Anda di halaman 1dari 4

DNA Terdiri dari rantai polynucleotide

Fitur yang paling penting dari DNA adalah bahwa hal itu biasanya terdiri dari
dua rantai polinukleotida memutar sekitar satu sama lain dalam bentuk
double helix (Gambar 6-1). Bagian atas dari angka (a) menyajikan
struktur helix ganda ditampilkan dalam bentuk skema. Perhatikan bahwa jika
terbalik 180 ° (misalnya, dengan mengubah buku ini terbalik), yang
helix ganda tampak dangkal sama, karena saling melengkapi
Sifat dari dua untai DNA. Model ruang-pengisian ganda
helix, di bagian bawah dari angka (b), menunjukkan komponen
DNA molekul dan posisi relatif mereka dalam struktur heliks.
Tulang punggung setiap untai heliks yang terdiri dari bolak
gula dan fosfat residu, basis proyek ke dalam tetapi dapat diakses
melalui alur besar dan kecil.

Mari kita mulai dengan mempertimbangkan sifat nukleotida, yang mendasar


blok bangunan DNA. Nukleotida terdiri dari fosfat
bergabung dengan gula, yang dikenal sebagai 2-deoksiribosa?, yang basis terpasang.
Fosfat dan gula memiliki struktur yang ditunjukkan pada Gambar 6-2.
Gula disebut 2?-Deoksiribosa karena tidak ada hidroksil pada
posisi 2? (Hanya dua hidrogen). Perhatikan bahwa posisi pada ribosa yang
yang ditunjuk dengan bilangan prima untuk membedakan mereka dari posisi di
basa (lihat pembahasan di bawah).
Kita bisa memikirkan bagaimana dasar yang bergabung dengan 2-deoksiribosa? Dengan membayangkan
penghapusan sebuah molekul air antara hidroksil pada
1? karbon gula dan dasar untuk membentuk ikatan glikosidik (Gambar
6-2). Gula dan basis saja disebut nukleosida a. Demikian juga, kita
bisa membayangkan menghubungkan fosfat untuk 2-deoksiribosa? dengan menghapus
molekul air dari antara fosfat dan hidroksil pada
5? karbon untuk membuat 5? phosphomonoester. Menambahkan fosfat (atau
lebih dari satu fosfat) ke nukleosida menciptakan sebuah nukleotida. Dengan demikian,
dengan membuat ikatan glikosidik antara dasar dan gula, dan oleh
membuat ikatan phosphoester antara gula dan fosfat yang
Asam, kami telah membuat (Tabel 6-1) nukleotida.
Nukleotida yang, pada gilirannya, bergabung satu sama lain dalam polynucleotide
rantai melalui 3? hidroksil dari 2-deoksiribosa? satu nukleotida dan
fosfat melekat pada 5? hidroksil lain Gambar (nukleotida
6-3). Ini adalah hubungan fosfodiester di mana kelompok fosforil
antara dua nukleotida memiliki satu gula diesterifikasi untuk itu melalui
3? hidroksil dan gula kedua diesterifikasi untuk itu melalui 5? hidroksil.
Hubungan fosfodiester menciptakan, berulang gula-fosfat backbone
dari rantai polinukleotida, yang merupakan fitur biasa dari DNA. Di
Sebaliknya, urutan basa sepanjang rantai polinukleotida tidak teratur.
Ini penyimpangan serta panjang panjang, seperti yang akan kita lihat,
dasar untuk isi informasi yang sangat besar dari DNA.
Keterkaitan fosfodiester memberikan suatu polaritas yang melekat pada DNA
chain. Polaritas ini didefinisikan oleh asimetri dari nukleotida
dan cara mereka bergabung. Rantai DNA memiliki 5 gratis? fosfat
atau 5? hidroksil pada salah satu ujung dan 3 gratis? fosfat atau 3? hidroksil pada
ujung lainnya. Konvensi adalah untuk menulis urutan DNA dari
5? end (di sebelah kiri) ke 3? end, umumnya dengan 5? fosfat dan
3? hidroksil.
Struktur DNA 3
P
asam fosfat
2 'deoksiribosa

