En todos los organismos vivos

las transformaciones
metabólicas son catalizadas por
enzimas

Red Metabólica
 Las enzimas
• Catalizan reacciones químicas necesarias para la
sobrevivencia celular
• Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan
lentos que las células no podrían existir.
• Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera
de ésta, y en el tubo de ensayo.
 Enzimas

• Muchas proteínas son enzimas

• Las enzimas son catalizadores biológicos
• Los catalizadores aumentan la velocidad
de las reacciones
Sin embargo, no todas las enzimas son proteínas.
Existen moléculas de RNA con actividad catalítica:

En 1982 Thomas Cech y Sidney Altman

descubrieron las ribozimas. En 1989 les
concedieron el premio Nobel de Química
Estructura tridimensional de una ribozima “hammerhead”
 Importancia del estudio de enzimas

1. La función enzimática normal es requerida para la

mantención de la vida

2. Tratamientos médicos y diagnóstico

3. Desarrollo de drogas
Aplicaciones y usos de las enzimas

1. Aspectos clínicos del uso de enzimas

2. Usos biotecnológicos de las enzimas

Uso de enzimas para determinar la concentración
de metabolitos de importancia clínica

Metabolito Enzima
Glucosa sanguínea Hexoquinasa, Glucosa oxidasa,
Glucosa deshidrogenasa
Ácido úrico Urato oxidasa
Urea Ureasa
Colesterol Colesterol oxidasa
riacilglicéridos Glicerol quinasa + Piruvato quinasa
+ Lactato deshidrogenasa
 Determinación de actividades enzimáticas
como diagnóstico clínico

ENFERMEDADES HEPÁTICAS ENFERMEDADES CARDÍACAS

Fosfatasa alcalina Creatina quinasa

g-glutamiltransferasa Lactato deshidrogenasa
Aspartato aminotransferasa Aspartato aminotransferasa
Alanina aminotransferasa
 Polvo neutral de la enzima de la
celulasa, enzimas de pulido de las
celulasas para el lavado del dril de
algodón

Fertilizante para el
cultivo de marihuana
Industrial Enzymes and Their Commercial Uses
EL LADO OSCURO
DE LAS
ENZIMAS...
Algunas enfermedades genéticas asociadas a la ausencia
o defecto en una enzima o proteína
Enfermedad Efectos fisiológicos Enzima o proteína

Fibrosis quística Secreción anormal en los Canal de cloruro

pulmones, pancreas, glándulas
salivales; enfermedad pulmonar
crónica que generalmente conduce
a la muerte en niños y jóvenes

Síndrome de Lesch-Nyan Defectos neurológicos, Hipoxantina guanina

automutilación, retardo mental fosforibosil transferasa

Gota (primaria) Sobreproducción de ácido úrico Fosforibosil pirofosfato

que resulta en ataques recurrentes sintetasa
de artritis aguda

Enfermedad de Tay-Sachs Debilidad motora, deterioro Hexosaminidasa A

mental, muerte a los 3 años
aproximadamente.

Hipercolesterolemia Ateroesclerosis resultante de Receptor de lipoproteínas

familiar concentraciones elevadas de de baja densidad
colesterol en la sangre; a veces
muerte prematura por falla
cardíaca

Anemia falciforme Dolor, hinchazón en manos y pies; Hemoglobina

puede conducir a dolor súbito y
severo en huesos o articulaciones,
muerte
E + S ESEP  E + P

E E E E
 La catálisis ocurre en el sitio activo
Región de la proteína donde se une el sustrato y ocurre la catálisis, es decir la
transformación química del sustrato en producto

Residuos
claves del Sustrato
sitio activo
Una enzima puede unir dos sustratos
en su sitio activo
 Modelo por homología

Glucoquinasa ADP-dependiente de T. litoralis

AMP

Proteína fluorescente verde PFK ADP-dependiente de P. horikoshii

Sitios de unión de ligandos

• Sitio activo (unión, catálisis)

• Sitio alostérico (regulación)

