Chemical Composition of The Body - StelaMaris
Chemical Composition of The Body - StelaMaris
Disusun oleh:
Stella Maris Adinda 22030113120020
Struktur dan proses fisiologis tubuh berdasarkan untuk tingkat besar, pada sifat dan
interaksi dari atom, ion, dan molekul. Air adalah konstituen utama dari tubuh dan
menyumbang 65% hingga 75% dari berat badan orang dewasa. Dua-pertiga dari air terdapat
dalam sel-sel tubuh, atau dalam kompartemen intraseluler; sisanya terdapat dalam
kompartemen ekstraseluler (cairan darah dan jaringan). Banyak molekul organik yang terlarut
dalam air (misalnya molekul yang mengandung karbon seperti karbohidrat, lemak, protein,
dan asam nukleat) serta molekul anorganik dan ion (atom dengan muatan bersih).
A. Atom
Atom adalah unit terkecil dari materi yang dapat mengalami kimia
perubahan kimia. Atom terlalu kecil untuk dilihat secara sendiri-sendiri,
bahkan dengan mikroskop elektron. Pusat atom merupakan nukleus.
Nukleus berisi dua jenis partikel-proton, yang menyimpan muatan positif dan neutron, dan
tidak membawa muatan (netral). Massa proton sama dengan massa neutron,dan jumlah dari
proton dan neutron dalam atom sama dengan massa atom dari atom. Sebagai contoh, sebuah
atom karbon, yang berisi enam proton dan enam neutron, memiliki massa atom 12 (tabel 2.1).
Massa elektron tidak dianggap ketika menghitung massa atom, karena terlalu kecil apablia
dibandingkan dengan massa proton dan neutron.
Jumlah proton dalam atom disebut nomor atom. Karbon memiliki enam proton dan dengan
demikian memiliki nomor atom 6. Di luar inti/nukleus yang bermuatan positif terdapat
partikel subatomik bermuatan negatif yang disebut elektron. Karena nomor
elektron dalam atom sama dengan jumlah proton, atom memiliki muatan bersih nol. Sebuah
elektron dapat menempati posisi apapun dalam volume tertentu pada ruang yang disebut
orbital dari elektron. Orbital membentuk kulit, atau tingkat energi, di luar yang biasanya tidak
dilalui elektron.
Terdapat sejumlah kulit yang berpotensi berada di sekitar inti, dengan masing-masing kulit
secara berturut-turut jauh dari inti. Kulit pertama, yang paling dekat dengan inti, hanya dapat
berisi dua elektron. Jika atom memiliki lebih dari dua elektron (seperti semua atom kecuali
hidrogen dan helium), elektron tambahan harus menempati kulit yang lebih jauh dari inti.
Kulit kedua dapat berisi maksimal delapan elektron dan kulit yang lebih tinggi dapat
mengandung lebih banyak lagi elektron yang memiliki lebih banyak energi yang lebih jauh
dari inti. Kebanyakan elemen penting biologis (selain hidrogen) memerlukan delapan
elektron untuk melengkapi kulit terluar. Kulit diisi dari yang terdalam ke luar. Karbon,
dengan enam elektron, memiliki dua elektron pada kulit pertama dan empat elektron di kulit
kedua (gambar 2.1). Elektron selalu di kulit terluar apabila kulit tidak lengkap, yang
berpartisipasi dalam reaksi kimia dan membentuk ikatan kimia. Elektron terluar dikenal
sebagaielektron valensi atom.
Tabel 2.1 Tabel Atom yang sering dijumpai di Molekul Organik
Atom Simbol Nomor Massa Kulit 1 Kulit 2 Kulit 3 Jumlah
Atom Atom Ikatan
Kimia
Hidrogen H 1 1 1 0 0 1
Karbon C 6 12 2 4 0 4
Nitrogen N 7 14 2 5 0 3
Oksigen O 8 16 2 6 0 2
Sulfur S 16 32 2 8 6 2
Isotop
Sebuah atom tertentu dengan sejumlah proton dalam nukleus
dapat ada dalam beberapa bentuk yang berbeda satu sama lain dalam neutron. Atom dalam
bentuk ini sama tetapi massa atom mereka berbeda. Perbedaan bentuk ini disebut isotop.
Semua bentuk isotop dari atom yang diberikan termasuk dalam unsur kimia. Elemen
hidrogen, misalnya, memiliki tiga isotop. Yang paling umum dari isotop
yaitu memiliki inti yang terdiri dari hanya satu proton. Isotop lain dari
hidrogen (disebut deuterium) memiliki satu proton dan satu neutron dalam inti, sedangkan
isotop ketiga (tritium) memiliki satu proton dan dua neutron. Tritium adalah isotop radioaktif
yang umum digunakan dalam penelitian fisiologis dan dalam banyak
prosedur laboratorium klinis.
