Disusun oleh :
JURUSAN BIOLOGI
Februari 2017
KATA PENGANTAR
Puji syukur kehadirat Tuhan Yang Maha Kuasa atas segala Rahmat, sehingga
penulis dapat menyelesaikan penyusunan makalah ini dalam bentuk maupun isinya
yang mungkin sangat sederhana. Makalah ini berisikan tentang “RNA, Transkripsi
dan Translasi”. Terima kasih kami ucapkan kepada Ibu Nuning Wulandari, S.Si,
M.Si selaku dosen pembina mata kuliah. Semoga makalah ini dapat dijadikan
sebagai acuan dan juga sumber belajar mengajar di dalam perkuliahan.
Semoga makalah ini dapat dipergunakan sebagai salah satu acuan, petunjuk
maupun pedoman dan juga berguna untuk menambah pengetahuan bagi para
pembaca.
Penulis mengakui makalah ini masih banyak kekurangan karena pengalaman
yang penulis miliki sangat kurang. Oleh karena itu penulis harapkan kepada para
pembaca untuk memberikan masukan-masukan yang bersifat membangun untuk
kesempurnaan makalah ini.
Tim Penyusun
ii
DAFTAR ISI
halaman
ABSTRAK …………………………….…….………………..v
ABSTRACT …………………………….…….………………..vi
BAB I PENDAHULUAN
iii
DAFTAR GAMBAR
halaman
2.1 Transfer RNA. ........................................................................................5
2.2 Messenger RNA......................................................................................5
2.3 Transkripsi dan Translasi pada Prokariotik............................................8
2.4 Transkripsi Eukariotik..............................................................................9
2.5 Struktur dua dimensi tRNA......................................................................11
2.6 Struktur RNA Transfer............................................................................12
2.7 Model Komputer Ribosom.......................................................................13
2.8 Model Skema ..........................................................................................13
2.9 Model Skema dengan mRNA dan tRNA................................................14
2.10 Ribosom...................................................................................................14
2.11 Elongasi...................................................................................................16
2.12 Terminasi.................................................................................................17
iv
ABSTRAK
Rohmah Aini F., Ramadani Dhita A., Oktaviana Merinda. 2017. RNA Transkripsi
dan Translasi. Makalah Biokimia, Offering B S1 Pendidikan Biologi
Universitas Negeri Malang.Dosen Pembina Mata Kuliah: Ibu Nuning
Wulandari, S.Si, M.Si
v
ABSTRACT
Rohmah Aini F., A. Dhita Ramadani, Oktaviana Merinda. 2017. RNA Transcription
and Translation. Papers Biochemistry, Biology Education Offering B S1
Malang.Dosen Pembina State University Course: Mother Nuning Wulandari,
S.Si, M.Si
vi
BAB I
PENDAHULUAN
1
1.3 Tujuan
Tujuan dari pembuatan makalah ini adalah :
1.4 Manfaat
2
BAB II
PEMBAHASAN
3
1. Jenis Utama RNA
a. RNA ribosom (rRNA)
Molekul RNA ribosom terdiri dari 65 sampai 70% dari massa ribosom
(yang bertanggung jawab untuk sintesis protein). Ribosom merupakan
organel yang sangat besar; ribosom prokariotik memiliki berat molekul
sekitar 2,5 juta, sedangkan eukariotik ribosom memiliki berat molekul
sekitar 4 juta. Sebagai catatan penelitian asli pada ribosom digunakan
relatif teknik mentah yang tidak dapat mengukur ukuran dalam hal berat
molekul. Sebaliknya ukuran partikel ribosom dan komponen mereka
diukur dengan tingkat mereka sedimentasi (gerakan didorong oleh
percepatan gravitasi atau percepatan sentrifugal). Sedimentasi
merupakan fungsi dari ukuran, bentuk, dan kepadatan, dengan objek
yang lebih besar cenderung sedimen lebih cepat daripada yang lebih
kecil. Ukuran objek yang diukur dalam satuan Svedberg. Ribosom
prokariotik 70 partikel S, dengan masing-masing terdiri dari besar (50
S) dan kecil (30 S) subunit. Ribosom eukariotik 80 S partikel, terdiri
dari besar (60 S) dan kecil (40 S) subunit. Unit Svedberg adalah tidak
aditif untuk partikel ukuran; hal ini disebabkan efek dari bentuk pada
sedimentasi.
