2. CARACTERIZAO DE MICRORGANISMOS
Identificao de microrganismos: por tipo e por quantidade
Meio de cultura: Material nutritivo preparado em laboratrio que permitem o
crescimento (aumento em quantidade) de microrganismos.
Contm os nutrientes necessrios e indispensveis ao
crescimento microbiano.
Preparados em laboratrio ou adquiridos comercialmente.
MEIOS DE CULTURA
Lquidos
Um meio lquido (ou caldo, em ingls broth) contm os nutrientes dissolvidos em
gua. Uma vez preparado e esterilizado, pode ser inoculado com microrganismos e
colocado a incubar para que ocorra crescimento. As culturas que crescem nestes meios
no esto individualizadas em colnias, por isso no so usados no isolamento, mas sim
para o crescimento de culturas ou para a identificao de culturas puras atravs de testes
bioqumicos. O crescimento pode ocorrer por todo o tubo de ensaio, pode-se formar um
depsito ou sedimento (pellet) ou uma pelcula superfcie.
Slidos
Um meio slido para alm dos nutrientes dissolvidos em gua, contm um agente
solidificante (gar) fornecendo desta forma uma superfcie firme onde pode ocorrer o
crescimento de colnias de forma individualizada. Os diferentes aspectos das colnias
podem originar pistas na identificao dos microrganismos. Estes meios podem ser
usados em placas de Petri ou em tubos de ensaio. Estes meios so usados para:
contagem de colnias; crescimento de microrganismos; isolamento (permitindo obter
culturas puras); e conservao de estirpes.
Semi-slidos
Obtidos pela adio de uma quantidade reduzida de agente solidificante. Este meio
utilizado em tubo de ensaio e serve sobretudo para estudar a mobilidade dos
microrganismos.
INOCULAES
OBS: Quando se pretende obter uma determinada espcie em cultura pura (apenas
um tipo de microrganismo) a partir de um material contendo uma cultura mista (mais de
um tipo de microrganismo) deve-se proceder ao isolamento das culturas por um mtodo
adequado: inoculao em placas contendo meio slido (inoculao por estrias;
espalhamento em superfcie; inoculao por incorporao).
INOCULAO EM MEIO SLIDO/PLACA = CRESCIMENTO DE COLNIAS
= ISOLAMENTO
ESTRIAS crescimento de microrganismos isolamento em cultura pura (reduz
o nmero de clulas gradativamente em cada zona).
ESPALHAMENTO transferncia do meio lquido para o slido ideal para a
contagem de colnias (diluio).
INCORPORAO/POUR PLATE transferncia do inculo no meio agarizado
(ainda lquido, mas a baixa temperatura). Neste mtodo obtm-se colnias superfcie e
no interior do gar.
MEIO LQUIDO LQUIDO transferncia do inculo de um meio lquido para
outro meio lquido estril com a auxlio de um ansa de sementeira.
INOCULAO DE POR PICADA Consiste na inoculao com uma ansa de
picada no interior de um meio agarizado num tubo de ensaio. Utilizado para teste de
motilidade em semisslido ou incubao em microaerofilia/anaerobiose.
CONSERVAO DE CLULAS VIVEIS
Conservao por refrigerao frigorfico/geladeira 4 C. Conservao a curto
prazo at um mximo de alguns meses (dependendo da espcie).
Conservao por congelamento arca frigorfica/freezer -20 C com o auxlio de
uma substncia que impea a formao de cristais de gelo (ex: glicerol). Conservao a
mdio/longo prazo durante alguns anos.
Conservao em azoto lquido armazenamento da cultura num recipiente
contendo azoto lquido temperatura de -196 C com o auxlio de uma substncia que
impea a formao de cristais de gelo. Conservao a longo prazo virtualmente ad
eternum.
Liofilizao prvio congelamento das culturas e posterior desidratao das
mesmas sob vcuo onde sero mantidas em ampolas. Conservao a muito longo prazo
virtualmente ad eternum.
