Revisin
deEscherichiacoli paralaproduccin
debiocombustibles:cerrarla
brechadelapromesade
practicar
2,
SarahHuffer1,
2,
ChristineM.Roche1,
2,
HarveyW.Blanch1,
2,
DouglasS.Clark1,
Mostrarms
doi:10.1016/j.tibtech.2012.07.002
Obtnderechosycontenidos
El cambio anticipado de materias primas para biocombustibles a partir de maz de lignocelulosa
presenta retos enel desarrollo deenfoques de pretratamiento delabiomasa efectiva, locualincide
en la seleccin y capacidades delos organismos productores decombustible.Para un procesode
produccin de biocombustibles viable, el organismo ideales produccin de combustibledebe ser
capaz de convertir de manera eficiente una variedad de azcares a los combustibles
anaerbicamente a rendimientos cercanos terico, resistir inhibidores generados por el
pretratamiento de la biomasa y exhiben baja toxicidad delproducto. Escherichiacoliencuentrauso
extenso como un sistema modelo, pero no ha sido ampliamente utilizado como unhost industrial.
Esta revisin destaca los recientes avances en la ingeniera metablica de las vas de
biocombustiblesntesis en E. coli yresume losconocimientosadquiridosen la regulacin deestas
vas, ydescribe el progreso hacia lasuperacin delosdesafos queenfrentasuadopcincomouna
cepadebiocombustiblesalaproduccincoli.
Palabrasclave
Escherichia
biocombustibles
anaerbico
secrecin
fago
lignocelulosa
IngenieraE.coliparabiocombustibles
Lanecesidaddefuentesdeenergaalternativasyrenovablesest impulsandounresurgimientoenla
investigacin de biocombustibles, con nfasis en losbiocombustiblesderivados dematerias primas
lignocelulsicas. El etanolha sidoel focode mucha investigacin enlas ltimas dcadas, pero sus
deficiencias como combustible han llevado a la ingeniera metablica de huspedes microbianos
para producircombustiblesconpropiedadesmsdeseables,talescomobutanol,isobutanol,medio a
los hidrocarburos de cadena larga, y isoprenoides(Recuadro1).Una variedad de anfitriones estn
disponibles para la produccin de estos combustibles, incluyendo microalgas, hongos y bacterias.
Las algas ofrecen la capacidad de producir materias primas para biocombustibles y precursores
directamente de CO2 y la luz solar Sin embargo, sigue habiendo importantes retos de ingeniera
Box1.
Loscombustibles
Alcoholes
Biodiesel
Figura1.
OpcionesFigura
Tabla 1 contiene los rendimientos y productividades para la produccin de biocombustibles
informado para E.coli.La resistencia a los compuestos txicos que seencuentran en el hidrolizado
resultante de pretratamiento de la biomasa, que, en el caso de pretratamiento con cido diluido,
puede incluir furfural, cido actico, y 5hidroximetilfurfural (HMF),yalosproductosdecombustible
a s mismos, es necesario alcanzar concentraciones elevadas de productos y rendimientos. Los
productos de la combustin pueden ser txicos a niveles muy bajos y sofocar el crecimiento y la
produccin (porejemplo,4 g /ldebutanoldisminuyela tasade crecimientoespecfico deE.coliK12
en un 50%) [2].La secrecin del producto es otro factor importante, especialmente en el caso de
molculas decombustible hidrfobos.Estos productos decombustible sesabe queseacumulanen
la membrana plasmtica, que puede causar la ruptura celular. Que secretan los de combustible
permitir laseparacin defasesque se produzca, facilitar larecuperacindelcaldodefermentacin
yaliviarlosproblemaspotencialesdetoxicidad.
