A meta-analysis of hypoxia inducible factor 1-alpha (HIF1A) gene

polymorphisms: association with cancers

HIF1A adalah faktor transkripsi yang memiliki peranan penting sebagai

regulator. Hypoxia inducible factor 1 (HIF1A) adalah faktor transkripsi yang
memiliki dampak besar dalam proses pengembangan dan perkembangan kanker.
HIF1A mengatur ekspresi lebih dari 100 gen yang mengendalikan fungsi seluler
utama termasuk apoptosis, proliferasi sel, metabolisme glukosa, eritropoiesis,
metabolisme besi dan angiogenesis. Ini adalah pengatur utama oksigen
homeostasis. HIF1A telah menjadi fokus penelitian dan sejumlah SNP dalam gen
HIF1A telah diidentifikasi terkait dengan kanker, dengan polimorfisme yang paling
banyak dipelajari adalah polimorfisme C1772T (rs11549465) dan G1790A
(rs11549467). Kedua SNP ini berada dalam domain yang sama (ODD / pVHL) di
ekson 12 dari gen HIF1. Baru-baru ini sebuah meta-analisis telah mengungkapkan
bahwa C1772T tidak berada dalam ketidakseimbangan keterkaitan yang substansial
(LD) dengan G1790A. Sejumlah penelitian telah menyarankan bahwa kedua mutasi
nonsinonim ini dapat mengubah aktivitas transkripsional gen HIF1A dengan
menyebabkan perubahan struktural dengan stabilitas bervariasi, yang pada
gilirannya dapat mempengaruhi ekspresi dan peraturan gen target hilir. Dalam
penelitian ini, dilihat pengaruh polimorfisme rs11549465 (1772 G / A) dan
rs11549467 (1790 G / A) pada gen HIF1A dan hubungannya dengan kanker
melalui meta-analisis.

Studi meta-analisis ini berhubungan dengan polimorfisme HIF1A 1772 C / T

dilakukan pada 22 studi kontrol kasus dengan ukuran sampel 19024 dan untuk
polimorfisme 1790 G / A 19 dilakukan pada studi kasus kontrol dengan ukuran
sampel 10654. Genotipe dan frekuensi alel dibandingkan antara kasus dan kontrol
bersamaan dengan analisis subkelompok dilakukan oleh jenis kanker dan etnisitas.

Hasil penelitian menunjukkan bahwa polimorfisme HIF1A 1772 C / T secara

signifikan terkait dengan keseluruhan risiko kanker. Alel dan genotipe TT secara
signifikan terkait dengan peningkatan risiko kanker secara keseluruhan.

KESIMPULAN
Polimorfisme 1772 C / T dan 1790 G / A secara signifikan dikaitkan dengan
peningkatan keseluruhan risiko kanker. Analisis subkelompok berdasarkan jenis
kanker menunjukkan bahwa baik 1772 C / T dan 1790 G / A polimorfisme memiliki
hubungan yang signifikan dengan kanker paru-paru, sedangkan kedua
polimorfisme ini tidak menunjukkan hubungan yang signifikan dengan kanker
prostat. Dalam data subgrup karsinoma kardiovaskular menunjukkan hanya
polimorfisme 1790 G / A yang memiliki hubungan signifikan sedangkan
polimorfisme HIF1A 1772 C / T tidak menunjukkan hubungan yang signifikan.
Namun, polimorfisme C / T 1772 telah menunjukkan penurunan signifikan risiko
pada karsinoma sel ginjal. Juga, polimorfisme 1790 G / A telah meningkatkan risiko
kanker secara signifikan pada etnis Kaukasia dan Asia. Secara keseluruhan semua
data yang dianalisis, HIF1A bisa menjadi penanda prognostik yang berguna untuk
deteksi dini dan diagnosis kanker.

1
2