Parentesco y Endogamia
El parentesco genético es una medida de la proporción de genes que comparten
dos animales, esto como consecuencia de tener ancestros comunes. El grado de
parentesco entrega una magnitud de la confiabilidad con que el valor reproductivo o
genético de un individuo se puede predecir basado en el fenotipo de sus parientes. Otra
manera de definir parentesco aditivo es: la probabilidad de que un alelo escogido al azar
de dos animales sean copias de una alelo presente en un antepasado común.
n+ n'
⎛1⎞
∑⎜ ⎟ (1 + FA )
= ⎝ ⎠
2
RXY
(1 + FX )(1 + FY )
Donde:
n+ n'
⎛1⎞
RXY = ∑⎜ ⎟
⎝2⎠
Padres – hijos: 0,5 porque los padres pasan la mitad de sus genes a la progenie.
Abuelo – nieto: 0,25, porque el abuelo pasa la mitad de sus genes al padre, del individuo,
quien luego pasa la mitad de estos a su progenie
Medios hermanos: 0,25, porque la probabilidad de que ambos medios hermanos reciban
los mismos genes de un progenitor común es 0,25.
Hermanos: 0,5, porque los hermanos tienen genes en común a través de los dos padres.
Gemelos de un mismo embrión: 1,0, porque estos animales son genéticamente idénticos.
Es importante recalcar que estos ejemplos son válidos solamente si los animales
no son endogámicos.
n + n' +1
⎛1⎞
FX = ∑⎜ ⎟ (1 + FA )
⎝2⎠
Esta fórmula es la sumatoria de todos los senderos que unen a los padres de X
con un antepasado común.
Donde:
1 2 3
AA Aa* aa
4 5
Aa* a* a
6
a* a *
En este caso el animal 6 (a*a*) es endogámico ya que recibió del padre el alelo a*
el cual es una réplica del alelo recibido de la madre. Esto se produjo ya que los padres del
animal 6 son medios hermanos. La probabilidad de que esto ocurra, en este simple
ejemplo, es de 25%, entonces hay un 75% de probabilidades de que producto del
apareamiento de los animales emparentados 4 y 5 la descendencia no sea endogámica.
Fz = 1/2 abx Donde abx indica el parentesco genético aditivo entre los animales b y x.
azz = 1 + Fz
Esto indica que el parentesco genético aditivo de un animal consigo mismo puede
ser mas de 100% si este es endogámico.
Método Lineal
Este método se basa en el principio de que solo la mitad de los genes se pasan
desde un padre a la progenie y que la proporción de genes comunes disminuye un 50%
en cada generación. Esta metodología se basa en la fórmula de Wright.
Las reglas a seguir para calcular el grado de parentesco entre individuos z y x con
este método son:
G y H son los padres de del animal I de tal forma que este es endogámico. El
coeficiente de endogamia del animal I es:
Método Tabular
Cuando el pedigree es más complejo y hay muchos mas animales involucrados el
cálculo de endogamia y parentesco es muy difícil de obtener con el método lineal, la
posibilidad de cometer errores detectando conecciones entre animales es alta. El método
tabular, aunque es menos didáctico y mas mecánico, es más simple y fácil de programar
en un lenguaje computacional. Esta metodología entrega el parentesco genético aditivo es
decir el numerador de la fórmula de Wright. Este método se basa en el principio de que si
un animal es pariente de otro animal, el primero es también pariente de los padres del
segundo animal.
Si el parentesco de un animal (x) con los padres de otro (z) es conocido entonces
el parentesco entre x y z es:
1/2(axm + axp) donde axm y axp representan el parentesco genético aditivo del animal x con
la madre y el padre, respectivamente, del animal z.
Para la aplicación del método tabular se pueden seguir los siguientes pasos:
5) Empezando por la primera celda, calcule la cifra de cada una como el promedio de las
cifras correspondientes a cada padre del animal.
6) La tabla es simétrica entonces cuando se termina la primera fila escriba los mismos
valores en la primera columna.