Gambar 2.1 Diagram atom hidrogen dan karbon. Kulit elektron di sebelah kiri diwakili oleh bidang
berbayang yang menunjukkan kemungkinan posisi elektron. Kulit di bagian kanan digambarkan oleh
lingkaran konsentris.
Ikatan Kovalen
Ikatan kovalen terjadi ketika atom membagikan elektron valensi mereka.
Ikatan kovalen yang terbentuk antara atom-atom yang identik, seperti dalam gas oksigen (O2)
dan gas hidrogen (H2), merupakan ikatan yang terkuat karena elektron mereka sama-sama
terbagi. Karena elektron sama-sama didistribusikan antara dua atom, molekul ini dikatakan
nonpolar dan ikatan antara molekul ini adalah ikatan kovalen nonpolar.
Ikatan tersebut juga penting dalam kehidupan organisme. Sifat unik dari atom karbon dan
molekul organik yang terbentuk melalui ikatan kovalen antara atom karbon
memberikan pondasi kimia. Ketika ikatan kovalen terbentuk antara dua atom yang berbeda,
elektron dapat ditarik lebih ke arah satu atom dibanding yang lain. Molekul paling akhir
menuju ke arah elektron yang ditarik merupakan negatif secara elektri dibandingkan dengan
ujung yang lain. Seperti halnya, molekul dikatakan polar (memiliki kutub positif dan negatif).
Atom oksigen, nitrogen, dan fosfor memiliki kecenderungan sangat kuat untuk menarik
elektron terhadap diri mereka sendiri ketika berikatan dengan atom lain; dengan demikian,
mereka cenderung membentuk molekul polar.
Gambar 2.2 Sebuah molekul hidrogen menunjukkan ikatan kovalen antara atom hidrogen. Ikatan ini
terbentuk karena berbagi elektron dalam jumlah sama.
Air adalah molekul yang paling banyak dalam tubuh dan berfungsi sebagai pelarut untuk
cairan tubuh. Air adalah pelarut yang baik karena polar; atom oksigen menarik elektron dari
dua hidrogen ke sisinya dari molekul air, sehingga sisi oksigen bermuatan lebih negatif
daripada sisi hidrogen dari molekul (gambar. 2.4).
Gambar 2.3 Molekul-molekul metana dan amonia diwakili dalam tiga cara yang berbeda. Ikatan
antara dua atom terdiri dari sepasang elektron bersama (elektron dari kulit terluar setiap atom)
Gambar 2.4 Sebuah model dari molekul air menunjukkan sifat kutub. Sisi oksigen dari molekul
adalah negatif, sedangkan sisi hidrogen positif. ikatan kovalen polar lebih lemah daripada ikatan
kovalen nonpolar. Akibatnya, beberapa molekul air mengionisasi untuk membentuk
ion hidroksil (OH-) dan ion hidrogen (H +).
Ikatan Ionik
Ikatan ion terjadi ketika satu atau lebih elektron valensi dari satu atom secara lengkap
dikirim ke atom kedua. Dengan demikian, elektron tidak dibagi sama sekali. Atom pertama
kehilangan elektron, sehingga jumlah elektron menjadi lebih kecil dibanding jumlah proton;
dan itu menjadi bermuatan positif. Atom atau molekul yang memiliki muatan positif atau
negatif disebut ion. Ion bermuatan positif disebut kation karena mereka bergerak ke arah
kutub negatif, atau katoda dalam medan listrik. Atom kedua sekarang memiliki lebih banyak
elektron dibanding memiliki proton dan menjadi ion bermuatan negatif, atau anion (disebut
demikian karena bergerak menuju kutub positif, atau anoda,dalam medan listrik). Kation dan
anion kemudian menarik satu sama lain untuk membentuk senyawa ionik.
Garam meja biasa, natrium klorida (NaCl), adalah contoh dari senyawa ionik. Natrium,
dengan total sebelas elektron, memiliki dua elektron di kulit pertama, delapan elektron di
kulit kedua, dan satu di kulit ketiga. Klorin, sebaliknya, adalah elektron yang melengkapi
kulit terluarnya dari delapan elektron. Elektron dalam kulit luar natrium ini tertarik untuk ke
kulit luar klorin. Hal ini menciptakan ion klorida (Cl-) dan ion natrium (Na+). Meskipun
garam meja ditampilkan sebagai NaCl, itu sebenarnya terdiri Na+ Cl- (gambar. 2.5).
Gambar 2.5 Reaksi natrium dengan klorin untuk menghasilkan ion natrium dan klorida. Natrium
positif dan ion klorida negatif menarik satu sama lain, menghasilkan ion senyawa natrium klorida
(NaCl).