Dua Strands dari Double Helix Apakah Dimiliki Bersama oleh


Basis Pairing dalam Orientasi Anti-Paralel
Helix ganda terdiri dari dua rantai polinukleotida yang
diselenggarakan bersama oleh yang lemah, non-kovalen ikatan antara pasangan basa, seperti
ditunjukkan pada Gambar 6-3. Adenin pada satu rantai selalu dipasangkan dengan
timin pada rantai lain dan, juga, guanin selalu dipasangkan
dengan sitosin. Dua helai memiliki geometri heliks sama tetapi
pasangan basa memegang mereka bersama-sama dengan polaritas yang berlawanan. Artinya,
dasar di 5? akhir satu untai dipasangkan dengan basis di
3? akhir untai lainnya. Helai dikatakan memiliki anti-paralel
Struktur DNA 5
N
NH
N
N1
2
3
4
5
76
8
9
N
N
N
N
NH2
N NH2
N
N
NH
O
N
N3
2
1
6
5
4
N
N
NH2
N
N
H3C
O
O
O
purin
adenin
guanine
pirimidin
sitosin
timin
F IGU R E 6-4 Purin dan Pyrimidin.
Garis putus-putus menunjukkan situs lampiran
dari dasar ke gula.

orientation. This anti-parallel orientation is a stereochemical consequence


of the way that adenine and thymine and guanine and cytosine
pair with each together (see Figure 6-6).

Dua Chains dari Double Helix Memiliki


pelengkap Urutan
Para pasangan antara adenin dan timin dan guanin dan antara
sitosin menghasilkan hubungan saling melengkapi antara urutan
dari basis pada dua rantai saling terkait dan memberikan DNA-nya sendiri-encoding
karakter. Sebagai contoh, jika kita memiliki urutan 5-ATGTC?-3? pada satu
rantai, rantai sebaliknya harus memiliki urutan komplementer
3?-TACAG-5?.
Ketatnya aturan untuk pasangan "Watson-Crick" berasal
dari saling melengkapi baik dari bentuk dan sifat ikatan hidrogen
antara adenin dan timin dan antara guanin dan sitosin
(Gambar 6-6). Adenin dan timin cocok sehingga ikatan hidrogen
dapat membentuk antara gugus amino exocyclic di C6 pada adenin dan
karbonil di C4 di timin, dan juga, ikatan hidrogen dapat membentuk antara
N1 dari adenin dan timin N3. Sebuah pengaturan yang sesuai
dapat ditarik antara guanin dan sitosin, sehingga ada baik
ikatan hidrogen dan saling melengkapi bentuk dalam hal ini pasangan basa juga.
AG: pasangan basa C memiliki tiga ikatan hidrogen, karena NH2 exocyclic di
C2 pada guanin terletak berlawanan dengan, dan bisa berikatan hidrogen dengan, karbonil yang
di C2 pada sitosin. Demikian juga, ikatan hidrogen dapat membentuk antara N1 dari
guanin dan sitosin dari N3 dan antara karbonil di C6 guanin
dan NH2 exocyclic di C4 dari sitosin. Watson-Crick pasangan basa membutuhkan
bahwa basis berada di negara-negara yang mereka sukai tautomerik.
Sebuah fitur penting dari helix ganda adalah bahwa dua pasangan basa
memiliki persis geometri yang sama, memiliki A: pasangan basa T atau G: dasar C
pasangan antara dua gula tidak mengusik susunan
gula. Juga tidak T: A atau C: G. Dengan kata lain, ada sekitar
ganda sumbu simetri yang menghubungkan dua gula dan semua

four base pairs can be accommodated within the same arrangement


without any distortion of the overall structure of the DNA.