4
Gambar 2.1
Sumber : Mugiyanto, 2014
Gambar 2.2
Sumber : Mugiyanto, 2014
5
c. Basis RNA
Dasar yang digunakan untuk RNA yang melekat pada
ribosa. Namun, banyak yang secara signifikan dimodifikasi dari
khas empat basa biasanya dianggap sebagai bagian dari RNA. ini
adalah terutama berlaku untuk tRNA. Basis yang dimodifikasi
meliputi pseudouracil dan versi alkohol dari sitosin dan adenin.
Perbedaan antara RNA dan DNA adalah transkripsi yang mirip
dengan replikasi DNA, hususnya dalam penggunaan substrat
trifosfat nukleosida dan template diarahkan pertumbuhan rantai
asam nukleat dalam 5'→ 3' arah. Dua perbedaan utama adalah
sebagai berikut: (1) Dengan pengecualian tahu sedikit, hanya satu
untai DNA template yang ditranskripsi, dan (2) hanya sebagian
kecil dari potensi genetik seluruh organisme diwujudkan dalam
satu sel. (Mathews van Holde, hal:956)
Ekspresi informasi genetik normalnya melibatkan produksi
molekul RNA yang ditranskripsi dari templat DNA. Rantai DNA
dan RNA mungkin kelihatan sama, perbedaan hanya terletak pada
posisi 2’ pentosa dan penggantian Tymin menjadi Urasil. RNA
merupakan satu-satunya makromulekul yang berfungsi untuk
menyimpan, mentransmisikan informasi genetik, dan sebagai
katalis. Penemuan katalis RNA atau ribozim telah merubah
defenisi dari enzim. (Shabarni Gaffar.hal:31-33)
2. Struktur RNA
Molekul RNA mempunyai bentuk yang berbeda dengan
DNA. RNA memiliki bentuk pita tunggal dan tidak berpilin. Tiap
pita RNA merupakan polinukleotida yang tersusun atas banyak
ribonukleotida. Tiap ribonukleotida tersusun atas gula ribosa,
basa nitrogen, dan asam fosfat.
6
dan uridin trifosfat (UTP). RNA disintesis oleh DNA di dalam
inti sel dengan menggunakan DNA sebagai cetakannya.
Susunan RNA terdiri atas:
1) Gugus fosfat
2) Gula pentosa (gula ribosa),
3) Basa nitrogen.
Basa nitrogen dibedakan menjadi dua jenis.
1) Basa purin yang tersusun dari Adenin (A) dan Guanin (G).
2) Basa pirimidin yang tersusun dari Sitosin (S) dan Urasil
(U).
Transkripsi adalah proses sintesis RNA dari sekuen DNA sebuah Gen oleh
enzim RNA polimerase. RNA diproduksi dengan menggunakan template/anti-
sense/non-coding strand. Sintesis RNA yang diarahkan oleh DNA terjadi pada
sel prokariota dan eukriota ; Pada sel prokariota, transkripsi terhenti tepat fase
terminasi, ketika enzim polimerase mencapai titik tersebut polimerase melepas
RNA dan DNA. Pada sel eukriota enzim-enzim memodifikasi kedua ujung
melekul pra-mRNA. Tutup terdiri guonosin trifosfat yang sudah dimodifikasi
ditambahkan ke ujung 5’ segera setelah RNA dibuat.Ekor poli (A) yang
mengandung hingga 200 nukleotida adenin dilekatkan pada ujung 3’, ujung
yang terbentuk pemotongan di arah downstream dari terminasi sinyal
pengakhir UAA / UAG / UGA. Ujung-ujung termodifikasi ini membantu
melindungi RNA dari dagradasi, dan ekor poli (A) dapat mempermudah ekspor
mRNA dari nukleus Ketika mRNA mencapai sitoplasma, ujung-ujng
termodifikasi bersama protein sitoplasma tertentu mensinyal ribosom untuk
melekat pada mRNA.