Ikatan ion lebih lemah daripada ikatan kovalen polar, danoleh karena itu senyawa ionik
dengan mudah terpisah ketika dilarutkan dalam air. Disosiasi NaCl, misalnya, menghasilkan
Na+ dan Cl-. Masing-masing ion ini menarik molekul air polar; ujung negatif molekul air
tertarik ke Na+, dan ujung positif dari molekul air tertarik ke Cl- (gambar. 2.6). Molekul air
yang mengelilingi ion ini pada gilirannya menarik molekul air lainnya untuk membentuk
bulatan hidrasi sekitar masing-masing ion.
Ikatan Hidrogen
Ketika atom hidrogen membentuk ikatan kovalen polar dengan atom oksigen atau nitrogen,
hidrogen memperoleh sedikit muatan positif sebagai elektron dan ditarik menuju atom
lainnya. Atom lain ini sehingga digambarkan sebagai elektronegatif. Karena hidrogen
memiliki sedikit muatan positif, maka itu akan memiliki daya tarik yang lemah untuk atom
elektronegatif kedua (oksigen atau nitrogen) yang mungkin berlokasi dekat. Daya tarik yang
lemah ini disebut ikatan hidrogen. Ikatan hidrogen biasanya ditampilkan dengan putus-putus
atau garis putus-putus (gambar. 2.7) untuk membedakan mereka dari ikatan kovalen yang
kuat, yang ditunjukkan dengan garis yang solid.
Gambar 2.7 Ikatan hidrogen antara molekul air. Atom oksigen dari molekul air secara lemah
bergabung bersama-sama karena tarikan oksigen elektronegatif untuk hidrogen bermuatan positif.
Ikatan tersebut merupakan ikatan hidrogen.
Meskipun setiap ikatan hidrogen relatif lemah, jumlah kekuatan menarik mereka sebagian
besar bertanggung jawab untuk lipatan dan bengkokan dari molekul organik yang panjang
seperti protein dan untuk memegang bersama-sama dari dua helai molekul DNA. Ikatan
hidrogen juga dapat terbentuk antara molekul air yang berdekatan (gambar. 2.7). Ikatan
hidrogen antara molekul air bertanggung jawab untuk banyak sifat biologis air, termasuk
tegangan permukaan dan kemampuannya untuk ditarik sebagai kolom melalui saluran sempit
dalam proses yang disebut aksi kapiler.
pH
Konsentrasi H+ pada larutan biasanya ditunjukkan dalam unit pH pada skala pH yang
berjalan dari 0 sampai 14. Nilai pH sama untuk logaritma dari 1 lebih konsentrasi H+.
Panah ganda menunjukkan bahwa reaksi bersifat bolak-balik; arah tergantung pada
konsentrasi molekul dan ion di setiap sisi. Jika asam (seperti asam laktat) harus melepaskan
H+ dalam larutan, misalnya, peningkatan konsentrasi H+ akan mendorong keseimbangan ke
kanan dan reaksi berikut akan dipromosikan.
Perhatikan bahwa, dalam reaksi ini, H + diambil dari larutan. Dengan demikian,
konsentrasi H+ dicegah daripeningkatan (dan pH dicegah untuk turun) oleh aksi penyangga
bikarbonat.
pH Darah
Asam laktat dan asam organik lainnya yang diproduksi oleh sel-sel tubuh dan disekresikan
ke dalam darah. Meskipun pembebasan H + oleh asam ini, pH darah arteri biasanya tidak
turun tapi sangat konstan pada pH 7,40 ± 0,05. Bikarbonat berfungsi sebagai penyangga
utama darah.
Kondisi tertentu dapat menyebabkan perubahan berlawanan pH.
Misalnya, muntah yang berlebihan yang mengakibatkan hilangnya asam lambung
dapat menyebabkan konsentrasi bebas H+ dalam darah turun dan pH darah meningkat. Dalam
hal ini, reaksi yang dijelaskan sebelumnya bisa dibalik:
Disosiasi asam karbonat menghasilkan ion bebas H+, yang membantu untuk mencegah
peningkatan pH. Ion bikarbonat dan asam karbonat sehingga bertindak sebagai sepasang
penyangga untuk mencegah baik berkurang atau meningkatnya pH, masing-masing.
Tindakan penyangga ini biasanya mempertahankan pH darah dalam kisaran sempit 7,35-7,45.
Jika pH darah arteri turun di bawah 7,35, kondisi ini disebut asidosis. Peningkatan pH darah
di atas 7,45, sebaliknya, dikenal sebagai alkalosis. Asidosis dan alkalosis biasanya dicegah
dengan tindakan pasangan asam penyangga bikarbonat/karbonat dan oleh fungsi paru-paru
dan ginjal.