3. CULTIVO DE MICRORGANISMOS
Necessidades nutricionais comuns a todos os organismos vivos: - fonte de carbono,
azoto e gua (absoro de nutrientes dissolvidos).
Cultivo de microrganismos meios contendo os nutrientes necessrios ao seu
crescimento
Factores que afectam o crescimento microbiano.
As condies principais que influenciam o meio fsico de um microrganismo so:
temperatura, presso osmtica/ hidrosttica, pH, atmosfera gasosa, potencial redox.
A taxa especfica de crescimento de um microrganismo () funo da concentrao de
nutrientes (ou substratos) presentes no meio de cultura, podendo ser expressa pela
equao de Monod (mantendo-se os outros parmetros fsicos invariveis):
=
+
taxa especfica de crescimento
mx valor de quando o microrganismo se encontra saturado de substrato (S)
KS constante de saturao (numericamente igual concentrao de substrato para a
qual a taxa de crescimento igual a metade da taxa de crescimento mxima ( =
Mx/2).
GRAFICAMENTE A TAXA DE CRESCIMENTO APRESENTADA COMO
FUNO DA CONCENTRAO DE SUBSTRATO.
OBS: Quando a concentrao de substrato atinge valores de saturao, a taxa
especfica de crescimento atinge o seu valor mximo (Mx). quando a concentrao
de substrato reduzida, os sistemas de permease das clulas no conseguem manter as
concentraes intracelulares de substrato saturantes, ou seja, a taxa especfica de
crescimento diminui.
Os microrganismos podem crescer numa determinada gama de temperaturas que pode
ser maior ou menor consoante o microrganismo.
A dependncia da velocidade de uma reaco enzimtica com a temperatura pode ser
dada pela equao de Arrenhius:
10 () = +
2,303
v velocidade da reao
Ea energia de activao da reao
R constante de gases ideais
T temperatura absoluta em Kelvin.
Temperatura ptima de crescimento: temperatura na qual uma espcie de
microrganismo cresce mais rapidamente; situa-se mais prxima do limite superior.
OBS: at um certo ponto, a velocidade das reaces enzimticas aumenta com o aumento
da temperatura; por outro lado, a composio fosfolipdica da membrana
citoplasmtica dos microrganismos pode alterar-se com a temperatura de
crescimento.
Mtodo de Kirby-Bauer: uma placa de Petri contendo meio slido inoculada com uma
amostra e, em seguida, o antibitico colocado no centro da placa impregnado num disco
de papel de filtro - amostras colocadas em cavidades feitas no meio solidificado em placa
previamente inoculado.
Os constituintes mais habituais dos meios de cultivos so:
gar: (polissacardeo obtidos de lagas marinhas; um agente gelificante usados nos
meios slidos e semi-slidos);
Peptonas: (ricas as pptidos e aminocidos; obtidas por digesto enzimtica de protenas
vegetais ou animais);
Extratos: (por ex: extracto de carne: contm bases orgnicas solveis, vitaminas e
minerais);
Sistema tampo: (utilizam-se para manter o pH do meio num determinado valor);
Indicador de Ph
Agentes redutores: (ex: cistena, tioglicolato; usam-se para o desenvolvimento de
microrganismos microaerfilos ou anaerbios)
Fluidos corporais: (ex: sangue ou plama; contm factores de crescimento e so usados
para microrganismos exigentes);
Substncias seletivas: (determinadas substncias so adicionadas com o propsito de
tornar o meio selectivo para determinados microrganismos; ex: determinados
antibiticos);
MORFOLOGIA BACTERIANA
Flagelos
Fmbrias
Parede Celular
Tem uma espessura de cerca de 7.5 nm sendo composta principalmente por fosfolpidos
(20 a 30%) e protenas (50 a 70%).
