TEHNICA PCR PCR TECHNIQUE (PO Cercetări privind polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul
aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la taurine 13 Tehnica PCR exploatează unele caracteristici ale
replicării ADN, unde pentru amplificarea secvenţei de ADN dorite se utilizează o secvenţă de
oligonucleotide numită primer sau amorsă. Primerii sunt secvenţe scurte de 15 – 35 nucleotide,
complementare capetelor 3’ ale secvenţei de ADN ce se doreşte a fi amplificată; ei sunt specifici fiecărei
gene şi sunt sintetizaţi cu ajutorul unor sintetizatoare automate de ADN. Pentru amplificarea secvenţelor
specifice de ADN, prin tehnica PCR, se foloseşte o soluţie tampon (PCR buffer) în care se introduce ADN ce
conţine gena de interes, primerii sintetizaţi, Taqpolimeraza şi cele patru tipuri de deoxinucleotid-trifosfaţi
(dATP, dGTP, dCTP şi dTTP). Tehnica PCR presupune parcurgerea a trei etape principale, într-un aparat în
care realizarea ciclurilor termice este controlată automat de Termocycler: 1. Denaturarea ADN, presupune
încălzirea soluţiei în care se află ADN la 940C timp de 5 minute, efectul fiind ruperea legăturilor de hidrogen
şi separarea celor două catene. 2. Ataşarea primerilor se realizează prin răcirea la 40 – 600C a soluţiei în care
se află secvenţa de amplificat. Primerii se leagă la capetele 3’ a celor două catene de ADN ale genei pe care
dorim să o amplificăm. De obicei, este nevoie de doi primeri numiţi sens şi antisens, dar amplificarea se
poate realiza şi cu un singur primer, în cazul tehnicii PCR ancorat. 3. Elongaţia se produce la temperatura de
circa 720C, temperatură la care Taqpolimeraza funcţionează optim, în faza de extensie, iar ciclul se repetă de
25 – 40 ori. Amplificarea este aproximativ exponenţială, realizându-se după 3 cicluri 2 copii, după 10 cicluri
256 copii, iar după 32 cicluri 1,73 miliarde copii ale secvenţei supuse amplificării. (Vlaic A. şi colab.,1997).
După amplificare, gena de interes se vizualizează în lumină ultravioletă, la nivelul gelului de agaroză în care
fragmentele au fost colorate cu bromură de etidiu. Dacă amplificarea s-a produs, în gel se vor observa una
sau mai multe benzi, corespunzătoare secvenţei specifice de ADN. În tehnica PCR, alegerea primerilor este
primordială şi putând fi utilizaţi două tipuri de primeri: Cercetări privind polimorfismul la locusul genei
leptinei în scopul aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la taurine 14 primeri specifici - sunt dirijaţi
spre un situs foarte precis al ADN, reprezentat de genele sau fragmentele de gene cunoscute. Prin primer
specific se înţelege o secvenţă cunoscută de ADN utilizată pentru începerea sintezei unei anumite gene, cu
structură cel puţin parţial cunoscută. Primeri specifici pot fi dirijaţi şi spre regiunile situate în amonte sau
aval de secvenţele unice, la nivelul secvenţelor minisatelit (Edwards A., şi colab., 1991) sau microsatelit
(Hubert R., şi colab.,1989). Secvenţele de tip satelit, specifice fiecărui individ sunt astfel amplificate.
Evidenţierea acestor polimorfisme se utilizează în momentul de faţă în medicina criminalistică pentru
identificarea suspecţilor, pornind de la diferite mostre de ţesut (sânge, spermă, bulbi de păr etc.), pentru
marcarea cărnii, sau altfel spus, urmărirea ei pe parcursul filierei de distribuţie şi consum. (Fabrice D., şi
colab.,2002). primeri aleatori - sunt de dimensiuni reduse (10 – 20 perechi baze, în medie). Alegerea
secvenţelor care constituie aceşti primeri este complet arbitrară. În cursul reacţiei PCR aceşti primeri se vor
hibrida de fiecare dată când în ADN se vor găsi secvenţe care le sunt complementare şi de orientare opusă.
