por décadas, la , especies acidogenic azúcar fermentación sujetos enfermos [11] . Un obstáculo importante para determinar la etiología de la caries
Estreptococo mutans ha sido considerado el principal causante agente de la dental es que muchas muestras no fueron tomadas del sitio de la enfermedad en sí,
caries dental y la mayoría de diagnóstico y terapéutico estrategias se han sino de otras muestras, no invasivas tales como la saliva, que no representa la
orientado hacia este microorganismo. Sin embargo, la reciente ADN y microbiota cariogénico ( Recuadro 1 ). Sin embargo, en un trabajo seminal, Aas y
RNAbased Los estudios de lesiones de caries han descubierto una colaboradores obtuvieron más de 1200 clones del gen 16S rRNA de las placas dentales
extraordinaria diverso ecosistema donde S. mutans y lesiones de caries en diferentes etapas de la enfermedad [12] . Este trabajo mostró que
cuentas sólo una pequeña fracción de la comunidad bacteriana. Esta apoya la concepto
de que los consorcios formado por múltiples acto microorganismos colectivamente, S. mutans no podría ser PCR amplificado en una fi no puede proporción considerable de
probablemente sinérgicamente, a iniciar y ampliar la cavidad. Por lo tanto, los muestras y otras bacterias tales como Atopobium, Prevotella, y Propionibacterium parece
antimicrobianos Las terapias no se espera que sean eficaces en el tratamiento de la estar asociado con la enfermedad. Un trabajo reciente ha añadido wiggsiae Scardovia como
caries y otros enfermedades polimicrobianas que no siguen Los postulados de Koch un nuevo agente etiológico de la caries severas en la primera infancia [13] . En los últimos
clásica. años, el uso de secuenciación y metagenomic técnicas de segunda generación ha
descubierto un ecosistema extraordinariamente diversa donde
El primero de estos estudios basados en ARN en la superficie de los dientes [18] estudiado las
comunidades microbianas activos en LMS bio fi orales antes y después de una comida, la
indican que diferentes consorcios microbianos se forman en la placa dental de los diferentes
y bi fi dobacterias [9] . los introducción de enfoques moleculares para el estudio de la individuos. Por lo tanto, la determinación de la microbiota activa en las lesiones de caries puede fi
humana microbioma revelaron que la oral ecosistema es habitado por cientos de especies nalmente desentrañar la etiología difícil de alcanzar de la enfermedad, allanando el camino para
bacterianas [10] , La mayoría de los cuales son considerado comensales, y que especies considerado
las herramientas de diagnóstico y preventivos.
como patógenos se encuentran frecuentemente en saludable individuos, aunque a niveles
más bajos que en
géneros en una presencia de más de 1% en ambas lesiones del esmalte y la dentina. Sin [25] . Por ejemplo, S. gordonii modula la formación de bio fi lm de Candida albicans y Candida
embargo, cada lesión parece albergar una combinación diferente de las bacterias. Sólo carga en la diversidad orales uido fl bacteriana y resistencia a antibióticos
hubo un caso en el que la lesión estaba dominado por un solo género bacteriano (revisado en
(marcado como muestra CA085, el diente 47 en la figura). esta excepcional ejemplo involucrado
[26] ). Además, los virus pueden jugar un papel vital en la formación de las poblaciones
Lactobacillus, que se encontró que representan el 99% de la población basada en ARN en microbianas [27] , Pero esto no ha sido bien estudiado en entornos orales [27] . En la lista
una oculto dentina cavidad (55% de las lecturas tenía similitud máxima a Lactobacillus putativa de bacterias asociadas a la caries reveladas por este enfoque
gasseri, pero otras tres especies de lactobacilos fueron presente). Sin embargo, todas las metatranscriptomic, S. mutans
otras muestras mostró diverso bacteriano composiciones que variaban dramáticamente Entre
individuos, incluso dentro de la misma caries Tipo de lesión ( Figura 1 ). La diversidad cuentas para 0,02% de los microorganismos activos en cavidades de dentina ocultos, 0,48%
bacteriana estimado estaba bajo para las lesiones de caries de esmalte, con un promedio en cavidades dentinales abiertos, y 0,73% en las lesiones de caries de esmalte [20] . Por lo
de 177 a nivel de especies filotipos por muestra, y la más alta de 'abierto' cavidades de tanto, aunque hay evidencia sustancial de que S. mutans se asocia con un riesgo de caries,
dentina que fueron expuestos a la vía oral cavidad, que tuvo un promedio de 251 otras especies surgen claramente como principales actores de la comunidad microbiana,
