Senyawa target yang digunakan yaitu enzim Protease HIV-1 (Indentitas PDB 3NU3).
Makromolekul 3NU3 merupakan struktur enzim Protease yang berikatan dengan
Amprenavir (Ligan ko-kristal). Amprenavir digunakan sebagai senyawa pembanding untuk membandingkan potensi antara obat dengan senyawa dari genus Nigella sebagai senyawa uji dalam berikatan dengan enzim Protease HIV-1. Struktur 3NU3 diunduh