Tabla1.
actualescombustibles,concentraciones,ylosrendimientosproducidoseningenieraE.colicepasendiversascondiciones.
rendimie
nto Rendimie promediode
Concentraci Reportad nto productividad
n o terico volumtrica
Abbreviations:AE,aerbicoAN,anaerbicoIL,lquidoinicoMA,microaerbica.ND,nodeterminado
Incluyecontribucionesdeloscomponentesdelmediocomplejos16:....
defermentacinFedbatch
Eninsitulaeliminacindecombustible
Rentabilidadtericasebasaenhacer0FFA
opcionesCuadro
En los ltimos aos, un creciente cuerpo de literatura se ha centrado en E. coli como organismo
modelo para la optimizacin de rutas metablicas [3]. E. coli se utiliza tambin, por ejemplo, enla
produccin comercial de laqumica de1,3propanodiol alto volumen [4].Adems, lafacilidad con la
quesusvasmetablicas pueden ser borradosy sustituidoshaceE. coli un candidato idealparael
desarrollo de las vas para la produccin de biocombustibles [5].Esta revisin destaca el
estadodelarte actual en la ingeniera cepa de E. coli para la produccin de biocombustibles, as
como su uso como una herramienta para comprender la regulacin metablica de las vas
biosintticas de productos y los efectos txicos de las molculas decombustible y los inhibidores.
Tambin se discutennuevasoportunidades para explorar la secrecinde productos ylaproduccin
debiodieselanaerbico.
Utilizacindesustrato
La capacidad de convertir una variedad de sustratos (por ejemplo, los derivados de los residuos
lignocelulsicos agrcolasyforestales,pastos,cultivos oleaginososyresiduos urbanos)enproductos
de inters es unagranventajaparauna posiblecepade produccin. E. coli utiliza deformanatural
una amplia gama de sustratos, incluyendo glucosa, xilosa, arabinosa, galactosa y a partir de
lignocelulosa, y los cidos grasos y glicerol a partir de cultivos de semillas oleaginosas 6 y 7.La
eficiencia con la que se metabolizan mezclas complejas de sustratos no es ideal para procesos
industriales y mucho esfuerzo se ha dirigido hacia la reconfiguracin de las vas de utilizacinde
sustratonativas de E.coli.Losprocesosindustriales msexitososproducenbiocombustibles a partir
de materias primas defcildigestincomoelalmidn (maz)ysacarosa(caadeazcar).Adems,
la glucosa, que seobtiene fcilmenteporhidrlisis decualquierade materia prima, es la fuente de
carbono preferida de E. coli y por lo tanto se consume yse metabolizan demanera eficiente. Sin
embargo, independientemente del sustrato de azcar ltimo, el uso de materias primas
lignocelulsicas de bajo costo y sostenibles en un proceso industrial basado en E. coli requiere
mayordesarrollodeprocesoseingenieradeunacepadeproduccinadecuado.
La naturalezacomplejadelacorrientederivadadelaenzimticacatalizadaporcidoo sacarificacin
de la biomasa pretratada (hidrolizado), junto con su potencial toxicidad para E. coli y otros
organismos (discutido en una seccin posterior), son obstculos actuales para la fermentacin
eficiente de hexosa y mezclas de azcar pentosa. E. coli utiliza represin catablica por carbono
(CCR) [8] para regular su uso de fuentes de carbono, por lo que la presencia de una fuente de
carbono preferida (glucosa) suprime la expresin de genes necesarios para la captacin y la
utilizacin de una fuente menos preferido(xilosa). Esta regulacin resultados en el consumo
secuencial deazcares, ypor lotanto diauxic no ideal(bifsica)de crecimiento, lo que requiereun
tiempoderesidenciamslargoparaelconsumocompletodelasfuentesdecarbono[9].
Otro enfoque inspirado por eliminacin de glucosa / diauxie xilosa en la levadura se aplic
recientementeenE.coli12y13.Fueronalimentadosconmezclasdecelobiosa/xilosaauncelobiosa
metabolizadoras deingeniera E.coli cepa que expresaba un transportador celobiosa y un
glucosidasa intracelular para facilitar hexosa / cometabolismo de las pentosas. Hidrlisis
intracelular de celobiosaa glucosa porglucosidasaminimizadoglucosarepresindelmetabolismo
delaxilosa,permitiendoascometabolismodelahexosaypentosaazcares13y14.