D. Molekul Organik
Molekul organik adalah molekul yang mengandung atom karbon dan hidrogen. Karena
atom karbon memiliki empat elektrondi kulit terluarnya, ia harus berbagi empat elektron
tambahan dengan ikatan kovalen dengan atom lain untuk mengisi kulit terluarnya dengan
delapan elektron. Persyaratan ikatan yang unik pada karbon mengaktifkannya untuk
bergabung dengan atom karbon lainnya membentuk rantai dan cincin, sementara itu masih
memungkinkan atom karbon untuk berikatan dengan hidrogen dan atom lainnya.
Kebanyakan molekul organik dalam tubuh mengandung rantai dan cincin hidrokarbon,
serta atom lain terikat karbon. Dua atom karbon yang berdekatan dalam rantai atau cincin
dapat berbagi satu atau dua pasangan elektron. Jika dua atom karbon berbagi satu pasang
elektron, mereka dikatakan memiliki ikatan kovalen tunggal dan setiap atom karbon bebas
untuk berikatan dengan sebanyak tiga atom lainnya. Jika dua atom karbon berbagi dua pasang
elektron, mereka memiliki ikatan kovalen ganda, dan setiap atom karbon dapat berikatan
dengan maksimal dua atom tambahan (gambar. 2.8).
Ujung beberapa hidrokarbon bergabung bersama-sama untuk membentukcincin. Dalam
rumus struktur singkatan untuk molekul-molekul ini, atom karbon tidak ditampilkan tetapi
dipahami terletak di sudut-sudut cincin. Beberapa molekul siklik memilikiikatan ganda antara
dua atom karbon yang berdekatan. benzena danmolekul terkait ditampilkan sebagai cincin
enam sisi dengan ikatan ganda. Senyawa-senyawa tersebut disebut aromatik. Karena semua
karbon dalam cincin aromatik setara, ikatan ganda akan ditampilkan antara dua karbon yang
berdekatan di cincin (gambar. 2.9), atau bahkan sebagai lingkaran dalam struktur heksagonal
dari karbon.
Gambar 2.8 Ikatan kovalen tunggal dan ganda. Dua atom karbon dapat bergabung dengan ikatan
kovalen tunggal (kiri) atau ikatan kovalen ganda (kanan). Di kedua kasus, setiap atom karbon berbagi
empat pasang elektron (memiliki empat ikatan) untuk menyelesaikan delapan elektron yang
dibutuhkan untuk mengisi kulit terluarnya.
Gambar 2.9 Perbedaan bentuk molekul Gambar 2.10 Berbagai kelompok
hidrokarbon (a)Linear (b) siklik (c) memiliki fungsional molekul organik. Simbol umum
cincin aromatik untuk kelompok fungsional adalah "R."
Gambar 2.11 Kategori molekul organik Gambar 2.12 Gugus karboksil dari asam
berdasarkan kelompok fungsional. organik
Stereoisomer
Dua molekul mungkin memiliki atom yang sama yang diatur dalam
urutan yang sama persis namun berbeda tata ruang orientasi kelompok fungsional utama.
Molekul tersebut disebut stereoisomer satu sama lain. Tergantung pada arah di mana
kelompok fungsional utama berorientasi sehubungan dengan molekul, stereoisomer disebut
D-isomer (untuk dextro, atau tangan kanan) atau L-isomer (untuk levo, atau kidal).
Perbedaan yang halus dalam struktur sangat penting secara biologis. Mereka memastikan
bahwa enzim-yang berinteraksi dengan molekul seperti dengan cara stereo khusus di reaksi
kimia tidak dapat bergabung dengan stereoisomer yang salah. Enzim dari semua sel (manusia
dan lain-lain) dapat bergabung hanya dengan asam L-amino dan D-gula, misalnya.
stereoisomer berlawanan (D-asam amino dan L-gula) tidak dapat digunakan oleh setiap
enzim dalam metabolisme.
Gambar 2.13 rumus struktur untuk tiga gula heksosa. Representasi di sebelah kiri menunjukkan
atom dalam setiap molekul, sedangkan struktur cincin di sebelah kanan lebih
akurat mencerminkan cara atom-atom ini disusun.
Monosakarida, Polisakarida, Disakarida
Dua monosakarida dapat bergabung secara kovalen untuk membentuk disakarida,
atau gula ganda. Disakarida umum meliputi gula meja, atau sukrosa (terdiri dari glukosa dan
fruktosa); gula susu atau laktosa (terdiri dari glukosa dan galaktosa); dan gula malt, atau
maltosa (terdiri dari dua molekul glukosa). Ketika banyak monosakarida bergabung bersama-
sama, molekul yang dihasilkan disebut polisakarida. Pati, misalnya, polisakarida ditemukan
dalam banyak tanaman, dibentuk oleh ikatan bersama ribuan subunit glukosa. Glikogen (pati
hewani), ditemukan di hati dan otot, juga terdiri dari mengulangi molekul glukosa, tetapi
lebih bercabang dari pati tanaman (gambar. 2.14).