1.2. 1.2. VARIANTE ALE TEHNICII PCR VARIANTS OF THE TECHNIQUE 1.2.1. Tehnica RFLP RFLP
technique (Restriction Fragment Length Polymorphism) Această tehnică se bazează pe proprietăţile de
hibridare care există între două fragmente de ADN, prezentând un grad înalt de omologie (RFLP- bazat pe
hibridare) şi tehnica PCR – denumită PCR-RFLP, în care se evidenţiază polimorfismele existente la nivelul
situsurilor enzimelor de restricţie. 1. Tehnica RFLP bazată pe hibridare cu o sondă, implică parcurgerea
următoarelor etape: extracţia ADN din organismele ce urmează să fie analizate; digestia ADN cu
ajutorul enzimelor de restricţie; separarea fragmentelor obţinute în urma digestiei, în funcţie de mărimea
lor, prin electroforeză în gel de agaroză; transferul ADN sub formă denaturată pe o membrană de nylon
(Southern blotting) în care poziţia relativă a diferitelor fragmente de ADN din gel se păstrează pe parcursul
transferului; hibridarea ADN cu sonda marcată prealabil, în regiunile în care prezintă omologie; Cercetări
privind polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la
taurine 16 vizualizarea regiunilor hibridate cu ajutorul unui film sensibil la radiaţii (autoradiografie) sau cu
ajutorul unei reacţii enzimatice, care dă o coloraţie specifică. În tehnica RFLP pot fi utilizate diferite tipuri
de sonde, care permit evidenţierea unor tipuri diferite de polimorfism (Favre D.,1996). Sondele mono- sau
oligogenice pun în evidenţă unul sau mai mulţi loci; ele dau un profil simplu care include câteva benzi.
Utilizarea acestui tip de sonde permite vizualizarea polimorfismelor de secvenţă, localizate la nivelul
situsurilor de restricţie, precum şi a polimorfismelor de inserţie/deleţie, situate între situsurile de restricţie.
Acest tip de sondă a fost utilizat pentru a alcătui hărţi genetice la om, pentru a identifica unele varietăţi de
măr şi pentru a pune la punct un test de depistare a anemiei falciforme (Myrick K.V. şi colab., 2002).
Sondele poligenice sau multilocus pot fi dirijate spre zonele care prezintă variabilitate foarte mare, cum sunt
secvenţele de tip micro şi minisatelit, alcătuite de 2 până la 16 perechi de baze, repetate în tandem. Cu
ajutorul sondelor multilocus, se observă, în general un grad ridicat de polimorfism între genotipurile înrudite.
Acest tip de sondă a fost utilizat pentru prima dată de Jeffreys şi colab., (1985) la hibridarea cu ADN
genomic uman digerat şi amprentizarea genetică a fiecărui individ. Ulterior, au fost descoperite alte secvenţe
satelit şi la alte mamifere, la insecte şi plante. Sondele multilocus permit evidenţierea polimorfismului de
secvenţă la nivelul situsurilor de restricţie, polimorfismului de inserţie/deleţie precum şi polimorfismului
determinat de numărul unităţilor repetitive, pentru fiecare individ în parte (Barroso A., şi colab., 1998). 2.
Tehnica RFLP, bazată pe PCR, utilizează o enzimă de restricţie pentru digerarea unui produs de amplificare,
obţinut cu primeri specifici, iar în gelul de agaroză se vor obţine benzi de dimensiuni diferite,
corespunzătoare celor trei genotipuri (homozigoţi pe una din cele două alele şi heterozigoţi). Markerii RFLP
sunt markeri cu polimorfism limitat ce identifică variaţiile secvenţei de ADN la nivelul unui situs de
restricţie, prin analiza RFLP. O sursă abundentă de markeri genetici, utilizaţi în tehnicile de cartare a
genomului animal au la bază modificările unor secvenţe de ADN care se produc la nivelul situsurilor de
restricţie De regulă aceste variaţii sunt cauzate de mutaţii punctiforme (substituţia unei nucleotide Cercetări
privind polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la
taurine 17 cu o alta), inserţii sau deleţii, în interiorul situsului de restricţie şi astfel, enzima de restricţie, nu
mai recunoaşte situsul respectiv şi nu mai taie. Aceasta va determina obţinerea unor fragmente de restricţie
de lungimi diferite (polimorfice) care pot fi uşor vizualizate şi identificate în gelul de agaroză datorită
lungimii lor diferite. Din această cauză ele se vor separa în gelul de electroforeză sub forma unor benzi
situate în diferite regiuni. Greutatea moleculară se apreciază cu ajutorul unui ADN standard de etalonare
”leadder” În practică, mărimea unui fragment ce se detectează prin Southern blotting este de 300 pb – 15 kb
cu diferenţe detectabile mai mici de 50 pb. Prin tehnica PCR se detectează produşi între 60 pb-2kb, cu
diferenţe chiar de câteva baze. Indivizii diferiţi genetic pentru un anumit locus, vor prezenta fragmente de
restricţie de lungimi diferite, într-un număr diferit pentru un anumit cuplu format din sonda moleculară –
enzimă de restricţie. În acest context, fiecare sistem format din ADN genomic – enzimă de restricţie, poate
defini un locus polimorf care are cel mult două alele diferite.( Pierce K.E. şi colab., 2007). Cu ajutorul RFLP
se pot identifica variaţiile genetice dintre indivizi doar la nivelul situsurilor de recunoaştere a enzimelor de
restricţie, respectiv dintre indivizii care posedă unul din cele trei genotipuri existente în locusul de interes
(AA, Aa, aa) şi nu se pot detecta variaţiile la nivelul întregului genom, care la mamifere este de ordinul 3x
109 pb(Bekman , J.S. şi colab., 1983).
