RESUMEN
El ADN es una macromolécula química, ésta pertenece al grupo de los ácidos
nucleicos. Forma los cromosomas del núcleo presentes en las células y es portador
de la información genética de cada individuo. El código genético (formado por el
ADN) es un lenguaje basado en combinaciones que se pueden formar a partir de la
guanina, timina, citosina y adenina. Cualquier característica biológica está
determinada por su orden y forman un triplete; cada triplete es una palabra cifrada
o señal que conduce a un aminoácido. La extracción de ADN de las células donde
se halla confinado es un procedimiento analítico y diagnóstico emanado en
diferentes etapas y para lo cual existen en el estudio de la biología molecular
diversos protocolos; para el desarrollo de la práctica se utilizó una modificación del
protocolo “Salting-out” lo que permitió mediante la implementación de procesos de
centrifugación e incubación y el uso de algunas soluciones como buffer lisis,
proteinasa K, acetato de potasio, etanol absoluto frío y agua ultrapura, obtener 6.1
ng/µl de ácidos nucleicos, A260 = 0.121, A280 = 0.057, 260/280 = 2.13, 260/230 =
0.12. A partir de lo cual se desarrollaron y alcanzaron los objetivos planeados en la
experiencia práctica “extracción de ADN” con el fin de afianzar conocimientos de
futuros profesionales de la medicina.
ABSTRACT
DNA is a chemical macromolecule, this belongs to the group of nucleic acids. It forms
the nucleus chromosomes present in the cells and carries the genetic information of
each individual. The genetic code (formed by DNA) is a language based on
combinations that can be formed from guanine, thymine, cytosine and adenine. Any
biological characteristic is determined by its order and forms a triplet; Each triplet is
an encrypted word or signal that leads to an amino acid. The extraction of DNA from
the cells where it is confined is an analytical and diagnostic procedure emanated in
different stages and for which several protocols exist in the study of molecular
biology; For the development of the practice, a modification of the "Salting-out"
protocol was used, which allowed the use of centrifugation and incubation processes
and the use of some solutions such as buffer lysis, proteinase K, potassium acetate,
cold absolute ethanol and Ultrapure water, obtain 6.1 ng / μl of nucleic acids, A260
= 0.121, A280 = 0.057, 260/280 = 2.13, 260/230 = 0.12. From there, the objectives
planned in practical experience "DNA extraction" were developed and achieved in
order to strengthen knowledge of future medical professionals.
2. ¿Qué es TRIS-HCL?
CONCLUSIONES
Tris es el nombre abreviado del
Se cumplió cabalmente con los compuesto orgánico conocido como
objetivos planteados, extraer tris(hidroximetil)aminometano, de
nítidamente DNA de una muestra de fórmula (HOCH2)3CNH2. Se utiliza
sangre periférica. Se comprendió la ampliamente en bioquímica y biología
utilización del método de aislamiento molecular, en particular para preparar
de DNA a partir de una modificación disoluciones tampón (por ejemplo,
del protocolo “Salting-out”, como tampones Tris-HCl, Tris-Gly, TAE y
también el manejo de instrumental TBE). Es una amina primaria, con la
para esta clase de prácticas como reactividad típica, por ejemplo la
micro-pipetas las cuales nos permiten condensación con aldehídos y el
obtener cantidades exactas. Los establecimiento de un equilibrio ácido-
conceptos aprendidos en clase fueron base (responsable de su capacidad
afianzados y aclarados, tales como los tamponante).9
de lisis celular (ruptura de
membranas), utilización de buffers y
microcentrifugación entre otros. 3. ¿Qué es EDTA?
El ácido etilendiaminotetraacético,
también denominado EDTA o con
ANEXOS
menor frecuencia AEDT, es una
Cuestionario sustancia utilizada como agente
quelante que puede crear complejos
1. ¿Qué es TES? con un metal que tenga una estructura
de coordinación octaédrica. Coordina
Es una solución tampón usada con el
a metales pesados de forma reversible
propósito de romper células abiertas
por cuatro posiciones acetato y dos
para uso en experimentos de biología
amino, lo que lo convierte en un
molecular que analizan los
ligando hexadentado, y el más 6. ¿Qué es el fenol-cloroformo?
importante de los ligandos quelatos.10
El cloroformo es un líquido incoloro de
fórmula química CHCl3, dulcemente
perfumado. Hoy en día, el cloroformo
4. ¿Qué es SDS?
