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UNIVERSIDAD SAN PEDRO

FACULTAD DE MEDICINA HUMANA

ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE MEDICINA

GUIA PRACTICA DE GENETICA E

INTRODUCCION A LA
EMBRIOLOGIA

PRACTICA 3

Autor:
MD. CALDERON CHAVEZ JUAN CARLOS T.

Coordinador de Asignatura

Año
2018
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Capacidad específica:

El estudiante explica las características de la información genética, mediante la

exploración de los genes en el genoma humano, demostrando predisposición al
aprendizaje, responsabilidad, pensamiento crítico, creatividad y trabajo en equipo

Objetivos:

a) Explorar los genes relacionados a la Diabetes Mellitus Tipo II

Requisitos:

a) Todos los estudiantes deben venir leyendo la presente práctica, dicha lectura debe ser
complementada con sus libros base.
b) Todos los estudiantes deben traer sus mapas conceptuales relacionados con los
contenidos de la presente semana.
c) Identificar en las páginas web sugeridas en el silabo los 02 genes más relacionados a
la Diabetes Mellitus Tipo II.
http://www.malacards.org/card/diabetes_mellitus_noninsulin_dependent
d) Traer impresas las fichas informativas de los genes identificados.

Materiales:
Por cada grupo de práctica se constituirán 02 equipos de como máximo 7 integrantes
cada uno; cada equipo de los grupos de práctica deberá contar con lo siguiente (todos
los materiales solicitados se traen al aula, no se concederá permiso para salir a
adquirirlos, para ello se entrega la práctica con anticipación):

a) Ficha Técnica de los genes relacionados a Diabetes Mellitus Tipo II.

b) 02 Laptops por grupo de práctica con el programa de Powerpoint instalado.
c) 01 copia individual de la práctica, así como también 01 copia adicional para ser
entregada al docente como practica grupal.

Conceptos Básicos:

1. Generalidades:

1.1. Conceptos de "gen"

No hay una definicion unica para “gen” El concepto tradicional, derivado del
estudio de los rasgos externos del organismo (fenotipo) y del estudio de las
genealogias, es el de una unidad heredable, que puede mutar y ocasionar cambios
en los rasgos o fenotipo. Esa unidad, para ser un gen nuclear, debe pertenecer a un
mapa de ligamiento (que es la representacion de un cromosoma, vease cap. 11 de
Solari), donde presenta un lugar o “locus” Por otro lado, los estudios moleculares
han llevado a un concepto util de un gen, como un segmento de molecula de ADN
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que contiene una unidad de transcripcion y sus secuencias de bases reguladoras

principales (“promotor”) Esta ultima definicion no implica que esas unidades
codifiquen proteinas, aunque muy frecuentemente sea asi, porque un numero de
unidades de transcripcion codifican ARN que no se traducen en proteina smo que
son “estructurales” o “reguladores” los ARN ribosomicos y los de transferencia son
un ejemplo; los ARN “nucleares pequenos” (ARNnp=snRNA) que intervienen en
el procesamiento del ARN transcripto original, llamados U, son otro ejemplo; el
producto del gen XIST es otro mas. Por otra parte, no hay una relación clara y unica
entre la definicion tradicional y la definicion molecular citadas. Asi, varias
mutaciones de un unico “gen” (definido como segmento de ADN) pueden
determinar cambios fenotipicos diferentes, tales como variantes graves y leves de
enfermedad, o aun enfermedades diferentes (como las diversas mutaciones del RA.
receptor de androgenos, que provocan feminizacion testicular o atrofia muscular
espinobulbar).
Tampoco la definicion molecular esta libre de imprecisiones. La presencia de
unidades de transcripcion, insertadas dentro de intrones en algunos casos, parece
indicar la presencia de genes anidados uno dentro de otro. Por otra parte, el
procesamiento (empalme) alternativo de ARN puede servir para producir
polipeptidos diferentes provenientes de la misma unidad transcripcional. Sin
embargo, con el fin mas didactico de enumerar genes, puede considerarse una
definicion molecular restringida a genes de proteinas: gen seria aquel segmento de
ADN que contiene una unidad de transcripcion que puede ser traducida en una o
varias secuencias polipeptidicas. De esta manera se cuentan comoun solo gen
aquellos segmentos de ADN cuyo transcripto de ARN puede ser cortado y
empalmado en mas de una secuencia de aminoácidos.

