Mutasi DNA

Rehmadanta Sitepu
 Mutasi
Perubahan diwariskan dalam material genetika
sel dari pembelahan sel; keturunan dari proses reproduksi

mutasi somatik
– hasil mitosis sel yang identik secara genetik
dapat menyebabkan mosaikisme
– Tumor - Pertumbuhan yang tidak terkendali
mutasi Germ-line
– Timbul dalam sel yg ditakdirkan untuk menjadi gamet
– Diteruskan ke keturunannya; hadir dalam setiap sel organisme

mutasi gen
– Mempengaruhi gen tunggal
mutasi kromosom
– Perubahan besar-besaran
– Mungkin dpt diamati dengan mikroskop
 Tipe Mutasi
• Subtitusi basa/point mutation
– Satu basa diganti yg lain

– Transisi
• Satu purin digantikan oleh purin lain; satu pirimidin
digantikan oleh pirimidin lain
– Transversi
• Purin digantikan oleh pirimidin, atau sebaliknya
 Tipe Mutasi
• Insersi atau delesi
– Satu atau lebih nukeotida
– Mutasi Frameshift
• Dalam gen mRNA, mempengaruhi semua asam amino hilir,
kecuali dalam kelompok tiga di tempat kodon yang normal
• Perpanjangan pengulangan trinucleotide
– gen tertentu mengandung tandem pengulangan
– Jumlah tandem dapat meningkat pd keturunan karena untai selip
atau tidak merata persilangan
 Efek Fenotipik
• Mutasi Missense
– Menyebabkan asam amino yang salah diletakkan di
polipeptida
– Mutasi netral - fungsi protein tidak terpengaruh
karena asam amino yg tertukar memiliki sifat yang
mirip
• Mutasi Nonsense
– Memperkenalkan STOP kodon sebelum waktunya
– Hasil dalam polipeptida terpotong
• Silent mutation
– Karena redudansi/kelebihan kodon, mutasi masih
mengkode untuk asam amino yang sama
 Efek Fenotifik samb.
• Kehilangan Fungsi
– polipeptida fungsional tidak dibuat
– resesif
• gen normal masih membuat polipeptida yang
benar
• Bertambahnya fungsi yg tidak diharapkan
– Produksi polipeptida abnormal
– dominant
 Penyebab Mutasi
• Spontan
– Perubahan alami
– Replikasi errors dan perubahan senyawa
kimia

• Induksi
– Disebabkan agen-agen lingkungan
• Chemical, radiation
Kesalahan Replikasi/replication
errors spontan
• Tautomers
• Wobble
• Strand slippage
• Unequal crossing over
 Tautomers
• Berbagai bentuk basa
nitrogen
– perubahan posisi dari proton
(ion hidrogen)

• Dapat menunjukkan
pasangan basa
konvensional
– bentuk yang jarang dari C
dapat ikatan dengan A;
bentuk yang jarang dari G
dapat ikatan dengan T

• Awalnya dianggap sumber

utama mutasi - tidak ada
bukti pendukung
 Wobble
• Fleksibilitas pd
heliks DNA
• kesalahan
memasukkan
– TA base pair becomes
CA
• Satu untai benar
TA, untai lain CG
– Karena semua
basa dengan benar
dipasangkan, tidak
ada mekanisme
perbaikan yg dapat
memperbaiki
 Strand slippage/untai slip
• Menyebabkan
insersi dan delesi
kecil
• Satu nukleotida
loop keluar
– Pada untai baru– results
in an insertion
– Pada untai lama–
results in a deletion
 Strand slip pd pengulangan
trinukleotida
• Selip untai baru dapat
mengakibatkan
sejumlah diperluas
pengulangan dalam
sel anak

• Penyebab antisipasi
 Unequal crossing over
• keselarasan yang
salah dari kromosom
homolog
• Crossing over hasil
dalam penyisipan
dalam satu molekul
dan penghapusan
pada molekul lain
• Bisa juga
menyebabkan
perluasan
pengulangan
trinucleotide
 Perubahan kimia spontan
• Depurination
– Nukleotida kehilangan basa purin tersebut; apurinic
– tidak dapat bertindak sebagai template
– A biasanya dasar ditempatkan di untai baru
 Deaminasi
• Hilangnya gugus asam
amino

• Deaminasi sitosin
menjadi urasil
– Since U is not present in
DNA, usually correctly by
repair mechanisms

• Deaminasi metilsitosin
menjadi Timin
– Causes CG to AT – not
detected by repair
mechanisms
 Mutasi yg diinduksi senyawa
kimia
• Mutagen - agen lingkungan dengan
kemampuan untuk mengubah urutan DNA
• Basa analog
• agen pengalkilasi
• deaminasi
• reaksi oksidatif
• agen terinterkalasi
 Chemically induced mutagens
• Basa Analog
– Memiliki struktur yang
mirip dengan
nukleotida yang
normal
– Ketika terionisasi,
menunjukkan
pasangan basa
konvensional
– Transisi atau
transversi mutasi
ditampilkan?
 Mutasi yg diinduksi kimiawi
• Agen pengalkilasi
– Mendonasi gugus alkil ke basa
– Pasangan basa tidak tepat

• deaminasi
– Dapat terjadi secara spontan atau diinduksi
– Adenin menjadi hipoxantin (berpasangan
dengan C)
– Guanin menjadi xanthine (berpasangan
dengan T)
 Chemically induced mutagens
• Reaksi Oksidatif
– bentuk reaktif oksigen
– penyebab transversi
• pasang G dengan A
• Agen Penginterkalasi
– Memasukkan diri ke DNA
- mendistorsi molekul
– Sering menyebabkan
mutasi frameshift
 Radiasi
• Radiasi ionisasi
– energi tinggi, ikatan
fosfodiester pecah
– Hasil  rusaknya untai
ganda
• UV light
– dimer pirimidin - biasanya
dimer timin
– Penyebab TpT untuk
obligasi kovalen
• Replikasi DNA diblokir dan
sel mati, atau transkripsi
diblokir
 DNA repair
• Mismatch repair
• Direct repair
• Base excision repair
• Nucleotide excision repair
 Mismatch repair
• Corrects replication
errors/improper base
pairing not fixed by
DNA polymerase III

• Recognizes structural
distortions

• New strand section is

cut out and replaced
– Old strand is
methylated – strand
distinction
 Direct Repair
• Converts altered nucleotide
back to original form

• Methylguanine binds with A

– Enzymes remove methyl
group to return to normal
guanine

• Photolyase
– Found in E. coli and some
eukaryotes (not humans)
– Break covalent bonds of
dimers
 Base Excision Repair
• Repairs abnormal/ modified
bases

• Nitrogenous base is first

removed
– Apurinic or apyrimidic site

• Followed by removal of rest

of nucleotide

• DNA polymerase replaces

nucleotide; DNA ligase seals
nick by forming
phosphodiester bond
 Nucleotide excision repair (NER)
• Removes lesions that distort DNA
helix

• Several enzymes/ genes involved

– Recognize distortion

• DNA strand is separated; single-

strand binding proteins stabilize

• Large section is removed

• DNA polymerase fills in; DNA ligase

seals nicks