Características del Sitio Activo

•Contiene residuos de aminoácidos que participan en la unión del

sustrato y aminoácidos que participan en la catálisis

•Comprenden una parte relativamente pequeña del volumen total de la

proteína

•Es una entidad tridimensional, formada por grupos que vienen de

diferentes partes de la molécula

•Los sustratos se unen a la enzima por interacciones débiles

•Los sitios activos son hendiduras

El sitio activo es una entidad tridimensional
Los sustratos se unen a la enzima por interacciones débiles
La secuencia de aminoácidos tiene dirección
 Los sitios activos pueden incluir residuos distantes
en la cadena polipeptídica

(A) Los aminóacidos que se muestran en color forman parte del sitio activo de la lisozima.
(B) Una representación esquemática de la estructura primaria de la enzima muestra que los
aminoácidos que conforman el sitio activo se encuentran en diferentes partes de la
cadena polipeptídica
Sitio Activo
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación del substrato unión
• Transformación catalítica del mismo catálisis

En ambas funciones participan:

• Cadenas laterales de los aminoácidos
• Grupos o moléculas no proteicas:
❖ Grupos prostéticos
❖ Iones metálicos
❖ Cofactores
 Cofactores y coenzimas

Algunas enzimas necesitan de cofactores o coenzimas para su

actividad.

• Los cofactores son moléculas inorgánicas y las coenzimas son moléculas

de mayor tamaño orgánicas.

• Grupos prostéticos moléculas orgánicas u organometálicas que están

fuertemente unidas a la enzima o proteína.

Proteína grupo Holoproteina Enzima

+ Holoenzima Activa
Enzima prostético

Proteína - grupo Apoproteína Enzima

Enzima prostético Apoenzima Inactiva
Algunos elementos inorgánicos que sirven como
cofactores de enzimas

Elemento Enzima
2+
Cu Citocromo oxidasa
2+ 3+
Fe o Fe Citocromo oxidasa, Catalasa, Peroxidasa
+
K Piruvato quinasa
2+
Mg Hexoquinasa, glucosa 6-fosfatasa,
Piruvato quinasa
M n2+ Arginasa, Ribonucleótido reductasa
Mo Dinitrogenasa
2+
Ni Ureasa
Se Glutatión peroxidasa
2+
Zn Anhidrasa carbónica, Alcohol
deshidrogenasa, Carboxipeptidasas A y B
 Coenzimas
• Las coenzimas son pequeñas moléculas
orgánicas, que se unen a la enzima.
• Las coenzimas colaboran en la reacción
enzimática recibiendo transitoriamente algún
grupo químico: H+ , OH, CH3 .
El NAD es una coenzima aceptora de H+

Sustrato
oxidado
 Nomenclatura de enzimas
• Algunas tienen nombres históricos comunes Tripsina,
Quimotripsina
• Algunas tienen nombres comunes relacionados con el
sustrato , usualmente nombres que terminan con el sufijo
“asa”. ureasa, proteasa, ribonucleasa, ATPasa, glucosa-6-
fosfatasa
• Otras son llamadas de acuerdo a la reacción que catalizan,
lactato deshidrogenasa, piruvato descarboxilasa
• Todas las enzimas tienen un nombre sistemático basado en
un acuerdo internacional
 ATP + D-Glucosa ADP + D-Glucosa-6-fosfato

IUBMB - ATP:glucosa fosfotransferasa

Número Enzyme Commission:

Enzyme
Comission E.C. 2.7.1.1
1 indica que D-
glucosa es el
receptor del
2 clase – grupo fosfato
Transferasa
7 subclase – 1 sub-subclase –
Fosfotransferasas Fosfotransferasa que utiliza
grupo hidroxilo como receptor

Nombre trivial: Hexoquinasa

 Clasificación y nomenclatura

Clasificación de enzimas por Grupos

EC 1.x  Oxidorreductasas
EC 2.x  Transferasas
EC 3.x  Hidrolasas
EC 4.x  Liasas
EC 5.x  Isomerasas
EC 6.x  Ligasas
 Clasificación internacional de las enzimas
Clase Tipo de reacción que cataliza