Apabila sel menyimpan banyak ribuan molekul monosakarida yang terpisah, namun,
konsentrasi mereka dalam jumlah tinggi akan menarik jumlah yang berlebihan dari air
ke dalam sel dan merusaknya. Pergerakan air melalui membran disebut osmosis. Sel yang
menyimpan karbohidrat untuk energi, meminimalkan kerusakan osmotik ini dengan bukan
bergabung dengan molekul glukosa bersama-sama untuk membentuk pati polisakarida atau
glikogen. Karena ada lebih sedikit dari molekul-molekul yang lebih besar, air yang kurang
tersebut diambil ke dalam sel melalui osmosis.
Gambar 2.15 sintesis dehidrasi disakarida. Dua disakarida yang terbentuk di sini adalah (a) maltosa
dan (b) sukrosa (gula meja). Perhatikan bahwa molekul air yang dihasilkan sebagai disakarida
terbentuk.
Gambar 2.16 Hidrolisis pati. polisakarida yang pertama dihidrolisis menjadi (a) disakarida (maltosa)
dan kemudian ke (b) monosakarida (glukosa). Perhatikan bahwa sebagai ikatan kovalen antara
pecahan subunit, molekul air adalah dibelah. Dengan cara ini, atom hidrogen dan gugus hidroksil dari
air ditambahkan ke ujung subunit dirilis.
LEMAK
Kategori molekul yang dikenal sebagai lipid meliputi beberapa jenis molekul yang
berbeda dalam struktur kimia. Lipid terutama terdiri rantai hidrokarbon dan cincin, yang
nonpolar dan karena itu bersifat hidrofobik. Meskipun lipid tidak larut dalam air, mereka
dapat larut dalam pelarut nonpolar seperti eter, benzena, dan senyawa terkait.
Trigliserida
Trigliserida adalah subkategori dari lipid yang mencakup lemak dan
minyak. Molekul-molekul ini dibentuk oleh kondensasi satu molekul gliserol (alkohol tiga
karbon) dengan tiga molekul asam lemak. Setiap molekul asam lemak terdiri dari rantai
hidrokarbon nonpolar dengan gugus karboksil (disingkat COOH) pada satu
akhir. Jika terdapat atom karbon dalam rantai hidrokarbon yang bergabung dengan ikatan
kovalen tunggal sehingga setiap atom karbon dapat juga berikatan dengan dua atom hidrogen,
asam lemak dikatakan jenuh. Jika ada sejumlah ikatan kovalen ganda dalam rantai
hidrokarbon sehingga setiap atom karbon hanya dapat berikatan dengan satu atom hidrogen
maka asam lemak dikatakan jenuh. Trigliserida mengandung kombinasi yang berbeda jenuh
dan asam lemak tak jenuh. Mereka dengan asam lemak jenuh sebagian besar disebut lemak
jenuh; sedangkan dengan lemak tak jenuh sebagian besar asam disebut lemak tak jenuh
(gambar. 2.17).
Gambar 2.17 Rumus struktur untuk asam lemak. Ikatan ganda ditandai dengan warna kuning.
Gambar 2.18 Pembentukan molekul trigliserida (triasilgliserol) dari gliserol dan tiga asam lemak
dengan reaksi sintesis dehidrasi. Garis bergelombang merupakan rantai hidrokarbon, yang
dilambangkan oleh R.
Dalam sel-sel adiposa tubuh, trigliserida dibentuk sebagai karboksil molekul asam lemak
mengembun dengan kelompok hidroksil dari molekul gliserol (gambar. 2.18). Sejak
atom hidrogen dari karboksil berakhir pada asam lemak dari molekul air selama sintesis
dehidrasi, asam lemak yang dikombinasikan dengan gliserol tidak bisa lagi melepaskan H+
dan fungsi sebagai asam. Untuk alasan ini, trigliserida dikategorikan sebagai lemak netral.
Badan Keton
Hidrolisis trigliserida dalam jaringan adiposa lemak membebaskan
asam ke dalam darah. Asam lemak bebas dapat digunakan sebagai sumber energi langsung
oleh banyak organ; mereka juga dapat dikonversi oleh hati menjadi turunan yang disebut
badan keton (gambar. 2.19). Ini termasuk molekul asam empat karbon panjang (asam
asetoasetat dan asam ß-hidroksibutirat) dan aseton. Sebuah pemecahan lemak yang cepat,
mungkin terjadi selama diet rendah karbohidrat ketat dan diabetes mellitus yang tidak
terkontrol, hasil di peningkatan kadar badan keton dalam darah. Ini adalah suatu kondisi
disebut ketosis. Jika ada jumlah badan keton yang cukup dalam darah untuk menurunkan pH
darah, kondisi ini disebut ketoasidosis. Ketoasidosis berat, yang dapat terjadi pada diabetes
mellitus, dapat menyebabkan koma dan kematian.
