1. MIKROBIOLOG (Orang)
TAKSONOMI
Virologi
Bakteriologi
Mikrobiologi
Fikologi (Algologi)
2. MIKROBA
Virus
Bakteri
Fungi
Algae
Protozoa
APLIKASI
Mikrobiologi Industri
Mikrobiologi Kesehatan
Mikrobiologi Pertanian
Mikrobiologi Pangan
Mikrobiologi Lingkungan
PROSES
Fisiologi mikroba
Genetika mikroba
Ekologi mikroba
1. Organisme Prokariotik :
Organisme yang tidak memiliki memberan inti
Organel sel sederhana
Domains : Bacteria, Archaea, Cyanobacteria (Alga hujau-biru)
2. Organisme Eukariotik :
Organisme yang sudah memiliki memberan inti
Organel sel lengkap
SITOPLAMA NUKLEUSPLASMA
Dinding sel
Senyawa –senyawa:
ORGANEL -pigmen antosianin
Memberan sel -alkaloid
Nukleus
RE -tanin
Asam nukleat
-glikosida
Aparatus Golgi
-garam nitrat
Mitokondria -butir glikogen
Ribosom -garam oksalat
Sebtrosom
Lisosom
Plastida
Vakuola
Soal
Jawaban :
Materi 3
Morfologi dan struktur sel
Bakteri :
Bersel tunggal
Tidak ada inti
Struktur sederhana
Biasanya berkisar ukuran dari sekitar 0,1 hingga 20 µm
Karakteristik Bakteri
1. Sel bakteri adalah sel prokariotik
2. Sel bakteri sangat kecil (sekitar 0,1 hingga 20,0 µm)
3. Bakteri tersebar luas. Ditemukan di tanah, udara, air, dan benda hidup
4. Beberapa bakteri menyebabkan penyakit pada hewan dan tumbuhan
5. Beberapa bakteri hidup dalam tubuh kita sebagai flora normal yang tidak berbahaya
Flora Normal
Spesies bakteri yang menjajah tubuh manusia dan biasanya tidak menyebabkan
penyakit
Dapat menyebabkan beberapa masalah jika dipindahkan atau habis karena
menggunakan antibiotik
Organisme dari flora normal biasanya ditemukan pada jaringan permukaan (yaitu,
kulit, selaput lendir, sistem pencernaan, dan vagina
Fungsi Flora Normal
1. Melakukan fungsi metabolisme yang tidak penting misalnya:
a. Sintesis vit. K
b. Konversi pigmen empedu dan asam empedu
c. Penyerapan nutrisi dari usus
2. Menghambat kolonisasi dan infeksi oleh bakteri patogen karena :
a. Mengganggu kepatuhan bcterial
b. Pertahankan pH dalam vagian dan kulit
c. Bersaing untuk nutrisi penting
d. Menghasilkan zat penghambat misalnya : Asam lemak dan colicin
Keanekaragaman Bakteri :
1. Coccus (pl. Cocci)
2. Coccobacillus
3. Vibrio
4. Bacillus (pl. Bacilli)
5. Escherichia coli
6. Spirillum
7. Spirochete
KERAGAMAN KOLONI BAKTERI
KERAGAMAN BENTUK BAKTERI
PERTANYAAN
1. SEBUTKAN KARAKTERISTIK BAKTERI?
JAWABAN:
Karakteristik Bakteri
1. Sel bakteri adalah sel prokariotik
2. Sel bakteri sangat kecil (sekitar 0,1 hingga 20,0 µm)
3. Bakteri tersebar luas. Ditemukan di tanah, udara, air, dan benda hidup
4. Beberapa bakteri menyebabkan penyakit pada hewan dan tumbuhan
5. Beberapa bakteri hidup dalam tubuh kita sebagai flora normal yang tidak berbahaya
MATERI 4
MORFOLOGI DAN STRUKTUR FUNGI
mycology
Mycologi adalah ilmu yang mempelajari tentang fungi
Karakteristik Jamur
- Tumbuhan primitif, ditemukan di udara, tanah, tanaman dan air
- Sebagian besar nonmotil
- Tidak mengandung klorofil
- Tidak ada fotosintesis (heterotrof)
- Jamur bisa menjadi parasit
- Jamur bisa berupa saprofit
- Pengurai
- Jamur bisa merusak makanan
- Jamur dapat merusak kain dan kulit
- Jamur bisa bersifat parasit pada tanaman dan menghasilkan toksin
- Jamur dapat menyerang manusia dan hewan dan menyebabkan penyakit
Klasifikasi Morfologi
1. Ragi : ini adalah sel oval atau bulat yang berkembang biak dengan tunas
2. Jamur / Jamur berfilamen: ini adalah filamen bercabang (hifa) yang mungkin terpisah
atau tidak terpisah. Cetakan menghasilkan spora untuk bereproduksi
3. Jamur dimorfik:
Ini terjadi dalam 2 bentuk
Bentuk ragi di jaringan atau ketika tumbuh pada usia 37⁰C
Bentuk berserabut saat ditanam pada usia 22⁰C
4. Jamur : macrofungi
Klasifikasi Klinis
1. Mikosis superfisial : seperti kandidiasis mulut dan vaginitis yang disebabkan oleh
Candida albicans
2. Mikosis kulit: melibatkan kulit, kuku atau rambut misalnya : dermatofita, kandidiasis
kulit
3. Mikosis sistemik : seperti infeksi paru-paru yang disebabkan oleh fumigasi
Aspergillus, dan demam gurun yang disebabkan oleh Coccidioides immitis
Reproduksi
