23.

RANCANGAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH BIOLOGI MOLEKULER

1 Fakultas : Biologi
2 Program Studi : S1 Biologi
3 Tahun Akademik :
4. Semester : Gasal/Genap
5. Nama Mata Kuliah : BIOLOGI MOLEKULER
6 Kode Mata Kuliah
7 SKS : 3 (2-1)
8 Prasyarat : GENETIKA
9 Tim Pengajar : Dr. Hendro Pramono, MS
Drs. Agus Heri Susanto, MS
Dr. Nurtjahyo Dwisasongko, MApp.Sc
Drs. Adi Amurwanto, MSc
Drs. Daniel Joko Wahyono, M.Biomed
Ir. Alice Yuniarti, MSc., Ph.D
Saefudin Azis, S.Si
10 Kompetensi :
Mahasiswa mampu menjelaskan konsep-konsep dasar biologi molekuler serta aplikasinya dalam
teknologi DNA rekombinan
11 Deskripsi Singkat MK :
Materi Mata Kuliah Biologi Molekuler meliputi sejarah perkembangan, dan hubungan biologi
molekuler dengan beberapa disiplin ilmu lainnya, asam nukleat, struktur molekuler kromosom,
replikasi DNA, transkripsi, translasi, pengaturan ekspresi gen, mutasi, dasar-dasar teknologi DNA
rekombinan, perpustakaan gen, vektor kloning, metode PCR, sekuensing DNA, bioinformatika, serta
organisme transgenik dan pro-kontra pemanfaatannya.
12 Tujuan Pembelajaran :

Untuk mencapai kompetensi pembelajaran, tujuan pembelajaran disusun agar mahasiswa mampu:
1. menjelaskan struktur, sifat fisika-kimia asam nukleat, sifat spektroskopik-termal asam nukleat,
superkoiling DNA
2. menjelaskan struktur kromosom prokariot dan eukariot
3. mendiskusikan cara, arah, dan komponen replikasi DNA
4. mendiskusikan transkripsi pada prokariot dan eukariot
5. mendiskusikan translasi pada prokariot dan eukariot
6. menjelaskan pengaturan ekspresi gen pada prokariot dan pada eukariot
7. menjelaskan kloning gen, enzim restriksi, ligasi, transformasi
8. menjelaskan perpustakaan genom dan cDNA, cara konstruksi dan besarnya perpustakaan

Draf kurikulum Baru 1

 genom, elektroforesis, prosedur skrining DNA rekombinan (uji fenotipe dan macam-macam
teknik hibridisasi)
9. menjelaskan persyaratan vektor kloning, plasmid, kosmid, YAC, bakteriofag, vektor-vektor
eukariot, dan vektor ekspresi
10. menjelaskan pengertian dan kegunaan PCR, komponen dan optimasi PCR
11. menjelaskan pengertian dan macam teknik sekuensing DNA
12. menjelaskan pangkalan data genom dan analisis komputasi sekuens DNA dan protein
13. menjelaskan pengertian organisme transgenik, kontruksi tanaman dan hewan transgenik, pro-
kontra penggunaannya
13 Outcome : Mahasiswa mampu menjelaskan secara garis besar isi artikel ilmiah bidang biologi molekuler

14. Jadwal Kegiatan

a. Perkuliahan
Minggu Pokok Bahasan (Topik) Substansi Metode Media
ke Pembelajaran*) Pembelajaran
1 KONTRAK PEMBELAJARAN manfaat, deskripsi, tujuan, strategi, dan jadwal  ceramah  papan
pembelajaran, serta bahan bacaan dan kriteria penilaian  diskusi tulis
 LCD
PENDAHULUAN ruang lingkup, sejarah perkembangan, dan hubungan  ceramah  papan
Biologi Molekuler dengan disiplin ilmu lainnya  diskusi tulis
 LCD
2 ASAM NUKLEAT struktur, sifat fisika-kimia asam nukleat, sifat  ceramah  papan
spektroskopik-termal asam nukleat, superkoiling DNA  diskusi tulis
 LCD
3 STRUKTUR KROMOSOM struktur kromosom prokariot dan eukariot  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD
4 REPLIKASI DNA cara, arah, dan komponen replikasi DNA  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD
5 TRANSKRIPSI transkripsi pada prokariot dan eukariot  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD
6 TRANSLASI translasi pada prokariot dan eukariot  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD

Draf kurikulum Baru 2

 7 PENGATURAN EKSPRESI GEN pengaturan ekspresi gen pada prokariot dan pada eukariot  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD
8 UJIAN TENGAH SEMESTER
9 DASAR-DASAR TEKNOLOGI DNA kloning gen, enzim restriksi, ligasi, transformasi  ceramah  papan
REKOMBINAN  diskusi tulis
 LCD
10 PERPUSTAKAAN GENOM perpustakaan genom dan cDNA, cara konstruksi dan  ceramah  papan
besarnya perpustakaan genom, elektroforesis  diskusi tulis
prosedur skrining DNA rekombinan (uji fenotipe dan  LCD
macam-macam teknik hibridisasi)
11 VEKTOR KLONING persyaratan vektor kloning, plasmid, kosmid, YAC,  ceramah  papan
bakteriofag, vektor-vektor eukariot, dan vektor ekspresi  diskusi tulis
 LCD
12 PCR pengertian dan kegunaan PCR, komponen dan optimasi  ceramah  papan
PCR,  diskusi tulis
 LCD
13 SEKUENSING DNA pengertian dan macam teknik sekuensing DNA  ceramah  papan
 diskusi tulis
 LCD
14 BIOINFORMATIKA pangkalan data genom dan analisis komputasi sekuens  ceramah  papan
DNA dan protein  diskusi tulis
 LCD
15 ORAGNISME TRANSGENIK Pengertian organisme transgenik, kontruksi tanaman dan  ceramah  papan
hewan transgenik, dan pro-kontra penggunaannya  diskusi tulis
 LCD
16 UJIAN AKHIR SEMESTER

b. Praktikum

Minggu Acara Praktikum Substansi Tempat

ke
1 Asistensi Ruang kuliah

Draf kurikulum Baru 3

 2 Isolasi DNA kromosom Isolasi DNA kromosom Bacillus sp.  Lab.
Genetika
3 Isolasi plasmid Isolasi plasmid pUC19  Lab.
Genetika
4 Restriksi DNA plasmid Restriksi DNA plasmid pUC19 dengan enzim EcoRI  Lab.
Genetika
5 Elektroforesis DNA Elektroforesis DNA kromosom dan plasmid pUC19  Lab.
Genetika
6 Transformasi Eschericia coli Transformasi Eschericia coli menggunakan plasmid pUC19  Lab.
Genetika
7 Bioinformatika (1) Cara mengakses pangkalan data, mendapatkan urutan basa gen  Unit
yang diinginkan, dan alignment (pensejajaran) urutan basa dan Layanan
urutan asam amino menggunakan program BLAST Komputer
8 Bioinformatika (2) Analisis restriksi menggunakan program Clone, DNAstar, dan  Unit
GenMon. Layanan
Komputer

1. Monitoring dan Evaluasi

A. Evaluasi proses pembelajaran
1. Monitoring
Monitoring pembelajaran, baik menyangkut pemahaman mahasiswa akan materi yang telah dan sedang dibicarakan maupun motivasi
dan respon mahasiswa terhadap kegiatan pembelajaran, dilakukan oleh staf pengajar Biologi Molekuler selama berlangsungnya proses
pembelajaran. Monitoring pemahaman dan respon dilakukan dalam bentuk tanya-jawab langsung mengenai materi yang telah dan sedang
dibicarakan, sedangkan monitoring motivasi dilakukan melalui pemeriksaan daftar hadir.

2. Evaluasi
Evaluasi pembelajaran meliputi evaluasi proses dan evaluasi hasil pembelajaran. Evaluasi proses dilakukan terutama oleh mahasiswa
melalui pengisian kuisener, baik yang disusun oleh staf pengajar Biologi Molekuler maupun dari Tim Monitoring dan Evaluasi fakultas.
Kuisener dari staf pengajar diberikan pada tengah semester atau pertemuan ke-7 (lihat Rancangan Evaluasi Pembelajaran), sedangkan
kuisener dari tim fakultas diberikan menjelang akhir semester. Di samping itu, evaluasi terhadap kualitas administrasi pembelajaran
dilakukan melalui reviu dokumen dan observasi oleh staf pengajar Biologi Molekuler pada akhir semester (lihat Rancangan Evaluasi
Pembelajaran). Adapun evaluasi hasil pembelajaran dilakukan oleh staf pengajar Biologi Molekuler berupa komponen penilaian terhadap
mahasiswa.

