
enhancer-binding protein (C/EBP).
Ada banyak regulator lain pada urutan gen, yaitu tempat berikatannya berbagai faktor
transkripsi. Urutan regulator ini sebagian besar adalah terletak hulu (5') dari situs inisiasi
transkripsi, meskipun beberapa elemen terjadi hilir (3') atau bahkan di dalam gen itu sendiri. Jumlah
dan jenis elemen regulator ditemukan bervariasi tiap masing-masing gen. Kombinasi yang berbeda
dari faktor transkripsi ini memberikan efek yang berbeda. Berbagai jenis sel mengekspresikan kombinasi
karakteristik dari faktor transkripsi, dan ini menghasilkan mekanisme utama untuk kekhususan tipe
sel dalam regulasi ekspresi gen.