Gambar 2.19 Badan Keton. Asam asetoasetat, sebuah keton asam tubuh, secara spontan dapat
mengalami dekarboksilasi (kehilangan karbon dioksida) untuk membentuk aseton. Aseton adalah
badan keton mudah menguap dan dihembuskan melalui napas, sehingga meminjamkan menghasilkan
bau nafas "buah" pada orang dengan ketosis (peningkatan badan keton darah).
Fosfolipid
Jenis yang paling umum dari molekul fosfolipid adalah salah satu di mana tiga-karbon
molekul alkohol gliserol terpasang untuk dua molekul asam lemak; atom karbon ketiga
molekul gliserol yang melekat ke gugus fosfat, dan fosfat Kelompok pada gilirannya terikat
dengan molekul lain. Jika kelompok fosfat melekat pada molekul kolin yang mengandung
nitrogen maka terbentuklah lesitin (atau fosfatidilkolin). Gambar 2.20 menunjukkan cara
sederhana untuk menggambarkan struktur dari bagian-bagian fosfolipid dari molekul yang
mampu mengionisasi (dan dengan demikian menjadi bermuatan) akan ditampilkan sebagai
lingkaran, sedangkan bagian nonpolar dari molekul diwakili dengan garis gigi gergaji.
Gambar 2.20 Struktur Lesitin. Struktur rinci fosfolipid yang (atas) biasanya ditampilkan dalam bentuk
disederhanakan (bawah), di mana lingkaran mewakili bagian kutub dan garis bergigi bagian nonpolar
dari molekul.
Steroid
Dalam hal struktur, steroid sangat berbeda dari trigliserida atau fosfolipid, namun steroid
masih termasuk dalam kategori molekul lipid karena mereka nonpolar dan tidak larut dalam
air. Semua molekul steroid memiliki struktur dasar yang sama: tiga cincin enam karbon
bergabung ke salah satu cincin lima karbon (gambar. 2.22). Namun, berbagai jenis steroid
memiliki kelompok fungsional yang berbeda melekat pada struktur dasar ini, dan mereka
bervariasi dalam jumlah dan posisi ikatan kovalen ganda antara atom karbon di cincin.
Kolesterol merupakan molekul penting dalam tubuh karena berfungsi sebagai prekursor
(molekul induk) untuk hormon steroid diproduksi oleh gonad dan korteks adrenal. Testis dan
ovarium (disebut gonad) mengeluarkan steroid seks, yang meliputi estradiol dan progesteron
dari ovarium dan testosteron dari testis. Korteks adrenal mensekresi kortikosteroid, termasuk
hidrokortison dan aldosteron, serta androgen lemah (termasuk dehydroepiandrosterone, atau
DHEA). Kolesterol juga merupakan komponen penting dari membran sel, dan berfungsi
sebagai prekursor molekul untuk garam empedu dan vitamin D3.
Prostaglandin
Prostaglandin adalah jenis asam lemak dengan kelompok siklik hidrokarbon.
Prostaglandin terlibat dalam regulasi diameter pembuluh darah, ovulasi, kontraksi rahim
selama persalinan, peradangan reaksi, pembekuan darah, dan banyak fungsi lainnya. Formula
struktur untuk berbagai jenis prostaglandin ditunjukkan pada Gambar 2.23.
F. PROTEIN
Asam amino ini, seperti yang akan dijelaskan pada bagian berikutnya, bergabung
bersama untuk membentuk rantai. Karena interaksi kimia antara asam amino, rantai dapat
memutar dan melipat dengan cara spesifik. Urutan asam amino dalam protein, dan sehingga
struktur spesifik dari protein, ditentukan oleh informasi genetik. Informasi genetik ini untuk
sintesis protein terkandung dalam kategori lain dari molekul organik, asam nukleat, yang
meliputi makromolekul DNA dan RNA.
Struktur Protein
Protein terdiri dari rantai panjang dari subunit yang disebut asam amino.
Sesuai namanya, masing-masing asam amino mengandung gugus amino
(NH2) pada salah satu ujung molekul dan gugus karboksil (COOH) pada akhir lain.
Perbedaan antara asam amino disebabkan oleh perbedaan dalam kelompok fungsional
mereka. "R" adalah singkatan untuk kelompok fungsional dalam rumus umum untuk
asam amino (gambar. 2.24). Simbol R sebenarnya adalah singkatan untuk kata residu, tetapi
dapat dianggap menunjukkan "sisa molekul. "
Ketika asam amino bergabung bersama oleh sintesis dehidrasi, hidrogen dari ujung amino
menggabungkan asam amino satu dengan kelompok hidroksil dari akhir karboksil asam
amino lain. Sebagai ikatan kovalen yang terbentuk antara dua asam amino, air dihasilkan
(gambar. 2.25). Ikatan antara asam amino yang berdekatan disebut ikatan peptida, dan
senyawa terbentuk disebut peptida. Dua asam amino terikat bersama-sama disebut dipeptida;
tiga, tripeptida. Ketika banyak asam amino bergabung dengan cara ini, rantai asam amino,
atau polipeptida diproduksi.
Struktur protein dapat dijelaskan di empat tingkat berbeda. Pada tingkat pertama, urutan
asam amino dalam protein dijelaskan; ini disebut struktur utama dari protein. Setiap jenis
protein memiliki struktur utama yang berbeda. Semua miliaran salinan dari jenis tertentu dari
protein dalam diri seseorang memiliki struktur yang sama, namun, karena struktur yang
didapat dari protein dikodekan oleh gen seseorang. Struktur utama protein diilustrasikan pada
Gambar 2.26a. Ikatan hidrogen yang lemah dapat membentuk antara atom hidrogen
dari gugus amino dan sebuah atom oksigen dari asam amino yang berbeda di dekatnya.
Ikatan yang lemah dapat menyebabkan rantai polipeptida mengasumsikan bentuk tertentu,
yang dikenal sebagai struktur sekunder protein (gambar. 2.26b, c). Ini bisa menjadi bentuk
alpha (α) heliks, atau secara alternatif, bentuk yang disebut beta (β) lembar lipit.
Kebanyakan rantai polipeptida tikungan dan lipat menghasilkan kompleks bentuk tiga
dimensi yang disebut struktur protein tersier (gambar. 2.26d). Setiap jenis protein memiliki
struktur tersier karakteristik sendiri. Hal ini karena lipat dan lentur dari rantai polipeptida
diproduksi oleh interaksi kimia antara asam amino tertentu yang terletak di berbagai daerah
rantai. Struktur tersier dari beberapa protein, bagaimanapun, dibuat lebih stabil dengan ikatan
kovalen yang kuat antara atom sulfur (disebut ikatan disulfida dan disingkat
S-S) pada kelompok fungsional asam amino yang dikenal sistein (gambar. 2.27).
Hemoglobin dan insulin terdiri dari sejumlah rantai polipeptida kovalen terikat bersama.
Ini adalah struktur kuartener molekul-molekul. Insulin, misalnya,terdiri dari dua polipeptida
rantai-satu yang dua puluh satu asam amino yang panjang, yang lain yang tiga puluh amino
Asam panjang. Hemoglobin terdiri dari empat rantai polipeptida yang terpisah
(Lihat gambar. 2.26e). Komposisi berbagai protein tubuh ditunjukkan dalam tabel 2.4.
Tabel 2.4 Komposisi Protein yang ditemukan dalam tubuh
Protein Jumlah rantai Komponen Fungsi
polipeptida nonprotein
Gambar 2.24 asam amino representatif. Gambar tersebut menggambarkan berbagai jenis fungsional
kelompok (R). Setiap asam amino berbeda dari asam amino lainnya dalam jumlah dan susunan
kelompok fungsional.
Gambar 2.25 Pembentukan ikatan peptida oleh reaksi sintesis dehidrasi. Molekul air memisahkan diri
sebagai ikatan peptida yang diproduksi antara asam amino.
Gambar 2.26 Struktur protein. (A) Struktur primer mengacu pada urutan asam amino dalam rantai
polipeptida. Struktur sekunder mengacu pada konformasi rantai yang dibuat oleh ikatan hidrogen
antara asam amino; ini dapat berupa heliks alfa (b) atau beta lipit (c) struktur tersier (d) struktur tiga
dimensi protein. Pembentukan protein oleh ikatan bersama-sama dari dua atau lebih
rantai polipeptida adalah struktur kuaterner (e) dari protein.
Fungsi Protein
Contoh fungsi protein seperti protein struktural termasuk kolagen (gambar. 2.28) dan
keratin. Kolagen adalah protein berserat yang menyediakan kekuatan tarik ke jaringan ikat,
seperti tendon dan ligamen. Keratin ditemukan di lapisan luar sel-sel mati di epidermis, yang
mana mencegah kehilangan air melalui kulit.
Enzim dan antibodi, misalnya, adalah protein jenis lain dari molekul
yang menyediakan susunan yang luas dari struktur yang berbeda yang dibutuhkan
untuk fungsi mereka yang sangat bervariasi. Sebagai contoh lain,
protein dalam membran sel dapat berfungsi sebagai reseptor untuk molekul regulator spesifik
(seperti hormon) dan sebagai pembawa untuk transportasi molekul tertentu melintasi
membran. Protein menyediakan keragaman bentuk dan sifat kimia yang dibutuhkan
oleh fungsi-fungsi ini.
G. ASAM NUKLEAT
Nukleotida adalah subunit asam nukleat, terikat bersama-sama
dalam reaksi sintesis dehidrasi untuk membentuk polinukleotida rantai lama. Setiap
nukleotida terdiri dari tiga subunit kecil: lima karbon (pentosa) gula, kelompok fosfat yang
melekat pada salah satu ujung gula, dan basa nitrogen yang
yang melekat pada ujung gula (gambar. 2.29). Basa nitrogen
adalah molekul yang mengandung nitrogen dari dua jenis: pirimidin dan purin. Pirimidin
mengandung cincin karbon tunggal dan nitrogen, sedangkan purin memiliki dua cincin
tersebut.
H. ASAM DEOKSIRIBONUKLEAT
Struktur DNA (asam deoksiribonukleat) berfungsi sebagai dasar untuk kode genetik..
DNA memang lebih besar daripada molekul lain dalam sel, namun struktursebenarnya lebih
sederhana daripada kebanyakan protein. Molekul gula pada nukleotida DNA adalah
jenispentosa (lima karbon) gula yang disebut deoksiribosa. Setiap deoksiribosadapat terikat
kovalen satu dari empat basa yang mungkin. Dasar tersebut mencakup dua purin (guanin dan
adenin) dan dua pirimidin (sitosin dan timin) (gambar. 2.30).
Ketika nukleotida dikombinasikan untuk membentuk rantai, kelompok fosfat
satu mengembun dengan gula deoksiribosa nukleotida lain. Karena basa nitrogen yang
melekat pada molekul gula, rantai gula-fosfat terlihat seperti "tulang punggung"
dari dasar proyek. Setiap pangkalan tersebut dapat membentuk ikatan hidrogen dengan basa
lainnya, yang pada gilirannya bergabung ke rantai nukleotida yang berbeda. Seperti ikatan
hidrogen antara basa sehingga menghasilkan molekul DNA untai ganda; dua helai
seperti tangga, dengan basa dipasangkan sebagai anak tangga (gambar. 2.30).
Sebenarnya, dua rantai DNA satu sama lain membentuk helix ganda, sehingga molekul
menyerupai tangga spiral (gambar. 2.31). Telah terbukti bahwa jumlah basa purin dalam
DNA adalah sama dengan jumlah basa pirimidin. Hal tersebut dijelaskan oleh hukum dasar
pasangan komplementer: adenin dapat memasangkan hanya dengan timin (melalui dua ikatan
hidrogen), sedangkan guanin dapat memasangkan hanya dengan cytosine (melalui tiga ikatan
hidrogen). Dengan pengetahuan tentang aturan ini, kita bisa memprediksi urutan dasar satu
untai DNA jika kita tahu urutan basa dalam untai komplementer.
Gambar 2.29 Struktur general nukleotida
Gambar 2.30 Empat basa nitrogen dalam asam deoksiribonukleat (DNA). Perhatikan bahwa ikatan hidrogen
dapatterbentuk antara guanin dan sitosin dan antara timin dan adenine.
Gambar 2.31 Struktur double-helix dari DNA. Dua helai yang terbentuk bersama ikatan
hidrogen antara basa komplementer di setiap untai.
I. ASAM RIBONUKLEAT
DNA dapat mengarahkan aktivitas sel hanya dengan cara jenis lain nukleat asam-RNA
(asam ribonukleat). Seperti DNA, RNA terdiri dari rantai panjang nukleotida bergabung
bersama oleh ikatan gula-fosfat. Nukleotida dalam RNA, berbeda dari yang di DNA dalam
tiga cara (gambar 2.32.): (1) ribonukleotida mengandung ribosa gula (bukan deoksiribosa),
(2) basa urasil ditemukan di tempat timin, dan (3) RNA terdiri dari polinukleotida untai
tunggal. Ada tiga jenis molekul RNA yang berfungsi dalam sitoplasma sel: messenger RNA
(mRNA), RNA transfer (TRNA), dan RNA ribosomal (rRNA).
Gambar 2.32 Perbedaan antara nukleotida dan gula di DNA dan RNA. DNA memiliki deoksiribosa
dan timin; RNA memiliki ribosa dan urasil. Tiga basa lainnya yaitu sama dalam DNA dan RNA.