Tahapan Transkripsi
Transkripsi terjadi pada sel kariotik dan eukariotik melaui tahapan sebagai
7
berikut:
A. Transkripsi Prokariotik
B. Transkripsi Eukariotik.
Gambar 2.4
Sumber : Fried, (tanpa tahun)
9
2. Elongasi : Untaian yang sedang tumbuh memperlihatkan jejak dari
polimerase, panjang setiap untai baru mencerminkan sejauhmana enzim itu
telah berjalan dari titik awal disepanjang cetakan tersebut. Banyaknya molekul
polimerase secara simultan menstranskripsi gen tunggal akan meningkatkan
jumlah mRNA dan membantu suatu sel membuat protein jumlah yang lebih
besar.
Terminasi : Enzim polimrase ini terus melewati sinyal terminasi, suatu
urutan AAUAA didalam pra-mRNA. Pada titik yang lebih jauh kira-kira 10 – 35
nukleotida, pra-mRNA ini hingga terlepas dari enzim tersebut. Tempat
pemotongan pada RNA juga merupakan tempat untuk penambahan ekor poli (A).
10
Molekul RNA transfer ditranskripsi dari template DNA. Dalam sel
eukariotik, tRNA, seperti mRNA, dibuat dalam nukleus dan kemudian
perjalanan dari inti ke sitoplasma, di mana ia akan berpartisipasi dalam proses
penerjemahan. Dalam kedua sel bakteri dan eukariotik, setiap molekul tRNA
digunakan berulang kali, mengambil asam amino yang ditunjuk di sitosol
menyimpan kargo ini ke rantai polipeptida di ribosom, dan kemudian
meninggalkan ribosom, siap untuk mengambil lain dari asam amino yang sama.
(Campbell, dkk, 2014)
11
Gambar 17.15 Struktur RNA Transfer (tRNA). don Antico- secara
konvensional ditulis 3’ S 5’ untuk menyelaraskan dengan baik dengan
kodon ditulis 5’ S 3’ (lihat Gambar 17.14). Untuk pasangan basa,
RNA untai harus antiparalel, seperti DNA. Misalnya, antikodon 3’-
AAG-5’ berpasangan dengan kodon mRNA 5’-UUC-3’.
Gambar 2.6
Sumber : Campbell, 2014
b. Ribosom
12
(A) Model komputer yang berfungsi ribosom. Ini adalah model
dari ribosom bakteri, menunjukkan bentuknya secara keseluruhan.
Ribosom eukariotik adalah kira-kira sama. Sebuah subunit
ribosom adalah kompleks molekul RNA ribosom dan protein.
Gambar 2. 7
Sumber : Campbell, 2014
(C) Model Skema dengan mRNA dan tRNA. Sebuah tRNA cocok
13
menjadi situs mengikat bila pasangan basa antikodon dengan
sebuah kodon mRNA. Situs P memegang tRNA melekat pada
polipeptida yang sedang tumbuh. Situs A memegang tRNA
membawa asam amino berikutnya yang akan ditambahkan ke
rantai polipeptida. tRNA dibuang berangkat dari situs E.
polipeptida tumbuh pada akhir karboksil
Gambar 2.9
Sumber : Campbell, 2014
2. Membangun Polipeptida
Kita dapat membagi translasi, sintesis rantai polipeptida, menjadi tiga
tahap: inisiasi, elongasi, dan terminasi. Semua tiga tahap membutuhkan
protein "faktor" yang membantu dalam proses penerjemahan. Untuk aspek-
aspek tertentu dari inisiasi rantai dan perpanjangan, energi juga diperlukan.