se usa en una variedad de procesos
El dodecilsulfato sódico (SDS o NaDS) industriales, refrigerantes y
(C12H25NaO4S), también conocido disolventes. al ser tóxico y debe ser
como laurilsulfato sódico (SLS), es un manejado con cuidado. La exposición
compuesto tensioactivo aniónico, excesiva a cloroformo puede causar
empleado en diversos productos de daños a largo plazo para la salud. El
higiene personal, como pasta de cloroformo es un líquido transparente,
dientes, champú y jabones de baño. incoloro, de olor agradable y sabor
La molécula posee una cola de 12 dulce pero produce ardor en la boca y
átomos de carbono, adosada a un la garganta. Es volátil y no es
grupo sulfato, dotando a la molécula inflamable.
de las propiedades anfifílicas
Uso industrial
requeridas para todo detergente.11
El cloroformo se utiliza en la industria
química, para fabricar plásticos o
5. ¿Qué es el acetato de potasio? teflón o en la síntesis orgánica.
¿Cuál es su estructura química? Antiguamente se usó como anestésico
y como arma.
El acetato de potasio es una sal neutra
del ácido acético y el Hidróxido de Empleado en la industria para la
potasio cuya fórmula es: CH3CO2K. limpieza como desengrasante de
Se encuentra presente en la savia de metales.
diversas plantas, al calcinarse la
En química se utiliza en la separación
madera el acetato de potasio se
orgánica.
descompone en ácido carbónico. Era
empleado en medicina como un En la fabricación de plásticos que se
fármaco con propiedades diuréticas. utiliza en el proceso de unión.
En las tecnologías de extinción de
Se utiliza como un precursor en la
incendios (de origen oleoso).
fabricación de teflón (antiadherente).
En altas concentraciones de acetato
Como anestésico
de potasio el ADN cromosomal
precipita, obedeciendo a la El cloroformo es un anestésico eficaz
reasociación inespecifica de las largas al inhalar su vapor. Deprime la
cadenas de ADN simple cadena, que actividad del sistema nervioso central.
ocurre en diferentes sitios formando Fue sustituido por éter, que es menos
una masa insoluble.12 peligroso.
Cuando se utiliza fenol-cloroformo en
la extracción del ADN, el fenol:
desnaturaliza las proteínas liofilizado o congelado, que puede
contaminantes de la muestra. Se usa romperse con un mortero, por
para eliminar la proteínas (proteasas, congelación-descongelación o usando
nucleasas...); disminuye el ultrasonidos. El lisado de células se
rendimiento de la PCR a puede extraer con cloroformo, alcohol
concentraciones del 0,2% y al 0,5% la isoamílico o fenol, siendo las proteínas
inhibe completamente. Y el y otros componentes de la célula
Cloroformo: permite la separación de solubles en el disolvente orgánico, por
2 fases; el ADN queda en la fase lo que de esta forma se logra la
acuosa y en la fase orgánica quedan separación de los ácidos nucleicos.
las proteínas y otros contaminantes.13 Este método se puede usar para
moléculas de ADN de alto peso
7. ¿Qué otros métodos de extracción
molecular, obteniendo buenos
existen?
rendimientos de moléculas
Incubación del lisado para su uso. relativamente puras, siempre teniendo
en cuenta que hay que controlar el pH
Una posible forma de aislar el ADN de la fase acuosa y la concentración
genómico es incubar el lisado crudo a de sales, que son los factores que
temperaturas entre 90 – 100 ºC y aseguran una buena separación. Las
luego usarlo directamente. Es desventajas de este método son el uso
evidente que mediante este método el de disolventes orgánicos dañinos para
ADN obtenido es de muy baja pureza la salud humana y que pueden quedar
y con aplicaciones muy reducidas. como trazas en la muestra de ADN y
Otra desventaja de este método son luego actuar como interferentes en
las pérdidas de ADN por acción de las técnicas como el PCR, que es largo,
nucleasas y otros componentes de los en ocasiones puede dar rendimientos
orgánulos que están en contacto con poco reproducibles y requiere de
el ADN y pueden destruirlo, por lo que varios trasvases que aumentan la
no es útil para almacenar el ADN pues posibilidad de contaminación de la
los contaminantes pueden degradar muestra.
las moléculas de ADN.