8
n+ n'
⎛1⎞
∑⎜ ⎟ (1 + FA )
= ⎝ ⎠
2 a DY 0,875 0,875
RDY = = = = 0,72
(1 + FD )(1 + FY ) (a DD )(aYY ) (1,125)(1,3125) 1,215
n+ n'
⎛1⎞
∑⎜ ⎟ (1 + FA )
= ⎝ ⎠
2 aYY 1,3125 1,3125
RYY = = = =1
(1 + FY )(1 + FY ) (aYY )(aYY ) (1,3125)(1,3125) 1,3125
n + n'
⎛1⎞
∑⎜ ⎟ (1 + FA )
= ⎝ ⎠
2 a AB 0,5 0,5
R AB = = = = 0,5
(1 + FA )(1 + FB ) (a AA )(a BB ) (1)(1) 1
σxz = axz σ ga
2
- esto es el parentesco genético aditivo multiplicado por la varianza genética
aditiva ( σ ga
2
).
11
Ejercicios
3.- ¿Cuál es el parentesco genético aditivo entre usted y un medio hermano de su abuelo
paterno? Cuáles son los supuestos de su respuesta.
A A A
C D E
S S
V
T
X Y
S
W
U
Genética Cuantitativa
Características Cuantitativas
En clases anteriores se han considerado caracteres los cuales son heredados en forma
simple y su expresión es regulada por un pequeño número de genes. Estos caracteres se
conocen como cualitativos y la medición de la expresión de estos se hace en forma discreta o
categórica, por ejemplo el color blanco y rojo o blanco y negro en bovinos, presencia o
ausencia de cuernos en bovinos Hereford, presencia o ausencia de albinismo.
Características Métricas
Son muchas las características métricas que pueden ser estudiadas en animales
domésticos. Cualquier característica que cambie en forma continua y pueda ser medida,
puede ser estudiada como una característica métrica. Medidas corporales como peso y
estatura, medidas de producción, concentración de ciertas substancias de interés en la
sangre, son algunos ejemplos de características métricas. Velocidad y fuerza en equinos
están reguladas por muchos genes. La única condición es que estas se puedan medir en
forma objetiva.
Media Poblacional
Anteriormente se describieron las propiedades de una población en términos de
frecuencias génicas y genotípicas. El objetivo de esta sección es mostrar la relación entre
frecuencias génicas y genotípicas por un lado y diferencias cuantitativas manifestadas por
características métricas.
P=G+E
Donde
P = es el fenotipo o expresión que observamos o medimos de la característica (Valor
fenotípico).
G = es la influencia del genotipo en lo que observamos. Esta influencia está dada por la
dotación genética del animal. (Valor Genotípico)
E = es la influencia del ambiente en la expresión de la característica. La influencia del
ambiente son todos los efectos no genéticos que están afectando la expresión del fenotipo.
(Desviación Ambiental).
Para deducir la media poblacional es necesario volver al modelo de un locus con dos
alelos, y tres genotipos, y crear un valor genotípico ficticio para cada uno de ellos:
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M = a(p - q) + 2pqd
Si no existe dominancia:
d = 0 el segundo término desaparece y la media poblacional es:
M = a(p - q)
M = a(1 - 2q)
16
Primero hay que expresar los valores genotípicos reales desviados del punto medio
entre los dos homocigotos:
M = a(p - q) + 2pqd
Efecto Medio
En mejoramiento genético animal interesa saber cómo se transmiten los genes desde
una generación a la otra y el efecto de estos. Es necesario indicar que los animales en su
proceso reproductivo no transmiten genotipos a la descendencia, solo pasan una muestra
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aleatoria de la mitad de sus genes, no sus genotipos. Los genotipos se forman en cada
generación con el aporte de genes de los dos progenitores. Entonces el valor como
reproductor de un animal no puede ser determinado por medio de su valor genotípico ya que
este no se traspasará a la progenie.
Una nueva medida, la cual se refiere al valor de los genes y no de los genotipos debe
ser usada. Esta medida de conoce como efecto medio y se atribuye a los alelos que tiene un
animal y no al genotipo. El concepto de efecto medio es más abstracto y un poco difícil de
entender, sin embargo este concepto es fundamental para entender los mecanismos de
herencia de características cuantitativas. Efecto medio de un alelo se puede definir de la
siguiente manera:
Se debe indicar que el efecto medio depende de la media poblacional, la cual a su vez
depende de la frecuencia génica de la población y de los valores genotípicos a y d. Entonces
el efecto medio de un gen es una propiedad de los genes que está relacionada a una
determinada población. No se puede hablar del efecto de un gen sin tener como referencia
una población. En otras palabras el efecto de un mismo gen es diferente en dos poblaciones
si la frecuencia génica es diferente.