especies por muestra. Esta sugiere que las cavidades dentinales abiertos tienen una incluyendo Veillonellas, Rothia, y
entrada de microorganismos de la saliva, incluso si el bio película formada en la parte
superior de la lesión es eliminado de la muestra, como fue el caso aquí. cavidades de Leptotrichia en la caries de esmalte y Streptococcus sanguinis, Atopobium, Schlegelella,
dentina 'ocultos', que tienen casi ningún en contacto con la cavidad oral a excepción de Pseudoramibacter, y Lactobacillus en la caries de la dentina. Algunas de estas bacterias
una lesión mínima a través de esmalte, tenía un número estimado de especies a nivel filotipos están pobremente caracterizados, como ejemplificado por el género Schlegelella, en el
de 201 [20] . La observación de que múltiples especies son detectado por su ARN en las que el 16S rRNA secuencias ed fi identi en este y otros estudios [28] indican que este
lesiones de caries inequívocamente demuestra que están vivos y apoya la concepto que microbio oral de caries asociadas es una especie diferente de los dos únicos organismos
los consorcios formados por múltiples microorganismos actúan colectivamente para aislados en este género que en la actualidad se describen, tanto en nichos no humanos.
iniciar y expandir la cavidad. Se ha demostrado que varias especies orales pueden La naturaleza polimicrobiana de lesiones de caries implica que los modelos animales no
actuar sinérgicamente para aumentar su efecto patógeno [21] . En un fascinante ejemplo son probablemente representante de la enfermedad oral humana, especialmente en los
de metabolito la alimentación cruzada, Estreptococo gordonii fue demostrado aumentar la casos en especies bacterianas individuales se inoculan en el animal
virulencia de
DNA-basado estudios de la diversidad microbiana en la cavidad oral han estimado que la humana la ejemplo, [54,55] ). Sin embargo, cuando se analizan saliva, placa dental, y lesiones de caries de los
placa dental supragingival (la biopelícula formada en diente superficies) contiene entre 500 y 700 mismos individuos, se observa fácilmente que la saliva no es representativa de la diversidad
especies bacterianas [10,12,16] . Estas estimaciones son aún mayores en la saliva, probablemente bacteriana situado en el sitio de la enfermedad ( Figura I ). La composición microbiana de la lesión
porque este fluido oral está en contacto con todos los nichos en la boca, alcanzando valores entre 1000 esmalte en estudio (círculo naranja) parece estar dominada por Veillonellas, Fusobacterium, y Porphyromonas,
y 2000 especies en saliva estimulada mientras que en la muestra de saliva (azul, círculo exterior) del mismo individuo Streptococcus,
Neisseria,
[52] . En cariado lesiones, sin embargo, el número disminuye drásticamente a 100-200 a nivel de especies filotipos,
tanto en inicial, lesiones de caries de esmalte y en o la dentina cavidades profundas-dentina [14,15,35,53] , y Prevotella son los géneros que se encuentran en las proporciones más altas. Esto está de acuerdo con
pero porque estas estudios se basan en PCR amplificación de ADN muchos de el organismos detectado otros estudios que sugieren fuertemente que las muestras de saliva no son apropiados para el estudio de la
puede ser inactivo y no contribuye a la lesión progresión. El reciente datos basados en ARN (ver Figura 1 en microbiología de las enfermedades orales [52,56] . Aunque las muestras de placa dental (círculo verde) son
el texto principal) identificar las bacterias que participan activamente en los procesos de traducción, reducción más similares en la composición bacteriana a la encontrada en sus respectivas lesiones cariosas, varios
de la lista de organismos relacionados caries-a 40- 160 por de la muestra, que son presumiblemente las disminución géneros y otro aumento de la proporción en la cavidad, como consecuencia del nicho más
que actúan en las cavidades individuales. Ha sido asumido desde hace años que las bacterias implicadas especializado. Por lo tanto, incluso la placa dental no se mostrará con precisión las comunidades
en el enfermedad también debe estar presente en la saliva, que ha sido el oral preferida muestra recogido bacterianas responsables de la caries dental y los datos recomienda encarecidamente el uso de muestras
en etiológico y estudios epidemiológicos de caries dental debido a su naturaleza no invasiva (véase, por de lesión de caries con RNAbased se acerca (rosa, círculo interno) para determinar los agentes etiológicos
activas de la enfermedad.
