TINJAUAN PUSTAKA

Menganalisis sampel dengan PCR adalah rutinitas di lab. Pendekatan baru

memungkinkan peneliti melakukan pengujian ini dimanapun mereka butuhkan.
Penelitian biomedis yang bekerja di lapangan menghabiskan banyak waktu
mereka di luar, dan mereka membutuhkan instrumen mereka bersama mereka.
Sekarang ada cara baru bagi mereka untuk diterapkan peristiwa polymerase chain
reaction (PCR) ketika tidak ada bangku lab klasik atau outlet listrik terdekat.
Mereka membutuhkan ini pendekatan PCR mobile karena sampel dapat
menurunkan perjalanan dari lokasi terpencil kembali ke lab. Dan dalam banyak
pengaturan, para ilmuwan dan kolaborator mereka ingin bertindak pada hasil
dengan cepat. Perangkat dan pendekatan baru dan portabel biarkan para ilmuwan
mencari pasangan genetik tertentu-rial dalam sampel mereka saat mereka berburu
patho-gens yang mempengaruhi ekosistem dinamis, layar orang yang bermigrasi
untuk penyakit menular atau menganalisis kondisi air yang berubah dengan cepat
tions. Beberapa perangkat adalah prototipe; yang lain sudah dijual. Beberapa
desainer menggunakannya instrumen PCR standar, yang lain punya
mengembangkan perangkat keras miniatur baru dan yang lain menghindari
menggunakan instrumen sepenuhnya. PCR di pedesaan Kamboja Pada 2013,
menurut World Health Organisasi, ada sekitar 198 mil- kasus singa malaria dan
sekitar 580.000 kematian terkait di seluruh dunia. Pengobatan dan pencegahan
telah menyebabkan penurunan malaria kematian: ada 4,3 juta lebih sedikit
kematian antara 2001 dan 2013 dibandingkan dengan apa mungkin terjadi jika
insiden itu terjadi tinggal di level 2000. Lima spesies parasit
mampu menginfeksi orang dengan malaria, di antaranya Plasmodium falciparum
adalah yang paling banyak mematikan. Tapi malaria tetap sulit diberantas,
untuk banyak alasan. Bahkan saat transmisi dari parasit Plasmodium melalui mos-
nya vektor quito jauh lebih rendah, misalnya di Kamboja, reservoir parasit tetap
ada. Waduk ini terinfeksi tetapi asimtom- orang atic dengan tingkat parasit rendah
di darah mereka. Pembasmian malaria lengkap, kata Didier Ménard, sebuah

5
 6

epidemi molekuler ologist di Institut Pasteur di Kamboja, berarti menemukan

orang-orang ini, khususnya migran. “Saat mereka bergerak kita perlu menguji dan
mengobati dalam penundaan seminimal mungkin, ” kata Ménard. Mendeteksi
kepadatan parasit yang rendah — juga disebut parasitemia — yang melibatkan
micros- pemeriksaan berbasis salinan darah dan PCR- berdasarkan tes,
membutuhkan 5-7 hari, jangka waktu itu termasuk pengiriman sampel ke pusat
lab tral. Ménard dan rekan-rekannya menemukan cara melakukan tes di lapangan
dan mendapatkan hasil dalam 48 jam untuk perjalanan mereka melalui desa-desa
miskin di Ratanakiri wilayah di Kamboja timur, di mana malaria adalah
penyumbang kematian bayi yang tinggi menilai. Listrik ada baik tidak teratur atau
benar-benar absen1. Bekerja sama dengan sebuah perusahaan bernama FEMIL,
para peneliti dirancang dan dibangun laboratorium keliling, semacam kontainer
pengiriman dengan denah lantai sekitar 15 meter persegi dan itu bisa digandeng
oleh truk. Truk mengakomodasi generator listrik, dan lab bergerak memiliki ruang
untuk kantor, par- ruang budaya asite dengan freezer, dan mikroskop. Ada yang
terpisah ruang khusus untuk tes PCR: memegang dua instrumen PCR real-time
sebagai serta dua instrumen PCR lainnya dan ahood dengan spektrofotometer
UV1.
Para peneliti mengembangkan tes untuk mendapatkan hasil genus-
spesifik untuk empat spesies Plasmodium berdasarkan Gen penyandi basa
sitokrom klomodium. Mereka pertama kali menggunakan PCR untuk menemukan
sampel positif untuk malaria dan kemudian lakukan putaran kedua PCR dengan
primer spesifik spesies. Ménard dan timnya melakukan perjalanan ke hampir 100
komunitas timur Kamboja, pengujian antara 200 dan 300 sampel dan 40 sampel
kontrol kualitas sehari di mereka lab seluler. Dari tusukan darah, kata Ménard, tes
PCR mendeteksi level serendah satu parasit per 5 mikroliter (µl) darah. Dalam
pandangannya, karya mereka menunjukkan kelayakan mendeteksi tingkat infeksi
yang rendah dalam skala besar dan bergerak, yang seharusnya membantu
memberantas malaria di daerah tertentu. Mengadministrasikan obat untuk banyak
orang independen dari status infeksi risiko meningkat
 7

resistansi obat, kata Ménard. Ponsel ini strategi hanya menemukan orang yang
membutuhkan untuk diperlakukan dan karena itu menghemat waktu dan uang,
katanya. PCR Lautan Ketika tingkat bakteri tinggi di laut air dekat dengan pantai,
pejabat masyarakat pasang tanda peringatan untuk perenang. Tetapi proses
pengujian terlalu lama. Para ilmuwan di California Selatan Proyek Penelitian Air
Pesisir (SCCWRP), agensi publik yang mengembangkan dan mengevaluasi-
teknologi ates untuk pemantauan laut, adalah menjelajahi cara menggunakan PCR
digital droplet (ddPCR) untuk mendeteksi kontaminan mikroba dalam air lebih
cepat. Bersama dengan Institut Penelitian Akuarium Monterey Bay dan Arizona
State University, mereka berkembang- oping teknologi ddPCR seluler baru.
Mereka ingin melengkapi perangkat baru dengan kemampuan mengirim hasil ke
lab. Tim mengharapkan untuk memiliki prototipe instrumen capa- Lebih dari
telemetri ini akhir tahun ini, kata John Griffith, seorang ahli mikrobiologi dengan
SCCWRP. Di antara tugas validasi yang dia rencanakan adalah untuk menguji dan
bandingkan hasilnya dengan hasil dari Bio-Rad benchtop ddPCR instrumen.