Siguiendo las explicaciones de Falconer (3ra ed, pág. 116), el efecto medio se puede
relacionar con los valores genotípicos de la siguiente manera:
Considere un locus con 2 alelos (A2 y A1). Los gametos que se pueden producir tendrán
el alelo A2 o el alelo A1 con frecuencia p y q, respectivamente. Primero se considera el alelo
A2, si se cruza en forma aleatoria con gametos de la población este puede formar el genotipo
A2A2 con una frecuencia p (porque con esa frecuencia se encuentra el otro alelo A2 necesario
para formar el genotipo A2A2) y el genotipo A2A1 con una frecuencia q. El valor del genotipo
A2A2 es a y el valor del genotipo A1A2 es d, entonces el valor promedio de los genotipos
producidos será entonces: pa + qd. Al efecto medio del gen se le resta la media poblacional,
esta se ha descrito como:
M = a(p - q) + 2pqd
Entonces el efecto medio del alelo A2, el cual se denomina alfa1, es:
α1 = qd + aq - 2pqd
α1 = q[a + d - 2pd]
En el caso del alelo A1, si se cruza en forma aleatoria con gametos de la población este
puede formar el genotipo A1A2 con una frecuencia p y el genotipo A1A1 con una frecuencia q.
El valor del genotipo A1A1 es -a y el valor del genotipo A1A2 es d, entonces el valor promedio
de los genotipos producidos será: -qa + pd. Entonces el efecto medio del alelo A1, menos la
pedia poblacional, el cual se denomina α2, es:
α2 = pd - ap - 2pqd
α2 = p(d - a - 2qd)
α2 = p(-a + d - 2qd)
Valor medio
Valores y frecuencias de los
Tipo de de los genotipos genotipos Efecto medio del
Gameto producidos producidos Media Poblacional Gen
A2A2 A1A2 A1A1
a d -a
Se puede ver que el efecto medio del gen depende de la frecuencia génica ya que p y q
están involucrados en las fórmulas. Como la frecuencia génica depende de la población
entonces el efecto medio de un gen es una medida del efecto del gen con respecto a una
población específica.
En el caso de un locus con dos alelos se pueden expresar los efectos medios de ambos
alelos a la vez en un nuevo concepto llamado efecto medio de sustitución de un gen. Esto
es la diferencia entre el efecto medio de cada alelo y se denomina alfa (α).
α = α1 - α2
α = α1 - α2
Entonces:
α= q[a + d(q - p)] - {-p[a + d(q - p)]}
α = a + d(q - p)
α1 = qα
α2 = -pα
Ejemplo: (continuación).
Con los valores dados anteriormente al calcular la media poblacional, ahora deseamos
saber el efecto medio del gen dominante, efecto medio del gen recesivo y el efecto medio de
sustitución.
α1 = 1,24 grs.
Esto significa que los individuos que recibieron el alelo A2 de uno de los padres y el otro
gen en forma aleatoria de la población (el otro alelo puede ser A2 ó A1) tendrán una media
genotípica de 1,24 gramos por sobre la media genotípica poblacional. La media genotípica
poblacional de estimó en 5,76 gramos. Entonces los animales que recibieron el gen A2 de uno
de los padres tendrán una media genotípica de:
α2 = -4,96 gramos
Esto significa que los individuos que recibieron el alelo A1 de uno de los padres y el otro
gen en forma aleatoria de la población tendrán una media genotípica de 4,96 gramos por
debajo de la media genotípica poblacional. Entonces los animales que recibieron el alelo A1
de uno de los padres tendrán una media genotípica de:
21
α = α1 - α2
Valores de Cría
Anteriormente se presentó el concepto de valor genotípico el cual en teoría es
mensurable pero en práctica no se puede medir. Solo sería mensurable en práctica en
condiciones experimentales con líneas puras o en características reguladas por un solo gen.
