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La clasificacin adoptada aqu utiliza una jerarqua de Linneo modificado por el Cdigo

Internacional de Nomenclatura Botnica (Cdigo) (. McNeill et al 2006), y utiliza siete filas,


incluyendo: fin (sufijo: -ales), subclase (-mycetidae), clase (-mycetes), subfilo
(-mycotina), Phylum (-mycota, a excepcin microsporidios), subkingdom, y reino. Las
clasificaciones de los taxones reflejan las preferencias y las prcticas anteriores de varios autores,
as como la necesidad de mantener las jerarquas anidadas de clados, taxones colocados en el
mismo rango que no son necesariamente equivalentes en edad (excepto taxones hermanos), el
nmero de especies, o el grado de divergencia morfolgica.

La clasificacin se limita a taxones hasta el nivel de orden. En muchos rdenes, especialmente las
que representan ms grande grupos, como los Agaricales, todava no hay suficiente resolucin
o taxn de muestreo para estructurar un nivel integral de la familia clasificacin. El desafo de
crear clasificaciones a nivel de familia se hace an ms difcil por el Cdigo, que requiere que los
nombres de los taxones en el rango de la familia o menor siga el principio de prioridad (que no se
aplica a los rangos ms altos). Idealmente, la construccin de las clasificaciones de consenso en
muchas de las rdenes reconocidas aqu implicar los esfuerzos coordinados de grupos de
especialistas en taxonoma. Eso Se espera que la actual clasificacin facilitar los esfuerzos.

Los taxones incluidos aqu estn, todos los admite como monofiltico por al menos un anlisis
filogentico publicada (no aplicable a monotpico taxones), con la excepcin de los Lahmiales y
Triblidiales (Pezizomycotina) y Asellariales (Kickxellomycotina), para los que los datos moleculares
no estn disponibles. El apoyo a la monofilia de cada grupo se resume en tres tablas, qu lista
seleccionada estudios filogenticos, el tipo de datos que fueron analizados, el nmero de UOT en
la muestra, y las frecuencias BS y bayesiano PP. se ha hecho ningn intento para citar todos los
estudios pertinentes para cada grupo. Los anlisis elegidos para su inclusin en las tablas son las
que tienen el mayor nmero de loci o taxones, y que proporcionan el apoyo ms fuerte para la
monofilia de los clados en cuestin.

La clasificacin acepta un reino, una subkingdom, siete filos, diez subphyla, 35 clases, subclases 12,
y 129 ordenes. Los taxones que se describe aqu o son validadas incluye Chytridiomycota,
Monoblepharidomycetes, neocallimastigomycota, Neocallimastigomycota, dikarya, Acarosporales,
Baeomycetales, Candelariales, Umbilicariales, Lecanoromycetes, Eurotiomycetidae,
Mycocaliciomycetidae, Melanosporales, Corticiales, Gloeophyllales, y trechisporales. Por lo tanto,
aproximadamente el 90% de los 195 nombres de los taxones empleados en la presente
clasificacin estan vlidamente publicado . El clado que contiene el Ascomycota y Basidiomycota
est clasificada como la subkingdom Dikarya (como se usa en James et al. 2006), lo que refleja la
putativo sinapomorfa de hifas dicaritico (Tehler 1988). Toda la otros nuevos nombres se basan
en forma automtica y tipificados los nombres de manera teleomrfica. La clasificacin de los
Ascomycota en paralelo esta en gran parte la clasificacin Myconet, incluyendo reciente los
cambios que se adoptarn en el prximo ao 2007. En Basidiomycota, los clados anteriormente
llamados Basidiomycetes, Urediniomycetes y ustilaginomycetes en la ltima edicin del
Diccionario de la Hongos Ainsworth y Bisby de se llama el Agaricomycotina, Pucciniomycotina, y
Ustilaginomycotina, respectivamente, como en Bauer et al. (2006). Esto se hace para minimizar la
confusin entre los nombres de taxones y las informales trminos (basidiomicetos es un trmino
informal usado comnmente para todo Basidiomycota) y para referirse a la Agaricus gneros
incluidos (Incluyendo el champin cultivado) y Puccinia
(Que incluye xido agracejo-trigo). otro significativo cambio en la clasificacin Basidiomycota es la
inclusin de la Wallemiomycetes y Entorrhizomycetes como clases incertae sedis dentro del
phylum, lo que refleja la ambigedad acerca de su colocaciones de ms alto nivel.

El phylum Zygomycota no es aceptado en esta clasificacin, hasta la resolucin de las relaciones


entre los clados que tradicionalmente se han colocado en el Zygomycota (ver debate en relacin
mucoromycotina). El tradicional Zygomycota estn distribuidos entre el filo Glomeromycota y
cuatro sedis subphyla incertae, incluyendo mucoromycotina, Kickxellomycotina, Zygomycota y
Entomophthoromycotina. El clado que contiene la Glomeromycota y la dikarya se resolvi con
anterioridad sobre la base de los genes del RNA ribosomal y se clasific como el Symbiomycota
(Tehler et al., 2003). Taxn que no se incluye aqu, porque no haba un fuerte apoyo para el clado
en los anlisis de James et al. (2006) o Liu et al. (2006). Si se aade el Symbiomycota de esta
clasificacin, ser necesario asignar un rango entre reino y subkingdom, o tal vez ser clasificado
como un unranked taxn.

El concepto de los hongos como uno de los seis reinos de la vida era introducida por Jahn & Jahn
(1949), y un sistema de cinco reinos fue adelantada por Whittaker (1959), pero ninguno de estos
trabajos fue valido bajo el cdigo hasta que se requerida, entonces fue proporcionado por Moore
(1980). Aunque Moore no hizo una referencia especfica a libro de John & John, era muy
consciente de que el nombre estaba en uso generalizado en el rango de reino. Bajo el actual
Cdigo, Jahn & Jahn y no se van a incluir en la citacin autor. Sin embargo, una propuesta para
modificar esta disposicin en el Cdigo hacerse en el prximo Congreso Internacional de Botnica
(D. L. Hawksworth, no publ.). Si se aprueba, la cita correcta sera Hongos T. L. Jahn y F. F. Jahn ex R.
T. Moore (este cambio de regla afectara tambin a las citas de Ascomycota Basidiomycota.