Losesfuerzos hansidodurantemuchotiempoenmarchaparadesarrollarunmicroorganismoquees
capaz de convertir directamente lignocelulosa para alimentar los productos, sobre la base de la
expresin natural o recombinante de celulasas y hemicelulasas. Aunque los rendimientos de los
biocombustibles obtenidos atravs deesteenfoquebioprocesamientoconsolidadosonbajos,varios
estudios depruebadeconcepto sehanmostradoprometedoresenlaproduccin deunavariedad de
combustibles directamente de lignocelulosa17 y 18.Unetanolognico ingeniera E.coliquecontiene
el SIDA celobiasa y actividades pectinolticas en el consumo de pectina rica en biomasa
lignocelulsica[19].
anaerbicoproduccin
anaerbica produccin de biocombustibles elimina la necesidad de airear grandes volmenes de
medios de comunicacin y reduce el riesgo de contaminacinmicrobiana. AunqueE. coli produce
naturalmente etanol bajo condiciones anaerbicas, muchas de las vas incorporadas en su
metabolismo para biocombustibles o productos bioqumicos de produccin requieren regeneracin
aerbica de exceso reducida cofactores [NAD (P) H] derivados de la reduccin desequilibradade
azcaresalos combustibles. Silavametablicagenerarlosequivalentesreductoresnoseequilibra
conla va deproduccin decombustible,el exceso deNAD(P)Hdebeserregenerado,tpicamente
por formacin de agua durante el metabolismo aerbico. Esto requiere tpicamente el crecimiento
bajocondicionesmicroaerbicas,quepuederesultardifcildecontrolaragranescala.
[23].Optimizacindelas condicionesdedeformacinydefermentacineranecesariodesviarNADH2
Estos y otros estudios han demostrado que el uso de la ingeniera metablica para superar los
desequilibrios cofactor y los cuellos de botella pueden mejorar en gran medidalos rendimientosy
concentraciones de alcoholes en condiciones anaerbicas.Sin embargo, hasta la fecha,no sehan
publicado estudios sobre la produccin anaerbica de mediano y de cadena larga alcoholes o
steres. La comprensin de cmo recin graso introducido vas cidos funcionan en condiciones
anaerbicas proporcionar oportunidades para utilizar enin silico modelospara determinar la
disponibilidadcofactor,ascomoparaencontrarnuevasenzimasquerealizanlasmismasreacciones
encondicionesanaerbicas.
deproduccindecombustible
Tcnicasde la ingenierametablica ylabiologasintticapermitenahoranuevasvasdeproduccin
de combustible para ser construidos en E.coli.Para aumentar las concentraciones de productos y
productividades, E. coli cepas se pueden desarrollar para expresar enzimas heterlogos con
actividades de mayor catalticos para intermedios clave en las nuevas vas y knockoutsde genes
construidos para canalizar mayorflujo decarbonohacia el productodeseado20,22,23,24,25,26,
27, 28, 29, 30 y 31.Vas de ejemplo se muestran en la Figura 2y la Tabla 1se resumen los
combustibles actuales producidos junto con sus concentraciones, rendimientos, productividad y
condicionesdefermentacin.
Figura2.
opciones
Introduccindelasvasnonaturales
E. coli no produce de formanativa muchosde losproductosde combustibleactualmentedeseadas,
tales como hidrocarburos de cadena larga o alcoholes de cadena ms larga, y las vas exgenos
para estoscombustiblesdebeserintroducido yoptimizado. Ejemplosdetalesproductosnonaturales
incluyen 3metil1pentanol [31],3metil1butanol[32], nbutanol [22],isobutanol 20,23,24,33, 34 y
35,a medioy alcoholes de cadena larga o cidos27,29,36,37,38,39,40y41,yalcanos.42y43Un
desafo actual para la produccin de dichos combustiblesreside enlaoptimizacin denuevas vas
quecontienenvariasenzimasheterlogas.
S.
Extraccin del codn de parada aument la concentracin isobutanol 13,6 a 21,2 g / l. Tanto
mutagnesis aleatoria y diseo racional se han utilizado para mejorar las concentraciones de
3metil1butanol [32].Unanlogodeleucina,4aza,D Lleucina,yNTGdesreguladoslavadeleucina
y mejoraron las concentraciones de 3metil1butanol 0,45 a 4,4 g / l. Estos estudios ilustran una
estrategia general para la mejora delas concentraciones de productos,especialmentelosalcoholes
sintetizadosatravsdevasdeaminocidos.
