METABOLISME

DES
ACIDES AMINES
 OBJECTIFS

Connaître les réactions et les mécanismes de dégradation des

acides aminés

Assimiler le cycle de l’urée

connaître l’intérêt des acides aminés comme précurseurs de

nombreuses molécules biologiques

Connaître les principales anomalies du métabolisme des acides

aminés
 CHAPITRE - I -
--------------
GENERALITES
INTRODUCTION

AA : molécules à fonctions amine et acide fixés en α

R – CH – COOH
l
NH2

20 AA constitutifs des protéines naturelles

Rôles:

Structural: monomères des protéines

fonctionnel: ex glutamine et transmission de l’influx
nerveux

énergétique

Métabolique: précurseurs

Classification: chaîne latérale, polarité
I- ACIDES AMINES COMMUNS

20 AA, série L

AA indispensables: 10

Leu, Ile, Val

Mét, Thr, Lys

Phé, Trp

Arg, His

AA non indispensables: 10

Ala, Sér

Gly, cys

Pro, tyr

Asp, Asn

Glu, gln
 II- ACIDES AMINES PARTICULIERS

1- Hydroxyproline

Hydroxylation de la proline après son incorporation dans

la chaîne peptidique

Stabilisation de la structure hélicoïdale du collagène
2- gamma- carboxy glutamate

NH2
l
HOOC – CH – CH2 – CH – COOH
l
COOH

Protéines de la coagulations

Carboxylation du Glutamate vitamino K dépendante

Exemple: Facteurs II, VII, IX, X
III- ORIGINE DES ACIDES AMINES

A- ORIGINE EXOGÈNE

Alimentation: protéines animales, végétales

Hydrolyse par les enzymes protéolytiques puis absorption
intestinale des AA

AA essentiels

1- Besoin de l’organisme

Ration alimentaire:

Adulte: 60 à 70 g de protéines /j, soit 1 à 1,2 g/kg de poids

< 1 an: 3 à 4 g/kg de poids

Grossesse et allaitement: 80 à 100 g de protéines /j
2- Digestion des protéines

Hydrolyse par des protéinases gastriques et pancréatiques

2.1- Endopeptidases

Endopeptidase gastrique: pepsine

Coupe au niveau des liaisons peptidiques impliquant les

AA aromatiques

Endopeptidases pancréatiques:

Trypsine: liaisons peptidiques impliquant COOH des AA

basiques

Chymotrypsine: liaisons peptidiques impliquant COOH

des AA aromatiques
2.2- Exopeptidases

Carboxypeptidases:

Enzymes pancréatiques

Liaison carboxylique terminale

Aminopeptidases:

Muqueuse intestinale

Liaison N-terminale

Ex: Leucine aminopeptidase
B- ORIGINE ENDOGÈNE

Turn-over des protéines +++

Catabolisme en cas de jeûne prolongé

Synthèse des AA non essentiels.
IV- BIOSYNTHESE DES ACIDES AMINES NON ESSENTIELS

1- A partir d’acides aminés essentiels:

Méthionine Cystéine
Phénylalanine tyrosine

2- A partir d’acides aminés non essentiels et métabolites :

Pyruvate Alanine

Oxaloacétate α -cétoglutarate

Glycine Aspartate Glutamate

sérine Asparagine Glutamine Proline Arginine

3-phosphoglycérate
A- SYNTHESE DE LA TYROSINE

THB DHB
(Tétrahydrobioptérine) (Dihydrobioptérine)

Tyrosine obtenue par hydroxylation de la Phé

Phénylcétonurie:

déficit en Phé hydroxylase

Aminoacidopathie +++

Retard psychomoteur +++

Hyperphénylalaninémies: déficit en bioptérines
 B - SYNTHESE DE L’ALANINE

Transamination à partir du pyruvate

CH3 C COOH CH3 CH COOH

O NH2
Pyruvate PPine PPal Alanine

COOH CH2 CH2 C COOH COOH CH2 CH2 CH COOH

O NH2

α-cétoglutarate Glutamate

Alanine amino transférase ( ALAT ou GPT)

 C - SYNTHESE DU GLUTAMATE ET DE LA GLUTAMINE

1 – Synthèse du glutamate

Voie 1:

amination réductrice de l’α-cétoglutarate

NH3 et NAD(P)H,H+

Glutamate déshydrogénase
COOH COOH COOH
C=O NH3+ H2O C=NH NADH,H+ NAD+ H C NH2

CH2 CH2 CH2

CH2 CH2 CH2
COOH COOH COOH

α-cétoglutarate Glutamate

Voie 2:

