GeneXpert adalah pemeriksaan molekular yang menggunakan metode Real Time Polymerase Chain Reaction Assay (RT-PCR) semi kuantitatif yang menargetkan wilayah hotspot gen rpoB pada M. tuberculosis, ang terintegrasi dan secara otomatis mengolah sediaan dengan ekstraksi DNA dalam cartridge sekali pakai. GeneXpert dapat mendeteksi kuman TB dengan minimal 131 kuman/ml sputum. Waktu pemeriksaan <2 jam dan alat mudah digunakan. Metode: sputum diinkubasi selama 15 menit di suhu ruangan sputum diambil dengan pipet khusus dimasukkan ke dalam cartridge cartridge dimasukkan ke dalam alat GeneXpert selama kurang lebih 2 jam sputum akan diproses dalam alat tersebut secara otomatis.
5. Perbedaan TB pada anak disbanding dewasa
Diagnosis pasti lebih sulit ditegakkan karena: o Jumlah kuman TB di sekret bronkus pasien anak lebih sedikit, karena lokasi kerusakan jaringan TB paru primer terletak di kelenjar limfe hilus dan perenkim paru bagian perifer. Sedangkan untuk mendapatkan hasil BTA positif dibutuhkan minimal 5000 kuman dalam 1 spesimen. o Sulitnya pengambilan specimen/sputum. Pada anak lokasi kelainannya di parenkim bagian perifer yang tidak berhubungan langsung dengan bronkus, maka produksi sputum tidak ada atau minimal dan gejala batuk juga jarang. Maka untuk menentukan diagnosis TB anak selain pemeriksaan mikroskopis bakteriologis dibutuhkan sistem scoring