Os fosfolpidos formam uma bicamada cuja fluidez essencial para vrias funes da
membrana (protenas embebidas podem-se deslocar modelo de mosaico fludo).
Barreira muito mais selectiva e eficaz para a maior parte das molculas hidrossolveis do
que a parede clula
Processo passivo (sem gasto de energia) = difuso simples (transporte celular de algumas
molculas pequenas atravs da membrana citoplasmtica (O2 e CO2 dissolvidos)
Osmose: As molculas dos solventes como a gua, tambm podem atravessar livremente
a membrana semipermevel, fluindo de uma regio de elevada concentrao destas
molculas (maior diluio de soluto) para uma de baixa concentrao (maior
concentrao de soluto)
As clulas microbianas esto expostas a trs tipos de condies osmticas num ambiente
aquoso: isotnicas, hipotnicas e hipertnicas.
Isotnica
Concentrao total dos solutos similar de ambos os lados da membrana;
No existe fluxo da gua quer para dentro quer para fora da clula.
Hipotnica
Concentrao dos solutos no meio mais baixa do que no interior da clula;
A gua entra na clula (nota: muitas bactrias crescem neste tipo de meios sendo a parede
celular rgida a responsvel por evitar que a clula arrebente)
Hipertnica
Maior concentrao de solutos no exterior da clula;
Fluxo de gua do interior para o exterior;
Contraco da membrana citoplasmtica a partir da parede celular.
Nucleide: cromossomo bacteriano, constitudo por uma nica molcula dupla fita
circular de DNA no delimitado por membrana nuclear e sem a presena de histonas.
Contm as informaes necessrias sobrevivncia da clula e capaz de replicao.
Elementos extracromossomais
Plasmdeos:, molculas menores de DNA, dupla fita, circulares, cujos genes no
codificam caractersticas essenciais, mas podem conferir vantagens seletivas para as
bactrias que os possuem (ex.: genes de resistncia a antibiticos, metais
txicos,produo de toxinas, etc). Auto-duplicao independente do cromossomo
bacteriano, e podem existir vrias cpias dentro da clula.
Esporos
Tambm chamados de endosporos (porque se formam dentro da clula). Contm
pouca gua no citoplasma, possuem parede celular muito espessa, so altamente
resistentes a agentes fsicos e qumicos, devido a sua capa impermevel de
protena tipo queratina (associado ao clcio) e presena de cido dipicolnico.
Tm pouca atividade metablica, pode permanecer latente por longos perodos -
forma de sobrevivncia, e no de reproduo. Ex. Bacillus e Clostridium.
Funo: proteo da clula vegetativa das adversidades do meio ambiente
(limitao de nutrientes, temperatura e dessecao). Sua formao leva em torno
de 6 horas.
MICROSCOPIA
Campo claro: luz direta que ilumina todo o campo da amostra; utilizao de corantes
(provoca a morte dos microrganismos)
Campo escuro: luz indireta microrganismo observado como uma estrutura brilhante sobre
um fundo escuro (estudo do movimento e forma de microrganismos vivos)
Microscopia electronica
A populao total final (N) de uma cultura microbiana a partir de uma clula de 2n:
Contagem em placa
Efectuadas diluies para obter 30< UFC <300.
UFC < 30 Sobrestimao do nmero real.
UFC > 300 Subestimao (sobreposicionamento).
Filtrao em membrana
Reteno de microrganismos existentes numa suspenso na superfcie da membrana
filtrante e deposio em agar diferencial/selectivo para microrganismos especficos.
Especialmente til para volumes elevados de lquidos com baixas concentraes de
microrganismos.
Os mtodos directos envolvem, por norma, a determinao do peso seco das clulas
presentes num determinado volume de cultura. Neste mtodo as clulas so
primeiramente separadas (filtrao ou centrifugao), lavadas e secas a uma dada
temperatura at um peso constante sendo, contudo, um processo moroso.