Grasosdeproduccindecido
sobreproducir metilcetonas alifticos con C11 a C15 cadenas de carbono [27].En tipo salvaje
E.coli,cetoacilCoAsedivideenacilCoAyacetilCoAporelFADE deshidrogenasaacilCoA.FADE
fue eliminadoy reemplazado con el tioesterasa FADMnativa para convertir cetoacilCoAaceto
cido, que se descompone espontneamente en una cetona de metilo. Estos estudios ponen de
relieve la complejidadde la modificacinde lasvas existentes y laintroduccinde nuevas vas en
E.coli,. mientras que el equilibrio de los muchos otros criterios deseados para un husped de
produccinadecuado
desecrecin
Muchas molculas de biocombustiblespotenciales se difunden librementea travs delamembrana
celular (por ejemplo, alcoholes de cadena corta) Sin embargo, otros se acumulan en la bicapa
lipdica de la membrana citoplasmtica (por ejemplo, alcoholes de cadena larga, hidrocarburos
cclicos, terpenos, yalcanos) [44].Laacumulacinde estos compuestos lipfilosenlamembrana es
en gran parte responsablede los efectostxicos deestasmolculas.La toxicidaddelproductopara
el microorganismo es a menudo una limitacin importante de la produccin de biocombustibles
microbianaysediscutebrevementeenelRecuadro2.
Cuadro2.
Lasbacteriasylaproduccindebiocombustiblesindustriales
condicionesnoasptica
Toxicidaddelosbiocombustiblesyproductosdedegradacin
Observacionesfinales
El desafo deproducirbiocombustiblesen E.coliha conducidoamuchosdescubrimientosrecientes
y los avances en la comprensin del metabolismo y la regulacin degenes en este organismo. El
impulso hacia la produccin de sustitutos de combustible diesel en particular, tambin ha
proporcionado nuevos conocimientos sobre cmo la clula regula su metabolismo de los cidos
grasos. Utilizando tcnicas conocidas, tales como la evolucinadaptativaen combinacin con alto
rendimiento de la secuenciacin del genoma, ha permitido a los investigadores a identificar
mutacionesbeneficiosas,informandoalaingenierademejoresbiocatalizadores.
Acknowledgments
The authors thank Dr. Chris Somerville for helpful discussions. This work was supported by the
Energy Biosciences Institute. SH acknowledges the National Science Foundation for a graduate
fellowship. CMR acknowledges the Department of Energy Office of Science Graduate Fellowship
Program (DOE SCGF) for funding, made possible in part by the American Recovery and
ReinvestmentActof2009,administeredbyORISEORAUundercontractno.DEAC0506OR231.
References
1
B.HahnHagerdal,etal.
MetabolicengineeringofSaccharomycescerevisiaeforxyloseutilization
T. Scheper, J. Nielsen (Eds.), Advances in Biochemical Engineering Biotechnology,
Springer(2001),pp.5384
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(143)
2
S.Huffer,etal.
Role of alcohols in growth, lipid composition, andmembranefluidityofyeasts,
bacteria,andarchaea
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.64006408
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(31)
3
C.Vickers,etal.
ExaminingthefeasibilityofbulkcommodityproductioninEscherichiacoli
Biotechnol.Lett.,34(2012),pp.585596
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(18)
4
A.Tullo
Alivingplant
Chem.Ing.News,85(2007),p.36
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(4)
5
J.Clomburg,R.Gonzalez
Biofuel production in Escherichia coli: the role of metabolic engineering and
syntheticbiology
Appl.Microbiol.Biotechnol.,86(2010),pp.419434
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(90)
6
DPClark
ThefermentationpathwaysofEscherichiacoli
FEMSMicrobiol.Rev.,5(1989),pp.223234
Article
|
PDF(986K)
|
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(267)
7
C.Dellomonaco,etal.