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Opinión Tendencias en Microbiología febrero 2015, Vol. 23, No. 2
Tendencias en Microbiología
Figura YO. Bacteriano composición de diferentes muestras orales de un mismo individuo. Cada anillo se corresponde con el ADN extraído de babeo saliva, placa dental de sonido superficies, y una lesión de caries de esmalte, así como a partir de ARN de la
misma lesión (círculo interior). Tamaño de la fuente está relacionada con la proporción de cada grupo taxonómico en el muestra.
esmalte caries bacterias tienen una sobrerrepresentación de la dieta genes de azúcar de y genes de estrés osmótico en cavidades de dentina [14] . Por lo tanto, los datos demuestran
alta fermentación, mientras que la caries de la dentina son organismos enriquecida en claramente que la caries microbiología es dependiente del tejido y no una tienen una etiología
genes implicados en el metabolismo de glicanos asociado humanos- [14] . Además, el única, que tiene consecuencias importantes para la prevención de enfermedades.
esmalte caries microorganismos son extremadamente rico en moléculas de adhesión mientras
que el microbiano comunidad en la caries de la dentina contiene una notable arsenal de
las proteasas para degradar dentinaria tejido, incluso colagenasas, dipeptidil peptidasas, serinaLa prevención de la caries dental
proteasas, glycoproteases, metalopeptidasas de matriz, y aminopeptidasas. los ambientes El hecho de que los consorcios bacterianos caries asociados varían en diferentes etapas
que los dos cariogénico consorcios microbianos también habitan se reflejan en la mayor de progresión de la enfermedad y son diferentes en diferentes individuos sugiere que las
parte genes de estrés comunes: los genes de estrés oxidativo en ambos tejidos, genes de mismas funciones pueden ser realizadas por diferentes grupos de microorganismos. Esto
estrés ácidos en lesiones del esmalte, parece ser una tendencia general en estudios metagenomic del microbioma humano,
donde radicalmente diferentes composiciones taxonómicos dar lugar a sorprendentemente
similares funcional
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100%
Llave: Otro
Veillonellas
90% Streptococcus
Selenomonas
Pseudoramibacter
Prevotella
70%
Porphyromonas
Neisseria Leptotrichia
60% Lactobacillus Kingella
Granulicatella Gemella
Fusobacterium
50%
Eubacterium
Corynebacterium
40%
Capnocytophaga
Atopobium Ac?
20%
10%
0% S
W
.4
6
S 8H
78 W .2
A0 47 S 86
S S S S SS SS S C 88
.
WDD DD D D D D 7H A0 48H 27H 47H 7H
4W 6W 6W 3W 6W 7W 6W 7W 5W S A0 12 8 8 5D 1D 4D 6D .3 C . . . .4
1.3 1.3 1.4 2.1 2.4 2.4 8.3 8.3 8.4 7W C 1.7.3 7.4 9.1 9.2 2.3 8.4 78 81 83 85 78
2 2 2 2 2 2 7 7 7 . 4 S 0
A1 0
7 0 7 0 7 0 7 0 8 0 8 A0 A0 A0 A0 A0
A0 A0 A0 A0 A0 A0 A0 A0 A0 78 5W C A CA CA CA CA CA C C C C C
C C C C C C C C C A0 .4 S C
C
0 89 3 W
A 2 muestras
.Las
C 01
A1
C
Tendencias en Microbiología
Figura 1. Metatranscriptomic perfil de las lesiones de caries. Se extrajo ARN de, blanco-punto caries iniciales de esmalte (WS), la capa profunda de las cavidades dentinales abiertos (DD), y oculta dentina cavidades (H). después de cDNA la
construcción, la taxonomía bacteriana se obtuvo por titanio-plus pirosecuenciación de 800 pb productos de PCR que abarca hipervariable regiones V1 a V4 y utilizando el clasificador Ribosomal Database Project (RDP). Más de 4000 lecturas por
muestra se obtuvieron, con información sobre el activo microbiano comunidad. Los dos números a la derecha del código de paciente indican el diente de donde se obtuvo la muestra. Elaborado a partir de datos en [20] .
per fi les [31] . Por lo tanto, incluso si determinar la etiología de una mediada por para predecir el riesgo de enfermedades orales y podría tener un potencial valor diagnóstico.
microbios la enfermedad podría ser considerado el primer paso en diseño preventivo estrategias,
conociendo el específico microbiano composición no bastar para entender y combatir la enfermedad.