Kuesioner Evaluasi Proses Pembelajaran

No. Aspek Indikator Skor (lingkari angka yang sesuai)

Draf kurikulum Baru 4

 1 Persepsi mahasiswa terhadap  Penguasaan staf pengajar terhadap materi 1 2 3 4 5
kemampuan staf pengajar pembelajaran rendah tinggi
dalam proses pembelajaran  Kemampuan staf pengajar dalam menjelaskan 1 2 3 4 5
materi pembelajaran rendah tinggi
 Kemampuan staf pengajar dalam menggunakan 1 2 3 4 5
media pembelajaran rendah tinggi
 Kemampuan staf pengajar dalam membangkitkan 1 2 3 4 5
motivasi dan respon mahasiswa rendah tinggi
2 Kualitas materi pembelajaran  Kualitas bahan ajar 1 2 3 4 5
rendah tinggi
 Kemutakhiran bahan bacaan 1 2 3 4 5
kuno mutakhir
 Sistematika materi pembelajaran 1 2 3 4 5
buruk baik
 Kualitas kuis dan tugas terstuktur 1 2 3 4 5
rendah tinggi
 Kualitas soal ujian tengah semester 1 2 3 4 5
rendah tinggi
3 Dampak pembelajaran  Manfaat materi pembelajaran untuk penyelesaian 1 2 3 4 5
tugas akhir sedikit banyak
 Manfaat materi pembelajaran setelah selesai studi 1 2 3 4 5
sedikit banyak

Draf kurikulum Baru 5

Pedoman Reviu Dokumen dan Media Pembelajaran
No. Aspek yang direviu Kondisi
1 Ketersediaan daftar hadir mahasiswa awal / tengah / akhir semester
2 Format daftar hadir mahasiswa ketikan / tulisan tangan mahasiswa
3 Ketersediaan daftar kegiatan staf awal / tengah / akhir semester
pengajar dalam proses pembelajaran
4 Pengisian daftar kegiatan staf pengajar .....%
dalam proses pembelajaran
5 Ketersediaan media pembelajaran yang tersedia / cukup / kurang / tidak tersedia
diperlukan

Pedoman Observasi Pemberlakuan Kontrak Pembelajaran

No. Aspek yang diobservasi Kondisi
1 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
rencana urutan penyampaian materi tidak kurang cukup sesuai sangat
pembelajaran sesuai sesuai sesuai sesuai
2 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
rencana strategi pembelajaran tidak kurang cukup sesuai sangat
sesuai sesuai sesuai sesuai
3 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
ketentuan tugas terstruktur tidak kurang cukup sesuai sangat
sesuai sesuai sesuai sesuai
4 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
ketentuan ujian tengah semester tidak kurang cukup sesuai sangat
sesuai sesuai sesuai sesuai
5 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
ketentuan ujian akhir semester tidak kurang cukup sesuai sangat
sesuai sesuai sesuai sesuai
6 Kesesuaian antara pelaksanaan dan 1 2 3 4 5
jadwal pembelajaran tidak kurang cukup sesuai sangat
sesuai sesuai sesuai sesuai

Draf kurikulum Baru 6

 B. Evaluasi Hasil Belajar Mahasiswa
Komponen Evaluasi Hasil Pembelajaran
No. Komponen penilaian Bobot (%) Nilai tertinggi
1 Nilai kuis rata-rata 15 100
2 Nilai tugas terstruktur 15 100
3 Nilai praktikum 20 100
3 Nilai ujian tengah semester 25 100
4 Nilai ujian akhir semester 25 100
T o t a l (nilai akhir) 100 100

Pedoman Penilaian
A. Nilai mutu untuk Nilai ≥80 :
B. Nilai mutu untuk Nilai 66,00-79,99
C. Nilai mutu untuk Nilai 56,00-65,99
D. Nilai mutu untuk Nilai 46,00-56,99
E. Nilai mutu untuk Nilai < 46

16. Referensi :
Loundish H, Berk A, Zipourskey, S.L., Matsudaria P. Baltimore, D., and Darnell, J.E. 2000. Moleculer Cell Biology 4th Ed. W.H. Freeman and Co,
New York.
Turner, P.C. Mc. Leman, A.G. Bates , A.D., Write, M.R.H. 1997. Instant Notes in Moleculer Biology. Bios Scientific Publ. Oxford.

Draf kurikulum Baru 7