The path to next generation biofuels: successes and challenges intheera of
syntheticbiology
Microb.CellFact.,9(2010)http://dx.doi.org/10.1186/1475285993
8
B.Gorke,J.Stulke
Carbon catabolite repression in bacteria: manyways to makethe most out of
nutrients
Nat.Rev.Microbiol.,6(2008),pp.613624
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(369)
9
J.Stlke,W.Hillen
Carboncataboliterepressioninbacteria
Curr.Opin.Microbiol.,2(1999),pp.195201
Article
|
PDF(913K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(208)
10
J.H.Kim,etal.
Simultaneousconsumption ofpentose andhexosesugars:anoptimalmicrobial
phenotypeforefficientfermentationoflignocellulosicbiomass
Appl.Microbiol.Biotechnol.,88(2010),pp.10771085
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(56)
11
L.Yomano,etal.
Deletionof methylglyoxal synthase genemgsAincreasedsugarcometabolism
inethanolproducingEscherichiacoli
Biotechnol.Lett.,31(2009),pp.13891398
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(45)
12
S.J.Ha,etal.
Engineered Saccharomyces cerevisiae capable of simultaneous cellobiose
andxylosefermentation
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,108(2010),pp.504509
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(3)
13
P.Vinuselvi,SKLee
EngineeredEscherichiacolicapableofcoutilizationofcellobioseandxylose
EnzymeMicrob.Technol.,50(2012),pp.14
Article
|
PDF(337K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(9)
14
P.Vinuselvi,SKLee
EngineeringEscherichiacoliforefficientcellobioseutilization
Appl.Microbiol.Biotechnol.,92(2011),pp.125132
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(12)
15
TADesai,CVRao
RegulationofarabinoseandxylosemetabolisminEscherichiacoli
Appl.Environ.Microbiol.,76(2010),pp.15241532
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(35)
16
D.Groff,etal.
Supplementation of intracellular XylR leads to coutilization of hemicellulose
sugars
Appl.Environ.Microbiol.,78(2012),pp.22212229
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(9)
17
G.Bokinsky,etal.
Synthesis of three advanced biofuels from ionic liquidpretreated switchgrass
usingengineeredEscherichiacoli
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,108(2011),pp.1994919954
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(108)
18
EJSteen,etal.
Microbial production of fattyacidderived fuels and chemicals from plant
biomass
Nature,463(2010),pp.559562
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(514)
19
MCEdwards,etal.
Addition ofgenes for cellobiase andpectinolytic activityin Escherichiacolifor
fuelethanolproductionfrompectinrichlignocellulosicbiomass
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.51845191
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(16)
20
S.Bastian,etal.
Engineered ketolacid reductoisomerase and alcohol dehydrogenase enable
anaerobic 2methylpropan1ol production at theoretical yield in Escherichia
coli
Metab.Eng.,13(2011),pp.345352
Article
|
PDF(511K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(81)
21
P.Nikel,etal.
Poly(3hydroxybutyrate) synthesis in microaerobic fedbatch cultures by a
recombinantEscherichiacoliarcAmutantusingglycerolasacarbonsource
J.Biotechnol.,131(2007),pp.S157S158
Article
|
PDF(80K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(2)
22
CRShen,etal.
Driving forces enable hightiter anaerobic 1butanol synthesis in Escherichia
coli
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.29052915
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(177)
23
CTTrinh,etal.
Redesigning Escherichia coli metabolism for anaerobic production of
isobutanol
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.48944904
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(28)
24
S.Atsumi,etal.
Engineering the isobutanol biosynthetic pathway in Escherichia coli by
comparisonofthreealdehydereductase/alcoholdehydrogenasegenes
Appl.Microbiol.Biotechnol.,85(2010),pp.651657
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(105)
25
BBBondWatts,etal.
Enzymemechanism as a kinetic controlelement fordesigningsyntheticbiofuel
pathways
Nat.Chem.Biol.,7(2011),pp.222227
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(138)
26
B.Gao,etal.
Development of recombinantEscherichiacoliwholecellbiocatalystexpressing
anovelalkalinelipasecodinggenefromProteusspforbiodieselproduction
J.Biotechnol.,139(2009),pp.169175
Article
|
PDF(769K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(33)
27
EBGoh,etal.
Engineeringofbacterialmethylketonesynthesisforbiofuels
Appl.Environ.Microbiol.,78(2012),pp.7080
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(34)
28
N.Narayanan,etal.
