Anda di halaman 1dari 5

Cabai digunakan secara luas dan dibudidayakan oleh orang-orang Indonesia.

Ada tiga jenis cabai

lada, yaitu Capsicum annuum, frutescens Capsicum, dan Capsicum violaceum. C. frutescens memiliki
nilai ekonomi yang lebih tinggi karena kepedasan dan kandungan karotenoid. C. frutescens memiliki
beberapa kultivar, salah satu dari mereka adalah

C. frutescens cv. Cakra Hijau. kultivar ini adalah tahan terhadap hama dan penyakit dan memiliki
kepedasan yang sangat tinggi. Karakter ini khusus cabai adalah capsaicin, metabolik sekunder. Selain
itu, capsaicin

juga berfungsi sebagai mekanisme pertahanan, antiarthritis, analgesik, dan antikanker. Penelitian ini
bertujuan untuk iso akhir gen cyltransferase (AT3) yang dikodekan capsaicin synthase (CS) enzim.
gen AT3 diisolasi

melalui PCR menggunakan primer forward 5 '-ATG GCT TTT GCA TTA CCA TCA-3' dan reverse primer
5'-CCT TCA CAA TTA TTC GCC CA-3 '. Data dianalisis dengan menggunakan DNA Baser, BLAST, dan
ClustalX.

Penelitian ini telah berhasil diisolasi 404 fragmen bp dari gen AT3. Fragmen ini terletak di

1918-1434 bp disebut gen AT3 dari C. frutescens cv. Shuanla. Isolasi fragmen aliran hulu dan ke
bawah dari gen AT3 dari C. frutescens cv. Cakra Hijau adalah menjalani ing.

PENGANTAR

Cabai secara luas digunakan dan dibudidayakan oleh

Orang Indonesia. Ada tiga spesies

cabai, yaitu Capsicum annuum, Capsicum

frutescens, dan Capsicum violaceum [1]. Di Indonesia,

C. frutescens yang paling banyak dibudidayakan [2],

dan merupakan tanaman ekonomi bernilai tinggi untuk konten pung ency dan karotenoid [3]. C.
frutescens memiliki

beberapa kultivar, yaitu, Sky Line, White Chili,

Bara, Cakra Putih, dan Cakra Hijau. Cakr a Hijau

kultivar tahan terhadap hama dan penyakit, memiliki sangat

kepedasan tinggi, dapat dipanen pada ± 80 hari,

dan berpotensi menghasilkan 12.000 kg / ha buah cabai

[4].

Kepedasan di cabai disebabkan oleh capsaicin senyawa. Capsaicin hanya ditemukan di dalam
genus Capsicum. Capsaicin telah digunakan di cine medi dan farmasi sebagai anti -arthritis dan
analgesik,

[5]. Ini juga telah digambarkan sebagai pengatur

distribusi lemak dalam tubuh [6], antibakteri [7],

dan antikanker [8].

Penulis yang sesuai:

Mohamad Habibi

Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Alam

Ilmu, Universitas Negeri Malang, Jalan Semarang 5,

Malang, Indonesia 65145

E-mail: habib1_m@yahoo.com

Beberapa enzim yang terlibat dalam Capsaicin

biosintesis. Capsaicin synthase (CS) adalah th e lalu

enzim yang memiliki peran penting dalam capsaicin

biosintesis oleh kondensasi vanillylamin dengan asil

gugus untuk menghasilkan capsaicin. CS juga berfungsi sebagai

regulator untuk pembentukan capsaicin [9].

Acyltransferase (AT3) gen diusulkan sebagai gen

encode CS enzim [10]. Pernyataan ini sup porting oleh Leung [11] yang proposesthat AT3 adalah

menyatakan pada plasenta dan gen ini terpisah

di C lokus. Di sisi lain, Kim et al. [12] kembali porting bahwa AT3 co-lokal dengan Pun1 dan 2,5

kb penghapusan AT3 ditemukan berkaitan dengan

non-kepedasan lada.