Lisado y purificación con un
Lisis por ruptura mecánica y detergente iónico. Método del CTAB
extracción con disolventes orgánicos
Este es un procedimiento básico para
Si se opta por realizar el lisado de las extraer ADN de vegetales, donde un
células mediante un proceso detergente aniónico puede romper la
mecánico hay que tener en cuenta la pared celular y así se produce la lisis
posibilidad de ruptura de las de las células. El uso de detergentes
moléculas de ADN que se intentan aniónicos no solo se restringe a la
separar, por lo que este debe bastar extracción de ADN vegetal, puede ser
para lograr la lisis de las células pero usado para ADN genómico de
no ser muy agresivo para proteger el bacterias y otros tipos de organismos.
ADN. Este método puede ser usado Un ejemplo de este método, quizás el
para extraer ADN de material crudo,
más conocido, es el uso de CTAB precipitar a las moléculas orgánicas.
(bromuro de cetil trimetil amonio) El precipitado formado se separa por
como detergente para lograr la lisis. El centrifugacón y luego se puede
CTAB además, en presencia de EDTA extraer el ADN de la disolución acuosa
como agente quelatante y TRIS-HCl mediante la adición de alcohol, por
como tampón, forma complejos precipitación.
insolubles con el ADN. Luego se
Este método es sencillo, pero no
extraen los residuos orgánicos con
siempre es eficaz, por lo que el ADN
cloroformo, para separar
obtenido en muchas ocasiones debe
posteriormente el ADN por
ser purificado antes de ser usado en
precipitación con etanol. Si se quiere
posteriores aplicaciones. La ventaja
evitar el uso de disolventes orgánicos
es que se elimina el uso de disolventes
se puede llevar a cabo el método del
orgánicos.
CTAB separando directamente los
complejos insolubles formados con el Uso de la proteinasa K y el
ADN del sobrenadante donde han dodecilsulfato de sodio
quedado disueltos el resto de
componentes celulares. Estos El procedimiento conocido como PK-
complejos se resuspenden en SDS por sus siglas en inglés
disolución salina y se adiciona proteinase K - sodium dodecyl sulfate,
posteriormente alcohol y RNAsa, es uno de los más usados para la
logrando que precipite el ADN con un extracción de ADN ya que la digestión
grado de pureza aceptable para de la muestra se puede realizar con
muchas aplicaciones. proteinasa K que es activada por el
dodecil sulfato de sodio. La proteinasa
Método de salting-out K inactiva las DNAsas presentes en el
lisado celular usando detergente
A partir de un lisado celular se pueden
aniónico el SDS. La proteinasa K
separar las moléculas de proteínas y
también es usada en otros de los
otros contaminantes del ADN
métodos descritos en este artículo
mediante la adición de altas
para la digestión de las proteínas y
concentraciones de sal que hacen que
otros contaminantes del lisado celular.
disminuya la solubilidad de las
moléculas orgánicas en la fase Método de extracción de ADN con
acuosa. En este método se utiliza yoduro de sodio como agente
frecuentemente la proteinasa K, el caotrópico en un único tubo
TRIS-HCl para regular el pH y otros
reactivos químicos que aseguren la La compañía Wako pone a disposición
total inactivación de las enzimas que de los investigadores y empresas
pueden actuar sobre las moléculas de varios kit de ADN que usan yoduro de
ADN. Para la extracción se utilizan sodio como agente caotrópico, que
sales inorgánicas como el perclorato tienen la ventaja de que la extracción
de sodio y el cloruro de sodio en se realiza en un único micro tubo de
concentraciones muy altas que hacen centrifugado. El yoduro de sodio
además de provocar la lisis celular
rompe la capa de hidratación que El cuerpo humano adulto tiene entre
rodea el ADN y logra que las cargas 4,5 y 6 litros de sangre. El 55% es
negativas de los grupos fosfatos del plasma, que es la parte líquida,
ADN queden más expuestas. En estos compuesta por agua, sales minerales
kits después del tratamiento de la y proteínas. El 45% restante se
muestra con yoduro de sodio en el compone de glóbulos rojos, glóbulos
mismo tubo se adicionan detergentes blancos y plaquetas. La sangre
aniónicos como es el caso del N-lauril también transporta gases, hormonas,
sarcosinato de sodio, proteinasa K y/o vitaminas, glucosa, etc.
otros reactivos que permiten separar
La sangre tiene la función de hacer
las proteínas y lípidos contenidos en
llegar el oxígeno y el alimento a todas
las muestras biológicas del ADN.
las células del cuerpo, y retirar el
anhídrido de carbono y las sustancias
de desecho.
