Anda di halaman 1dari 4

6.2 Refer to the alligator food choice example in Section 6.1.2.

a. Using the model fit, estimate an odds ratio that describes the effect of length on
primary food choice being either “invertebrate” or “other.”
> library(VGAM)
> alligator=read.csv("alligator.csv",sep=",",header=T)
> alligator
foodchoice size
1 I 1.24
2 I 1.45
3 I 1.63
4 I 1.78
5 I 1.98
6 F 2.36
7 F 2.79
8 O 3.68
9 I 1.30
10 O 1.45
11 O 1.65
12 I 1.78
13 F 2.03
14 F 2.39
15 F 2.84
16 F 3.71
17 I 1.30
18 I 1.47
19 I 1.65
20 O 1.78
21 F 2.03
22 F 2.41
23 O 3.25
24 F 3.89
25 F 1.32
26 F 1.47
27 F 1.65
28 I 1.80
29 F 2.16
30 F 2.44
31 O 3.28
32 F 1.32
33 I 1.50
34 F 1.65
35 F 1.80
36 F 2.26
37 F 2.46
38 F 3.33
39 F 1.40
40 I 1.52
41 F 1.68
42 F 1.85
43 F 2.31
44 O 2.56
45 F 3.56
46 I 1.42
47 I 1.55
48 I 1.70
49 I 1.88
50 F 2.31
51 F 2.67
52 F 3.58
53 F 1.42
54 I 1.60
55 O 1.73
56 I 1.93
57 F 2.36
58 I 2.72
59 F 3.66
> fit=vglm(foodchoice~size,multinomial,data=alligator)
> summary(fit)

Call:
vglm(formula = foodchoice ~ size, family = multinomial, data =
alligator)

Pearson residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
log(mu[,1]/mu[,3]) -2.330 -0.5075 0.5538 0.6836 1.452
log(mu[,2]/mu[,3]) -2.687 -0.4821 -0.1653 0.7093 3.439

Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept):1 1.6177 1.3073 1.237 0.21591
(Intercept):2 5.6974 1.7937 3.176 0.00149 **
size:1 -0.1101 0.5171 -0.213 0.83137
size:2 -2.4654 0.8996 NA NA
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

Number of linear predictors: 2


Names of linear predictors: log(mu[,1]/mu[,3]), log(mu[,2]/mu[,3])

Residual deviance: 98.3412 on 114 degrees of freedom

Log-likelihood: -49.1706 on 114 degrees of freedom

Number of iterations: 5

Warning: Hauck-Donner effect detected in the following estimate(s):


'size:2'

Reference group is level 3 of the response

Terlihat pada hasil dia atas yang menjadi baseline adalah respon ke 3 yang mana
dalam hal ini adalah jenis makanan lainnya maka persamaan
𝜋̂2
𝑙𝑜𝑔 ( ) = 𝛼 − 𝛽 𝑋
𝜋̂3

𝜋̂𝑓𝑖𝑠ℎ
𝑙𝑜𝑔 ( ) = 5.6974 − 2.4654 𝑋
𝜋̂𝑜𝑡ℎ𝑒𝑟
Maka Odds rasionya adalah 𝑒 𝛽 = 𝑒 −2.4654 = 0.084975
1
Karena nilai Odds rasionya kurang dari 1, maka nilai Odds bisa dibuat menjadi 𝑒 𝛽 =
1
= 11.7682.
𝑒 −2.4654
Artinya setiap kenaikan panjang aliigator sebesar 1 satuan, maka alligator tersebut
lebih suka memilih makanan lainnya dibandingkan Fish sebesar 11.7682
𝜋
̂1
𝑙𝑜𝑔 ( ) = 𝛼 − 𝛽 𝑋
𝜋
̂3
𝜋𝑖𝑛𝑣𝑒𝑟𝑡𝑒𝑏𝑟𝑎𝑡𝑒
̂
𝑙𝑜𝑔 ( ) = 1.6177 − 0.1101 𝑋
𝜋̂
𝑜𝑡ℎ𝑒𝑟
Maka Odds rasionya adalah 𝑒 𝛽 = 𝑒 −0.1101 = 0.8957
Karena nilai Odds rasionya kurang dari 1, maka nilai Odds bisa dibuat menjadi
1 1
= 𝑒 −0.1101 = 1.1164.
𝑒𝛽
Artinya setiap kenaikan panjang aliigator sebesar 1 satuan, maka alligator tersebut
lebih suka memilih makanan lainnya dibandingkan Invertebrate sebesar 1.1164.

b. Estimate the probability that food choice is invertebrate, for an alligator of


length 3.9 meters.
Untuk menentukan estimasi peluang dari alligator yang memiliki panjang tubuh
tertentu dan memilih makanan tertentu bisa digunakan rumus sebagai berikut:
𝑒 𝛼𝑗 +𝛽𝑗𝑋
𝜋𝑗 = , 𝑑𝑒𝑛𝑔𝑎𝑛 𝑗 = 1, … , 𝐽
∑ℎ 𝑒 𝛼ℎ +𝛽ℎ 𝑋
Maka dengan rumus di atas untuk menentukan estimasi peluang dari alligator yang
memiliki panjang tubuh 3.9 meter dan memilih makanan invertebrate bisa digunakan
rumus sebagai berikut:
𝑒 1.6177−0.1101𝑋
𝜋
̂1 =
1 + 𝑒 1.6177−0.1101𝑋 + 𝑒 5.6974−2.4654 𝑋
Dengan mensubtitusikan X= 3.9 didapatkan bahwa estimasi peluangnya sebesar
c. Estimate the length at which the outcomes “invertebrate” and “other” are
equally likely.
𝜋𝑖𝑛𝑣𝑒𝑟𝑡𝑒𝑏𝑟𝑎𝑡𝑒
̂ = 𝜋̂
𝑜𝑡ℎ𝑒𝑟

𝑒 1.6177−0.1101𝑋 1
1.6177−0.1101𝑋 5.6974−2.4654 𝑋
= 1.6177−0.1101𝑋
1+𝑒 +𝑒 1+𝑒 + 𝑒 5.6974−2.4654 𝑋