Isolasi gen AT3 dari C. annuum

[13] dan beberapa C. frutescens [14] telah kembali porting. Sejauh ini, tidak ada laporan tentang AT3
dari

C. frutescens dari Indonesia, dan data gen ini


belum tercatat dalam Gene Bank. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi gen AT3 dari C.

frutescens cv. Cakra Hijau.

BAHAN DAN METODE

C. frutescens cv. tanaman cakra Hijau yang

diperoleh dari Balai Pengkajian Teknologi Pertanian (BPTP) Karangploso, Malang, Indonesia.

Total DNA diisolasi dari daun dengan menggunakan

isolasi DNA tanaman kit (Nucleospin

II,

Macherey-Nagel, Jerman). Primer yang digunakan adalah

5'-ATG GCT TTT GCA TTA CCA TCA-3 '

(Maju) dan 5 '-CCT TCA CAA TTA TTC

GCC CA-3 '(reverse). siklus PCR: 94

Hai

C selama 5 m

(Pra denaturasi), 94

C selama 1 menit (denaturasi), 53

C selama 1 menit (anil), 72

C selama 2

menit (ekstensi), dan 72

C selama 10 menit

(Ekstensi akhir) di 30 siklus.

Produk PCR dielektroforesis oleh


menggunakan 1% gel agarose dan diurutkan oleh Big Dye

transiluminator melalui ABI 3130 mesin analyzer genetik di Eijkman Institute for Molecular

Biologi Jakarta. Hasil sekuensing adalah

dianalisis dengan menggunakan Bioedit, Peak jejak, DNA Baser,

BLAST, dan perangkat lunak Clustal X.

HASIL DAN DISKUSI

The AT3 gen isolasi dari C. frutescens cv.

Cakra Hijau menggunakan teknik PCR dengan sepasang

primersproduced 404 pasangan basa fragmen. Itu

posisi gen target yang diperkuat terletak di 1918 -1434 bp, lihat AT3 C. frutescens (kode akses:
HM854860.1 dan AY819026.1). Tersangka

gen AT3 hasil urutan dari C. frutescens cv.

Cakra Hijau ditunjukkan pada Gambar 1. analisis

Urutan menggunakan program BLAST dibandingkan

dengan AT3 C. frutescens cv. Shuanla (Gambar 2A)

dan C. frutescens cv. BG2814.6 (Gambar 2B). Itu

Hasil menunjukkan cakupan permintaan dari 24% dan 10%,

masing-masing, dengan indeks kesamaan 99% masing-masing.

Menurut hasil, urutan yang memiliki

telah diakuisisi AT3 gen.

DNA urutan dari gen AT3 C.

frutescens cv. Cakra Hijau dianalisis dengan menggunakan

ClustalX untuk membuat keselarasan asam amino

dengan AT3 C. frutescens cv. Shuanla dan C.

frutescens cv. BG2814.6. Asam amino menyelaraskan ment menunjukkan bahwa AT3 gen dari C.
frutescens cv.

Cakra Hijau terletak di asam amino 43

rd
untuk

139

th

urutan asam amino dari AT3 C. frutescens

CV. Shuanla dan C. frutescens cv. BG2814.6 (Gambar

3).

Kami kurang percaya diri untuk memastikan bahwa yang pertama

methyonin di urutan asam amino kami adalah sebuah awal

kodon, mengenai bahwa ada 42 asam amino

hulu ke kita mulai dengan methyonin yang memiliki

belum terisolasi. Selain itu, ada ano fragmen ther hilir dari asam amino 140

th

yang belum diperoleh dalam penelitian kami. Begitu

jauh, tidak ada laporan untuk panjang tepat

gen AT3 dari C. frutescens cv. Shuanla [15]

yang tidak menunjukkan kodon stop di melaporkan mereka

urutan AT3.

KESIMPULAN

Penelitian ini berhasil isolat 404 bp yang diduga

fragmen gen AT3 dari C. frutescens cv. cakra

Hijau yang mengkode 97 asam amino. urutan

diperoleh adalah bagian tengah gen AT3. Itu

isolasi up-stream dan down-aliran bagian dari

gen ini diperlukan untuk mendapatkan urutan utuh.