Quando se pretende apenas determinar rendimentos em biomassa podem-se utilizar
processo mais rpidos como os mtodos pticos (turbidimtricos), que permitem estimar
a concentrao celular de uma dada cultura. Estes mtodos baseiam-se na absorvncia.
Sabe-se que dentro de uma determinada gama de valores de absorvncia (at ~0,7) a
relao entre esta e a concentrao celular linear (fazer diluies para concentraes
superiores). necessrio proceder-se a uma calibrao (para cada espcie e comprimento
de onda.
O crescimento celular microbiano num recipiente com meio lquido em sistema fechado
implica que no haja adio suplementar de nutrientes nem remoo de produtos
metablicos excretados ao longo do tempo de cultura.
Neste tipo de sistema, a partir do tempo zero as clulas comeam a multiplicar-se - o
nmero de clulas aumenta at ao momento em que existe depleo de nutrientes ou uma
acumulao significativa de produtos metablicos nocivos at paragem do crescimento.
A anlise da curva de crescimento em sistema fechado demonstra a existncia de 4 fases
distintas:
1. Fase de latncia ou adaptao (Lag): Perodo inicial de adaptao sem crescimento em
termos do nmero de clulas, mas sendo metabolicamente activas, reparando os danos
celulares e sintetizando enzimas.
2. Fase de crescimento balanceado ou exponencial (Log): Perodo de rpido crescimento
balanceado com aumento dos constituintes celulares e do nmero de clulas.
3. Fase estacionria: Perodo de crescimento global nulo derivado da equivalncia entre
o nmero de clulas produzido por clulas viveis e o suprimido por fenmenos de
depleo de nutrientes ou acumulao de produtos txicos.
4. Fase de morte celular: Perodo de declnio da populao vivel at morte de todas as
clulas microbianas pela depleo de nutrientes e acumulao de produtos txicos.
Calor Seco:
Dependendo da temperatura utilizada pode permitir a destruio dos microrganismos.
Como no to eficiente quanto o calor hmido, temperaturas e tempos de exposio
mais elevados devem ser utilizados.
Por norma, valores de 160-180 C durante cerca de duas horas so utilizados para a
esterilizao de materiais de vidro em laboratrio ou de outros materiais que no possam
ser expostos humidade.
CLASSIFICAO DE ANTIBITICOS
Espectro antimicrobiano
Mecanismos de aco
Estirpe produtora
Forma de biossntese
Estrutura qumica
Lactmicos
Inibidores da sntese da parede celular (peptideoglicano)
Incluem as penicilinas, cefalosporinas, cefamicinas, carbapenemos e monobactamos.
Penicilina (principal)
As penicilinas naturais (Penicilina G e Penicilina V) so produzidas por fungos
(Penicillium)
Penicilina G: administrao parentrica (destruda pelo cido estomacal) - streptococos,
meningococos, pneumococos, espiroquetas, clostrdios, bacilos aerbios Gram +,
estafilicocos no resistentes
.
OBS: Os antibiticos antiparietais actuam nas diferentes fases da biossntese do
peptideoglicano: nas fases citoplasmticas (ex: fosfomicina), na fase membranar
(vancomicina e teicoplatina) e na fase parietal (-lactmicos). Independentemente do seu
local de aco, todos eles afectam a integridade da parede celular, sendo por isso
bactericidas. Estes antB no afectam as clulas dos animais.
RESISTNCIA A ANTIBITICOS
Pode ser natural (ex: micoplasmas) ou adquirida; esta ltima ocorre numa proporo
varivel de isolados de uma mesma espcie ou gnero, podendo ser varivel ao longo do
tempo;
A variabilidade na susceptibilidade bacteriana justifica a realizao do antibiograma, de
forma a permitir uma escolha teraputica adequada.
Mecanismos de resistncia adquirida: mutaes em genes especficos ou a aquisio
horizontal de genes de resistncia localizados em DNA mvel (transposes e plasmdeos.