1. Aseksual
Budding/tunas
Spora aseksual
Pembelahan
2. Seksual
Terjadi dengan pembentukan kuncup atau tunas pada jamur uniselluer serta
pemuntusan benang hifa
Ragi
- Mono / uniseluler
- Psoudohifa / tidak
- Aerob / anaerob
- Koloni bentuk pasta
Morfologi Ragi :
- Makroskopis: koloni mirip dengan bakteri
- Bervariasi dalam ukuran 1: 1-5 µm hingga 20-50 µm , w: 1-10 µm
- Bentuk bermacam-macam : bulat, oval, silinder, triangular, botol, lemon, pseudohifa,
dsb
- Susunan sel : pseudohifa / tidak
- Mikrostruktur terdiri dari kapsul, dinding sel, membran sitoplasma, nukleus, vakuola,
mitokondria, gumpalan lipid, sukarelawan / polifosfat dan sitoplasma
Struktur Ragi
1. Kapsul
Dimiliki beberapa khamir
Komponen ekstraseluler, berlendir, menutupi bagian luar dinding sel
Polisakarida dan heteropolisakarida
Hidrofobik
2. Dinding sel
Pada sel muda tipis, tua semakin tebal
Waktu generasi 1-6 jam
3. Memberan Sitoplasma
Tebal ± 8 um
Tersusun protein, asam ribonukleat dan lipid
Transpor nutrean & pelepasan hasil metabolism ke luar
4. Nukleus
Dikelilingi membrane inti (berpori-pori)
Pada pembelahan/pertunasan , kromosom terbagi dua
5. Vakuola
Kantong berisi cairan bening & encer
≥ 1, ukuran bervariasi
6. Mitokondia
P 0,4-0,6 µm diameter 0,2-0,3 µm
Proses respirasi
7. Globula Lipid
Jumlah dan ukuran bervariasi
8. Sitoplasma
Mengandung glikogen
Asam ribonukleat dan protein (terutama di ribosom)
PERTANYAAN
JAWABAN
Reproduksi
1. Aseksual
Budding/tunas
Spora aseksual
Pembelahan
2. Seksual
Terjadi dengan pembentukan kuncup atau tunas pada jamur uniselluer serta
pemuntusan benang hifa
MATERI 5
PERTUMBUHAN MIKROBA
Pertumbuhan mikroba
Media Selektif
Misalnya ;
Agar Macconkey yang mengandung garam empedu sebagai agen selektif
Garam gigitan adalah komponen dari wajah dan menghambat pertumbuhan bakteri
Gram-positif dan merangsang pertumbuhan batang Gram - negatif
Agen selektif lainnya:
Metilen biru dan kristal violet menghambat gram positif
Selenite dan green cemerlang digunakan di media untuk mengisolasi salmonella
dari wajah
Sodium azide digunakan untuk mengisolasi enterococci dari air dan makanan
Media Deferensial
Media diferensial menumbuhkan beberapa jenis organisme dan menunjukkan
perbedaan yang terlihat antara organisme
Perbedaan dapat muncul sebagai koloni, warna media, pembentukan gelembung
gas dan pembentukan endapan
Karakteristik Media :
Untuk menguji bakteri untuk aktivitas, produk, atau persyaratan tertentu
Misalnya urea broth yang digunakan untuk mendeteksi urease
Ikan asin, dendeng, madu, susu kental manis diawetkan dengan menarik air dari
bakteri
Medium hipotonik (osmolaritas rendah) dapat melisiskan bakteri tanpa dinding
sel
Asosiasi ekologis
reproduksi bakteri
Waktu generasi
fase pertumbuhan
Fase lag - membuat enzim baru sebagai respons terhadap medium baru
Fase log - pertumbuhan eksponensial
Diinginkan untuk produksi produk
Paling sensitif terhadap obat-obatan dan radiasi selama periode ini
Fase diam
nutrisi menjadi pembatas atau produk limbah menjadi beracun
tingkat kematian = tingkat pembagian
Fase kematian = kematian melebihi divisi
mengukur pertumbuhan
PERTANYAAN
JAWAB
ISOLASI MIKROORGANISME
Kultur Mikroba sebagai berikut :
1.Inokulasi
2. Isolasi
Isolasi: pemisahan organisme individu dari komunitas campuran
pure culture: isolasi pada media diferensial umum dan khusus
koloni di media, satu jenis mikroba, kultur murni
banyak kolon menggunakan jarum, pilih satu, dan ulangi coretan piring
pilih media yang tepat
3.Inkubasi
Inkubasi : memungkinkan organisme untuk tumbuh di bawah kondisi optimal
suhu, dengan atau tanpa oksigen dll
4.Inspeksi
Inspeksi : observasi, deskripsi
morfologi koloni, pemeriksaan mikroskopik (pewarnaan gram)
rekaman sistematis '' DATA ''
IDENTIFIKASI MIKROORGANISME
1.Identifikasi
Identifikasi : mengkorelasikan data dari semua pengamatan dengan organisme ID ke
spesies
Metode
a. Fenotip
Morfologi
reaksi gram, ukuran, bentuk, motilitas, pigmen, dll
reaksi biokimia
sumber daya: diagram alir, manual bergey dll.
