2 10/04/2013
Sequence
Filename : Avesconsenso.txt
Length : 1143 bp
Unresolved : 137 bp
GC % : 43,7 %
Upper primer
5'-position : 241
Length : 19
Sequence : 5´-CGNAACCTNCACGCAAACG-3´
3´-GCAAACGCACNTCCAANGC-5´
Tm (basic) : 58,0 ºC
Tm (salt) : 57,3 ºC
Tm (NN) : 58,1 ºC
GC % : 52,6 %
3´-tail GC % : 57,1 %
dG : -32,5 kcal/mol
3´-tail dG : -14,0 kCal/mol
Lower primer
5'-position : 840
Length : 19
Sequence : 5´-GGCGTAHGCGAATAGGAAG-3´
3´-GAAGGATAAGCGHATGCGG-5´
Tm (basic) : 58,0 ºC
Tm (salt) : 57,3 ºC
Tm (NN) : 57,3 ºC
GC % : 52,6 %
3´-tail GC % : 42,9 %
dG : -34,7 kcal/mol
3´-tail dG : -10,8 kCal/mol
PCR product
Position : 241 - 840
Length : 600 bp
GC% : 44,5 %
Tm(product) : 77,0 ºC
Tm(annealing) : 56,3 ºC
5'-CGNAACCTNCACGCAAACG-3'
::: ||| :::
3'-GAAGGATAAGCGHATGCGG-5'
dG: -3,54 kcal/mol