Enhancing functional expression of heterologous Burkholderia lipase in
Escherichiacoli
Mol.Biotechnol.,47(2011),pp.130143
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(6)
29
P.Nawabi,etal.
Engineering Escherichia coli for biodiesel production utilizing a bacterial fatty
acidmethyltransferase
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.80528061
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(30)
30
STWithers,etal.
Identification of isopentenol biosynthetic genes from Bacillus subtilis by a
screeningmethodbasedonisoprenoidprecursortoxicity
Appl.Environ.Microbiol.,73(2007),pp.62776283
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(80)
31
KCZhang,etal.
Expandingmetabolismforbiosynthesisofnonnaturalalcohols
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,105(2008),pp.2065320658
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(165)
32
MRConnor,etal.
3Methyl1butanol production in Escherichia coli: random mutagenesis and
twophasefermentation
Appl.Microbiol.Biotechnol.,86(2010),pp.11551164
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(61)
33
A.Baez,etal.
Highflux isobutanol production using engineeredEscherichiacoli:abioreactor
studywithinsituproductremoval
Appl.Microbiol.Biotechnol.,90(2011),pp.16811690
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(61)
34
EASavrasova,etal.
Useofthevalinebiosyntheticpathwaytoconvertglucoseintoisobutanol
J.Ind.Microbiol.Biotechnol.,38(2011),pp.12871294
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(13)
35
KMSmith,JCLiao
An evolutionary strategy for isobutanol production strain development in
Escherichiacoli
Metab.Eng.,13(2011),pp.674681
Article
|
PDF(637K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(40)
36
C.Dellomonaco,etal.
Engineered reversal of the oxidation cycle for the synthesis of fuels and
chemicals
Nature,476(2011),pp.355359
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(155)
37
Y.Duan,etal.
De novo biosynthesis of biodiesel by Escherichia coli in optimized fedbatch
cultivation
PLoSONE,6(2011)http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0020265
38
RMLennen,etal.
Aprocess for microbial hydrocarbonsynthesis: overproduction of fattyacidsin
Escherichiacoliandcatalyticconversiontoalkanes
Biotechnol.Bioeng.,106(2010),pp.193202
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(95)
39
TGLiu,etal.
QuantitativeanalysisandengineeringoffattyacidbiosynthesisinE.coli
Metab.Eng.,12(2010),pp.378386
Article
|
PDF(672K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(97)
40
X.Meng,etal.
Increasingfatty acidproductioninE.coliby simulatingthelipidaccumulationof
oleaginousmicroorganisms
J.Ind.Microbiol.Biotechnol.,38(2011),pp.919925
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(15)
41
P.Xu,etal.
Genomescale metabolic networkmodelingresultsinminimalinterventionsthat
cooperativelyforcecarbonfluxtowardsmalonylCoA
Metab.Eng.,13(2011),pp.578587
Article
|
PDF(1063K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(71)
42
SSChandran,etal.
Microbialproductionofisoprenoids
ProcessBiochem.,46(2011),pp.17031710
Article
|
PDF(396K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(20)
43
Y.Zhao,etal.
Biosynthesis of isoprene in Escherichia coli via methylerythritol phosphate
(MEP)pathway
Appl.Microbiol.Biotechnol.,90(2011),pp.19151922
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(35)
44
J.Sikkema,etal.
Mechanismsofmembranetoxicityofhydrocarbons
Microbiol.Rev.,59(1995),pp.201222
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(1182)
45
CFHiggins
Multiplemolecularmechanismsformultidrugresistancetransporters
Nature,446(2007),pp.749757
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(374)
46
JLRamos,etal.
Mechanismsofsolventtoleranceingramnegativebacteria
Annu.Rev.Microbol.,56(2002),pp.743768
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(385)
47
MJDunlop,etal.
Engineeringmicrobialbiofueltoleranceandexportusingeffluxpumps
Mol.Sys.Biol.,7(2011),p.487
48
A.Schirmer,etal.