Transamination de l’α-cétoglutarate avec l’alanine ou
l’aspartate

COOH CH2 CH COOH COOH CH2 C COOH

NH2 O
PPal PPine oxaloacétate
Aspartate

COOH CH2 CH2 CH COOH COOH CH2 CH2 C COOH

NH2 O

Glutamate α-cétoglutarate
2 – Synthèse de la glutamine
D - SYNTHESE DE L’ASPARTATE ET DE L’ASPARAGINE

1.Aspartate:

Transamination de l’oxaloacétate avec le glutamate

Désamination de Asn

2.Asparagine:

amidation du COOH de Asp par la Gln

Asparagine synthétase
IV- DESTINEE DES ACIDES AMINES

Protéines
Alimentation
endogènes

Glycolyse Précurseurs de
Cycle de krebs AA molécules d’intérêt
biologiques

NH3 Urée

CO2 Cétogénèse
Néoglucogénèse
 CHAPITRE - II -
---------
PROCESSUS GENERAUX DE
DEGRADATION DES ACIDES
AMINES
INTRODUCTION

R – CH – COOH Décarboxylation Amines

l
NH2

Copule carbonée NH3 NH4+ Gln

Glucoformatrice
Cétoformatrice Urée

Urines
I – DEGRADATION DES ACIDES AMINES

A – REACTIONS DE DEGRADATION DES ACIDES AMINES

1 – TRANSAMINATION

Transformation réversible des acides aminés en acides α-cétoniques

Intéresse le groupement NH2 en position α

Fait intervenir le couple α-cétoglutarate / glutamate

Tous les acides aminés (sauf leucine) ont une transaminase

2 transaminases d’intérêt médical

ALANINE AMINOTRANSFERASE

Alanine aminotransférase (ALAT)

Glutamate pyruvate transférase (GPT)

ASPARTATE AMINOTRANSFERASE

Aspartate aminotransférase (ASAT)

Glutamate oxaloacétate transférase (GOT)
Cas particulier: α-ω transamination

Ornithine:
H2N – (CH2)3– CH – COOH + α-cétoglutarate
l
NH2

CHO – (CH2)2 – CH – COOH + glutamate

l
Semi-aldéhyde glutamique NH2
2 – DESAMINATION OXYDATIVE

Fait intervenir des amino-acides oxydases

R – CH – COOH R - C – COOH
| ll
NH2 X XH2 NH
H2O

R - CO – COOH + NH3
 ATP GTP

Glutamate déshydrogénase

Foie, cerveau
Enzyme allostérique
3 – DESAMINATION NON OXYDATIVE

Possible pour quelques acides aminés: sérine et thréonine

Sérine déshydratase

CH2 – CH – COOH CH2 = C – COOH

| | |
OH NH2 H2O NH2
sérine
NH3

CH3 – C – COOH
ll
O
Acide pyruvique
4 – DESAMIDATION

AA qui possèdent un radical amide: glutamine et asparagine

Glutaminase et l’asparaginase
5 – DECARBOXYLATION

Aboutit à la formation d’amines

Coenzyme: phosphate de pyridoxal

décarboxylase
R – CH – COOH R- CH2 – NH2
|
NH2 CO2

Exemples:

Glu → GABA

Tyr → Dopa → Dopamine

His → Histamine

Sér → éthanolamine
B – MECANISMES DE DEGRADATION

1– DOUBLE TRANSAMINATION

Aspartate
Acide aminé α-cétoglutarate Alanine

AT ALAT /ASAT

Acide α-cétonique Glutamate Pyruvate

oxaloacétate
 2–TRANSDESAMINATION

Acide aminé α-cétoglutarate NH3

AT Glu DH

Acide α-cétonique Glutamate

II – DEVENIR DU GROUPEMENT AMINE

Production de l’ammoniac par les tissus de l’organisme de

façon constante

Origine:dégradation des aa, amines, bases puriques…

Taux sanguins:20 à 60 µmol/l

NH3 toxique pour le cerveau
B– METABOLISME DE LA GLUTAMINE
1- Synthèse de la glutamine ou glutaminogénèse

A partir de NH3 issu de la désamination oxydative du

glutamate

Glutamine synthétase

ATP, Mg2+

Circulation sanguine: 400 à 700 µmol/l

Rôle: détoxification et de transport de l’ammoniac

2- Cycle de la glutamine α -CG Tissus

NH3

Glu

Gln

Rein

Glu + NH3

Urines
 4- Rôle de la glutamine

Elimination de l’ammonium

Biosynthèse des composés azotés: bases puriques et bases
pyrimidiques

Synthèse des osamines: glucosamine

Ammoniophérèse rénale:

libération du NH3 sous l’action de la glutaminase

Maintien de l’équilibre acido-basique
C – UREOGENESE

Voie métabolique qui abouti à la synthèse de l’urée à partir

de l’ammonium plasmatique et des ions bicarbonates.