1.3. 1.4. TEHNICI BAZATE PE SECVENŢIERE TECHNIQUES BASED ON SEQUENCING Prima secvenţă
descifrată a fost a ARNt pentru alanina de la drojdie (1964), făcută de către Robert Holley şi colegii săi de la
Universitatea Cornell. Aceştia au utilizat enzime specifice care au rupt molecula de ARNt în segmente mici
până când s-a reuşit secvenţierea directă prin metode de degradare enzimatică. Abia în 1976 a fost descifrată
secvenţa completă a ARN monocatenar de la fagul MS2, de către Walter Fiers în laboratorul din Ghent. S-a
stabilit atunci structura completă a genomului viral şi organizarea acestuia, corespondenţa dintre codoni şi
cele trei proteine codificate de genele fagului MS2 şi că un codon stop cauzează terminarea transcripţiei
(Watson şi colab., 1992). Secvenţierea ADN poate fi făcută prin procedee chimice (metoda Maxam şi
Gilbert) sau cu ajutorul terminatorilor de lanţ (metoda dideoxi sau Sanger), aceasta din urma fiind astăzi
utilizată mai mult. Prima metodă a fost pusă la punct de către Maxam si Gilbert (1977) şi este de fapt o
clivare chimică. Cea de-a doua, metoda dideoxi sau Sanger, a fost pusă la punct în acelaşi an de către Sanger
şi se bazează pe întreruperea controlată a sintezei enzimatice a ADN, amplificat prin PCR. În ambele cazuri,
fragmentele obţinute sunt supuse marcării radioactive (cu 32P, de exemplu) înaintea separării pe baza
greutăţii moleculare într-un gel de poliacrilamidă. Vizualizarea şi analizarea produşilor rezultaţi se face prin
autoradiografie. O metodă mult mai convenabilă şi mai precisă este marcarea fluorescentă a fragmentelor şi
secvenţierea automată. Fragmentele de ADN sunt migrate într-un gel de poliacrilamidă iar aparatul
(secvenţiatorul), prevăzut cu un fascicul laser, excită fiecare moleculă marcată Cercetări privind
polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la taurine 31
fluorescent şi transformă valorile fluorescente în secvenţa în nucleotidice a fragmentului analizat. Un astfel
de aparat (ALFexpress Auto Read) poate detecta 200 pb pe oră. Fiecărei secvenţe de acizi nucleici îi
corespunde o diagramă a succesiunii de baze numită electroforegramă. În această diagramă fiecărei baze îi
corespunde un vârf şi o coloraţie caracteristică. O altă tehnică este secvenţierea automată, în cazul căreia,
catena de ADN care va intra în reacţia de secvenţiere depinde de primerul utilizat, putând fi supusă
secvenţierii atât catena sens cât şi cea antisens. În studiile de secvenţiere a genelor, pentru precizia
rezultatelor obţinute sau atunci când sunt căutate mutaţii punctiforme, se recomandă secvenţierea ambelor
catene şi compararea rezultatelor obţinute. În acest caz, este necesară cunoaşterea ambilor primeri, care să
iniţieze sinteza genei ce urmează să fie descifrată. În cazul în care se doreşte descifrarea structurii unui
fragment de ADN, sau a unei gene, de la specii a căror genom nu este saturat în hărţi genetice, pentru
amplificare se utilizează primeri universali, cum este cel de la fagul M13 (Veira ,J şi colab., 1982.. Pentru
fragmente de dimensiuni diferite se aleg vectori corespunzători pentru clonare, de exemplu: plasmide (0,1-10
kb), fagi (8-20 kb), cosmide (35-50 kb), BAC (cromozom artificial bacterian 75-300 kb) şi YAC (cromozom
artificial de drojdie 100-1000 kb) la care genomul este complet descifrat şi sunt întocmite hărţile de
restricţie. Etapele secvenţierii: 1. Izolarea ADN genomic sau a fragmentului (genei) de interes ce urmează să