1.2. El proyecto ENCODE y los cambios en el concepto de gen:

En 2003 el Instituto Nacional de la Salud de los Estados Unidos inicio un proyecto

cuya primera fase termino en 2007 y se prolonga hasta la actualidad, y que
constituye en cierta forma una continuación del Proyecto Genoma Humano. El
objetivo de este proyecto es identificar todos los elementos funcionales del ADN
humano, como lo establece su nombre (ENCyclopedia Of DNA Elements) Como
consecuencia de los resultados de ese proyecto, se han producido importantes
cambios en los conceptos de la información genética humana. En primer lugar, se
ha confirmado que el transcriptoma humano es muy grande, es decir que el número
de transcriptos es mucho mayor que el número de genes humanos. El número de
genes humanos codificantes de proteína es de solo 22.726, casi igual al número de
genes codificantes de proteínas del gusano pequeño (mide 1 mm) Caenorhabditis
elegans. Es decir que, a pesar de una diferencia de tamaño genómico de unas 30
veces y de una enorme disparidad de estructura y funciones, el número de genes de

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proteína es prácticamente el mismo, lo cual desde ya excluye al número de genes de

proteína como un indicador de mayor complejidad biologica.
Por otro lado, la gran cantidad de ARN transcriptos por el genoma humano indica
que esas secuencias anteriormente consideradas como “desperdicio” no lo son
tanto, porque el genoma se transcribe en más de un 90%. El examen de los
transcriptos globales deparo sorpresas, porque la mayoría no estaban destinados a
codificar proteínas, pero eran sintetizados por la misma polimerasa II, y se
superponían con los genes de proteínas, empezando antes y terminando mucho
después de esos genes, como si la polimerasa hiciera una síntesis que fue llamada
traspasante (“pervasive”) Los transcriptos no proteínicos son estables y
comprenden más de la mitad del transcriptoma humano conocido, tienen expresión
en tipos celulares específicos, pueden ser procesados y empalmados y pueden tener
colas poliadeniladas, todas características que sugieren un significado funcional. En
realidad, un número creciente de estos ARN ha demostrado ser funcional, estas
observaciones han cambiado la actual concepción de los genes humanos, porque ya
no es factible reducirlos a los codificantes de proteínas y de ARN estructurales
como los ARN ribosomales, sino que actualmente se está reviendo el concepto de
gen, como una unidad definida básicamente por su trasncripto y su funcionalidad.
De acuerdo con estos conceptos más recientes un gen (en general) sería una
secuencia genómica (de ADN o ARN) que codifica directamente moléculas
funcionales, ya sean ARN o proteinas.

1.3. Numero de Genes en el Genoma Humano

E1 número de genes del genoma humano no se conoce con precisión. Se han

realizado estimaciones basadas en diversas hipótesis, que dieron resultados, antes
de la finalización de la secuenciación del ADN humano, en un número de genes del
genoma humano fluctuante entre 25.000 y 30.000; la cifra actual más probable es la
de 25.000 genes aunque como se dijo más arriba los genes estrictamente
codificantes de proteína son 22.726. Un tipo antiguo de estimaciones del número de
genes se basa en el concepto de carga mutacional. Las mutaciones que no son
estrictamente neutras (polimorfismos) y que producen algún deterioro o desajuste,
se suman para constituir la carga mutacional total promedio en la especie humana.
Si se acepta que la tasa promedio de incidencia de nuevas mutaciones en células
germinales por generación y por “locus” (gen) oscila alrededor de 10(-5), un número
de genes mayor de 105 determinaría más de una nueva mutación desfavorable por
cada individuo por generación en la especie humana, lo cual es claramente
inaceptable para mantener la especie (una cifra un poco menor de una mutación,
por individuo y por generación, es aceptable, porque no necesariamente se
acumulan). Otro tipo de estimación se basa en la proporción del genoma que es
transcripta; esta proporción es muy variable de célula en célula, pero, considerando
los tejidos que tienen mayor cantidad de unidades transcripcionales activas, se