Por lo tanto, el cambio de paradigma en la etiología de la caries dental debe ser
Inicial hipótesis sobre el subyacente microbiología de enfermedades orales, que se traducido a terapias apropiadas
centró en la determinación de los agentes fi c causales específicos, dio paso a la [35] . Dada la naturaleza polimicrobiana de la caries dental, predecimos que las estrategias de
ecología de base proposiciones donde la enfermedad es visto como el salida de una diagnóstico y prevención dirigidas hacia especí fi cas especies bacterianas no serán
comunidad microbiana sesgada debido a ambiental cambios [32] . Si la composición universalmente eficaz. Estos incluyen kits de diagnóstico de la evaluación de riesgo de caries,
microbiana de cariado lesiones es tan variable y el combinaciones de posible consorcios que se centran tradicionalmente en los recuentos de cultivo de estreptococos mutans y
por lo numerosos ( Figura 1 ), Que es relevante para conocer una lista de cariogénicos lactobacilos [4] mientras que los datos muestran que los primeros se encuentran en
jugadores? La hipótesis ecológica de caries dental considera que se centra en el proporciones extremadamente bajas, incluso dentro de las cavidades y el último sólo se
metabolismo salida del microbiano comunidades pueden ser la clave comprensión y controlencuentran en varias cavidades de dentina y no en, lesiones iniciales de caries de esmalte ( Figura
de la enfermedad, independientemente de la microorganismos implicados en el 1 ), Confirmando que esta especie no está involucrado en la iniciación de la caries [36] . Con
proceso de respecto a los enfoques preventivos o terapéuticos, las estrategias de inmunización pasiva,
tales como el uso de anticuerpos sintéticos dirigidos contra S. mutans- antígenos especí fi co [37]
se prevé que sea ineficiente, dada la naturaleza de múltiples especies de la iniciación de la
caries. estrategias de inmunización activa (es decir, una vacuna caries) están siendo
exploradas principalmente contra mutans antígenos de estreptococos [6,38] e incluso las
[33] , y diferentes OMIC Se han iniciado enfoques para comprender la holístico salidamúltiples especies que se acercan
funcional de la placa dental [17,34] . Desde un aplicado punto de vista, creemos
que la detección de metabólica asociada con la enfermedad pro fi les habría Más informativo
que la composición microbiana
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Atopobium
rium
Fusobacte
lla
us
ge
Kin
phil
mo
ilo
ac era
Hae
ob
ha
sp
ct
ga
Me
veillo la
nella
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c oco
CA078.47H
Po
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nnogr CA078.47WS
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Tendencias en Microbiología
Figura 2. los bacteriano composición de la caries es tejido dependiente. Una muestra de una, caries iniciales mancha blanca de esmalte (WS) y una lesión de la dentina oculto se tomaron de la misma diente (el segundo molar del cuarto cuadrante). La
falta de contacto entre las dos lesiones se evaluó radiográficamente. El, taxonomía bacteriana basada en ARN activo fue obtenido por pirosecuenciación de productos de PCR largos que abarcan regiones hipervariables V1 a V4. Elaborado a partir
de datos en [20] .
estaba luego propuesto [39] puede no bastar si una clave, bacteriana universal, repertorio
no está presente en caries desarrollo. Así, futuro la investigación debe centrarse en la
interceptación de funciones relacionado con enfermedad iniciación y progresión Caja 2. cuestiones pendientes
independientemente de Cuál es el El jugador bacteriana detrás del papel ( Recuadro 2 ).
