INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

ESCUELA SUPERIOR DE MEDICINA

FARMACOLOGIA MOLECULAR PRIMER SEMESTRE

RELACION ESTRUCTURA ACTIVIDAD

ALUMNO

ABRAHAM CRIVELLI PUGA

MÉXICO, CIUDAD DE MÉXICO, 2018

La actividad biológica es la Concentración inhibitoria 50. A mayor actividad inhibitoria 50 (unidades μM ) es menor

actividad biológica; A menor actividad inhibitoria 50, (μM unidad) es mayor actividad biológica.

Para el determinado compuesto leader, donde el sustituyente es Hidrogeno, se calculó una log (1/AB) = 7.82

Se Escribieron los valores de Pi aromático (Liposolubilidad) y Sigma para (descriptor electrónico) Y se determinó el valor de

Log (1/AB) para los siguientes sustituyentes, obteniendo estos valores:

Sustituyente pi sigmap log(1/IC50) (1/IC50) IC50 (M) IC50 (μM)

Adamantilo 3.3 -0.13 11.8061 6.39882E+11 1.56279E-12 1.56279E-06
Ferrocenilo 2.46 -0.18 10.9136 81959632048 1.22011E-11 1.22011E-05
Si(CH3)3 2.59 -0.07 10.9014 79689297807 1.25487E-11 1.25487E-05
(CH2)3CH3 2.13 -0.16 10.5047 31966861543 3.12824E-11 3.12824E-05
C(CH3)3 1.98 -0.2 10.391 24603676041 4.06443E-11 4.06443E-05
OC6H5 2.08 -0.03 10.2561 18034329488 5.54498E-11 5.54498E-05
SC6H5 2.32 0.18 10.2234 16726304547 5.97861E-11 5.97861E-05
C6H5 1.96 -0.01 10.0887 12265916390 8.15267E-11 8.15267E-05
CH(CH3)2 1.53 -0.15 9.8 6309573445 1.58489E-10 0.000158489
CH2CH2CH3 1.55 -0.13 9.7936 6217273893 1.60842E-10 0.000160842
OCH(CH3)2 0.85 -0.45 9.459 2877398415 3.47536E-10 0.000347536
O(CH2)2CH3 1.05 -0.25 9.395 2483133105 4.02717E-10 0.000402717
N(CH3)3 0.18 -0.83 9.2471 1766444513 5.66109E-10 0.000566109
CH2CH3 1.02 -0.15 9.2135 1634933151 6.11646E-10 0.000611646
N=NC6H5 1.69 0.39 9.1902 1549530040 6.45357E-10 0.000645357
SEt 1.07 0.03 9.0064 1014845663 9.85372E-10 0.000985372
I 1.12 0.18 8.8434 697268426.4 1.43417E-09 0.001434168
CHCL2 1.1 0.19 8.8057 639293074.9 1.56423E-09 0.001564228
CH--CH2 0.82 -0.02 8.7924 620011864.2 1.61287E-09 0.001612872
SCF3 1.44 0.5 8.741 550807696.4 1.81552E-09 0.001815516
CH3 0.56 -0.17 8.7139 517487662.3 1.93241E-09 0.001932413
OCH2CH3 0.38 -0.24 8.6098 407192715.4 2.45584E-09 0.00245584
CH2Br 0.79 0.14 8.5227 333196169.5 3.00123E-09 0.003001235
SCH3 0.61 0 8.5215 332276785.2 3.00954E-09 0.003009539
NHCH3 -0.47 -0.84 8.5143 326813509 3.05985E-09 0.003059849
OCF3 1.04 0.35 8.5015 317321866.4 3.15137E-09 0.003151374
Br 0.86 0.23 8.4709 295733143.7 3.38143E-09 0.003381427
Cl 0.71 0.23 8.2984 198792502.1 5.03037E-09 0.005030371
SF5 1.23 0.68 8.2349 171751287 5.82237E-09 0.005822373
OCH3 -0.02 -0.27 8.1939 156278775.6 6.39882E-09 0.006398822
NNN 0.46 0.15 8.1285 134431176.7 7.43875E-09 0.007438751
SH 0.39 0.15 8.048 111686324.8 8.95365E-09 0.008953648