fie clonat sau secvenţiat; 2. Purificarea ADN izolat; 3. Amplificarea prin PCR a fragmentului de analizat cu
ajutorul primerilor specifici sau a primerilor universali, în prezenţa celor patru dNTP marcaţi florescent,
fiecare cu altă culoare - (adenina în verde, timina în roşu, guanina în negru şi citozina în albastru) şi a
polimerazei ; 4. Vizualizarea produşilor de amplificare prin migrarea în gel de agaroză (procedeu care face
posibilă atât identificarea produşilor de amplificare, determinarea lungimii fragmentelor amplificate şi a
calităţii produsului de amplificare; Cercetări privind polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul
aplicării selecţiei asistate de markeri genetici la taurine 32 5. Purificarea produşilor de amplificare; pentru ca
produşii de amplificare să poată fi utilizaţi în reacţii de secvenţiere trebuie să aibă un grad înalt de puritate
(evitându-se contaminarea cu inhibitori şi prezenţa rezultatelor eronate) ; 6. Secvenţierea automată; 7. Citirea
secvenţelor pe catena analizată; 8. Alinierea secvenţelor de pe cele două catene sens şi antisens; Reacţia de
secvenţiere începe întotdeauna după ce ADN supus secvenţierii a fost iniţial amplificat prin PCR, purificat şi
cuantificat (Coşier Viorica, 2007).
1.4. Tehnicile moleculare disponibile pentru studierea polimorfismului dintr-un genom vizează descoperirea
mutaţiilor la nivelul situsurilor de restricţie prin tehnica PCR-RFLP sau depistarea polimorfismelor
punctiforme din regiunile genice sau intergenice, denumite generic SNP. Aceste tehnici împreună cu cele ale
amprentelor genetice, fac practic posibilă localizarea şi vizualizarea directă, la nivel molecular, atât a genelor
responsabile de fenogeneza unui anumit caracter calitativ (monogenic), cât şi a sectoarelor de ADN,
denumite generic markeri moleculari, care delimitează anumite gene majore sau anumiţi loci cantitativi,
prezenţi în vecinătatea lor. Alegerea unei tehnici în studierea polimorfismelor depinde de acurateţea
rezultatelor obţinute, reproductibilitate, costuri şi echipamentele disponibile în laborator. În cazul cercetării
noastre am ales studierea polimorfismelor de tip RFLP datorită disponibilităţii tehnicii în laborator,
existenţei unei aparaturi de înaltă performanţă, costurilor relativ scăzute, existenţa literaturii de specialitate
mai bogate şi a avantajelor Cercetări privind polimorfismul la locusul genei leptinei în scopul aplicării
selecţiei asistate de markeri genetici la taurine 84 date de această tehnică, furnizarea markerilor codominanţi
de tip RFLP ce pot fi urmăriţi în descendenţă, dar şi a reproductibilităţii ridicate. Tehnica PCR-RFLP se
bazează pe modificările unor secvenţe din ADN la nivelul situsurilor de restricţie. De regulă, aceste variaţii
sunt cauzate de mutaţii punctiforme (substituţia unei nucleotide cu alta), inserţii sau deleţii în interiorul
situsului de restricţie. În acest fel, enzima de restricţie nu mai recunoaşte situsul respectiv şi nu mai
realizează scindarea. Variaţia secvenţelor de tip RFLP, ne arată de fapt, un polimorfism de lungime a
fragmentelor de ADN după tratare cu o enzimă de restricţie şi analiza electroforetică a lungimii
fragmentelor. Polimorfismele de tip SNP, caracterizează un polimorfism punctiform prin detectarea
mutaţiilor, determinate de substituţia unei singure nucleotide cu alta. Acest tip de polimorfism este cel mai
frecvent întâlnit, fiind determinat fie de agenţi mutageni chimici, fie de greşelile din timpul replicării ADN.