Es la salida funcional de una comunidad microbiana más importante que su composición taxonómica en
Tentativo ejemplos de funciones para ser inhibidos en futuras caries preventivo estrategias términos de entender una enfermedad polimicrobiana? Son las estrategias de inmunización y
podrían incluir la detección de quórum y otro intercelular señales de comunicación, antimicrobianos eficaces en la prevención de enfermedades orales? ¿Estamos tratando trastornos
hidratos de carbono-fermentación vías, intermicrobial y microbial- humana adhesión compuestos,orales polimicrobianas como singlespecies enfermedades infecciosas? Lo que no antimicrobiano
estrategias terapéuticas son factibles para prevenir enfermedades polimicrobianas como la caries
sistema de diafonía bacteriana-inmune moléculas, y pH de regulación de partículas. La
dental? Teniendo en cuenta que el microbioma humano contiene no sólo las bacterias sino también
interrupción de adhesión moléculas pueden ser una estrategia fructífera para cualquiera prevenir
organismos fúngicos y virales, lo común que son polimicrobiana (en contraposición a polybacterial)
o modular microbiano unión al diente película o entre los actores clave en la formación de enfermedades?
biopelícula
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Opinión Tendencias en Microbiología febrero 2015, Vol. 23, No. 2
Etiología Tipo de enfermedad Presente en la salud comportamiento virulento Respuesta inmune Tratamiento
Soltero especies Infeccioso No (invasiva) Patógeno Activo antimicrobiano
polimicrobiana disbiosis Sí (comensal) Pathobiont Basal restablecer el equilibrio
[40] . Esto es basado en la premisa de que interferencia en el desarrollo de la biopelícula enfermedades polimicrobianas está emergiendo fuera de la cavidad oral, que van desde
oral, causada por alterar el diente fijación de principios colonizadores o su capacidad los abscesos a la vaginosis bacteriana, diarrea, rinosinusitis, e infección crónica en el
pulmón de pacientes con fibrosis quística [49] . La detección común de los patógenos
para reclutar otra tecla jugadores durante la formación de película bio afectarían el todo procesar
presentes en niveles bajos en la salud en enfermedades orales más polimicrobianas
y evitar la presencia de cariogénico o periodontal patógenos. Por ejemplo, Fusobacterium nucleatum
es un prometedor candidato dada su capacidad para coaggregate con ambos sugiere fuertemente que no pueden considerarse que tienen carácter infeccioso y que
colonizadores tempranos y tardíos de la vía oral bio fi lm [41] . Controlada (por ejemplo, en los agentes causantes microbianas se describen mejor como pathobionts
subinhibitorias niveles), uso fi c limitada, o específico de la terapia con antibióticos tiene
también estado propuesto [42] . Otro alternativa a modular la placa desarrollo sin haciendo
uso de una estrategia antimicrobiana es el uso de probióticos. los introducción de cepas [50,51] . Estos organismos son bacterias, por lo tanto residentes con el potencial de
específica a la bio fi lm podría teóricamente modificar las interacciones microbianas clave causar enfermedades, y bajo condiciones de equilibrio del sistema inmunitario no
o buffer efectos cariogénicos, favoreciendo una sana y equilibrada ecosistema. Sin tiene una respuesta activa contra ellos ( tabla 1 ). Desde un punto de vista aplicado,
creemos que los tratamientos antimicrobianos serán estériles en la curación o la
embargo, los ensayos clínicos actuales con probióticos tratamiento no han sido particularmente
eficaz en la reducción de tasas de caries [43] . Una razón de esto puede estar relacionado prevención de enfermedades orales polimicrobiana y estrategias dirigidas a la
modulación de las interacciones microbianas y / o su producción funcional debe
con el uso de soltero especies en probiótico enfoques. No sólo los patógenos actúan en grupos:
comensales de equilibrio entre la promoción probablemente necesitar grupos de especies desarrollarse más.
múltiples a su facilitan la sedimentación en el bio fi lm y para proporcionar efectos
beneficiosos. tal vez por esta razón, en el intestino humano, fecal trasplantes tienen estado
demostrado ser eficaz en el tratamiento Clostridium di fi cile infecciones, colitis, y síndrome
del intestino irritable, lo que sugiere que una ya formada comunidad se asienta de referencias
manera más efectiva en el nicho receptor y tiene una probabilidad más alta de confiriendo 1 Fredericks, DN y Relman, DA (1996) basada en la secuencia
identificación de patógenos microbianos: una reconsideración de los postulados de Koch. Clin. Microbiol.
una Efecto positivo [44] . Sin embargo, la aplicación práctica de orales trasplantes tendrían
Rdo. 9, 18-33
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Más uno 7, e47722
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