Anda di halaman 1dari 10

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA KOMPUTASI

OLEH

NAMA : FADHILAH TARMIZI

NIM : 16036039

PRODI/KELAS : KIMIA / B

DOSEN : Dr. FAJRIAH AZRA,S.Pd,M.Si

JURUSAN KIMIA

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS NEGERI PADANG

2O18
A.TUJUAN
Untuk menghitung muatan atom dan menganalisis statistika data menggunakan
HYPERCHEM dan SPSS dari senyawa induk dan turunan senyawa.

B.WAKTU DAN TANGGAL


Hari / tanggal : Kamis /
Waktu : 13.20 – 15.00 wib
Tempat : Laboratorium ICT FMIPA UNP

C.DASAR TEORI
Hyperchem adalah suatu program simulasi dan permodelan melekuler untuk
menghitung perhitungan kimia kompleks. Adapun fasilitas yang tersedia pada aplikasi
Hyperchem :
1. Menggambar molekul dan permodelan 3 dimensi.
2. Struktur bangun protein dan asam nukleat dari residu standar.
3. Menentukan efek isotop dalam perhitungan analisis vibrasi dengan metode
semi empiris dan ab initio.
4. Grafik dari hasil perhitungan kimia.
5. Perhitungan mekeanika molekuler dan mekanika kuantum dengan metode
semi empiris dan ab initio.
Terdapat beberapa tipe perhitungan antara lain kalkulasi single point,optimasi
geometri,frekuensi vibrasi,pencarian keadaan transisi,simulasi dinamika molekuler,simulasi
dinamika langevin dan simulasi monte calo.Perhitungan single point dapat digunakan untuk
menyediakan energi molekul dari struktur yang ditentukan tanpa proses optimasi,sedangkan
perhitungan optimasi geometri menggunakan algoritma minimasi energi untuk
mendapatkan struktur paling stabil.Dalam optimasi geometri disediakan 5 algoritma
minimisasi.
Senyawa induk N-(7-chloroquinolin-4-yl)ethane-1,2-diamine memiliki 18 turunan
senyawa dan memiliki aktivitas biologis sebagai antiplasmadial,kemudian dihitung muatan
atomnya dengan komputasi.
Salah satu hal yang bisa dilakukan dengan kimia komputasi adalah analisis muatan
atom,bahkan hanya kimia komputasi yang bisa menghitung muatan atom karena muatan
atom tidak dijumpai dalam sifat fisika ataupun sifat kimia.Bnayak konsep yangberikatan
dengan muatan atom diantaranya adalah ikatan ion,kovalen,polaritas,redoks,elektrofilik dan
nukleofilik.
SPSS adalah singkatan dari Statistical Package for the Social Sciences. Aplikasi untuk
melakukan analisis statistik. SPSS itu termasuk salah satu program aplikasi yang memiliki
kemampuan didalam menganalisis statistik yang memiliki keakuratan yang cukup
tinggi.Kemudian juga sistem manajemen data dalam lingkungan grafis yang memakai menu-
menu deskriptif serta kotak dialog yang sederhana. Selain itu, pengoperasiannya mudah
dilakukan. Selain itu SPSS bisa untuk membaca beraneka macam jenis data maupun
memasukkan data secara langsung pada SPSS data editor. Hasil-hasil analisis nantinya akan
muncul dalam SPSS Output Navigator. Data editor merupakan jendela di dalam pengolahan
data.
Penggunaan SPSS sebagai berikut :
1.Melakukan riset pemasaran (market research).
2.Analisis data survey atau kuesioner.
3.Populer dipakai dalam penelitian akademik mahasiswa.
4.Populer digunakan oleh keperluan pemerintahan seperti lembaga BPS.
5.Data Mining.
6.Membantu untuk pengambilan keputusan dalam suatu perusahaan.
7.Penelitian kesehatan masyarakat.
8.Mendokumentasikan data.
9.Representasi data statistik.
D.ALAT DAN BAHAN

1.ALAT
Komputer/ laptop
2.BAHAN
Jurnal
Aplikasi Hyperchem
Aplikasi SPSS

E.PROSEDUR KERJA
1.Menghitung muatan atom
Buka aplikasi Hyperchem
Gambarkan senyawa induk
Save as
Klik start log
Klik setup
Pilih semi empiris AM1
Atur pilihan Total charge 0
Spin multiplicity 1
Convergence limit 0.001
Iteration limit 50
Compute geometry optimazion
Setelah ‘YES”
Stop log
Save as senyawa yang telah dicompute
Ulangi untuk turunan senyawanya

2.Menganalisis statistika data


Buka aplikasi SPSS
Klik file pilih new Data
Kemudian pada halaman data set 1
Pilih data view
Masukkan data dari excel
Kiri aktivitas biologis kanan muatan atom
Pada variable view ganti name dan label
Klik analyze pilih regression linear
Aktivitas pada dependent
Muatan pada independent
Klik statistics pilih Durbin-watson
Klik plots ZPRED untuk x SRESID untuk y
Pilih histogram dan Normal probability plot
Klik save pilih Undstandardized
Klik continue
Kemudian OK
Lalu save data dan output
F.TABEL PENGAMATAN
Struktur Senyawa induk

