Captulo 3: Anlisis de cultivos GE

Un caso ficticio
En una reunin municipal, los residentes de una comunidad agrcola expresan su preocupacin
sobre los alimentos derivados de cultivos GE. Los residentes quisieran confirmacin por parte de
las autoridades de que sus alimentos derivan de cultivos convencionales. Para tranquilizar a los
residentes, la junta municipal solicita al Ministerio de Agricultura que enve un grupo de expertos a
su prxima reunin mensual.

En la siguiente reunin, los expertos en agricultura empatizan con la preocupacin de los

residentes sobre la inocuidad de sus alimentos. Las autoridades ofrecen su pericia en la
identificacin de cultivos GE. Tambin ofrecen hacer unos tests a los cultivos de maz, soja y trigo
de la zona.

Los expertos concuerdan en que la PCR es un mtodo preciso para la diferenciacin entre cultivos
convencionales y GE, y deciden analizar el maz amarillo de la cosecha reciente.

Preguntas

Cul es el trmino general para un organismo (vegetal, animal o microbiano) que ha sido
genticamente modificado?
Cul sera la fuente del DNA molde para realizar una prueba de PCR?
En qu secuencia particular de DNA dentro del genoma del maz se enfocara para una
prueba de PCR? Cuntos pares de bases contiene el marcador de DNA?
Conocemos la secuencia completa del promotor CaMV35s. De qu manera sera de
ayuda este dato en el diseo de los dos cebadores?
Si el producto de la PCR se analiza en gel de agarosa, qu marcador de peso molecular
se asemejara estrechamente a la banda que contiene CaMV35s?
Si el producto de PCR no produce una banda de 195 bp en el gel de agarosa, qu
indicara esto?
Cmo sabe que el ensayo de PCR funcion? Qu tipo de control incluira en su ensayo?
Incluira un gen endgeno de referencia del maz?
Asumamos que la secuencia de abajo pertenece a CaMV35s:

Cul sera la secuencia de aminocidos de este gen?

a. Ile.Tyr.ArgGlu.Gly.Trp.Ile.Ala.ThrLeu.Ile.Asp.Asp
b. Ile.Thr.Arg. Gly.Glu.Trp.Ile.Ala.ThrLeu.Ile.Asp.Asp
c. Ile.Tyr.ArgGlu.Gly.Trp.Ile.Ala.TryLeu.Ile.Asp.Asp
 El producto de PCR de un maz de origen distinto (ej.: de otro pas) revela la siguiente
secuencia:

Compare esta secuencia con la mostrada en el ejercicio anterior. Asuma que el centsimo
par de bases tiene una mutacin, como se muestra arriba. De qu tipo de mutacin es un
ejemplo?

Cul sera la secuencia de aminocidos correcta en este gen mutante?

a. Ile.Tyr.ArgGlu.Gly.Trp.Ile.Ala.TryLeu.Ile.Asp.Asp
b. Ile.Tyr.ArgGlu.Gly.Trp.Ile.Ala.ThrLeu.Ile.Asp.Asp
c. Ile.Thr.arggly.glu.trp.ile.ala.thrleu.ile.asp.asp
El anlisis minucioso de esta mutacin revela que un sitio Bam HI ha sido creado en el
medio del promotor CaMV35s. Asuma que no existe ningn otro sitio Bam HI en ninguna
parte del promotor CaMV35s. En ese caso, cuntos fragmentos de DNA producira la
digestin del producto de PCR? Aproximadamente qu tamao tendran los fragmentos
resultantes en bp?
Asuma que la de abajo es la secuencia de CaMV35s. Cul de las hebras (la de arriba o la
de abajo) se considera como la hebra codificante? Por qu?

Qu otro nombre se le da a la hebra codificante?

A qu hebra es complementario el mRNA?
 Por favor escriba la secuencia del mRNA resultante.
Es apropiada la designacin hebra superior y hebra inferior? Por qu?
Cul es la caracterstica comn de la citosina, la timina y el uracilo?
Cul es la caracterstica comn de la guanina y la adenina?
Si no se puede extraer u obtener genoma de maz en suficiente cantidad, cules seran sus
otras opciones para identificar este cultivo GE?
El tomate Btes decir, que contiene el gen Bt de Bacillus thuringiensis es capaz de
protegerse de todos los insectos.
a. Verdadero
b. Falso
El siguiente es un caso hipottico. Se le solicita que realice PCR en un maz convencional
de color amarillo. Asuma que para el gen del color amarillo, A es el alelo dominante y a es
el alelo recesivo. Entonces, un maz de color amarillo podra tener genotipo AA o Aa. Y el
maz de color blanco tendra el genotipo aa. Asuma que el protocolo de PCR producira un
fragmento de DNA de 4 kb a partir de estos alelos. Un sitio de restriccin EcoRI que
flanquea ambos lados de ambos alelos. Adems, el alelo blanco tiene un sitio de
restriccin EcoRI localizado aproximadamente en las primeras 1 kb de su alelo.
a. Si el producto de PCR es digerido con enzima de restriccin EcoRI y slo se detecta un
fragmento en el gel de agarosa, qu dira sobre el genotipo del maz?
b. Si el producto de PCR es digerido con enzima de restriccin EcoRI y se detectan dos
fragmentos en el gel de agarosa, qu dira sobre el genotipo del maz?
c. Si el producto de PCR es digerido con enzima de restriccin EcoRI y se detectan tres
fragmentos en el gel de agarosa, qu dira sobre el genotipo del maz?

La siguiente electroforesis en gel de agarosa representa las muestras de DNA de los tres
genotipos de maz de arriba luego de la digestin con EcoRI. Use este gel como una
herramienta para visualizar las opciones de las respuestas a, b y c.

M: marcador molecular de maz. a: fragmento de 4 kb. b: fragmento de 1 kb y 3 kb. c: 1 kb,

3 kb y 4 kb.