Zona Central
1. Parque Nacional La Tigra
2. Parque Nacional Montaña de Yoro
3. Parque Nacional Montaña de Comayagua
4. Parque Nacional Cerro Azul Meámbar
5. Parque Nacional Sierra de Agalta
6. Reserva Biológica Misoco
7. Reserva Biológica Montecillos
8. Área de Uso Múltiple Lago de Yojoa
9. Reserva Biológica El Chile.
Zona Norte
1. Parque Nacional Pico Bonito
2. Parque Nacional Punta Sal
3. Parque Nacional Punta Izopo
4. Refugio de Vida Silvestre Cuero y Salado
5. Parque Nacional Capiro y Calentura
6. Parque Nacional Cusuco
7. Jardín Botánico Lancetilla
8. Refugio de Vida Silvestre Laguna de Guaimoreto
9. Refugio de Vida Silvestre Texiguat
10.Monumento Cultural Fuerte de San Fernando de Omoa.
Parque Nacional La Tigra
Montaña de Yoro
Parque Nacional Montaña de Comayagua