UNAN-MANAGUA
UNIDAD 6:
DIAGNÓSTICO GENÉTICO
AÑO ACADEMICO 2017
Molecular:
Bandeo FISH
Cariotipo
Cromosomas Cariotipo
Espectral
CARIOTIPO
Representación gráfica de los Cromosomas.
Cromosomas son
visualizados durante la
METAFASE
14q31.42
Cromosoma 14
Brazo q (brazo largo), Región 3,
la banda 1 y, separado por un
punto, la subbanda 4 y la
subsubbanda 2.
p: brazo corto del cromosoma.
q: brazo largo del cromosoma.
+: ganancia de un cromosoma completo.
-: pérdida de un cromosoma completo.
tel: telómero.
r( ): cromosoma en anillo. Entre paréntesis ponemos
el cromosoma involucrado.
del( )( ): deleción de. En el primer paréntesis ponemos
los cromosomas en los que se produce la deleción, y
en el segundo de dónde a dónde se produce la
deleción.
ins: inserción de.
dup: duplicación de.
inv( )( ): inversión de. En el primer paréntesis
ponemos los cromosomas en los que se produce la
inversión, y en el segundo los extremos del segmento
invertido.
t: translocación de.
i: isocromosoma, es decir, cromosoma que tiene los
dos brazos iguales ya sean dos brazos p o dos brazos
1.
.ish: cariotipo estudiado por FISH.
tri: trisomía.
trp: triplicación de una porción de un cromosoma.
INDICACIONES CARIOTIPO
• RN con dismorfogénesis.
• Niños con retraso en el desarrollo y crecimiento.
• Individuos con ambigüedad en los genitales.
• Adolescentes sin desarrollo de caracteres
sexuales secundarios.
• Parejas con abortos a repetición.
• Parejas infértiles.
• Para diagnóstico prenatal
• Para apoyo diagnóstico padecimientos. Ej:
Leucemia.
BANDEO CROMOSÓMICO
• Para visualizar los cromosomas en un cariotipo
deben aplicarse diferentes tinciones para que las
bandas transversales sean evidentes.
• Consiste en someter a los cromosomas a
desnaturalizaciones, a digestión enzimática o a
ambos, seguido de una tinción con colorante
específico para ADN. Esto hace que los
cromosomas se tiñan con una serie de bandas
claras y oscuras.
Bandeo G Tripsina + Calor+ SSN+ Giemsa
BANDEO CROMOSÓMICO
Colorante fluorescente:
Bandeo Q
Quinacrina. Coincide con G
Calor+ Giemsa
Bandeo R bandas invertidas o “reverso”
respecto al bandeo G
Giemsa o fluorocromos
Bandeo C Heterocromatina de los
centrómeros.
Solo revelan deleciones grandes de una resolución por arriba de 4 Mb
Bandeo G: Patrón de regiones claras (G-, Bandas R) y
oscuras (G+).
Bandeo R
Bandeo R y T.
DIRECTO INDIRECTO
Examina la Marcadores
mutación vinculados
Credit: Case It!: Huntington’s disease case with online role playing
PCR y Sondas Alelo-Oligonucleótido específico
(ASO): Amplificación por PCR-Alelo específica
• Las sondas ASO son secuencias de nucleótidos
cortas que se unen específicamente a un
único alelo del gen.
• Ejemplo:
• Hemocromatosis (Mutación C282Y sustitución
codón 282 G:A)
• Anemia Drepanocítica (Mutación GAG:GTG;
Glutamato:Valina)
Unión de la sonda ASO "S" al ADN "S" (arriba) o al ADN
"A" (abajo).
Souce: http://www.cram.com/flashcards/mbm-2f-recombinant-dna-1883792
DNA-Chips
• Este enfoque implica incrustar miles de
oligonucleótidos diferentes, que representan diversas
mutaciones y secuencias normales, en un chip de
silicona.
• Regiones específicas del ADN del paciente son
amplificadas por PCR, marcado con una etiqueta
fluorescente y luego es expuesto a los oligonucleótidos
del Chip.
• Los sitios de hidridización en el chip son grabados por
una computadora.
• Ventajas: Registro computarizado y el tamaño
compacto del chip.
Análisis Polimorfismo Longitud de Fragmento de
Restricción de productos de PCR (RFLP-PCR)
• RFLP: Secuencias específicas de nucleótidos
en el ADN que son reconocidas y cortadas por
las enzimas de restricción (endonucleasas de
restricción) y que varían entre individuos.
• Se usan como marcadores para identificar
grupos particulares de personas con riesgo a
contraer ciertas enfermedades genéticas.
• Ejemplo: Enfermedad de Gaucher, Fibrosis
quística, Distrofia miotónica.
• En primer lugar se realiza una amplificación por
PCR del gen que queremos estudiar, y
posteriormente se realiza la digestión (o corte en
fragmentos) del producto amplificado con
enzimas de restricción, para ver los fragmentos
resultantes o fragmentos de restricción de ese
gen.
• Permite determinar inserciones o deleciones en
fragmentos de restricción de un gen y para
mutaciones puntuales que alteran la secuencia de
los mismos, pueden crear o hacer desaparecer
sitios de restricción en un gen que alteran el
patrón de fragmentos de restricción observados
en electroforesis.
Mujer de 16 años
Dx: Enfermedad de Gaucher
Mutación T1448C
Afecta sitio de restricción Hphl
Normal: No corta producto 150 bp
Mutado: 114 y 36 bp
Secuenciación Directa ADN
• Secuenciación completa del gen en estudio.
• Es costoso y conlleva a un mayor tiempo.
• A veces es necesario si ningún conjunto
específico de mutaciones es responsable de la
mayoría de los casos de enfermedad.
• Ejemplo:
Cáncer de seno familiar.
Southern Blot
• Detecta la presencia de una secuencia de ADN
• Utiliza electroforesis en gel de agarosa.
• Se usa para diagnóstico de inserciones o
deleciones.
• Ej: Prader willi, Angelman, X frágil.
DIAGNÓSTICO GENÉTICO INDIRECTO
• Si la mutación causante de la enfermedad en una
familia es desconocida, el análisis genético
indirecto puede usarse para determinar si uno de
los progenitores a transmitido la alteración a su
descendencia.
• Debe conocerse la localización del gen afectado
pero el gen por sí mismo y su función se
desconocen, o cuando el gen es conocido pero las
mutaciones son tan variadas y heterogéneas que
hacen difícil una análisis directo.
• Utiliza maracadores genéticos que están
estrechamente ligados al locus de la enfermedad.
• Los mismos utilizados en los estudios de mapeo
genético: RFLP, STRP y SNP.
• Un marcador genético es un polimorfismo del
gen o de un segmento próximo al locus génico
siendo los más utilizados los polimorfismos
debidos a dianas de restricción.