MATERI TUTORIAL III

1. a. Jelaskan secara interaksi kimia apa yang terjadi antara enzim dan substrat pada kompleks ES.
b. Jelaskan manakah yang lebih stabil, enzim bebas atau kompleks enzim-substrat? (ES)

2. Untuk data kinetika enzim di bawah ini,

V0 (µM/sec) untuk E = 0,001µM

S (mM) I = 0 (mM) I = 2 (mM)

5 1,43 0,53
15 3.33 1,43
25 4.55 2,17
40 5,71 3,08

a. tentukan jenis inhibitor.

b. tentukan nilai Vmax dan Km untuk enzim tanpa inhibitor.
c. Berapakan nilai Kcat untuk enzim tersebut dan jelaskan apakah enzim bersifat efisien atau
tidak.
d. Tentukan nilak KI dari inhibitor.

3. Data pada tabel merupakan data hasil percobaan studi aktivitas katalitik dari enzim peptidase
dengan substrat glisilglisin
Tentukanlah Vmax dan Km enzim.

4. Prostaglandin merupakan golongan dari eikosanoid, suatu turunan asam lemak dengan kerja
yang potensial pada sel vertebrata, yang bertanggungjawab terhadap timbulnya demam dan
inflamasi yang berasosiasi dengan rasa sakit.. Prostaglandin merupakan turunan dari asam
lemak arakidonat yang mengandung 20 atom karbon. Dalam reaksinya dikatalisa oleh enzim
prostaglandin endoperoksidase sintase. Enzim ini, merupakan suatu siklooksigenase yang
menggunakan oksigen untuk merubah asam arakidonat menjadi PGG2, suatu prekursor
intermediet dari berbagai macam prostaglandin.

a. Data kinetik yang diberikan di dalam tabel berikut merupakan data dari reaksi yang
dikatalisa oleh prostaglandin endoperoksidase sintase.

KIS2104 BIOKIMIA INSTITUT TEKNOLOGI DEL RFK

 Menggunakan data di kolom pertama dan kedua tentukanlah, Vmax dan Km

b. Ibuprofen adalah suatu inhibitor prostaglandin endoperoksidase sintase. Dengan

menghambat sintesa prostaglandin, ibuprofen mengurangi inflamasi dan rasa sakit. Dengan
menggunakan data pada kolom pertama dan ketiga, tentukan tipe inhibisi dari ibuprofen
tersebut.

5. Anda bermaksud untuk mengulang data percobaan dari teman anda yang telah melaporkan
bahwa enzim yang dipelajari memiliki kcat 1875 s-1 dan efisiensi katalitik = 7,5 x 107 M-1s-1.

a. Berapakah nilai Km dari enzim tersebut?

b. Dalam mengulang percobaan tersebut anda bermaksud membuat Vmax = 10 mMs-1.
Berapakah konsentrasi enzim (dalam M) yang harus anda gunakan?
c. Hitunglah pada konsentrasi substrat (dalam M) yang mana harus anda ukur untuk
memperoleh vo seperti pada tabel di bawah ini.

Substrat (M) V0 (mM s-1)

? 2,5
? 4,5
? 6,0
? 9,0

6. a. Apa yang dimaksud dengan pH optimum?

b. Rantai samping apakah yang kemungkinan terdapat pada asam-asam amino yang
merupakan sisi aktif enzim yang memiliki pH optimum 4?
c. Rantai samping apakah yang kemungkinan terdapat pada asam-asam amino yang
merupakan sisi aktif enzim yang memiliki pH optimum 11?

7. Suatu reaksi yang dikatalisa oleh enzim, memiliki Vmaxapp = 0,8 Vmax pada saat kehadiran
5 nM inhibitor reversibel tetapi nilai Km tetap.
a. Jelaskan tipe inhibisi dari inhibitor tersebut.
b. Berapa persenkah molekul enzim yang berikatan pada inhibitor
c. Hitunglah konstanta inhibisi.

KIS2104 BIOKIMIA INSTITUT TEKNOLOGI DEL RFK

8. Sebutkan golongan masing-masing enzim yang mengkatalisa reaksi seperti di bawah ini:

9. Suatu enzim yang mengkatalisa substrat A menjadi B dengan persamaan reaksi A  B.

a. Pada percobaan pertama dengan [Et] = 4 nM dieperoleh Vmax = 1,6 M s-1. Berdasarkan
data ini, berapakah kcat. (beri satuan yang benar).
b. Pada percobaan lain dengan [Et] = 1 nM dan konsentrasi A = 30 M diperoleh
V0 = 300 nM s-1. Berapakah Km untuk substrat A tersebut?
c. Dari proses pemurnian enzim tersebut diketahui bahwa pada saat pengukuran aktivitas
pada a dan b di atas, enzim tersebt terkontaminasi dengan suatu inhibitor I. Setelah
dilakukan proses pemisahan inhibitor I dengan enzim. Maka diperoleh data;
Vmax pada percobaan (a) meningkat menjadi 4,8 M s-1 dan Km pada percobaan (b)
menjadi 15 M. Berdasarkan hasil ini tentukan  dan ’.
d. Berdasarkan data di atas apakah tipe inhibitor tersebut?

10. Suatu perusahaan merekayasa 2 enzim yang mendegradasi senyawa toksik menjadi senyawa
non-toksik. Tugas anda adalah mendegradasi jumlah senyawa toksik yang tinggi dalam waktu
yang singkat, Sifat kinetik dari kedua enzim tersebut ditampilkan pada tabel di bawah ini:

Enzim Km Vmax
A 2 mM 100 mM s-1
B 10 mM 500 mM s-1

KIS2104 BIOKIMIA INSTITUT TEKNOLOGI DEL RFK

 a. Berdasarkan data di atas, pada konsentrasi substrat yang rendah enzim yang manakah
yang akan lebih baik digunakan. Jelaskan mengapa.
b. Pada konsentrasi saturasi substrat, enzim manakah yang paling baik digunakan?
Jelaskan mengapa.

KIS2104 BIOKIMIA INSTITUT TEKNOLOGI DEL RFK