b. Genotip
pola teknik berbasis sidik jari
teknik berbasis squeen
ex gram bacill, fermentasi laktosa, kilau hijau pada EMB: E.coli
gram + cocci, kelompok mirip anggur, koloni kuning keemasan, katalase +,
koagulase +, tahan terhadap Metisilin (MRSA)
1. Pewarnaan Sel Bakteri
pewarnaan sel bakteri untuk pemeriksaan mikroskopis memungkinkan
Karakteristik ini dapat digunakan untuk identifikasi bakteri
pewarnaan satu pewarna sederhana
prosedur pewarnaan diferensial yang kompleks, lihat perbedaan antar sel
pewarnaan diferensial
a. pewarnaan gram
b. gram + dan dinding sel
c. pewarnaan gram
PERTANYAAN
JAWAB
pewarnaan diferensial
Genetika adalah cabang biologi yang mempelajari pewarisan sifat pada mikroorganisme
maupun suborganisme.
TERMINOLOGI
Produksi
Genetika
Gene
Genom
Formasi Filamen
Pembelahan biner:
satu orang tua yang terlibat
keturunan identik dengan induk & satu sama lain
Amitosis
a. Kerugian
tidak ada variasi genetik
satu kondisi lingkungan yang tidak menguntungkan dapat menghapus seluruh
populasi
Jika pembelahan biner menghasilkan keturunan klon, mengapa bakteri begitu
beragam secara genetis ???
faktor berkontribusi terhadap keragaman genetik di antara dan di dalam spesies
bakteri
Mutasi
Rekombinasi
b. Kekurangan:
lebih kompleks: lebih lambat karena harus menemukan mitra yang kompatibel
tidak ada individu baru yang diproduksi (mis. tidak ada peningkatan populasi)
Konjugasi
Transformasi
Transduksi
JAWAB
Kekurangan:
lebih kompleks: lebih lambat karena harus menemukan mitra yang kompatibel
tidak ada individu baru yang diproduksi (mis. tidak ada peningkatan populasi)
MATERI 8
VIROLOGI
Virus
Karakterikstik virus
TAKSONOMI VIRUS
Herpesvirida
Herpesvirus
Human herpes virus 1, HHV 2, HHV 3
Retroviridae
Lentivirus
Human Immunodeficiency Virus 1, HIV 2
Klasiffikasi virus
Sesuai dengan macam inang yang diinfeksi, missal hewan/ manusia, tumbuhan,
bakteri.
Sesuai dengan ukuran/ struktur (ada tidaknya selubung / envelope dan bentuk
capsid)
Sesuai dengan jaringan yang biasa diserang(hanyaterdapatpadagroup virus
mamalia)
Sesuai dengan materi genetiknya
Berdasarkan jenis materi genetika, virus dibagi menjadi2, yaitu:
Litensi virus
Virus dapat dimanfaatkan dalam bidang rekayasa genetika (vektor mutasi gen)
maupun penelitian di bidang kedokteran.
Virus yang digunakan untuk memproduksi interferon berfungsi untuk mencegah
replikasi virus di dalam sel hospes. Interferon merupakan protein kecil yang
dihasilkan oleh sel normal sebagai respon terhadap infeksi virus.
Virus digunakan untuk pembuatan vaksin. Vaksin adalah mikroorganisme patogen
yang telah dilemahkan sehingga sifat-sifat patogenitas penyebab penyakitnya hilang,
tetapi sifat-sifatnya antigenitas penimbul antibodi tetap.
PERTANYAAN
JAWAB
Virus dapat dimanfaatkan dalam bidang rekayasa genetika (vektor mutasi gen)
maupun penelitian di bidang kedokteran.
Virus yang digunakan untuk memproduksi interferon berfungsi untuk mencegah
replikasi virus di dalam sel hospes. Interferon merupakan protein kecil yang
dihasilkan oleh sel normal sebagai respon terhadap infeksi virus.
Virus digunakan untuk pembuatan vaksin. Vaksin adalah mikroorganisme patogen
yang telah dilemahkan sehingga sifat-sifat patogenitas penyebab penyakitnya hilang,
tetapi sifat-sifatnya antigenitas penimbul antibodi tetap.