(Campbell, dkk, 2014)
a. Inisiasi
Tahap inisiasi dari translasi menyatukan mRNA, sebuah tRNA yang
memuat asam amino pertama dari polipeptida, dan dua subunit ribosom
Pertama, subunit ribosom kecil mengikat kedua mRNA dan inisiator
spesifik tRNA, yang membawa asam amino metionin. Dalam teria bakterial,
subunit kecil dapat mengikat kedua dalam rangka baik; ia mengikat mRNA
di urutan RNA yang spesifik, hanya hulu dari kodon start, AUG. Pada
eukariota, subunit kecil, dengan inisiator tRNA sudah terikat, mengikat ke
5’ tutup mRNA dan kemudian bergerak, atau scan, hilir sepanjang mRNA
hingga mencapai kodon start; tRNA inisiator maka hidrogen obligasi untuk
AUG mulai kodon. Dalam kedua kasus, kodon start sinyal awal dari
terjemahan; ini penting karena menetapkan kodon reading frame untuk
mRNA. Dalam keterampilan Latihan ilmiah, Anda dapat bekerja dengan
urutan DNA yang mengkode ribosom situs di mRNA dari sekelompok gen
E. coli yang mengikat.
b. Elongasi
Pada tahap elongasi dari translasi, asam amino ditambahkan satu per satu
pada asam amino sebelumnya di C-terminus dari rantai berkembang. Setiap
Selain melibatkan partisipasi dari beberapa protein yang disebut faktor elongasi
dan terjadi dalam tiga langkah siklus dijelaskan pada Gambar 17,19. Energi
pengeluaran mendatang terjadi di langkah pertama dan ketiga. Pengakuan kodon
membutuhkan hidrolisis satu molekul GTP, yang meningkatkan akurasi dan
efisiensi langkah ini. Satu lagi GTP dihidrolisis untuk menyediakan energi untuk
langkah translokasi.
MRNA bergerak melalui ribosom dalam satu arah saja, 5’ ujung pertama;
ini setara dengan ribosom bergerak 5’ S 3’ pada mRNA. Yang penting adalah
bahwa ribosom dan mRNA bergerak relatif satu sama lain, tidak searah , kodon
oleh kodon. Siklus elongasi memakan waktu kurang dari sepersepuluh detik di
bakteri dan diulang karena setiap asam amino ditambahkan ke rantai sampai
15
polipeptida selesai. TRNA kosong yang dilepaskan dari situs E kembali ke
sitoplasma, di mana mereka akan dimuat ulang dengan asam amino yang sesuai.
c. Terminasi
16
Tahap akhir translasi adalah terminasi (Gambar 17.20). Elongasi terus
sampai berhenti kodon pada mRNA mencapai situs A ribosom. Dasar nukleotida
kembar tiga UAG, UAA, dan UGA tidak mengkode asam amino melainkan
bertindak sebagai sinyal untuk menghentikan translasi. Faktor rilis, protein
berbentuk seperti aminoasil tRNA, mengikat langsung ke kodon berhenti di situs
A. Faktor rilis menyebabkan penambahan molekul air bukan asam amino pada
rantai polipeptida. (Ada banyak molekul air yang tersedia di lingkungan selular
berair.) Reaksi ini istirahat (menghidrolisis) ikatan antara polipeptida selesai dan
tRNA di situs P, melepaskan polipeptida melalui terowongan keluar dari subunit
besar ribosom. Sisa dari perakitan terjemahan kemudian datang terpisah dalam
proses multi, dibantu oleh faktor protein lainnya. Rincian perakitan terjemahan
membutuhkan hidrolisis dua molekul GTP lagi.
17
BAB III
PENUTUP
3.1Simpulan
3.2 Saran
18
DAFTAR RUJUKAN
19