Tabel I. Struktur I seri senyawa turunan

NO Nama Senyawa R Aktivitas


biologis

5. N-(2-(5-(1H-Pyrrol-2-yl)-1H- 0.72 ± 0.02


imidazol-1-yl)ethyl)-7-
chloroquinolin-4-amine

6. 7-Chloro-N-(2-(5-(3- 0.63 ± 0.04


methylthiophen-2-yl)-1H-
imidazol-1-yl)ethyl)quinolin-4-
amine

7. N-(2-(5-(1H-Indol-3-yl)-1H- 0.83 ± 0.03


imidazol-1-yl)ethyl)-7-
chloroquinolin-4-amine

8. 7-Chloro-N-(2-(5-(4- 0.62 ± 0.05


(trifluoromethyl)phenyl)-1H-
imidazol-1-yl)ethyl)quinolin-4-
amine

9. 7-Chloro-N-(2-(5-(4- 0.42 ± 0.02


isopropylphenyl)-1H-imidazol-
1-yl)ethyl)quinolin-4-amine

10. 7-Chloro-N-(2-(5-(4- 0.52 ± 0.03


(dimethylamino)phenyl)-1H-
imidazol-1-yl)ethyl)quinolin-4-
amine

11. 7-Chloro-N-(2-(5-(quinolin-2- 0.68 ± 0.04


yl)-1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine
12. 7-Chloro-N-(2-(5-(3- 0.73 ± 0.03
phenoxyphenyl)-1H-imidazol-1-
yl)ethyl) quinolin-4-amin

13. N-(2-(5-Tert-butyl-1H-imidazol- 0.64 ± 0.02


1-yl)ethyl)-7-chloroquinolin-4-
amine

14. 7-Chloro-N-(2-(5-(furan-2-yl)- 0.69 ± 0.04


1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

15. 4-(1-(2-(7-Chloroquinolin-4- 0.71 ± 0.03


ylamino)ethyl)-1H-imidazol-5-
yl)

benzonitrile

16. 7-Chloro-N-(2-(5-(4- 0.73 ± 0.04


methoxyphenyl)-1H-imidazol-
1-yl)ethyl)quinolin-4-amine

17. 7-Chloro-N-(2-(5-cyclopentyl- 0.63 ± 0.03


1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

18. 7-Chloro-N-(2-(5-(2,3- 0.69 ± 0.02


dihydrobenzo[b][1,4]dioxin-6-
yl)-1Himidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

19. 7-Chloro-N-(2-(5-(4- 0.79 ± 0.04


fluorophenyl)-1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

20. 7-Chloro-N-(2-(5-(naphthalen- 0.75 ± 0.03


1-yl)-1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

21. 7-Chloro-N-(2-(5-cyclohexyl- 0.67 ± 0.03


1H-imidazol-1-
yl)ethyl)quinolin-4-amine

22. 4-(1-(2-(7-Chloroquinolin-4- 0.81 ± 0.04


ylamino)ethyl)-1H-imidazol-5-
yl)

phenol
PEMBAHASAN

Pada percobaan ini bertujuan untuk menghitung muatan atom dan menganalisis
statistika data pada senyawa induk N-(7-chloroquinolin-4-yl)ethane-1,2-diamine dan 18
turunan senyawanya.Senyawa ini memiliki aktivitas biologis sebagai antiplasmadial.

Dengan hyperchem senyawa induknya digambarkan terlebih dahulu Setelah


membuat permodelan untuk senyawa induk, dilanjutkan dengan pengoptimasian nya ambil
start log pada menu bar file. Kemudian simpan dengan nama file yang diinginkan. Setelah itu
klik setup dan pilih semi-empirical computation. Kemua di dalam semi-empical ini pilih menu
AM 1 dan klik option. Kemudian ganti convergence menjadi 0.001 dan iteration limit menjadi
50 lalu ok. Am 1 adalah model perhitungan yang di gunakan.

Selanjutnya pilih menu compute lalu pilih geometry optimation.Klik polak-ribiere lalu
ganti RMS gradient of 0.001 kcal or 32767 maximum cycles.Setalah pengoptimasian
dilakukan dan mendapatkan yes maka optimasi berhasil. Kemua stop log yang gunanya
untuk menghentiakan pengootimasian. Setelah itu save as.

Setelah didapatkan semua data muatan atom pada hyperchem dimana pada senyawa
induk muatan atom yg terdapat adalah 19 untuk turunan senyawanya terdapat 19 muatan
atom juga berdasarkan jumlah muatan atom induk.Selanjutnya data dipindahkan ke excel.

Selanjutnya yaitu menggunakan aplikasi SPSS dimana aplikasi ini bertujuan untuk
menganalisis statistika data Tabel yang di excel dipindahkan ke data review sebelah kiri
aktivitas biologis dan sebelah kanannya muatan atom dimana aktivitas biologis adalah
variabel terikat dan muatan atom variabel bebasnya.Selanjutnya di sesuaikan dengan
prosedur kerja didapatkan hasil data berupa output ditandai dengan adanya grafik,tabel dan
kita bisa melihat apakah data kita itu bagus atau tidak,Apabila lingkaran yg terdapat dalam
grafik berhimpit dengan garis maka data kita bagus.
KESIMPULAN

1. Hyperchem adalah suatu program simulasi dan permodelan melekuler untuk


menghitung perhitungan kimia kompleks.
2. Senyawa induk N-(7-chloroquinolin-4-yl)ethane-1,2-diamine memiliki 18 turunan
senyawa dan memiliki aktivitas biologis sebagai antiplasmadial
3. SPSS adalah singkatan dari Statistical Package for the Social Sciences. Aplikasi untuk
melakukan analisis statistik
DAFTAR PUSTAKA

S.Riswiyanto.2009.KIMIA ORGANIK.Jakarta : Erlangga

Saputra, Andrian. 2015. COMPUTATIONAL CHEMISTRY. Lampung: Universitas Lampung.