Para medir el valor genotípico se necesitaría un grupo de individuos con la misma constitución
genética, para una determinada característica, los cuales deben ser medidos en un ambiente
normal para la población. Un ambiente normal significa que en promedio la desviación
ambiental debe ser cero. Es obvio que esto existe solo en condiciones experimentales con
líneas puras.
para un mismo individuo de una población a otra si las estructuras genéticas de las
poblaciones son diferentes. No se puede hablar de valor genético sin tener una población
como referencia.
- un animal con genotipo A2A2: el efecto medio del gen A2 se indicó anteriormente
como α1. El valor de cría de este animal será: 2α1
- un animal con genotipo A1A2: efecto medio del gen A2 más el efecto medio del gen
A1. El valor de cría es: α1 + α2
- un animal con genotipo A1A1: el efecto medio del gen A1 se indicó anteriormente
como α2. El valor de cría de este animal será: 2α2
Con la información del ejemplo anterior los valores de cría para los tres genotipos son:
Para mostrar los conceptos de media poblacional, efecto medio del gen y valores de
cría se ha usado un modelo en el cual se considera una característica cualquiera regulada por
el efecto de un locus con dos alelos. Esto es una simplificación extrema de la realidad ya que
nuestro interés es en características métricas reguladas por un número grande (infinito en
teoría) de genes. La extensión de estos conceptos a modelos con más loci es completamente
23
posible y es lo que ocurre en la realidad. En un modelo con dos o más loci el valor de cría es
la suma de cada valor atribuible a cada locus en forma individual. Otros efectos como
interacciones entre diferentes loci han sido ignorados por ahora.
Desviación de Dominancia
Se indicó que una observación de producción de un animal se puede representar de la
siguiente manera:
P=G+E
8 – 5,76 = 2,24
El valor de cría para un animal con genotipo A2A2 fue calculado en 2,48 lo cual es
diferente de 2,24. La diferencia entre estos dos valores (0,24) es lo que se conoce como
desviación de dominancia.
Sin mostrar las derivaciones, las desviaciones de dominancia para los tres genotipos
son (Falconer, 1996):
24
G = GA + GD
Donde:
GA = es el valor de cría o valor genético aditivo
GD = es la desviación de dominancia
GD = -2q2d
GD = -(2)(0,22)(3) = -0,24
G = GA + GD
Valor genotípico
Desviación de
Genotipo Valor de Cría (corregido por la
Dominancia
media)
A2A2 2,48 -2q2d = -0,24 2,24
A1A2 -3,72 2pqd = 0,96 -2,76
A1A1 -9,92 -2p2d = -3,84 -13,76
25
G = Gx + Gz
G=2+3=5
Cuando el valor genotípico es diferente a 5 se dice que existe una interacción entre
genes en diferentes loci. Esta desviación se debe a interacción de genes en diferentes loci,
puede ser positiva o negativa.
G = Gx + Gz + Ixz
En otras palabras, interacción o epistásis ocurre cuando el efecto total de diferentes loci se
desvía de la suma de los efectos individuales de cada locus. Como en el caso de los efectos
dominantes, los efectos epistáticos no se transmiten a la progenie ya que estos se producen
debido a ciertas combinaciones de genes. La mitad de los genes que un progenitor transmite
a su progenie será una muestra aleatoria de sus genes los cuales segregan en forma
independiente.
26
Ejercicios
Media, Efecto Medio y Valor Genético Aditivo
1.- Calcule la media poblacional y el efecto medio de sustitución del gen para una población
en que los genotipos tienen valores de 18, 10 y 7 para los homocigotos al primer gen,
heterocigotos y homocigotos al segundo gen, respectivamente y con frecuencias
genotípicas de P = 0,36; H = 0,48; y Q = 0,16.
2.- Si la frecuencia génica del primer alelo es p = 0,50 el valor de a = 3 y el punto 0 es 15,
¿Cuál es el Valor Genético de los tres genotipos cuando?:
a) d = 0,0
b) d = - 0,5
c) d = 5,0
3.- Calcule la media poblacional, el efecto medio de sustitución del gen, los efectos medios
α1 y α2, los valores de cría (valor genético aditivo) y la desviación de dominancia de cada
genotipo, para las siguientes poblaciones: