Anda di halaman 1dari 36

KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah yang maha kuasa yang telah melimpahkan rahmat, taufik, hidayah, serta inayah-Nya sehingga pemakalah dapat menyelesaikan

makalah Biologi sel dengan judul “ RIBOSOM DAN SINTESIS PROTEIN”.

Pemakalah mengucapkan terima kasih kepada dosen pembina mata kuliah yang telah memberikan bimbingan sehingga pemakalah dapat menyelesaikan makalah ini dengan lancar.\

Semoga makalah ini dapat bermanfaat bagi kita semua. Dan apabila dalam penyusunan makalah ini terdapat kesalahan kami mohon kritik dan sarannya yang bersifat membangun, sehingga dapat memberikan bekal bagi pemakalah dalam pembuatan makalah berikutnya.

PALU, 22 Februari 2017

Penyusun

Halaman

DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR .....................................................................................

i

DAFTAR ISI ...................................................................................................

ii

BAB I

PENDAHULUAN

  • 1.1 Latar Belakang ...........................................................................................

1

  • 1.2 Rumusan Masalah

..............

2

  • 1.3 Tujuan Penulisan ........................................................................................

2

BAB II

PEMBAHASAN

  • 2.1 Pengertian ribosom ...................................................................................

3

  • 2.2 Struktur ribosom ......................................................................................

5

2.3. Macam Macam Ribosom .........................................................................

13

  • 2.4 Peran ribosom dalam sintesis protein .........................................................

16

  • 2.5 pengertian serta fungsi protein ...................................................................

18

 

BAB III PENUTUP

  • 3.1 Kesimpulan

...............................................................................................

17

  • 3.2 Saran ..........................................................................................................

18

DAFTAR PUSTAKA

1.1Latar Belakang

BAB I PENDAHULUAN

Istilah ribosom berasal dari bahasa yunani,yaitu dari kata soma yang berarti badan,dan ribonucleid acid atau asam ribonukleat,Ribosom adalah komponen sel yang membuat protein dari semua asam amino. Salah satu prinsip utama biologi, sering disebut sebagai “dogma sentral,” adalah DNA yang digunakan untuk membuat RNA, yang, pada gilirannya, digunakan untuk membuat protein. Urutan DNA gen disalin ke RNA (mRNA). Ribosom kemudian membaca informasi dalam RNA dan menggunakannya untuk membuat protein. Proses ini dikenal sebagai translasi; yaitu, ribosom “menerjemahkan” informasi genetik dari RNA menjadi protein. Ribosom melakukan hal ini dengan mengikat sebuah mRNA dan menggunakannya sebagai template untuk urutan yang benar asam amino pada protein tertentu. Asam amino yang melekat pada RNA transfer (tRNA) molekul, yang masuk salah satu bagian dari ribosom dan mengikat ke urutan messenger RNA. Asam amino terlampir yang kemudian bergabung bersama oleh bagian lain

dari ribosom. Ribosom bergerak sepanjang mRNA, “membaca” urutan dan

menghasilkan rantai asam amino. Ribosom terbuat dari kompleks dari RNA dan protein.

Ribosom dibagi menjadi dua subunit, satu lebih besar daripada yang lain. Mengikat subunit kecil untuk mRNA, sedangkan mengikat subunit yang lebih besar kepada tRNA dan asam amino. Ketika selesai membaca mRNA ribosom, kedua subunit terpecah. Ribosom telah diklasifikasikan sebagai ribozim, karena RNA ribosomal tampaknya paling penting bagi aktivitas transferase peptidil yang menghubungkan asam amino bersama. Ribosom dari bakteri, archaea dan eukariota (tiga domain kehidupan di Bumi), memiliki struktur secara signifikan berbeda dan urutan RNA. Perbedaan-perbedaan dalam struktur memungkinkan beberapa antibiotik untuk membunuh bakteri oleh ribosom menghambat mereka, sementara meninggalkan ribosom manusia tidak terpengaruh. Ribosom dalam mitokondria sel

eukariotik mirip pada bakteri, yang mencerminkan asal-usul evolusi kemungkinan organel ini berasal dari kata ribosom asam ribonukleat.

  • 1.2 Rumusan Masalah

Adapun rumusan masalah dalam makalah ini adalah:

  • 1. Bagaimana pengertian ribosom?

  • 2. Bagaimana struktur ribosom?

  • 3. Apa saja macam-macam ribosom ?

  • 4. Bagaimana peran ribosom dalam sintesis protein?

  • 5. Bagaimana pengertian serta fungsi protein?

    • 1.3 Tujuan

Adapun tujuan dibuatnya makalah ini adalah:

  • 1. Untuk mengetahui pengertian ribosom

  • 2. Untuk mengetahui struktur ribosom

  • 3. Untuk mengetahui macam-macam ribosom

  • 4. Untuk mengetahui peran ribosom dalam sintesis protein

  • 5. Untuk mengetahui pengertian serta fungsi protein

2.1.pengertian ribosom

BAB II PEMBAHASAN

Istilah ribosom berasal dari bahasa yunani,yaitu dari kata soma yang berarti badan,dan ribonucleid acid atau asam ribonukleat .Ribosom merupakan organel kecil dan padat dalam sel yang berfungsi sebagai tempat sintesis protein. Ribosom berdiameter sekitar 20 nm serta terdiri atas 65% RNA ribosom (rRNA) dan 35% protein ribosom (disebut Ribonukleoprotein atau RNP) Pengertian tersebut menurut dengan Subowo (2007). Organel Ribosom ini menerjemahkan mRNA untuk membentuk rantai polipeptida (yaitu protein) menggunakan asam amino yang dibawa oleh tRNA pada proses translasi. Di dalam sel, ribosom tersuspensi di dalam sitosol atau terikat pada retikulum endoplasma kasar, atau pada membran inti sel.

Ribosom merupakan partikel yang kampak/padat, terdiri dari ribonukleoprotein, melekat atau tidak pada permukaan external dari membran RE, yang memungkinkan sintesa protein. Menurut Johnson. E, Kurt (1994), Sifat dari Ribosom itu yaitu Bentuknya universal, pada potongan longitudinal berbentuk elips, Pada teknik pewarnaan negatif, tampak adanya satu alur transversal, tegak lurus pada sumbu, terbagi dalam dua sub unit yang memiliki dimensi berbeda, Dengan ultrasentrifugasi yang menurun pada kedua sub unit ribosom tersebut dapat dipisahkan sehingga dapat penyusunnya dapat dideterminasis. Sub unit-sub unit berasosiasi secara tegak iurus pada bagian sumbu dalam aiur yang memisahkannya, Dimensi ribosom serta bentuk menjadi bervariasi. Pada prokariot, panjang ribosom adalah 29 nm dengan besar 21 nm. Dan eukariot, ukurannya 32 nm dengan besar 22 nm, Pada prokariot sub unitnya kecil, memanjang, bentuk melengkung dengan 2 ekstremitas, memiliki 3 digitasi, menyerupai kursi. Pada eukariot, bentuk sub unit besar menyerupai ribosom E. coli.

A.Letak Ribosom

Letak ribosom ada yang bebas, ada juga yang menempel di retikulum endoplasma besar. Ribosom akan terikat dengan RE besar ketika ribosom akan mensintesis protein. Ribosom kadang disebut organel dan sedikit dibatasi penyebutannya karena sifatnya yang partikulat dan terkadang digambarkan sebagai

“membran sel bebas”.

  • B. Biogenesis Ribosom

Dalam sel bakteri, ribosom disintesis di dalam sitoplasma melalui transkripsi beberapa ribosom gen operons. Dalam bersel satu proses mengambil tempat dalam sitoplasma sel dan nukleolus, yang merupakan daerah dalam inti sel. Proses perakitan melibatkan fungsi terkoordinasi lebih dari 200 protein sintesis dan pemrosesan empat rRNA, serta perakitan rRNA dengan protein ribosomal.

Ribosom bebas dapat berpindah ke mana saja di sitosol kecuali di inti sel dan organel lain. Protein yang dibentu di ribosom bebas akan dikeluarkan dari sitosol dan digunakan oleh sel.

  • C. Sifat Ribosom

Ribosom merupakan partikel padat yang tidak dibatasi membran. Ribosom terdiri dari sub unit besar dan sub unit kecil. Ribosom merupakan partikel yang kampak/padat ini terdiri dari ribonukleoprotein, melekat atau tidak pada permukaan external dari membran RE, yang memungkinkan sintesa protein. Ribosom merupakan suatu partikel ribonukleoprotein yang berukuran kecil (20 X 30 nm). Ribosom terdiri dari dua unit yang dihasilkan didalamn nukleolus. Ribosom meninggalkan inti sebagai unit terpisah melalui pori inti. Ribosom utuh dibentuk di dalam sitoplasma. Penyatuan ribosom di ditoplasma adalah untuk mencegah terjadinya sintesis protein didalam inti.

  • 2.2 Struktur Ribosom

Ribosom terbentuk globular dengan dimeter sekitar 250 sampai 350 nm. Ribosom mampu menyebarkan maupun menyerap electron

Ribosom terbentuk globular dengan dimeter sekitar 250 sampai 350 nm. Ribosom mampu menyebarkan maupun menyerap electron dengan sangat kuat sehingga mikroskop electron dapat digunakan secara intensif untuk meneliti ribosom lebih dalam, sebenarnya selain dengan mikroskop electron, ribosom dapat diteliti dengan berbagai cara antara lain dengan defraksi sinar X, sentrifugasi atau pemusingan, maupun dengan imunositokimia. Analisis biokimia juga bisa dilakukan untuk mengetahui jumlah dan mengidentifikasi protein-protein dalam sub unit ribosom (Geneser, 2009).

Ribosom sub unit kecil, tampilannya mirip embrio yaitu seperti memiliki kepala dan badan yang dihubungkan dengan leher yang pendek. Leher tersebut dibentuk dengan takikan (sedikit lekukan) pada satu sisi dan lekukan yang dalam paa sisi yang lain. Badannya berbentuk batang yang membengkak. Pada subunit kecil terdapat daerah datar pada satu sisi bagian ini menempel pada sub unit.

Ribosom terdiri dari 2 sub unit yaitu sub unit besar dan kecil. Masing- masing disusun oleh rRNA dan protein ribosom. Stuktur ribosom merefleksikan fungsinya untuk mengumpulkan mRNA dengan tRNA pembawa asam amino. Suatu ribosom memiliki satu tempat pengikatan mRNA (subunit kecil) dan tiga tempat pengikatan tRNA dikenal dengan tempat E (exit), P (peptidil), dan A (aminosil) yang terdapat pada sub unit besar.

Tempat E merupakan tempat keluar tRNA yang tidak bermuatan. Tempat P merupakan tempat pengikatan tRNA-peptidil biasanya pengikat tRNA yang melekat pada rantai polipeptida yang sedang tumbuh. Tempat A merupakan tempat

pengikatan tRNA- aminoasil biasanya mengikat tRNA yang membawa asam amino berikutnya yang akan ditambah pada rantai polipeptida. Perbedaan pada eukariot dan prokariot terdapat pada ukuran dan jumlah RNA penyusunnya.

Stuktur ribosom merefleksikan fungsinya untuk mengumpulkan mRNA dengan tRNA pembawa asam amino. Suatu ribosom memiliki satu tempat pengikatan mRNA (subunit kecil) dan tiga tempat pengikatan tRNA dikenal dengan tempat E (exit), P (peptidil), dan A (aminosil) yang terdapat pada sub unit besar. Tempat E merupakan tempat keluar tRNA yang tidak bermuatan. Tempat P merupakan tempat pengikatan tRNA-peptidil biasanya pengikat tRNA yang melekat pada rantai polipeptida yang sedang tumbuh. Tempat A merupakan tempat pengikatan tRNA- aminoasil biasanya mengikat tRNA yang membawa asam amino berikutnya yang akan ditambah pada rantai polipeptida.

D. Strukur dari ribosom memilki sifat sebagai berikut :

  • 1. Bentuknya universal, pada potongan longitudinal berbentuk elips.

  • 2. Pada teknik pewarnaan negatif, tampak adanya satu alur transversal, tegak lurus pada sumbu, terbagi dalam dua sub unit yang memiliki dimensi berbeda.

  • 3. Setiap sub unit dicirikan oleh koefisiensi sedimentasi yang dinyatakan dalam unit Svedberg (S). Sehingga koefisien sedimentasi dari prokariot adalah 70S untuk keseluruhan ribosom (50S untuk sub unit yang besar dan 30S untuk yang kecil). Untuk eukariot adalah 80S untuk keseluruhan ribosom (60S untuk sub unit besar dan 40S untuk yang kecil).

  • 4. Dimensi ribosom serta bentuk menjadi bervariasi. Pada prokariot, panjang ribosom adalah 29 nm dengan besar 21 nm. Dan eukariot, ukurannya 32 nm dengan besar 22 nm.

  • 5. Pada prokariot sub unitnya kecil, memanjang, bentuk melengkung dengan 2 ekstremitas, memiliki 3 digitasi, menyerupai kursi. Pada eukariot, bentuk sub unit besar menyerupai ribosom E. Coli.

Perbedaan Ribosom pada Eukariotik dan Prokariotik

  • 1. Ribosom Pada Sel Prokariotik

Ribosom sel-sel prokariota memiliki massa molecular 2.520.000 dalton dan matranya 29 X 21 nanometer. Ribosom sel sel eukariota lebih besar dari pada ribosom sel sel prokariota tersebut. Massa molecular ribosom sel eukariot berkisar antara 4.220.000 dalton dan matranya 32 X 22 nanometer. Ukuran ukuran ribosom ditentukan dengan jalan analisis sedimentasi (pengendapan). Analisis ini mendasarkan pada pengukuran pada laju pengendapan suatu molekul atau zarah didalam larutan kental, biasanya larutan sukrosa yang dipusing dengan kecepatan yang sangat tinggi (70 gr atau lebih). Konfesiensi sedimentasi dinyatakan dalam S yaitu kesatuan atau unit Swedberg. Selain koefisien Swedberg, laju pengeendapan juga dipengaruhi oleh factor factor lain yaitu berat molekul, berat makro molekul, atau rakitan makro molukernya. Ribosom prokariota memiliki koevisien sedimentasi 70S, sedangkan pada sel eukariota koefisien sedimentasinya 80S (Johnson, 1994). Ribosom sel prokariota, bila berada di dalam larutan dengan kadar Mg ++

rendah misalnya 0,2 mm akan mengalami tersepai (terdisosiasi) menjadi 2 sub unit yang berbeda ukuran maupun koefisien sedimentasinya. Sub unit besar memiliki koefisien sedimentasi 50S, sedangkan pada yang kecil koefisien sedimentasinya

30S.

Sejak Semua protein dan RNA dari sub unit ribosom prokariot dapat di isolasi hal ini yang memungkin untuk menerangkan proses penyususnan ribosom melalui studi rekombinasi. Hal ini menunjukkan bahwa penyusunan sub unit dan penggabungan membentuk ribosom yang fungsional (mampu mentranslasi mRNA menjadi protein) yang terjadi secara spotan secara invitro bila komponen rRNA dan protei dapat digunakan. Penyusunan dapat dilakukan dengan sendiri dan struktur komplomen dari molekul protein dan RNA ribosom yang diproses melalui pembentukan ikatan hydrogen dan interaksi hidrofobik. Penambahan protein tertentu pada pembentukan sub unit dapat memudahkan penambahan dan pengikatan lain. Bila protein L ditambahkan pada RNA 16S atau bila protein S ditambahkan pada RNA 5S dan 23S, maka tidak akan

terjadi penyusunan. RNA sub unit 20S dari satu jenis spesies dapat bergabung dengan protein S dari prokariot yang lain akan membentuk subunit-subunit fungsional, juga untuk protein dan RNA 50S dari prokariot yang berbeda . Penyusunan sub unit dan pembentukan monomer fungsional hibrida ini ternyata sulit karena protein dan dan RNA ribosom dari prokariot yang berbeda pada kenyataannya mempunyai struktur primer yang berbeda. Jadi jelas bahwa struktur sekunder dan tersier yang sangat amat mirip lebih penting dalam interaksi rRNA protein, Jadi meskipun beberapa protein ribososm dari sel ragi, retikolosit, dan hati tikus dapat diganti oleh protein dari E.coli, namun monomer hibrida yang terbentuk dari sub unit prokariot dan eukariot ini tadak akan berfungsi dalam sistesis protein.

Struktur Ribosom Prokariotik

Ribosom prokariot mengandung RNA dan protein. Pada subunit ribosom prokariot mengandung satu molekul RNA yaitu RNA 16S (BM 0.6 X 10 6 ) sedangkan subunit besar mengandung 2 molekul RNA yaitu RNA 23S (BM 1.6 X

  • 10 6 ) dan RNA 5S (BM 3.2 X 10 4 ). Ketiga RNA merupakan produk transkripsi

secara tertutup dari rantai gen dalam urutan 16 S - 23 S - 5 S (Geneser, 2009). Protein sub unit kecil memiliki berat molekul antara 10.900 (S 17 ) sampai 65.000 (S 1 ), sedangkan protein sub unit besar antara 9600 (L 34 ) sampai 31500 (L 2 ). Umumya protein ribosom bersifat basah, kaya akan asam amino basah dan mempunyai titik isoelektrik pada ph 10 atau lebih, kira kira 33 dari 55 protein telah

diurut (13 dari sub unit kecil dan 20 dari sub unit besar). Bersamaan dengan penelitian mengenai RNA, dengan anggapan bahwa ribosom prokariot merupakan organel yang dipahami dengan baik dalam hal struktur dan fungsinya.

1.Model Ribosom Prokariotik

Meskipun komposisi ribosom dan interaksi dari komponennya sudah diketahui, namun masih sulit untuk mengusulkan suatu model dari struktur ribosom, karena terlalu kexcil untuk diamati dengan mikroskop electron dan dalam tekhnik isolasi serta penyediaan ribosom untuk dapat merubah bentuk dan

organisasi ribosom. Suatu model usulan yang sesuai dengan monomer ribosom dan sub unit-unit berdasarkan data pengamatan mikroskop (Johnson, 1994).

Sub unit 30S mempunyai bentuk olipsoid mempunyai dimensi 60 X 200À. Pada poros yang panjang terdapat bagian yang menjorok kedalam.sehingga bagian itu membagi sub unit dalam 1/3 dan 2/3 bagian. Sub unit besar bentuknya lebih bulat, mempunyai dimensi 150 x 200 x 200 À dan memiliki bagian dan menarik pada salah satu permukaannya. Penggabungan sub unit membentuk monomer 70S terjadi pada kedua sisi sub unit-subunit tersebut dan terbentuk suatu lorong. Monomer 70S mempunyai diameter maksimum sekitar 400 À (Geneser, 2009).

  • 2. Ribosom Pada Sel Eukariotik

Ribosom pada sitoplasma sel eukariotik yang mempunyai koefisien sedimentasi 80S yang tersusun dari sub unit masing masing koefisien sedimentas 40S dan 60S. sedangkan pada sel prokariot adalah 70S. dan dibentuk oleh sub unit 30S dan 50S. ribosom yang lengkap, yang dibentuk oleh sub unit unitnya yang disebut monomer.

Kadar protein pada ribosom dari ke dua sumber prokariot dan eukariot hamper sama yaitu sekitar 30 45 % (berat), dan sisa nya berupa RNA. Perbedaaan antara ke 2nya terletak pada komponen protein dan RNA Spesifik yang tidak mengandung karbohidrat dan lipid. Ion Mg yang berfungsi untuk mempertahan struktur ribosom. Penguraian menjadi sub unit unit terjadi bila Mg ++ di keluarkan. Tempat yang tepat untuk Mg ++ ini belum diketahui pasti mungkin berinterksi dengan ion fosfat yang terionisasi RNA sub unit.

Ribosom sitoplasma memiliki koefisien sedimentasi 80S yang terbentuk dari sub unit 40S. selain itu didalam sitoplasma ribosom terdapat dalam dua keadaan yaitu :

  • a. Berhubungan dengan membran sel, pada retikulum endoplasma serta dalam sintesis protein jaringan sekresi atau ginjal.

  • b. Terdistribusi secara bebas di dalam sitosol dan mensintesis protein yang dikenal didalam sel.

Struktur Ribosom Pada Eukariotik

Sub unit kecil eukariotik mengandung molekul RNA18S (BM 0,7x 10), sedangkan sub unit besar mengandung RNA 28S (BM 1,7x10), RNA 5S (BM 2,0x 10), dan RNA 5,8S (BM 5,0x 10) (Johnson, 1994).

RNA 18S, 5,8S dan 28S merupakan hasil transkripsi dari gen yang berhubungan dalam kromosom pada daerah pengatur inti (NOR) dari inti sel. RNA 5S dalah produk trankripsi primer, bukan dari pemutusan pada pos transkripsi precursor RNA prikariot dilepas secara berurutan dari transkrip yang sedang tumbuh, sedangkan pada eukariot dihasilkan suatu transkrip tunggal dengan berat molekul tinggi yaitu 45S yang mengandung precursor 18S, 5.8S, dan 28S. Tahap awal membagi 45S RNA menjadi dua bagian yaitu bagian besar (41S) yang akhirnya akan menjadi RNA 5.8S dan 28S. Dan bagian kecil menghasilkan 18S (Johnson, 1994).

Ribosom selain mengandung RNA juga protein. Subunit kecil mengandung 30 protein (S 1, S 2, dan lain-lain) dan subunit besar mengandung 40 protein (L 1, L 2, dan lain-lain). Selain jumlahnya lebih banyak , protein ribosom eukariot juga memiliki berat molekul yang sangat besar (Geneser, 2009).

Tiap ribosom mempunyai dua tempat pengikatan tRNA, yang masing- masing dinamakan tapak aminoasil (tapak A) dan tapak peptidil (tapak P). Molekul aminoasil-tRNA yang baru memasuki ribosom akan terikat di tapak A, sedangkan molekul tRNA yang membawa rantai polipeptida yang sedang diperpanjang terikat di tapak P.

Pembentukan Ribosom Pada Eukariot

RNA 45S hasil transkripsi bergabung dengan protein (RNP), tetapi tidak semua molekul kompleks tersebut menjadi bagian dari sub unit ribosom yang lengkap. Ada berapa protein yang dilepaskan seperti pada sintesis RNA.

Nukleoptioda kembali ke kelompok nukleolar dan digunakan kembali. Protein yang di tahan selama proses kemudian bagian sub unit yang sempurna disebut protein ribosom.

Pemutusan Frakmen, yaitu :

kompleks

RNP

secara

enzimatis

menghasilkan

3

kelompok

  • a. Fragmen pertama (1), berisi spacer RNA nukleolar protein (spacer RNA dihasilkan dari transkripsi rDNA dan bukan spacer DNA diantara gen). spacer RNA di hidrolisis dan nukleolar protein yang bebas kembai pada kumpulannya.

  • b. Fragmen kedua (2), berisi suatu kompleks dari RNA 18S dan protein Ribosom tertentu yang akhirnya menghasilkan sub unit ribosom 40S dalam sitoplasma.

  • c. Fragmen ketiga (3), berisi RNA 28S dan 5,85 dan protein ribososm yang bergabung dengan RNA 5S hasil transkripsi gen rDNA ekstra nukleolar. Kompleks ini ada di dalam inti menghasilkan sub unit 60S dalam sitoplasma. Seperti halnya pada gen gen untuk RNA 45S, gen gen RNA 5S ekstra nukleolar terdapat dalam kelipatan dua.

Model Ribosom Eukariot Morfologi ribosom eukariot hampir sama dengan ribosom prokariot, perbedaannya terletak pada ukuran BM, konstanta sedimentasi, ukuran rRNA, jumlah rRNA, dan protein yang lebih besar. Sub unit 40S berbentuk elips soid yang agak pipih berdimensi 115 x 140 x 230A, dan seperti ribosom prokariot terdapat lekukan yang menjorok yang membagi ribosom menjadi segmen 1/3 dan 2/3. sub unit 60S umumnya lebih bulat, mempunyai diameter ± 200A. terdapat bagian agak datar dan menarik pada salah satu sisinya. Jika kedua segmen ini bergabung maka terbentuk monomer yang memiliki lorong. Lorong ini digunakan untuk akomodasi rantai mRNA selama translasi(Geneser, 2009).

E.Perbedaan Ribosom Prokariotik dan Eukariotik

·

Perbedaan Berdasarkan Sifat dan Komposisi Ribosom Eukariotik dan Prokariotik

Tabel Sifat dan Komposisi Ribosom Eukariotik dan Prokariotik

 

Eukariotik

Prokariotik

Monomer Koefisiensi sedimentasi

80S

70S

Berat Molekul

4,5 x 10 6

2,6 x 10 6

Jumlah RNA

4

3

Jumlah Protein

70

55

Sub unit kecil Koefisiensi sedimentasi

40S

30S

Berat Molekul Jumlah RNA

1,5 x 10 6 18S (BM 0,7 x 10 6 )

0.9 x 10 6 16S (BM 0.6 x 10 6 )

Jumlah protein Sub unit Besar

30

21

Koefisiensi sedimentasi

60S

50S

Berat Molekul Jumlah RNA

3,0 x 10 3 5S (BM 3,2 x 10 4 ) 5,8 (BM 5,0 x 10 4 )

1.7 x 10 6 5S (BM 3,2 x 10 6 ) 23S (BM 1.1 x 10 6 )

28S (BM 1,7 x 10 4 )

Jumlah protein

40

34

·

Perbedaan Berat Molekul Rata-rata Protein Ribosom Prokariotik dan Eukariotik (Comarck, 1994).

Tabel Berat Molekul Rata-rata Protein Ribosom Prokariotik dan Eukariotik.

 

Prokariotik

Eukariotik

Sub unit kecil

18.900

25.300

Sub unit besar

16.400

28.100

  • 2.3 Macam macam Ribosom

Tabel Berat Molekul Rata-rata Protein Ribosom Prokariotik dan Eukariotik. Prokariotik Eukariotik Sub unit kecil 18.900 25.300
  • a. Ribosom terikat Ribosom ini tergabung dengan membrane intra seluler, terutama dengan reticulum endosplasma (RE)

  • b. Ribosom bebas Ribosom ini teresebar menembus Hyaoplasma atau sitosol. Ribosom bebas maupun terikat secara struktural identik dan dapat saling bertukar tempat. Sel dapat menyesuaikan jumlah relatif dari masing-masing jenis ribosom bengitu metabolismenya berubah.

Biogenesis Protein

Biogenesis ribosom merupakan salah satu yang paling penting dan memakan energi proses dari setiap sel. Biogenesesis ribosom adalah proses pembentukan sub unit ribosom. Pembentukan sub unit ribosom merupakan fungsi nukleolus. Nukleolus dibentuk dari konstriksi sekunder kromatin tertentu. Pada sel eukariota, biogenesis ribosom memerlukan aktivitas dari ketiga RNA polimerase. RNA polimerase II mensintesis pre-mRNA protein ribosom dan faktor tambahan yang terlibat dalam biogenesis ribosom, RNA polimerase III menghasilkan prekursor untuk 5S rRNA ribosomal (rRNA), dan RNA

polimerase I (RNA Pol I) menghasilkan

prekursor umum untuk rRNA 5.8S, 18S

dan 25S (ragi) / 28S (mamalia) (Johnson, 1994).

Biogenesis pada sel eukariotik dan prokariot berbeda.

Proses biogenesis pada sel eukariotik memiliki ciri-ciri sebagai berikut :

  • 1. Lebih kompleks

  • 2. Waktu lebih panjang

  • 3. Pembentukan 18S dan 28S rRNA terjadi di nucleolar organizer

  • 4. Pembentukan 5S rRNA terjadi di sisi luar nukleolus

Proses biogenesis pada sel prokariotik memiliki ciri-ciri sebagai berikut :

  • 1. RNA

Gen

yang

mengkode

untuk

5S,

23S

dan

16S

rRNA ribosom

secara

ketat bergerombol di wilayah kromosom dan yang

hadir hanya dalam beberapa salinan.

  • 2. Gen ribosom berada dalam operon tunggal yang ditranskripsi sebagai satu unit, yang segera secara langsung dibentuk molekul RNA dari DNA dan langsung terbentuk ribosom.

Fungsi Ribosom

Ribosom mempunyai fungsi sebagai berikut:

  • 1. Sebagai tempat sintesis protein.

  • 2. Protein yang dihasilkan oleh ribosom pada jalinan endoplasma kasar dirembeskan dalam bentuk enzim atau hormon.

  • 3. Protein yang dihasilkan oleh ribosom bebas digunakan oleh sel itu untuk pembesaran dan memungkinkan tindak balas yang dijalankan di dalam sel itu.

Sintesis Protein di Ribosom

Pada saat sintesis protein ribosom mengelompok menjadi poliribosom (polisom). Sebagian besar protein dibuat oleh ribosom bebas akan berfungsi di dalam sitosol. Sedang ribosom terikat umumnya membuat protein yang dimasukkan ke dalam membran, untuk pembungkusan dalam organel tertentu seperti lisosom atau dikirim ke luar sel. Ribosom berperan dalam proses sintesis protein atau tepatnya perakitan polipeptida. Ribosom mempunyai peranan yang sangat menentukan dalam proses perakitan polipeptida. Untuk perakitan polipeptida memerlukan pemandu yang diperlukan untuk menentukan apakah kodon yang terdapat pada mRNA dapat tepat berpasangan dengan anti kodon yang terdapat pada tRNA, sehingga penerjemahannya tidak meleset. Kejadian ini difasilitasi dan dikatalisis oleh ribosom, rRNA yang terkandung dalam ribosom akan bertindak sebagai katalisator. Dalam proses penerjemahan ini sub unit kecil ribosom berperan mengikat mRNA, sedangkan sub unit besar berpern sebagai tempat masuk dan keluarnya tRNA untuk membentuk ikatan polipeptida

Sebelum membahas lebih jauh lagi tentang proses sintesis protein maka sebagai langkah awal kita harus mengingat dulu pengetahuan yang sudah kita peroleh tentang pasangan kodon dan anti kodoon molukul mrna akan mengandung adenine (A).urasil (U).guanin (G)dan cytosine (C). Tiga basa ini akan bergabung membentuk kodon misalnya , UUC, merupakan kodon untuk asam amino fenilalanin (phe).UGC, untuk asam amino triptofan (Try), sebagai contohnya mRNA akan menyusun kodon-kodon tersebut dalam suatu rangkaian misalnya UGC/UUC/UGC/UUC kodon-kodon ini akan dibaca Try-Phe-Try-Phe.

Akan dapat di terjemahkan kodon-kodon tersebut harus berpasangan dengan anti kodonya. Misalnya A akan selalu bergabung dengan U anti kodonnya, demikian juga sebaliknya, seangkan G akan bergabung dengan C. jadi jika kodonnya adalah UUC maka anti koonnya adalah AAG. Kalau kodon dimiliki oleh mRNA maka anti kodon miliki oleh tRNA. tRNA selain memiliki antikodon juga

memiliki asam amino. Jadi misalnya kodon mRNA adalah UUC yang berarti harus dibaca fenilalanin maka antikodonnya AAG yang terdapat pada tRNA, menggandeng asam amino maka fenilalanin (Phe), sehingga kodon dan antikodon bersatu maka asam amino yang dibawa adalah sesuai dengan pesanan dari kodon.

2.4 Peran Ribosom dalam Sintesis Protein terhadap Inisiasi, Elongasi, dan Terminasi

Kita dapat membagi translasi, sintesis rantai polipeptida menjadi tiga tahap inisiasi,

elongasi dan terminasi. 1. Inisiasi

Tahap inisiasi dari translasi terjadi dengan adanya RNAd, sebuah RNAt yang memuat asam amino pertma dari polipeptida, dan dua subunit ribosom. Pertama, subunit ribosom kecil mengikatkan diri pada RNAd dan RNAt inisiator.Di dekat tempat pelekatan ribosom subunit kecil pada RNAd terdapat kodon inisiasi AUG, yang memberikan sinyal dimulainya proses translasi.RNAt inisiator, yang membawa asam amino metionin, melekat pada kodon inisiasi AUG.

Oleh karenanya, persyaratan inisiasi adalah kodon RNAd harus mengandung triplet AUG dan terdapat RNAt inisiator berisi antikodon UAC yang membawa metionin. Jadi pada setiap proses translasi, metionin selalu menjadi asam amino awal yang diingat. Triplet AUG dikatakan sebagai start codon karena berfungsi sebagai kodon awal translasi.

tRNA yang memuat asam amino pertama dari polipeptida, dan dua sub unit ribosom. Pertama, sub unit ribosom kecil mengikatkan diri pada mRNA dan tRNA inisiator khusus. Sub unit ribosom kecil melekat pada segmen leader pada ujung 5’(upstream) dari mRNA. Pada arah downstream dari mRNA terdapat kodon inisiasi, AUG, yang memberikan sinyal dimulainya proses translasi. tRNA inisiator yang membawa asam amino metionin, melekat pada kodon inisiasi. Penyatuan mRNA, tRNA inisiator, dan sub unit ribosom kecil diikuti oleh perlekatan subunit ribosom besar, menyempurnakan proses inisiasi translasi

2.

Elongasi

Pada tahap elongasi dari translasi, asam amino ditambahkan satu peratu pada asam amino pertama.

  • a) Pengenalan kodon : kodon mRNA pada tempat A dari ribosom membentuk ikatan hydrogen dengan anti kodon molekul tRNA yang baru masuk yang membawa asam amino yang tepat.

  • b) Pembentukan ikatan peptida : molekul rRNA dari subunit ribosom besar, berfungsi sebagai ribozim, mengkatalis pembentukan ikatan peptide yang menggabungkan polipeptida memanjang dari tempat P keasam amino yang baru tiba di tempat A. pada tahap ini polipeptida memisahkan diri dari tRNA tempat perlekatannya semula, dan asam amino pada ujung karboksilnya berikatan pada asam amino yang dibawa oleh tRNA ditempat A.

  • c) Translokasi : tRNA ditempat A, sekarang terikat pada polipeptida yang sedang tumbuh, di translokasikan ketempat P. saat RNA berpindah tempat, antikodonnya tetap berikatan dengan hydrogen pada kodon mRNA, mRNA bergerak bersama-sama dengan anti kodon ini dan membawa kodon berikutnya untuk ditranslasi di tempat A. sementara itu tRNA yang tadinya berada pada tempat P ke tempat E dan dari tempat ini keluar dari ribosom.

    • 3. Terminasi

Tahap akhir translasi adalah terminasi. Elongasi berlanjut hingga kodon stop mencapai tempat A di ribosom. Triplet basa yang istimewa ini yaitu UAA, UAG, UGA, tidak mengkode suatu asam amino melainkan bertindak sebagai sinyal untuk menghentikan transasi. Suatu protein yang disebut sebagai faktor pelepas langsung

mengikatkan diri pada kodon stop ditempat A. faktor pelepas ini menyebabkan penambahan molekul air, bukan asam amino, pada rantai polipeptida. Reaksi ini menghidrolisis polipeptida yang sudah selesai ini dari tRNA yang berada ditempat P, melepaskan polipeptida dari ribosom. Sisa-sisa penyusunan translasi kemudian terpisah-pisah.

2.5 Pengertian protein dan fungsinya

Protein merupakan kelompok dari makromolekul organik kompleks yang di antaranya terkandung hidrogen,oksigen,nitrogen,karbon,fosfor,dan sulfur serta terdiri dari satu atau beberapa rantai dari asam amino.Protein tersusun atas asam amino,yang mengandung 1 atom karbon (C) dan mengikat 1 atom hidrogen (H), 1 gugus amin (NH2),1 gugus karboksil (-COOH) dan gugus R.

Funggsi protein

  • 1. Mengatur metabolisme tubuh,

  • 2. Menjaga keseimbangan antara asam dan basa dan keseimbangan cairan dalam tubuh . Protein berperan penting dalam menjaga stabilitas pH cairan tubuh

    • 3 .Protein merupakan bahan dalam sintesis substansis seperti halnya hormon,zat antibodi dan organel sel lainya

      • 4. Membantu dalam proses pertumbuhan pada anak anak dan remaja karena sel sel tubuh mendapat cukup asupan zat pembangun.

      • 5. Membantu kerja tubuh dalam menetralkan atau menghancurkan zat zat asing yang masuk kedalam tubuh

      • 6. Menghasilkan energi dan kalori

      • 7. Dapat membentuk enzim,pigmen dan hormon.

      • 8. Sebagai unsur pembangun jaringan yang rusak.

Sintesis protein

Proses Sintesis Protein Sintesis protein merupakan proses terbentuknya protein yang terdiri dari 2 tahap yaitu tahap transkripsi dan tahap translasi. Tahap

transkripsi adalah tahap dimana pada saat pembentukan mRNA di dalam nukleus dari DNA template dengan dibantu oleh enzim polimerase. Tahap translasi adalah tahap dimana mRNA keluar dari inti sel dan bertemu dengan tRNA lalu dibantu

oleh Ribosom yang terdiri dari sub unit
oleh
Ribosom
yang
terdiri
dari
sub
unit

besar

dan

sub

unit

kecil.

Sebagian besar pada akhirnya diekspresikan sebagai protein. Proses pengerjaannya disebut ekspresi gen. pertama-tama sekuens deoksinukleotida ditranskripsi dari DNA kedalam sekuens ribonukleotida (RNA kurir atau mRNA). Kemudian sekuens ini ditranslasi kedalam sekuens asam amino untuk membentuk polipeptida. Sekuens asam amino menentukan bagaimana cara molekul melipat untuk menghasilkan protein yang aktif secara biologis. Dalam sel bakteri,tidak ada membrane yang mengelililngi DNA dan proses transkripsimaupun proses translasi berlangsung pada kompartemen sel tunggal. Dalam eukariot,inti sel diselungi dengan membrane. Proses transkripsi berlangsung dalam inti sel, dan mRNA harus masuk kedalam sitoplasma untuk ditraslantasikan. Seringkali,hasil polipeptida yang terbentuk segera termodifikasi setelah proses translasi.

1.

Transkripsi

Sebagian

besar

DNA

yang ditranskripsi menghasilkan mRNA,yang

kemudian ditranslasi menjadi protein. Namun demikian ,spesi RNA yang paling

melimpah

adalah

RNA

ribosom(rRNA)

 

dan

RNA

transfer(tRNA),yang

tidakmengkode

protein,tetapi

berfungsi

dalam

proses

translasi.

Transkripsi

semua

gen

dilakukan

oleh

RNA

polymerase,yang

menggunakan keempat ribonukleosida trifosfat (ATP,GTP,UTP,dan CTP)untuk membentuk rantai RNA,yaitu sekuens yang ditentukan oleh untai cetakan pada DNA. Penambahan nukleotida menjadi bertahap,ikatan fosfodiester terbentuk melalui mekanisme yang sama seperti dijelaskan untuk DNA polymerase. Pertumbuhan rantai RNA terjadi pada arah 5’ à 3’. Untuk mentranskripsikan bagian sekuens tertentu ,RNA polymerase terikat pada tapak DNA yang disebut promoter ,tepat dihulu (misalnya,pada sisi 5’) pada tapak awal transkripsi. Pada eukariot,RNA polymerase memerlukan factor-faktor tambahan untuk melangsungkan transkripsi secara aktif. Beberapa diantara factor-faktor ini diperlukan oleh semua promoter dan disebut factor transkripsi dasar,dan factor

lainnya bersifat spesifik untuk gen tertentu atau beberapa jenis sel dan terlibat dalam pengaturan yang tepat dari promoter-promoter itu. Factor-faktor transkripsi harus mengenal dan mengikat sekuens-sekuens DNA target yang spesifik dan juga mengaktifkan proses transkripsi.

  • 2. Perjuangan Hasil Transkripsi

Pada prokariot,hasil trankripsi (transkrip)primer memberikan mRNA fungsional,yang siap untuk melakukan proses translasi. Pada eukariot,hasil transkripsi dimodifikasi secara kimiawi sebelum terbentuk sebagai mRNA

fungsional. Hal ini dikarenakan gen eukariotik yang akan diekspresikan sebagai protein mengandung sekuens-sekuens penghalang yang tidak ditranslasi yang disebut intron. Intron tersebut dieksisi,atau dipotong,sehingga tersisa sekuen- sekuen yang berhubungan dengan segmen-segmen yang akan ditranslasi,atau ekson, mRNA.

Selain pemotongan,ujung 5’ pada hasil transkripsi harus diberi tudung

dengan nukleotida guanine termetilasi. Poliadenilasi akan menghasilkan penambahan ekor poli(A) yang terdiri dari 40 -200 residu pada ujung 3’ hasil transkripsi.

  • 3. Perlengkapan Translasi

Sekuens nukleotida dalam mRNA diubah melalui perlengkapan translasi menjadi sekuens asam amino yang menyusun suatu polipeptida. Perlengkapan ini antar lain tRNA dari ribosom(yang mengandung tRNA dan kumpulan protein yang

unik). Fungsi tRNA adalah sebagai pengadaptasi antara kodon dan asam amino. RNA transfer mengandung kira-kira 80 nukleotida dan mempunyai jenis struktur sekunder yang umum (daun semanggi)dimana rantainya melipat kebelakang untuk menghasilkan jumlah perpasangan basa intramolekularyang maksimal. Walaupun sedikitnya terdapat satu tRA untuk setiap asam amino,tidak ada pemisahan satu untuk setiap kodon. Hipotensi goyangan (wobble hypothesis) penyebabkan pembentukan pasangan basa yang tidak biasa antara basa pada posisi ketiga kodon (ujung 3’ triplet) dengan posisi pertama antikodon. Kemungkinan terbentuknya lebih dari satu jenis pasangan pada posisi ini menjelaskan fakta bahwa bila terdapat lebih dari satu kodon untuk suatu asam amino tunggal,maka pebedaannya biasanya pada posisi ketiga. Perekatan asam amino ke tRNA yang tepat dikerjakan dengan bantuan aminoasil-tRNA sintetase dan hidrolisis ATP. Setiap asam amino mempunyai enzim yang spesifik yang berbeda dengan enzim untuk asam amino lainnya,dan enzim ini akan mengenali semua tRNA untuk asam amino tersebut. Tahap pertama,yaitu aktivasi asam amino,menghasilkan pembentukan antara zat aminoasil-AMP-enzim. Pada tahap kedua,gugus aminoasil dipindahkan ke tRNAnya yang sesuai,asam amino dihubungkan dengan tRNA ini melalui ikatan ester. RNA kurir dan tRNA teraminoasilasi (bermuatan) berinteraksi dalam ribosom. Ribosom terdiri dari subunit kecil dan besar. Subunit kecilnya mempunyai peranan khusus dalam menginisiasi sintesis polipeptida. Proses translasi suatu pesan RNA kedalam rantai polipeptida terjadi melalui tiga tahap: inisiasi,elongasi,dan terminasi. Inisiasi melibatkan interaksi dari subunit 30S didaerah terdepan (leader) pada mRNA,yaitu sekitar 20 atau lebih nukleutida sebelum kodon inisiasi,AUG.tRNA inisiator khusus dimuati dengan metionin menempati tapak peptidil (tapak p) pada ribosom. GTP yang terikat kedalam kompleks inisiasi 30S terhidrolisis menjadi terlepas ketika berikatan dengan subunit 50S . pada tahap ini,tapak aminoasil-tRNA (tapak A),yang mampu menampung aminoasil-tRNA,menjadi kosong. Tahap berikutnya melibatkan elongasi (pemanjangan)rantai polipeptida salah satu komponen dari subunit 50S adalah peptidiltransferase,yang mengirimkan Met pertama (dan pada reaksi selanjutnya,mengirimkan peptide) dari tapak P ke

tapak A. untuk melakukan hal ini,ikatan ester menghubungkan Met dengan tRNA nya terputus dan aminoasil tRNA yang berdekatan (AA 2 taRNA). Protein merupakan polimer yang panjang dari asam-asam amino. Suatu protein biasanya mengandung sampai 20 asam amino yang berbeda-beda.asam. asam amino kecuali glycin mengandung satu atom yang tidak simetris yang dihubungkan dengan empat gugusan yang berbeda. Biasanya protein mengandung 100-1000molekul asam amino dan mempunyai berat molekul 16000-1000000,yang masing-masing berikatan kovalen yang disebut peptide. Masing masing ikatan peptide mengandung gugusan karbosil bebas diujung yang satu dan gugus asam amino d ujung lainnya, sedangkan yang lebih dari dua asam amino di sebut polipeptida. Dalam sintesisis protein pada prinsipnya dapat dibuat suatu diagram yang sederhana sebagai berikut : Replication transcription translation DNA RNA protein

F.Hubungan antara Kromosom, Gen, dn DNA dengan Sintesis

Dalam setiap tubuh makhluk hidup terdapat berjuta juta sel. Sel merupakan komponen terkecil penyusun makhluk hidup.Dalam setiap sel terdapat nukleus.Dalam nukleus terdapat benda benda yang mengatur seluruh kegiatan metabolisme tubuh. Benda benda tersebut disebut kromosom. Kromosom adalah struktur padat yang terdiri atas dua kompenen molekul , yaitu protein dan asam nukleat. Asam nukleat terdiri atas DNA dan RNA. pada DNA terdapat gen yang mengatur metabolisme dalam tubuh.

1. Kromosom Kromosom terdiri dari benang benang kromatin yang mudah menyerap warna. Kromosom mudah diamati menggunakan mikroskop saat sel mengalami pembelahan pad tahap metafase. Kromatid adalah salah satu dari dua lengan hasil replikasi kromosom.Kromonema merupakan benang benang spiral kromatid yang terlihat selama profase atau kadang kadang terlihat pada tahap metafase.Kromer adalah struktur berbentuk manik manik yang merupakan akumulasi mteri kromatin yang kadang kadang terlihat saat interfase.

Sentromer adalah bagian yang menyempit atau daerah pelekukan pada kromosom.Pada sentromer terdapat kinetokor.Kinetokor adalah bagian kromosom yang merupakan tempat melekatnya benang benang spindel selama pembelahan inti.Satelit adalah bagian ujung kromosom yang berbentuk bulat.Tidak semua kromosom memiliki satelit.Telomer adalah bagian terujung kromosom yang berfungsi untuk menjaga agar DNA didaerah tersebut tidak terurai. Dalam setiap sel tubuh , kromosom selalu berpasangan. Pasangan kromosom itu disebut kromosom homolog. Kromosom homolog bersifat diploid karen terdiri atas dua sel kromosom. Kromosom dalam sel kelamin tidak berpasangan sehingga bersifat haploid ( 1 set kromosom ). Ada dua tipe kromosom dalam setiap sel tubuh, yaitu autosom dan gonosom. 1. Autosom (kromosom tubuh) : tidak menentukan jenis kelamin dan umumnya disingkat A 2. Gonosom (kromosom kelamin) : menentukan jenis kelamin dan terdiri atas kromosom X dan Y.Gonosom ini berfungsi untuk menentukan jenis kelamin individu yang bersangkutan. Setiap nukleus manusia mempunyai kromosom berjumlah 46 yang

terdiri atas 44 autosom dan 2 gonosom. Penulisan simbol kromosom pada laki laki = 22 AA + XY, sedangkan pada perempuan = 22 AA + XX atau 44 A + XX, Jumlah kromosom pada sel telur yaitu 22 A + X dan jumlah kromosom pada sperma yaitu 22 A + X atau 22 A + Y. penyusun kromosom berdasarkan panjang , jumlah , dan bentuk kromosom disebut kariotipe.

  • 2. Gen dan Alel

Apabila diamati menggunakan mikroskop elektron kromosom terdiri atas substansi genetik yang dapat menentukan sifat individu.Substansi tersebut terdiri atas DNA dan RNA.DNA dan RNA membawa informasi genetik berupa basa basa nitrogen. Segmen DNA tertentu akan mengkode sifat sifat tertentu. Segmen segmen DNA tersebut dinamakan gen. Gen merupakan satuan terkecil substansi genetik. Gen terletak pada kromosom secara teratur dalam satu deretan , Gen berfungsi :

  • a. Mengatur proses metabolisme individu

  • b. Menyampaikan informasi genetik dari suatu generasi ke generasi berikutnya.

Gen terletak dalam lokus kromosom yang tersusun berderet secara linear. Gen gen yang terletak pada lokus yang bersesuaian pada pasangan kromosom homolog disebut alel. Setiap gen bertanggung jawab mengontrol satu sifat khusus. Suatu gen biasanya dituiskan dengan simbol huruf. Huruf kapital untuk gen pembawa sifat dominan dan huruf kecil untuk pembawa sifat resesif. Susunan gen dalam suatu individu disebut genotip, sedangkan sifat yang tampak disebut fenotip.

3.

Asam Nukleat Kromosom terdiri atas asam nukleat dan protein.Ada dua macam asam nukleat, yaitu DNA dan RNA.

a.

DNA (Deoxyribonucleic Acid)

1)

DNA terdiri dari banyak nukleotida (polinukleotida).Setiap nukleotida terdiri atas tida bagian. Gugusan gula ( gula pentosa yang dikenal sebagai deoksiribosa).

2)

Asam fosfat (penghubung dua gugusan gula)

3)

Basa nitrogen (adenin dan guanin dari golongan purin serta sitosin dan timin

dari olongan pirimidin). DNA merupakan dua rantai polinukleotida yang saling terpilin membentuk double helix. Dalam rantai DNA tersebut, sitosis (C ) selalu dihubungkan dengan guanin (G) oleh tiga ikatan hidrogen. Adenin (A)selalu dihubungkan dengan tmin (T) oleh dua ikatan hidrogen. Basa nitrogen membentuk rangkaian persenyawaan kimia dengan deoksiribosa menjadi suatu molekul yang disebut nukleosida atau

deoksiribonukleusosida.Nukleosida ini berperan sebagai prekursor elementer untuk sintesis DNA.Akan tetapi, sebelum nukleosida membentuk suatu molekul DNA, nukleosida harus bergabung dengan gugus fosfat untuk membentuk suatu nukleotida atau deoksiribonukleotida. DNA dapat bersifat heterokatalitik.DNA bersifat heterokatalitik karena mampu membentuk RNA melalui sintesis protein.DNA bersifat autokatalitik karena dapat melakukan replikasi mengasilkan DNA baru.

RNA merupakan rantai tunggal yang terdiri dari molekul gula D-ribosa (pentosa), gugus fosfat, dan basa nitrogen.Basa nitrogen dalam RNA terdiri atas

basa purin yang meliputi adenin (A) dan guanin (G) serta basa primidin yang meliputi urasil (U) dan sintosin (C). Ada tiga tipe RNA sebagai berikut :

  • 1. rRNA (Ribosoma RNA) atau RNA Ribosom rRNA terdapat dalam sitoplasma dan berfungsi dalam sintesin protein. rRNA dapat mencapai 80% dari jumlh RNA sel. rRNA berfungsi untuk mempermudah perkataan yang spesifik antara antikodon trna dengan kodom Mrna selama sitesis protein.

  • 2. mRNA (Messenger RNA) atau RNA Duta mRNA berupa rantai tunggal yang reatif panjang. mRNA dibentuk dalam nukleus dan berfugsi membawa kode genetik (kodon) dari DNA ke ribosom.

  • 3. tRNA (Transfer RNA ) atau Rantai Terpendek tRNA terdapat dalam sitoplasma dan berfungsi menerjemahkan kodon dari mRNA menjadi asam amino. Asam amino dibawa oleh tRNA ke ribosom.Pada salah satu ujung tRNA terdpat tiga rangkaian basa pendek disebut antikodon. Salah satu asam amino tertentu akan melekat pada ujung tRNA yang berseberangan dengan ujung antikkodon. Pelekatan ini merupakan cara agar tRNA berfungsi. Pengurutan asam amino sesuai dengan urutan kodon pada mRNA.

  • 4. Kode Genetik Kode genetik adalah cara pengkodean urutan nukleotida pada

DNA atau RNA untuk menentukan urutan asam amino pada saat sintesis protein. Informasi pada kode genetik ditentukan oleh basa nitrogen pada rantai DNA yang akan menentukan sususan asam amino. Namun, para ahli Genetika memandang bahwa komponen komponen kode genetiks berupa molekul molekul mRNA. Kode genetika bersifat degeneratif karena 18 dari 20 macam asam amino ditentukan oleh lebih dari satu kodon yang disebut kodon sinonimus.Hanya metionin dan triptofan saja yang memiliki kodon tunggal. Ekspresi gen merupakan proses penerjemahan menjadi urutan asam amino. Peristiwa ini terjadi pada saat sintesis protein.Ada dua tahap dalam sintesis

protein.Tahap pertama, kode genetika dalam DNA disalin dan menghasilkan satu rantai molekul RNA. Proses ini disebut transkripsi. Transkripsi berlangsung di

dalam inti sel. Tahap kedua merupakan sintesis polipeptida dengan urutan spesifik berdasarkan rantai RNA yang dibuat pada tahap pertama, proses ini disebut translasi.

a. Transkripsi
a.
Transkripsi

Sintesis RNA dari salah satu rantai DNA yang disebut sense (rantai cetakan). Adapun rantai DNA komplomennya disebut rantai antisense.Rentangan DNA yang di transkripsi menjadi molekul RNA disebut unit transkripsi.Transkripsi terdiri atas tiga tahap yaitu inisiasi, elongasi, dan terminasi. 1) Inisiasi (Permulaan) Inisiasi dimulai dari prometer yaitu daerah DNA yang merupakan tempatmelekatnya RNA polimerase. Promoter mencakup titik awal (start point) transkripsi yaitu adanya nukleotida yang menunjukkan dimulainya sintesis protein (kodon start). Promoter berfungsi untuk menentukan tempat dimulainya transkripsi dan menentukan satu rantai DNA yang akan digunakan sebagai cetakan. 2) Elongasi (Pemanjangan) Elongasi terjadi saat RNA bergerak di sepanjang DNA ,pilinan ganda Dnterbuka secara berurutan. Enzim RNA polimerase menambahkan nukleotida dari molekul RNA yang seddang tumbuh disepanjang rantai DNA, Setelah sintesis RNA selesai, rantai DNA terbentuk kembali dan molekul RNA bru terlepas dari cetakkannya. 3) Terminasi (Pengakhiran) Proses transkripsi akan berhenti setelah sampai pada terminator. Terminator adalah urutan DNA yang berfungsi menghentikan transkripsi (kodom terminasi) b. Translasi

Dalam translasi, terjadi pamelekatan antara Trna dengan asam amino. Tiap asam amino digbungnkan dengan trna yang

Dalam translasi, terjadi pamelekatan antara Trna dengan asam amino. Tiap asam amino digbungnkan dengan trna yang sesuai oleh enzim aminoasl-Trna

sintetase. Ribosom memudahkan pelekatan yang spesifik antara anti kodon trna dengan kodon mrna selama sintesi protein .ada tiga tahap dalam translasi sebagai berikut :

1) Inisiasi
1)
Inisiasi

Ribosom kecil mengikatkan diri pada mrna dan trna inisiator. Ribosom

melekat pada salah satu ujung mrna. Di dekat pelekatan tersebut terdapat kodon start AUG (yang membawa kode untuk membentuk asam amino metionin). Kodon ini memberikan sinyal dimulainya proses tanslasi.

2) Elongasi
2)
Elongasi

Selanjutnya terbentuk asam asam amino yang berikatan dengan metionin. Molekul rrna dari ribosom subunit besar berfungsi sebagai ezim. Enzim itu mengkatalis pembentukkan ikatan pepida yang menghubungkan polipeptida ke asam amino yang dibawa trna. Setelah itu, trna keluar dari ribosom. Ribosom dan

mrna bergerak dengan arah yang sama, kodon demi kodon. Peristiwa ini belangsung sampai terbentuk polipeptida.

3) Terminasi
3)
Terminasi

Elongasi akan berhenti setelah ribosom mencapai kodon stop. Triplet basa kodon stop yaitu UAA, UAG, atau UGA. Kodon stop bertindak sebagai sinyal untuk menghentikan translasi. Selanjutnya , polipeptida yang terbentuk lepas ribosom.

Pengertian Kode Genetik

genetik ialah kode yang dibawa oleh ARN duta (ARNd) untuk disampaikan kepada ARN transfer (ARNt). Kode genetik di bentuk sesuai dengan urutan basa

dalam rantai ADN. Peran ADN selain sebagai pengendali faktor-faktor keturunan, juga mengatur penyusunan protein yang kegiatannya di atur oleh enzim-enzim tertentu. Enzim itu sendiri adalah protein yang bekerjanya sangat khas. Sebagai tempat membangun protein-protein itu dalah didalam ribosom. Selanjutnya ADN menyampaikan informasi kepada ribosom untuk sintesis protein yang di perlukan. Adapun kode-kode perintah atau informasi yang tercermin pada urutan dan pengulangan basa-basa nitrogen yang teratur dalam ADN dibawa oleh ARN. ARN yang menerima perintah dari ADN segera meninggalkan inti pergi ke ribosom, tempat penyusunan protein. Penemu Kode Genetik Penemu kode genetik yang pertama adalah Marshall Warren Nirenberg (pakar biokimia Amerika Serikat)dan Heinrich Matthaei pada tahun 1960. Eksperimentnya adalah mengamati proses sintesis protein pada bakteri Escherichia colli. Berdasarkan eksperimen di atas serta diperkuat oleh pendapat G.H. Khorara,

diketahui bahwa kode genetik merupakan urutan 3 basa nitrogen yang membentuk suatu triple dan disebut kodogen aau kodon. Nirenberg dan Matthaei (1960) orang yang pertama kali telah berhasil mengemukakan hubungan antara ADN dengan ARN dan kemudian memberi arah kepada pengkodean dengan sistem 3 huruf, dengan mengadakan percobaan- percobaan. Caranya adalah sebagai berikut : mereka mencampurkan urasil (salah satu basa nitrogen pada ARN) dengan enzim pembentuk ARN. Dari percampuran ini dihasilkan ARN yang terdiri dari urasil yang disebut poli-U. Selanjutnya bila poli-U dimasukkan ke dalam campuran berbagai asam amino, akan terbentuklah fenilalanin (sejenis asam amino). Dari kejadian ini dapatah ditarik kesimpulan, bahwa kode Urasil-Urasil-Urasil (UUU) yang dibawa

oleh ARN itu berarti; “bentuklah protein dari asam amino fenilalanin.” UUU ini

kemudian disebut kodon untuk fenilalanin.

G.Mekanisme Penyampain Kode Genetik

Setiap kode (satu kodon) terdiri atas 3 basa N yang letaknya berurutan pada

ARNd. Kodon-kodon pada ARNd tersebut harus diterjemahkan oleh ARNt, agar dapat diketahui macam asam amino yang harus diangkutnya. Contoh : bila kodon pada ARNd berbunyi Urasil-Urasil-Urasil (UUU) maka ARNt harus mengangkut asam amino fenalalanin. Apabila ADN membentuk kode genetik AUU-CCU-GAC-AGA maka polipeptida yang dapat dibentuk tersusun dari asam-asam amino isoleusin-prolin- aspartik-arginin. Kode genetik untuk seluruh organisme bersifat universal, artinya kode genetik suatu organisme dapat diterjemahkan oeh organisme lain dan membentuk asam amino yang sama.

3.1 Kesimpulan

BAB III

PENUTUP

Dari makalah yang dibuat dapat disimpulan sebagai berikut:

  • 1. Ribosom adalah komponen sel yang membuat protein dari semua asam amino. Ribosom umumnya terdapat terikat ke retikulum endoplasma dan selaput inti, dan sebagian lainnya terdapat bebas dalam sitoplasma.

protein yang dihasilkan, diangkut ke luar sel. Ribosom eukaryot diproduksi dan dirakit di dalam nukleolus.

  • 3. Ribosom dibagi menjadi dua subunit, satu lebih besar daripada yang lain. Mengikat subunit kecil untuk mRNA, sedangkan mengikat subunit yang lebih besar kepada tRNA dan asam amino. Ketika selesai membaca mRNA ribosom, kedua subunit terpecah. Ribosom telah diklasifikasikan sebagai ribozim, karena RNA ribosomal tampaknya paling penting bagi aktivitas transferase peptidil yang menghubungkan asam amino bersama. Ribosom dari bakteri, archaea dan eukariota (tiga domain kehidupan di Bumi), memiliki struktur secara signifikan berbeda dan urutan RNA.

  • 4. Salah satu sifat Struktur dari ribosom adalah yaitu Setiap sub unit dicirikan oleh koefisiensi sedimentasi yang dinyatakan dalam unit Svedberg (S). Sehingga koefisien sedimentasi dari prokariot adalah 70S untuk keseluruhan ribosom (50S untuk sub unit yang besar dan 30S untuk yang kecil). Untuk eukariot adalah 80S untuk keseluruhan ribosom (60S untuk sub unit besar dan 40S untuk yang kecil).

  • 5. Ribosom berfungsi sebagai tempat sintesis protein dan merupakan contoh organel yang tidak bermembran. Organel ini terutama disusun oleh asam ribonukleat, dan terdapat bebas dalam sitoplasma maupun melekat pada RE.

  • 6. Ribosom juga dapat melakukan Transkripsi, Terminasi, Inisiasi, Elogasi dan Elongasi.

  • 7. Protein tersusun atas asam amino,yang mengandung 1 atom karbon (C) dan mengikat 1 atom hidrogen (H), 1 gugus amin (NH2),1 gugus karboksil (- COOH) dan gugus R.

  • 8. Funggsi protein

    • 1. Mengatur metabolisme tubuh,

  • 2. Menjaga keseimbangan antara asam dan basa dan keseimbangan cairan dalam tubuh . Protein berperan penting dalam menjaga stabilitas pH cairan tubuh

    • 3 Protein merupakan bahan dalam sintesis substansis seperti halnya hormon,zat antibodi dan organel sel lainya

      • 4. Membantu dalam proses pertumbuhan pada anak anak dan remaja karena sel sel tubuh mendapat cukup asupan zat pembangun.

3.2 Saran

Semoga materi ini bermanfaat bagi kita semua. amin

DAFTAR PUSTAKA

Al Qadir. 2011. Al Qur’an dan Terjemahannya. Jakarta : Ilmu Pustaka.

Comarck, David .H. 1994. Histologi Jilid 1 Edisi ke-9. Jakarta : Binarupa Aksara. Geneser, Finn. 2009. Buku Teks Histologi. Jakarta : Binarupa Aksara.

Johnson. E, Kurt. 1994. Histologi dan Biologi Sel. Jakarta : Nuha Post. Campbell, Reece, & Mitchell. (2004). Biologi edisi kelima-jilid 1. Jakarta:

Erlangga. Lucia, MS. (2006). Buku ajar biologi sel. Palembang: Universitas Sriwijaya.

MAKALAH RIBOSOM DAN SINTESIS PROTEIN

MAKALAH “ RIBOSOM DAN SINTESIS PROTEIN ” OLEH : KELOMPOK I MARATUL AZIZA : A 221

OLEH :

KELOMPOK I MARATUL AZIZA

:

A 221 15 114

NURHAEDA

:

A 221 15

087

HASRINA

:

A 221 15

045

NURHASANAH

:

A 221 15 057

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

JURUSAN PENDIDIKAN MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS TADULAKO

2016