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1. Título.

2. Resumen (1 o 2 párrafos).
3. Breve descripción de avances (1/2 cuartilla).
4. Cálculos realizados (1/2 cuartilla).
5. Software utilizado.
6. Recursos utilizados.
7. Lista de colaboradores.
8. Lista de artículos publicados.
9. Lista de alumnos graduados.
10. Lista de congresos nacionales e internacionales y participantes.

1.- Interacción de contaminantes metálicos con las bases nucleicas que conforman
al ADN.

2.- Se realizarán simulaciones moleculares que describan la interacción entre


contaminantes metálicos que se encuentran presentes en la atmósfera de las grandes
ciudades, con las bases nucleicas que conforman al ADN. Se ha reportado que los
contaminantes metálicos producen daños en el ADN lo cual esta relacionado con
problemas recientes de salud en los seres humanos. El objetivo de este trabajo es
describir con mayor precisión los mecanismos de reacción que puedan ocurrir entre los
compuestos metálicos y los pares de bases del ADN.

3.- Anteriormente se realizó un estudio acerca de los mecanismos de reacción presentes


entre las bases nucleicas del ADN con el sulfito de sodio (Na2SO3), el cual es un
derivado del dióxido de azufre, un contaminante atmosférico común en las grandes
ciudades. En este trabajo se encontraron mecanismos de reacción muy específicos entre
las bases A, G, C y T y el sulfito de sodio.

4.- Se realizaron simulaciones de dinámica molecular para estudiar las interacciones


entre las bases del ADN y el sulfito de sodio. Estas simulaciones se llevaron a cabo bajo
la aproximación de Born-Oppenheimer y enn cada instante de la dinámica se calculaban
las interacciones cuánticas mediante DFT lo cual requiere una gran cantidad de recursos
de cómputo.

5.- NWCHEM, TERACHEM.

6.- Simulaciones con alrededor de 64 a 120 cpus por períodos de 3 días.

7.- RSO, Tania González García, Cristian Joel Ordoñez Martínez


8.- Martínez-Zapata, D.; Rosas-Acevedo, H. & Santamaria, R.
The interaction of sodium sulfite with the DNA nucleic acid bases: A first-principles
molecular dynamics study Computational and Theoretical Chemistry, 2017, 1099, 116 -
122

9.- Actualmente me encuentro cursando el 4° semestre del Doctorado en Ciencias


Físicas.

10.- Presentación de poster titulado The interaction of sodium sulfite with the DNA
nucleic acid bases: a first principles molecular dynamics study D. Martínez-Zapata, H.
Rosas-Acevedo y R. Santamaría en el 8th Meeting on Molecular Simulations: from
simple fluids to chemical reactions Organizado por la Univ. Aut. Metropolitana,
Diciembre 7-9, 2016.

11.- Poster en el Congreso de Estudiantes del Posgrado del IF-UNAM.