department of biotechnology
2018
Instrumentation
1
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
added to a bucket of water travel slowly to the bottom of the
bucket by gravitation, but sediment much faster when the bucket
is swung around in a circle. Similarly, biological structures exhibit
a drastic increase in sedimentation when they undergo
acceleration in a centrifugal field. When designing a
centrifugation protocol, it is important to keep in mind that:
The sedimentation rate of a given particle will be zero when the density
of the particle and the surrounding medium are equal.
Types of centrifuges
separation.
2
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
o Excellent for gradient centrifugation.
pellets .
3
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
B- According to Attainable Speed :
1- Low speed :
temperature control.
swinging bucket.
rotors.
molecular weight.
3- Ultracentrifuge :
o Max ~ 10 5 rpm.
o It is the most
Ultracentrifuge
sophisticated instrument.
high vacuum.
5
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Types of Centrifugation Techniques
Isopycnic centrifugation
Rate zonal centrifugation
A- Preparative
Centrifugation
1-Differential centrifugation:
2-Density-gradient centrifugation:
7
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Rate zonal centrifugation
gradient.
The sample has a density greater than all the layers in the
solution.
8
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Isopycnic centrifugation
is a choice.
9
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Safety parameters:
4- Close lid.
10
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
2-Chromatography
Chromatography is a physical method of separation in
direction.
sample components:
Kd =
11
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Classification of Chromatography
A- On the basis of
B- On the basis of C- On the basis of
interaction of
chromatographic physical state of mobile
solute to the
bead Shape. phase
stationary phase
1- Two Dimensional:
1- Adsorption chromatography 1-Liquid Chromatography
i- Paper Chromatography.
2- Ion Exchange Chromatography 2-Super Critical Fluid
ii-Thin Layer Chromatography(TLC)
3-Partition Chromatography. Chromatography
2-Three Dimensional:
4-Size Exclusion Chromatography
3-Gas Chromatography
i-Column Chromatography
12
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
1- ION-EXCHANGE CHROMATOGRAPHY
industrial processes.
2-anion exchangers.
13
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
We use beads( )خرزاتof polymeric particles sucha as Cellulose
as stationary phase.
stationary phase .
as stationary phase .
14
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
The charge of carboxy methyl cellulose is negative (-ve).
1- Equilibration.
3- Elution.
4- Regeneration.
stationary phase.
15
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
When equilibrium is reached all stationary phase
16
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
The sample buffer should have the same PH and ionic
composition.
17
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
In order to desorb the bound proteins.
18
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
2-Gas chromatography (GC)
Stationary phase is an
volatile liquid.
In gas chromatography, a
19
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
It is well suited for use in the petrochemical, environmental
20
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
3-HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY (HPLC )
21
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
In HPLC the sample is forced by a liquid at high pressure
22
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Types of HPLC According to Mode of Separation
hexane
Mechanism:
23
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Mechanism:
column.
24
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Spectroscopic techniques الحقىيات الطيفية
light to interact with matter and thus المادة وبالتالى التحقق من مميزات
محددة للعينة وذلك لدراسة قوامها
probe certain features of a sample to
اوتركيبها
learn about its consistency or
each other.
25
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Frequency ( الترددν):
types of EM radiation.
26
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Types of Spectroscopy
Spectroscopy.
27
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
1- UV–VIS SPECTROSCOPY
gaseous samples.
800 nm.
Ethylene group .
28
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Instrumention
29
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
2-Double beam instrument جهاز مزدوج الطيف
4. Detector الكشاف
30
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
1. Light Source
3. Stable output.
A- UV source:
B- VIS. Source
o The tungsten filament lamp is
31
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
C- Xenon Source :
them.
32
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
3. Optical System (monochromator )موحد االطوال الموجية:
Components :
1-Entrance slit.
2-Dispersion device.
3- Exit slit.
Dispersion device:
1-Prisms :Simple glass prisms are used for visible range. For
33
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
2-Gratings محزوز الحيود: are often used in the monochromators of
34
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
الكشاف 4. Detector
give:-
هذا النوع من الكشفات عبارة عن خلية ضؤية التى درستها بالمرحلة الثانوية وتقوم بقياس شدة الضوء الساقط عليها وتحولها الى طاقة او
اشارة يمكن قياسها .
35
كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة)
استخدامات او تطبيقات APPLICATIONS OF U.V. SPECTROSCOPY
2- Structure elucidation of organic compounds توضيح الصيغ التركيبية للمركبات العضوية
36
كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة)
Mass spectrometer (MS)
مطياف الكتلة
organic compounds.
37
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Since it takes ~ 100 Kcal of energy to cleave a typical S
-oligonucleotides
38
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
2- Environmental analysis:
- Pesticides on food
3- Pharmaceutical analysis :
- Bioavailability studies.
1- Vaporization التبخير:
2- Ionization التايين:
39
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Electron beam ionize the molecule the species formed
molecule .
M +*
40
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
3- Acceleration التسريع او التعجيل
4- Deflection االنعطاف
5- Detection الكشف
Ions of increasing mass reach the detector one after another, and
41
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة
Ionization methods
42
)كلية العلوم والموارد الطبيعية قسم التقنيات الحيوية – جامعة الجفارة (االجهزة