1. Oxidoreductasas Transferencia de electrones (iones hidruro o átomos de H)

ej: alcohol DH: alcohol + NAD+ aldehido o cetona + NADH + H+

2. Transferasas Transferencia de un grupo funcional de una molécula a otra

ej: hexoquinasa glucosa + ATP glucosa-6-P + ADP

3. Hidrolasas Ruptura de enlaces por hidrólisis ej: acetilcolinesterasa

acetilcolina + H2O colina + acetato

4. Liasas Eliminación de un grupo o adiciones de un grupo a un doble enlace

ej: piruvato descarboxilasa 2 oxoácido aldehído + CO2

5. Isomerasas Transferencia de grupos dentro de la molécula (reordenamiento

intramolecular) ej fosfoglicertao mutasa 2-fosfoglicerato 3-fosfoglicerato

6. Ligasas Unión de 2 moléculas acoplada a la ruptura de ATP

ej piruvato carboxilasa: piruvato + CO2 + ATP oxaloacetato + ADP
Poder catalítico
Cantidad de producto (B) formado
Con enzima
(catalizada)

Reacción: A  B

Sin enzima
(no catalizada)

Tiempo
Aumento en la velocidad de reacción
producido por enzimas
 Essential Question
Although the catalytic properties of
enzymes may seem almost magical, it is
simply chemistry– the breaking and
making of bonds– that give enzymes their
prowess
➢What are the universal chemical principles
that influence the mechanisms of enzymes
➢To understand the enormous catalytic power
of enzymes
 Posibles modos de acción de una enzima
1. Actúan acelerando una reacción normalmente lenta (tanto que su velocidad
es indetectable), pero que es una reacción termodinamicamente posible?

2. Pueden hacer posible una reacción química que de otra manera sería
imposible?

6 C + 9 O2 + 6 H2

Proceso 2 Proceso 1

C6H12O6 + 6 O2

Proceso 3 6 CO2 + 6 H2O

Cambio de energía libre (G): medida de espontaneidad

Procesos espontáneos: se caracterizan por cambio de

nergía libre negativo. Ocurre cuando la energía libre de
los componentes disminuye. Proceso Exergónico

Procesos no espontáneos: se caracterizan por cambio de

energía libre positivo. Proceso Endergónico
Sin embargo la espontaneidad de un proceso no dice nada
acerca de cuán rápido éste ocurre.

Muchos procesos altamente espontáneos ocurren

extremadamente lento a temperatura ambiente.
 Para reacciones unimoleculares: A Producto

la velocidad es v= k [A]

Para reacciones bimoleculares: A +B Producto

la velocidad es v = k [A] [B]

Diferentes reacciones química proceden a distintas velocidades

porque tienen constantes de velocidad distintas.
Energía libre, G Estado de transición ( )

S
Estado basal
P
Estado basal

Coordenada de reacción
La velocidad de cualquier reacción está determinada por la
concentración de reactante(s) y por una constante de
velocidad k

v = k [A]

Por lo tanto para entender cómo las enzimas aumentan la

velocidad de una reacción debemos entender la relación
entre k y energía de activación.

Esta relación deriva principalmente del trabajo de Eyring

(1935) conocido como teoría del estado de transición, que
intenta relacionar la velocidad de las reacciones químicas
con propiedades termodinámicas de un estado particular
de alta energía, el estado de transición.
Estado de Transición
Isomerización de L-Prolina a D-Prolina por la
enzima racemasa

El análogo del estado de transición se

une 160 veces más fuerte que el
sustrato prolina

análogo del estado de transición

Se considera la formación del estado de transición como un equilibrio
químico corriente:

A+B AB# (estado de transición)

Estado de transición tiene constante de equilibrio: Keq# = [AB#] / [A] [B]

de donde se desprende que hay una energía libre de formación asociada a
AB# a partir de A y B:

G# = - RT ln Keq#

Eyring encontró que la velocidad de reacción está dada por:

v = RT [AB#] [AB#] = Keq# [A] ]B]

Nh
Por lo tanto:
v = RT Keq# [A] [B] = k [A] [B]
Nh
k constante de velocidad de segundo orden