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llegaba antes del estudio del transcriptoma a un porcentaje del 5% del ADN. Esta
cantidad ADN, dividida por la longitud promedio de los genes conocidos, también
conduce a una estimación que no sobrepasa los 30.000 genes. La finalización del
Proyecto Genoma Humano en 2003 ha permitido poner cierto límite pero no
definir totalmente el número de genes humanos que oscila alrededor de 25.000. Si
se toman promedios, esto significa existencia de un gen cada 80-90 kb de ADN
humano; pero, sin embargo, hay grandes variaciones de una región a otra. Otro
indicador útil para la detección de muchos de los genes es la presencia de las islas
CpG (citosina- fosfato-guanina), también llamadas HTE (por Hpall tiny fragments,
por ser cortadas en segmentos pequeños por la citada enzima de restricción), que
son secuencias con cantidades esperables en la frecuencia del di nucleótido CG (el
resto del genoma esta empobrecido de este di nucleótido), con la citosina libre de
metilación, y de alrededor de 1 2 kb de extensión, que se encuentran generalmente
previas a la región inicial (5’) de un gen (no todos los genes tienen “islas CpG”
asociadas; son más frecuentes en los genes de mantenimiento” o de función
continuada en todos los tipos celulares). Una estimación del número de islas CpG
en el genoma humano permitiría también predecir una cifra total de genes de
proteína) parecida a la citada anteriormente.
Sin embargo, como se dijo más arriba, el concepto aceptado de gen como
codificante de proteína está siendo restringido a solo un tipo de gen, los genes de
proteínas. En la actualidad se toman en cuenta también los genes de ARN, no solo
los ARNr y los ARNt, sino también los “ARN largos no codificantes de proteína”
que tienen funciones reguladoras y de otros tipos, de manera que el número total de
genes (de proteína mas de ARN) es todavía incierto. En 2009 el Centro Nacional
de Biotecnologia de los Estados Unidos tenía un listado de 34.596 genes
funcionales, que incluyen muchos que se transcriben y no codifican proteínas.

1.4. Esquema General de un Gen Humano de Proteina:

Un gen promedio contiene segmentos discontinuos de ADN codificantes de

aminoacidos, denominados exones, separados por secuencias no codificantes de aa,
los llamados intrones o secuencias intercaladas; la region que se transcribe o unidad
de transcripcion incluye, ademas de los exones e intrones, una secuencia
relativamente corta que antecede al primer exon, denominada secuencia anterior no
traducida (SANT), o secuencia no traducida en 5’, y ademas contiene, con
posterioridad al ultimo exon, una secuencia que a veces es de considerable longitud,
la secuencia posterior no traducida (SPNT), o secuencia no traducida en 3’, que
contiene la senal de poliadenilacion del transcripto primario. Ademas de la unidad
transcripcional en si misma, el esquema general de un gen debe comprender las
secuencias reguladoras inmediatas (promotor) y alejadas (intensificadores y/o
silenciadores) de ese gen, para que el concepto sea el de una unidad funcional.

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Esquema general de un gen humano que contiene 3 exones, sus intrones I y II, su region SANT
(secuencia anterior notraducida), su region SPNT (secuencia posterior no traducida), esta ultima con
la senal de poliadenilacion (n), la region promotora con sus secuencias proximales (TATA) y distales
(CG y CAAT). A una distancia variable se encuentra la secuencia “intensificador” Los tripletes de
iniciacion (ATG = AUG en transcripto) y uno de los de terminacion (TGA = UGA en transcripto)
estan senalados por uno y dos asteriscos, respectivamente. En los intrones, las senales de corte y
empalme estan senaladas por barras ([ y ]]). El sitio de la “caperuza” (nucleotido +1 de! transcripto)
se senala con un acento circunflejo (^). Por convencion, siempre se representa la cadena no molde o
“de sentido” del ADN en un sitio determinado de su molécula.