Şi tehnica RFLP detectează polimorfismul datorat unei singure nucleotide, dar la nivelul unui situs de
restricţie. Diferenţa între SNP şi RFLP este că majoritatea acestor profile de tip SNP nu sunt recunoscute de
către o anumită enzimă de restricţie
1.1.1 Diagnostic direct - bazat pe identificarea nemijlocită a mutaţiilor în gena de interes – are o precizie
ridicată (pînă la 100%), nu necesită prezenţa pacientului bolnav pentru DP şi analiza informativităţii familiei. Este
util pentru identificarea mutaţiilor majore, frecvenţa cărora este ridicată şi prezintă o mare valoare de diagnostic,
dar nu şi în cazul mutaţiilor minore, aceasta şi fiind dezavantajul acestuia deoarece în cazul că lipsesc mutaţiile
majore în genă se cere o analiză moleculară detaliată, ceea ce include scanarea totală a genei cu scopul de a
identifica aceste mutaţii mici. Este cunoscut faptul că frecvenţa diferitor mutaţii în fiecare genă variază. Există
mutaţii „majore” care au o frecvenţă ridicată şi există mutaţii minore (sporadice) care se întîlnesc rar. Pentru
multe din genele răspunzătoare de moştenirea unor maladii, spectrul de mutaţii este bine cercetat şi se alcătuiesc
algoritme de identificare ale acestora (de ex.: pentru gena DMD, codificatoare a protenei distrofina sunt
caracteristice deleţiile exstinse în proporţie de 60% la persoanele bolnave de miodistrofie Duchenne).
1.1.2 Diagnostic indirect. Acesta are la bază analiza site-urilor polimorfice intra- şi inter- genice. Condiţia
esenţială pentru acest tip de diagnostic este prezenţa copilului bolnav şi/sau posibilitatea investigării ADN-ului
său. Determinarea informativităţii presupune identificarea site-ului polimorfic ce poate fi utilizat ca marker
molecular pentru discriminarea alelelor mutante de cele normale. În cazul patologiilor autozomal-recesive-
părinţii vor fi heterozigoţi după acest polimorfism, iar bolnavul- homozigot. Heterozigotivitatea după
polimorfisme moleculare determină informativitatea familiei cu risc crescut de naştere a unui copil bolnav. În
dependenţă de amplasarea alelică a markerilor pe cromozomii omologi la pacient şi părinţii săi, familia poate fi
deplin informativă, parţial informativă şi neinformativă. Metoda indirectă are avantajul diagnosticului fără a
identifica mutaţia în gena respectivă, dar este imposibilă în absenţa copilului bolnav, întrucît nu e determinată
alela polimorfă cu care e linkată gena mutantă.
Autenticitatea diagnosticului molecular prin metode directe oferă o exactitate înaltă şi se apropie de
absolut. Cu toate acestea, luând în considerare multitudinea de schimbări posibile în genom datorită crossing-
overului sau datorită „efectului mutagen” prezent în primul trimestru de sarcină, diagnosticul direct oferă o
precizie de 99,9%.
Evaluarea rezultatelor în cazul metodelor indirecte este mai dificilă. Pentru identificarea polimorfismului
markerilor intragenici precizia diagnosticului indirect atinge 99%. Excepţie fac genele extrem de mari, de
exemplu gena distrofina, gena implicată în hemofilia A, gena neurofibromatozei şi altele. Astfel, în gena
distrofina, greşeala în timpul diagnosticului indirect poate fi de aproximativ de 2%, acest lucru datorându-se
frecvenţei crossing-overului în această genă gigantă.
Deasemenea, este important ca analiza prin metoda indirectă să fie facută corect în ceea ce priveşte gradul
de rudenie între persoana căruia i se face analiza, sau fătului şi persoana bolnavă de o maladie ereditară (sibs).
Posibilitatea apariţiei unei erori de diagnostic este cu atît mai mare cu cât marcarea (identificarea) alelei
purtătoare de mutaţie nu se face la persoana bolnavă dar la alte rude. Atenţie merită şi situaţiile când se evaluează
rezultatele diagnosticului indirect prin folosirea locusurilor polimorfice intragenice (extragenice). Şi în acest caz
diagnosticul prenatal este posibil doar dacă se testează mai multe site-uri adiacente genei mutante. O astfel de
abordare oferă posibilitatea diagnosticului indirect să atingă 99% exactitate.
Distrofia musculară este o afecţiune rară din clasa miopatiilor (Miopatie- din greacă mys, myos – muşchi; pathos-
suferinţă, durere), mai specific afecţiuni neuromusculare cu progresie lentă, ereditară şi caracterizată prin
deteriorare progresivă a muşchilor corpului, antrenând slăbiciune musculară şi ulterior invaliditate. Pentru a nu fi
induşi în eroare de termenul „neuromusculare” precizăm faptul că aceasta este o afecţiune non-inflamatorie, fără
o patologie a nervilor centrali sau periferici care, afectează în mare parte fibrele musculare striate [11].