Principale voie d’excrétion de l’ammoniac

Exclusivement dans le foie

Cycle à 5 réactions: 2 mitochondriales , 2 cytosoliques et 1

microsomale
 MITOCHONDRIE
HCO3- Carbamyl
NH4+ phosphate

citrulline Aspartate

Ornithine Arginosuccinate

M Arginine
I Urée
C Fumarate
R
O
S
O CYTOSOL
M
E
1- Etapes de l’uréogenèse

1.1- synthèse du carbamyl phosphate

• Carbamyl-phosphate synthétase
• Réaction mitochondriale, en 2 étapes
• Coenzyme: N acétyl glutamate
• HCO3-, NH4+, apport de 2 ATP
• réaction irréversible, limitante
 1.2- synthèse de la citrulline

Enzyme mitochondriale, passe dans le sang en cas de cytolyse

hépatique

Passage de l’ornithine du cytosol →mitochondrie: transport actif

Hyperornithinémie type I: ornithine +++, ammonium +++

Sortie de la citrulline dans le cytosol par transport actif
1.3- formation de l’acide argininosuccinique

+
- NH – C =NH
l
NH
l

Argininosuccinate synthétase cytosolique

Condensation de la citrulline avec l’aspartate

Apport d’énergie sous forme d’ATP

 1.4- formation de l’arginine

Fumarate rejoint le métabolisme général → oxaloacétate

 1.5- Formation de l’urée

Clivage hydrolytique de l’arginine

Retour de l’ornithine dans la mitochondrie

2- Bilan énergétique

2NH4+ + HCO3- + 3 ATP+ H2O

Urée + 2 ADP + AMP + 4 Pi

3- Régulation

2.1- Activation

N acétyl-glutamate: carbamyl phosphate synthétase

Jeûn prolongé ou hypercatabolisme protidique

Cortisol: stimule le catabolisme protidique

Glucagon

2.1- inhibiteurs

Androgènes: anabolisants protéiques

Insuline
4- Anomalies de l’uréogenèse

3.1 - Anomalies de transport

Hyperornithinémie type I

3.2- Déficits enzymatiques

Hyperammoniémie type I: déficit en carbamyl phosphate synthétase

Hyperammoniémie type II:: déficit en ornithine transcarbamylase

N acétyl glutamate synthétase

Citrullinémie: argininosuccinate synthétase

Acidurie argininosuccinique: arginosuccinate lyase

Hyperargininémie : arginase
 3.3- signes cliniques

Vomissements chez le nourrisson

Incapacité d’ingestion d’aliments riches en protéines

Irritabilité

Hépatomégalie (HMG)

Ataxie intermittente, léthargie , retard mental

III– DEVENIR DE LA COPULE CARBONNEE

A – CETOGENESE

AA mixtes: Ile Phé, Tyr, Trp et Lys

AA cétoformateur pur: Leu

B – NEOGLUCOGENESE
Thr
Gly Ser
pyruvate
Cys
His
Trp Ala
Asn Arg
Asp OAA Pro
Gln

Glu
Phé
fumarate
Tyr
Asp
Asn
α-cétoglutarate

Succinyl CoA

Propionyl CoA Ile, Val, Met, Thr

B .1 – ACIDES AMINES DONNANT LE FUMARATE

B.1.1 –PHE ET TYR

AA mixtes

Fumarate → néoglucogenèse

Acétoacétate → cétogenèse

Déficits enzymatiques → aminoacidopathies
1- formation du para-hydroxy-phényl pyruvate

Tyrosine transaminase, coenzyme phosphate de pyridoxal

Tyrosinémie type II: Tyr ++ urines
2- formation de l’acide homogentisique

P OH phényl pyruvate oxydase(dioxygénase, hydroxylase):

Dioxygénation

Décarboxylation

Déplacement de la chaîne latérale
3- formation du maléyl acétoacétate

homogentisate oxydase(dioxygénase):

Dioxygénation

Ouverture du cycle

Déficit: alcaptonurie

Noircissement des urines au contact de l’air
4- isomérisation du maléyl acétoacétate en fumaryl acétoacétate

Isomérisation cis- trans

5- hydrolyse du fumaryl acétoacétate

Fumarate → néoglucogenèse

Acétoacétate: corps cétonique

Déficit: Tyrosinémie de type I

Tyrosinémie de type I:

Tyrosinémie hépato-rénale

diagnostic biologique:

Sang : Tyr et Mét

Urines : idem, hyper-aminoacidurie généralisée

Succinylacétone : pathognomonique

Traitement:

Régime pauvre en Phé et Tyr

NTBC: 2-nitro-4-trifluorométhyl benzoyl 1,3 cyclohéxanedione, bloque la p-
OHphénylpyruvate dioxygénase
Tyrosine
transaminase

Homogentisate
oxydase

Fumaryl
acétoacétate
hydrolase
B.2- ACIDES AMINES DONNANT LE SUCCINYL COA

B.2.1- Valine et Isoleucine

Transamination:

dans le muscle et le cerveau

Transaminases spécifiques → α - acides cétoniques

α- Cétoglutarate / glutamate

Décarboxylation oxydative:

Foie et muscle

Déshydrogénases (NAD+) → acyl CoA

Dégradation des acyls CoA par β-oxydation

 Isoleucine Valine

Leu- Ile tran saminase Val transaminase

α-céto β méthyl- α-cétoisovalérate

valérate
Cétoacide déshydrogénase (BCKDH)

α Méthyl butyryl CoA

Isobutyryl CoA

β-oxydation

Acétyl CoA Succinyl CoA

Propionyl CoA
Néoglucogénèse
B.2.2- Méthionine

Donne α-cétobutyrate par trans-sulfuration

→ propionyl CoA: décarboxylation oxydative par une α cétoacide

déshydrogénase à coenzyme NAD

Vit B12
 CHAPITRE - III -

METABOLISME

PARTICULIER

DES ACIDES AMINES


AA: rôle métabolique important

Précurseurs de nombreuses molécules assurant des fonction s
différentes

Hormones

Pigmentation

Protection cellulaire

Hème …
 I- SYNTHESE DE LA CREATINE

Petite molécule présente dans le muscle ++, cerveau

Créatine phosphate: réservoir de phosphate à haute énergie

Forme d’énergie non recyclable:

CP → C + Pi+ En → créatinine → urines

Synthèse de la créatine:

Etape rénale :
arginine + glycine → guanidoacétate + ornithine

Etape hépatique:
guanidoacétate + S Adénosyl méthionine
↓
créatine+ S A homocystéine
 Amido transférase
rein
NH HN
COOH

Méthyl transférase
Foie

HN
N COOH
Déshydratation
non enzymatque

COOH
 II- SYNTHESE DU GLUTATHION

Tripeptide: γ Glu – Cys – Gly

Actif par le groupement sulfydryle de la Cys

 Glutathion
γ Glu – Cys – Gly

Rôles:

Réduction des molécules oxydées: Méthémoglobine,
péroxydes d’hydrogènes

Conjugaison à certains médicaments → hydrosolubles

Transport inter-membranaires des AA:
1- liaison de l’AA avec le glutathion à la surface de la cellule
γ -Glutamyl transpeptidase
AA+ glutathion γ glutamyl-AA + cystéinyl-glycine
2- le γ glutamyl-AA franchit la membrane cellulaire
3- libération de l’AA dans le cytoplasme:
γ glutamyl-AA Glutamate + AA
 III- SYNTHESE DES HORMONES THYROIDIENNES

Glandes thyroïdiennes

Iodation de résidus tyrosyls liés à la thyroglobuline (TG)

thyroxine ou T4 +++

triiodothyronine ou T3

Libération de T3 et T4 par protéolyse de la TG → sang: TBG ou
thyroxine binding globuline
IV- SYNTHESE DES CATECHOLAMINES

Noyau catéchol: noyau aromatique + 2 OH

HO

HO

Hormones :

Adrénaline (épinéphrine): H médullo-surrénaliennes

Noradrénaline et dopamine: neurotransmetteurs
Sang

Adrénaline

Noradrénaline

Espace inter-
synaptique
 IV- SYNTHESE DE LA MELANINE

Pigmentation de la peau et des phanères

Synthèse dans les mélanocytes

A partir de la tyrosine

Albinisme:

déficit en tyrosinase

Troubles oculaires

Peau et cheveux décolorés
 V- SYNTHESE DES BASES PYRIMIDIQUES

Noyau pyrimidine substitué

Cytosine

Uracyl (ARN)

Thymidine (ADN)

Biosynthèse:

6 étapes

Carbamyl phosphate synthétase cytoplasmique: Gln
Gln

Asp
Co2
VI- SYNTHESE DES BASES PURIQUES
VII- SYNTHESE DE L’HEME

Groupement prosthétique de:

Hémoglobine

Myoglobine

Enzymes: cytochromes, catalases, péroxydases

Synthèse à partir de la glycine et du succinyl CoA

8 étapes: la première et la dernière mitochondriales
 ALA synthétase
Glycine
ALA ALA déshydratase
Succinyl CoA

Porphobilinogène

Uro Pgène III

Hème cosyn thétase

Uroporphyrinogène
ferroch élatase
Uro Pgène
décar boxylase

protoporphyrine IX Coproporphyrinogène

ProtoPgène CoproPgène
oxydase oxydase
protoporphyrinogène
CONCLUSION