1.5. Secuenciacion de ADN (ADN genómico y ADN complementario)

De lo descrito en los parrafos anteriores, se deduce el gran interes que tiene obtener
la secuencia completa de bases de cada molecula de ADN representada en cada
cromosoma humano. La secuencia de bases completa de un cromosoma permite en
principio, identificar y localizar todos los genes situados en ese cromosoma,
conocer su estructura y hasta predecir que polipeptido codifica cada gen de
proteina. Se identifica un gen (de proteina) cuando, en una larga secuencia de bases
de ADN, se encuentran sus elementos constitutivos basicos: un marco abierto de
lectura (MAL), precedido general mente por las secuencias tipicas reguladoras de
un promotor, y que es una secuencia de tipo conservada (es decir que en especies
filogeneticamente cercanas se encuentra una secuencia muy parecida) Se localiza el
gen en forma absoluta, dentro de la secuencia total de bases; pero además se lo
localiza en forma relativa, o sea en relación con otros genes ya conocidos y cuya
secuencia se conoce, con lo cual puede medirse la distancia en pares de bases que lo
separan de un gen conocido o de un “marcador” (vease cap. 11 de solari), es decir,
se lo situa en un “mapa fisico” o mapa de secuencias de bases; se conoce su
estructura, esto es, cuantos y que tipo de exones e intrones tiene, como son las
senales en sus regiones no traducidas (SANT y SPNT, véase antes) y que tipo de
region promotora posee; finalmente, de las secuencias de los exones se deduce,
hasta cierto punto, que polipéptidos codifica cada uno, usando las reglas del código
genetico. Sin embargo, para este ultimo fin es mas util conocer la secuencia de
bases del ADNc (ADN complementario) respectivo, porque este representa
directamente el mensaje expresado por el gen. Si se recuerda (vease cap. 2 de
solari) que los ADNc se obtienen experimentalmente en el laboratorio mediante la
transcriptasa inversa que copia la secuencia de bases de un ARNm, es obvio que un
ADNc contiene exactamente la informacion codificada de todos los exones del gen,

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habiendose liberado de los intrones y de las secuencias reguladoras previas, por lo

cual la secuencia del polipeptido codificado es directamente legible.
La secuenciacion del ADN genomico humano no localiza facilmente los genes,
puesto que el genoma contiene grandes cantidades de ADN intergenico de variada
naturaleza (vease cap. 6 de solari), lo cual hace que existan regiones “pobres” en
genes y otras relativamente enriquecidas, que son las mas atractivas para los
investigadores. La secuenciacion total de todas las moleculas de ADN humanas fue
el principal objetivo del Proyecto Genoma Humano, iniciado en 1990 en los
Estados Unidos. Desde el ano1995 se acelero su velocidad, en consecuencia ya
existe un numero considerable de regiones (cada una de ellas pequena) totalmente
secuenciadas en muchos cromosomas humanos, por lo que se considero que en un
plazo de dos a cinco anos se poseeria el mapa total de secuencias de varios
cromosomas humanos, entre ellos el cromosoma 22, el 16, el 19, el 21 y el X y el Y
ll. Este avance fue mas rapido de lo esperado, y en 2001 se tuvo un “borrador” de
las secuencias y en 2003 el resultado completo.

Actividades:
1. Se constituirán 02 equipos por cada grupo de práctica como máximo de 7 cada uno y
procederán a leer el marco conceptual de la presente práctica.
2. Luego discutirán sus mapas y procederán a diseñar y elaborar un mapa conceptual
grupal en Powerpoint.
3. Cada equipo sustentara 01 gen de los 02 solicitados como requisito, estos serán
designados en clase. Para esta actividad se elegirá al azar a 2 miembros.
4. Se elegirá al azar un solo miembro por equipo para que proceda a sustentar.

Información a recolectar en la ficha de los genes solicitados:

1. Frecuencia de presentación en los pacientes con Diabetes Mellitus Tipo 2
2. Cromosoma en el que está ubicado (dibujar el cromosoma de acuerdo a la
página web)
3. Locus
4. Símbolo y Nombre del gen
5. Tamaño del Gen.
6. Distribución de sus partes
7. Proteínas que traduce
8. Tamaño de las proteínas
9. Función de la proteína

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