Anda di halaman 1dari 2

STUDI HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR-AKTIVITAS (HKSA)

DAN MOLECULAR DOCKING TURUNAN BENZAMIDA SEBAGAI


INHIBITOR ALOSTERIK MEK (MITOGEN ENHANCED KINASE)

Oleh

NURSAN
F1C113028

ABSTRAK

Studi hubungan kuantitatif stuktur dan aktivitas (HKSA) telah diidentifikasi


untuk senyawa turunan benzamida sebagai inhibitor alosterik MEK yang
merupakan penyebab penyakit kanker. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh
model persamaan HKSA yang dapat digunakan untuk memprediksi aktivitas
inhibisi alosterik MEK dan mendesain senyawa baru turunan senyawa benzamida.
30 senyawa turunan benzamida digambar dengan aplikasi Gaussview dan
dioptimasi menggunakan metode semiempirik AM1. Selanjutnya dilakukan
perhitungan nilai 13 deskriptor yang mewakili parameter sterik, hidrofobik dan
elektronik, serta dilakukan analisis statistik multilinier dengan metode validasi
silang leave one out (LOO) masing-masing menggunakan aplikasi MOE dan
SPSS. Kemudian persamaan HKSA terbaik yang diperoleh, dilakukan desain
senyawa baru berdasarkan skema Topliss dan didocking untuk melihat afinitasnya
terhadap reseptor MEK. Persamaan HKSA terbaik untuk senyawa turunan
benzamida adalah Log 1/IC50 = 14,229 + (-0,00001 x AM1_E) + (-0,043 x
ASA_H) + (-33,609 x Glob) + (0,648 x Log S) + (0,047 x Vol) dengan kriteria
statistik R=0,965; R2=0,930; Fhitung/ Ftabel= 17,693, dan q2 = 0,8897, serta terdapat
4 senyawa baru yang memiliki aktivitas (IC50) lebih rendah daripada senyawa
induknya.

Kata kunci : kanker, benzamida, HKSA, docking, MEK


STUDY OF QUANTITATIVE STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP
(QSAR) AND MOLECULAR DOCKING BENZAMIDE DERIVATIVES AS
ALLOSTERIC MEK (MITOGEN ENHANCED KINASE) INHIBITOR

By

NURSAN
F1C113028

ABSTRACT

Study of quantitative structure and activity relationship (QSAR) has been


identified for benzamide derivatives as allosteric MEK inhibitor which is a cause
of cancer disease. The purposes of this study were to obtain QSAR equation
model that can be used to predict the activity of allosteric inhibition of MEK and
designing new compounds benzamide derivative compounds. As well as 30
benzamide derivative is drawn with Gaussview applications and optimized using
the semi-empirical AM1 method. Furthermore, the calculation of the 13 descriptor
values that represent the parameters steric, hydrophobic and electronics, as well as
multilinear statistical analysis by the cross-validation leave one out (LOO) method
respectively using MOE and SPSS applications. The best QSAR equation
obtained was employed to the design of new compounds based on the scheme
Topliss and docking to see its affinity for the receptor MEK. It was obtained that
the best QSAR equation benzamide derivative is Log 1/IC50 = 14,229 + (-0.00001
x AM1_E) + (-0.043 x ASA_H) + (-33.609 x Glob) + (0.648 x Log S) + (0.047 x
Vol) with statistical criteria R=0.965; R2=0.930; Farithmetic/ Ftable = 17.693, and q2 =
0.8897, and there 4 new compounds that have activity (IC50) is lower than the
parent compound.

Keywords : cancer, benzamide, QSAR, docking, MEK