Extracción con gradientes de cloruro
de cesio – bromuro de etidio Por la circulación sanguínea viajan
tres tipos de células:
El ADN genómico puede ser purificado
por centrifugación selectiva a través 1.- Los glóbulos rojos o hematíes.
de la generación de gradientes de También llamados eritrocitos.
cloruro de cesio. Primeramente se Constituyen aproximadamente el 40%
lleva a cabo el lisado celular por del volumen sanguíneo. Se producen
métodos mecánicos o químicos y la en la médula ósea. Son células en
mezcla es centrifugada durante varias forma de disco bicóncavo que no
horas en presencia de bromuro de tienen núcleo. En la sangre hay
etidio. Como hay bromuro de etidio en normalmente entre 4 y 5,5 millones por
el medio, se pueden visualizar las milímetro cúbico (mm3). Viven unos
diferentes capas en las que se 120 días. Su tamaño es de unas 8
agrupan los ácidos nucleicos según su micras (8 milésimas de milímetro). Su
densidad con luz ultravioleta. Se función es transportar el oxígeno
obtienen varias capas que pueden desde los pulmones hasta las células
separarse y recuperar el ADN de todos los tejidos corporales. Para
purificado. ello utilizan una proteína llamada
hemoglobina, que contiene hierro y es
Este método a pesar de dar como
capaz de trasportar moléculas de
resultado un ADN de alta calidad tiene
oxígeno. La hemoglobina es lo que da
una serie de desventajas: es largo,
el típico color rojo a los hematíes.
imposible de automatizar, caro,
Cuando por alguna enfermedad hay
requiere una ultracentrífuga y usa
falta de hematíes en la sangre se
compuestos químicos tóxicos.14
padece de anemia. El índice
8. Realizar un esquema de los hematocrito es un indicador sobre el
componentes de la sangre porcentaje de glóbulos rojos que hay
en la sangre por unidad de volumen; lo
Composición de la sangre normal esta entre 42% y 50% en
hombres y entre el 38% y 47% en defensa ante los microorganismos no
mujeres. Las características de la fagocitables, como los parásitos.
membrana de los hematíes definen los
- Linfocitos: Son los leucocitos de
grupos sanguíneos.
menor tamaño y las células del
2.- Glóbulos blancos o leucocitos. Son sistema inmunológico especializadas
células defensivas que forman parte en regular la inmunidad adquirida. Se
del sistema inmunológico. Tienen la localizan en los ganglios linfáticos. Los
función de combatir los linfocitos son los encargados de la
microorganismos y cuerpos extraños. producción de anticuerpos y de la
Se producen en la médula ósea. En la destrucción de células defectuosas.
sangre hay entre 4.000 y 10.000 Hay dos tipos: 1) los linfocitos T tienen
leucocitos por milímetro cúbico. Los una función inmunológica celular; 2)
glóbulos blancos están dispersos por los linfocitos B se encargan de fabricar
todo el cuerpo, y muchos de ellos se los anticuerpos.
adhieren a las paredes de los vasos
- Monocitos: Son las células
sanguíneos o los traspasan para ir a
sanguíneas de mayor tamaño.
otros tejidos o allí donde sean
Después de viajar por la sangre llegan
necesarios.
al tejido conectivo, donde se
Hay varios tipos de leucocitos, que se convierten en macrófagos. Su función
clasifican en: consiste en fagocitar microorganismos
y restos celulares, rodeándolos con
- Granulocitos: Son células defensivas
sus pseudópodos.
que tienen un núcleo polimorfo con
numerosos gránulos en su citoplasma. 3.- Las plaquetas o trombocitos. Son
Se clasifican a su vez en 1) neutrófilos, partículas (no propiamente células)
2) basófilos y 3) eosinófilos. Los que participan en la coagulación de la
neutrófilos son los encargados de sangre. Son necesarias para taponar
fagocitar o "comerse" sustancias rápidamente las heridas e impedir
extrañas, como las bacterias y los hemorragias. Se fabrican en la médula
agentes externos que entran en el ósea. Tienen un tamaño de 3 o 4
cuerpo; son los leucocitos más micras, son de forma oval y no tienen
numerosos y su cantidad aumenta núcleo. Suele haber entre 140.000 y
cuando hay una infección. Los 450.000 plaquetas por milímetro
basófilos segregan sustancias cúbico. Hay una enfermedad
anticoagulantes y participan en el hereditaria llamada hemofilia que
control de la inflamación. Los consiste en un déficit en la
eosinófilos son células fagocitarias coagulación de la sangre.15
que eliminan los complejos antígeno-
anticuerpo y que por su capacidad
citotóxica tienen una función de
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