Anda di halaman 1dari 3

Campylobacter jejuni

Yafie Al Islami (3325122136)

Accession number AL111168

C. jejuni merupakan kuman Gram-negatif, berbentuk lengkung, S dan berbentuk batang


yang bergerak, memiliki panjang 0,5 – 5 µm dan lebar 0,2 – 0,5 µm. Kuman ini dapat bergerak
dengan sebuah flagel kutub, dan tidak membentuk spora (Gambar 1). Genom strain C. jejuni
NCTC11168 diterbitkan pada tahun 2000, menunjukkan 1.641.481 pasangan basa (30,6% G +
C) memprediksikan untuk mengkodekan 1.654 protein dan 54 spesies RNA yang stabil. Genom
tidak biasa karena hampir tidak ada urutan penyisipan atau urutan yang terkait dengan fag dan
sedikit sekali urutan ulang yang ditemukan. Salah satu temuan paling mencolok dalam genom
adalah adanya rangkaian yang hypervariable.

a b

Gambar 1. (a). Gambar C. jejuni dengan mikroskop elektron dalam pewarnaan coklat;
(b). Mikrograf elektron C. jejuni.

Pada tahun 1886 seorang dokter anak, Theodor Escherich, mengamati Campylobacters
dari sampel diare pada anak-anak. Isolasi pertama C. jejuni ada di Brussel, Belgia, dari sampel
tinja pasien dengan diare. Genom dari C. jejuni pertama kali dipublikasikan pada tahun 2000
oleh Parkhill, et. all.

Campylobacteriosis adalah penyakit menular yang disebabkan oleh bakteri dari genus
Campylobacter. Pada kebanyakan orang yang sakit dengan campylobacteriosis, gejala
berkembang dalam dua sampai lima hari setelah terpapar organisme dan penyakit biasanya
berlangsung tujuh hari setelah onset. Infeksi dengan C. jejuni biasanya mengakibatkan
enteritis, yang ditandai dengan sakit perut, diare, demam, dan malaise. Diare itu sendiri dapat
bervariasi dalam tingkat keparahan dari kotoran ke kotoran berdarah. Penyakit ini biasanya
membatasi diri. Namun, itu memang menanggapi antibiotik. Dalan kondisi yang sudah akut
(disertai demam, darah dalam tinja) atau kasus berkepanjangan mungkin memerlukan
eritromisin, azitromisin, siprofloksasin, atau norfloksasin. Penggantian cairan melalui Garam
Rehidrasi Oral mungkin diperlukan dan cairan intravena mungkin diperlukan untuk kasus
serius.

Gambar 2. Circular Map dari C. jejuni

Genom C. jejuni NCTC11168 adalah 1.641.481 pasangan basa (bp). Dari 1.654 prediksi
urutan pengkodean (CDS), setidaknya 20 mungkin mewakili pseudogen; rata gen rata-rata
adalah 948 bp, dan 94,3% kode genom untuk protein, menjadikannya genom bakteri terpadat
yang diurutkan sampai saat ini. Bias terhadap G pada untai utama kromosom menunjukkan
bahwa asal mula replikasi mendekati awal gen dnaA. Bias Strand juga terlihat dalam CDS;
Secara keseluruhan, 61,1% ditranskripsikan ke arah yang sama dengan replikasi (Gambar 2).
Kami menemukan dua wilayah besar dengan kandungan G + C yang lebih rendah yang
mencakup CDS Cj1135 ± Cj1148 (25,4%) dan Cj1421 ± Cj1442 (26,5%); Ini sesuai dengan
gen dalam kelompok biosintesis lipooligosakarida (LOS) dan ekstraselular polisakarida (EP).
Informasi fungsional (sesuai dengan gen fungsi yang diketahui, atau prosedural hidrofobisitas
informatif) dapat disimpulkan untuk 77,8% dari 1.654 CDS, sedangkan 13,5% cocok dengan
gen fungsi yang tidak diketahui dalam database dan 8,7% tidak memiliki kecocokan database,
atau fungsional lainnya. informasi. Jumlah yang tidak biasa yang tidak diketahui sebelumnya
menunjukkan kelebihan membran prediksi, periplasma dan lipoprotein; ini masing-masing
terdiri dari 10,3%, 7,8% dan 2,3% dari CDS, dan banyak dari ini tidak memiliki kecocokan
database.

Urutan genom dari C. jejuni dapat dilihat pada


https://www.ebi.ac.uk/Tools/dbfetch/dbfetch?db=embl&id=AL111168&style=raw

Terdapat 2 jurnal yang membahas C. jejuni, yang pertama diterbitkan oleh Parkhill, et.
all pada tahun 2000 “The genome sequence of thefood-borne pathogen Campylobacter jejuni
reveals hypervariable sequences” dan pada tahun 2007 oleh Gondogdu, Ozan et. all “Re-
annotation and re-analysis of the Campylobacter jejuni NCTC11168 genome sequence”.