CF3 0.88 0.54 8.0382 109194307.9 9.15799E-09 0.009157987
C---CH 0.4 0.23 7.9419 87478232.6 1.14314E-08 0.011431415
F 0.14 0.06 7.8928 78126793.46 1.27997E-08 0.012799706
P(CH3)2 0.44 0.31 7.8703 74182249.72 1.34803E-08 0.013480314
CH2Cl 0.17 0.12 7.8391 69039875.57 1.44844E-08 0.014484383
H 0 0 7.82 66069344.8 1.51356E-08 0.015135612
C--O(Oet) 0.51 0.45 7.745 55590425.73 1.79887E-08 0.017988709
NHNH2 -0.88 -0.55 7.6165 41352331.43 2.41824E-08 0.024182433
OH -0.67 -0.37 7.5934 39210285.09 2.55035E-08 0.025503513
(CH2)2CO2H -0.29 -0.07 7.5894 38850803.04 2.57395E-08 0.025739494
SCN 0.41 0.52 7.5271 33658906.29 2.97098E-08 0.029709819
NO -0.12 0.12 7.5056 32033176.01 3.12176E-08 0.031217635
NH2 -1.23 -0.66 7.3757 23751989.9 4.21017E-08 0.042101736
SC--O(CH3) 0.1 0.44 7.2882 19417798.94 5.14991E-08 0.051499143
CH--NOH -0.38 0.1 7.236 17218685.75 5.80764E-08 0.058076442
C--O(C2CH5) 0.06 0.48 7.1834 15254571.05 6.55541E-08 0.065554121
CH2CN -0.57 0.01 7.1498 14118871.97 7.08272E-08 0.070827188
C--O(OCH3) -0.01 0.45 7.147 14028137.05 7.12853E-08 0.071285303
CH2CO2H -0.72 -0.07 7.0949 12442280.85 8.03711E-08 0.080371116
SO2(CF3) 0.55 0.93 7.0854 12173066.65 8.21486E-08 0.082148569
S--O(C6H5) -0.07 0.47 7.0486 11184073.18 8.94129E-08 0.089412863
B(OH)2 -0.55 0.12 7.0111 10258881.19 9.74765E-08 0.097476516
CH2OCH3 -0.78 0.03 6.8789 7566586.479 1.3216E-07 0.132159991
CO2H -0.32 0.45 6.7905 6173052.919 1.61994E-07 0.161994399
NHOH -1.34 -0.34 6.7788 6008969.505 1.66418E-07 0.166417886
NHC=O(CH3) -0.97 0 6.7045 5064073.495 1.97469E-07 0.197469488
NHCHO -0.98 0 6.693 4931738.04 2.02768E-07 0.202768272
CH2OH -1.03 0 6.6355 4320161.676 2.31473E-07 0.231472819
OC=O(CH3) -0.64 0.31 6.6283 4249129.821 2.35342E-07 0.235342304
SO2(F) 0.05 0.91 6.5398 3465772.09 2.88536E-07 0.288535995
SO2C6H5 -0.27 0.7 6.4805 3023430.571 3.3075E-07 0.330750112
CHO -0.65 0.42 6.4551 2851674.814 3.50671E-07 0.35067112
C--O(CH3) -0.55 0.5 6.4525 2834653.633 3.52777E-07 0.352776787
NHSO2CH3 -1.18 0.03 6.4189 2623614.364 3.81154E-07 0.381153577
NO2 -0.28 0.78 6.3514 2245949.567 4.45246E-07 0.445245973
CN -0.57 0.66 6.1943 1564227.8 6.39293E-07 0.639293075
C=O(NH2) -1.49 0.36 5.5773 377833.0987 2.64667E-06 2.646671251
S--O(CH3) -1.58 0.49 5.2827 191734.3829 5.21555E-06 5.21554864
SO2(NH2) -1.82 0.57 4.8891 77464.01448 1.29092E-05 12.90921994
SO2CH3 -1.63 0.72 4.8871 77108.09966 1.29688E-05 12.96880619
O- -3.87 -0.81 4.5602 36324.52969 2.75296E-05 27.52960626
CO2 -4.36 0 2.806 639.7348355 0.001563148 1563.147643
IO2 -3.46 0.78 2.6944 494.7661737 0.002021157 2021.156767
+N(CH3)3 -5.96 0.82 -0.2394 0.576235486 1.735401626 1735401.626
Se realizo con estos valores una Gráfica en 3 dimensiones con los planos de:

X: Pi

Y: Sigma p

Z: log (1/AB)

Se mostro con un modelo de excelprimero la relación con todas las moléculas,

log(1/AB)

8
I
H F Br
Cl
B(OH)2
6

0
+N(CH3)3
Sigma
-5
-4
Pi -3
-2
-1
0.2 0
0.4 1
0.6
0.8
Se mostró para menos sustituyentes:

labels Pi Sigma log(1/AB)

H 0 0 7.82
Adamantilo 3.3 -0.13 11.8061
+N(CH3)3 -5.96 0.82 -0.2394
B(OH)2 -0.55 0.12 7.0111
Br 0.86 0.23 8.4709
Cl 0.71 0.23 8.2984
F 0.14 0.06 7.8928

log(1/AB)

10
Adamantilo
8
HF
Br
Cl
B(OH)2 6

Sigma
0
+N(CH3)3
-4
Pi
-2

0 0
0.2 2
0.4
0.6
0.8
}Ahora solo se seleccionaron los sustituyentes d ellos valores extremos, en Log(1/AB), en Sigma y e Pi

log
Sustituyente pi sigma (1/AB)
H 0 0 7.82
Adamantilo 3.3 -0.13 11.8061
+N(CH3)3 -5.96 0.82 -0.2394
NHCH3 -0.47 -0.84 8.5143
SO2(CF3) 0.55 0.93 7.0854

log (1/AB)

Adamantilo
10
NHCH3
8
H
SO2(CF3) 6

2
+N(CH3)3
0
pi -4sigma
-2
-0.8 -0.4 0
2
0 0.4 0.8

Farmaco de Mayor Liposolubilidad: Adamantilo, Pi 3.3

Farmaco de Menor Liposolubilidad: +N(CH3)3: pi -5.96

Farmaco de Mayor Sigma: SO2(CF3) 0.93

Farmaco de Menor Sigma: NHCH3 -0.84

Fármaco de Menor Actividad biológica: Fármaco de Mayor Actividad biológica

+N(CH3)3 Adamantilo
log(1/IC50) -0.2394 log(1/IC50) 11.8061
IC50 (M) : 1.735401626 M IC50 (M): 1.56279 E-12 M
IC50(μM): 1735401.626 μM IC50(μM): 0.000000156279 μM
Su concentración inhibitoria es la más alta Su concentración inhibitoria es la más chica
Análisis;
De forma empírica, se puede ver que el fármaco de mayor actividad biológica (Adamantilo), también es el más
liposoluble, o de mayor valor para Pi, donde al ser positivo su valor, significa mayor liposolubilidad.
El valor de Sigma no influye demasiado, pues a extremos del valor de sigma, el valor de Log (1/AB) no tiene
cambios importantes.
Y que el fármaco de menor actividad biológica (: +N(CH3)3) fue también el menos liposoluble, o de valor Pi más
bajo.
Se puede concluir que: El descriptor que más contribuye a la actividad biológica es Pi, mientras que el valor de
Sigma no influye demasiado.