Microbialbiosynthesisofalkanes
Science,329(2010),pp.559562
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(296)
49
JAHamilton
New insights into the roles of proteins andlipidsinmembranetransportoffatty
acids
ProstaglandinsLeukot.Essent.FattyAcids,77(2007),pp.355361
Article
|
PDF(632K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(46)
50
R.Radakovits,etal.
Geneticengineeringofalgaeforenhancedbiofuelproduction
Eukaryot.Cell,9(2010),pp.486501
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(247)
51
WM Haynes, DRLide (Eds.), CRC Handbook of Chemistry and Physics (92nd edn),
CRCPress(20112012)
52
R.Radakovits,etal.
GeneticengineeringoffattyacidchainlengthinPhaeodactylumtricornutum
Metab.Eng.,13(2011),pp.8995
Article
|
PDF(696K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(51)
53
Renninger,NSandMcphee,DJ(2008)AmyrisBiotechnologies,Inc.Fuel
compositionscomprisingfarnesaneandfarnesanederivativesandmethodof
makingandusingsame,7399323
54
MJCallanan,TRKlaenhammer
Bacteriophagesinindustry
EncyclopediaofLifeSciencesWiley&Sons,Ltd(2008)
55
S.Moineau,C.Levesque
Controlofbacteriophagesinindustrialfermentations
E. Kutter, A. Sulakvelidze (Eds.), Bacteriophages: Biology and Applications, CRC
Press(2004),pp.282293
56
Jones,DTetal.(2000)Bacteriophageinfectionsintheindustrialacetone
butanol(AB)fermentationprocess.2,2126
57
SANicolaou,etal.
A comparative view of metabolite and substrate stress and tolerance in
microbial bioprocessing: from biofuels and chemicals, to biocatalysis and
bioremediation
Metab.Eng.,12(2010),pp.307331
Article
|
PDF(741K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(162)
58
D.Dugar,G.Stephanopoulos
Relativepotentialofbiosyntheticpathwaysforbiofuelsandbiobasedproducts
Nat.Biotechnol.,29(2011),pp.10741078
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(31)
59
K.Ohta,etal.
Genetic improvement ofEscherichiacoliforethanol production:chromosomal
integrationofZymomonasmobilis genesencoding pyruvatedecarboxylaseand
alcoholdehydrogenaseII
Appl.Environ.Microbiol.,57(1991),pp.893900
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(267)
60
S.Atsumi,JCLiao
Directed evolution of Methanococcus jannaschii citramalate synthase for
biosynthesisof1propanoland1butanolbyEscherichiacoli
Appl.Environ.Microbiol.,74(2008),pp.78027808
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(101)
61
T.Hanai,etal.
EngineeredsyntheticpathwayforisopropanolproductioninEscherichiacoli
Appl.Environ.Microb.,73(2007),pp.78147818
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(109)
62
K.Inokuma,etal.
Improvement of isopropanol production by metabolically engineered
Escherichiacoliusinggasstripping
J.Biosci.Bioeng.,110(2010),pp.696701
Article
|
PDF(511K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(46)
63
S.Atsumi,etal.
Nonfermentativepathwaysforsynthesisofbranchedchain higher alcoholsas
biofuels
Nature,451(2008),pp.8689
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(710)
64
XFLu,etal.
OverproductionoffreefattyacidsinE.coli:implicationsforbiodieselproduction
Metab.Eng.,10(2008),pp.333339
Article
|
PDF(396K)
|
ViewRecordinScopus
|
Citingarticles(180)
65
X.Wang,etal.
Increased furfural tolerance due to overexpression of NADHdependent
oxidoreductase FucO inEscherichia coli strains engineered for the production
ofethanolandlactate
Appl.Environ.Microbiol.,77(2011),pp.51325140
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(27)
66
E.Leonard,etal.
Combining metabolic and protein engineering of a terpenoid biosynthetic
pathwayforoverproductionandselectivitycontrol
Proc.Natl.Acad.Sci.USA,107(2010),pp.1365413659
ViewRecordinScopus
|
FullTextviaCrossRef
|
Citingarticles(115)
67
PPPeraltaYahya,etal.
Identificationandmicrobialproductionofaterpenebasedadvancedbiofuel
Nat.Comm.,2(2011)http://dx.doi.org/10.1038/ncomms1494
Copyright