Degenerarea musculaturii fiind de fapt provocată de produsul truncat al codării a proteine musculare numită
distrofina [10].
1.1.3 Gena DMD (distrofina)
Gena distrofina a fost descoperită în 1987 de către Louis M. Kunkel. Ea este cea mai lungă genă a
genomului uman. Ca mărime ea cuprinde 0.08% din genomul uman. Gena distrofina este localizată pe braţul scurt
al cromozomului X (Xp21.2). Este formată 2.6 Mb . Conţine 79 de exoni şi 8 promotori(4 situaţi în zona
reglatoare şi 4 situaţi în zona centrală a genei). Pentru transcrierea a preARNm este nevoie de 16 ore; ARNm are
96 de exoni şi 14 kb. Are 2 site-uri de poliadenilare şi 18 transcripţi alternativi [47], [1].
Funcţiile genei DMD:
La nivel molecular: asigură sinteza proteinei distrofina; localizată pe suprafaţa internă a sarcolemei fibrei
musculare.
La nivel celular: produsul transcrierii genei DMD este distrofina - o proteina structurală legată de sarcolemă ce
interacţionează cu diferite complexe proteice asigurând integritatea membranei celulare musculare.
La nivel de organism: participă la homeostazia ţesutului muscular striat scheletal şi cardiac [1].
Heterogenitatea genică a DMD: gena este activată de factori trans-reglatori, specifici de ţesut; are cel puţin 8
promotori, 4 dintre ei sunt situaţi în regiunea reglatoare. Alţi 4 promotori sunt interni- în structura zonei centrale a
genei[15]
1.1.4 Proteina Distrofina
Proteina structurală, în forma de nuia, cu mărimea de cca 150 nm, alcatuită din 3685 aminoacizi, care este
legată de membrane celulară musculară, asigurîndu-i integritatea. Proteina Distrofina este localizată în muşchii de
tip scheletic (sub sarcolemă, asociată cu complexul proteic), cardiac (asociată cu tubulii T), neted (de-a lungul
membranei, alternând cu vinculina) şi în unele celule neurale. Ea este constituită din 4 domenii:
Actin-binding domain (aminoacizii 14-240)
Central rod domain (aminoacizii 253-3040)
Cysteine-rich domain (aminoacizii 3080-3360)
Carboxy-terminal domain (aminoacizii 3361-3685).
Ca forma funcţională, distrofina apare asociată cu un complex proteic, cunoscut sub denumirea de
costamer sau DAPC (dystrophin associated protein complex) . Complexul proteic include sarcoglicani,
distroglicani, distrobrevină, sintrofine, sacospan, laminina-2, caveolin-2 [63].
Funcţiile distrofinei: Mecanice: Stabilizarea membranei în timpul ciclurilor contracţie-relaxare. Parte a
legăturii dintre citoscheletul intra-celular şi matricea extracelulară. Funcţionale: Joacă un rol în abilitatea fibrelor
musculare de a se diferenţia în tipul glicolitic rapid. Poate juca un rol în organizarea membranelor postsinaptice.
Proteina Distrofina are diferite localizări cum ar fi: în regiunea sub sarcolemală a muşchiului cardiac, are
o organizare periodică în costameri, o concentraţie crescută se întîlneşte la joncţiunile miotendinoase şi
neuromusculare, în muşchiul cardiac (asociat cu tubuli T), în muşchii netezi (discontinuă de-a lungul membranei,
alternând cu vinculina) [66].
1.1.5 Forme de distrofie musculară progresivă
Distrofiile musculare au fost definite ca un grup de tulburări genetice care evoluează cu atrofie şi slăbirea
progresivă a muşchilor acolo unde boala prinde îndeosebi muşchii, la nivelul cărora sunt prezente modificări
microscopice caracteristice
1.1.6 Distrofia musculară Duchenne
Distrofia musculară Duchenne este o boală transmisă recesiv legată de cromozomul X, cu o incidenţă de
circa 1: 3300 nou-născuţi de sex masculin. Gena a cărei mutaţii determină distrofia musculară Duchenne a fost
identificată în 1986 fiind una dintre primele descoperiri majore care au evidenţiat potenţialul pe care îl are
medicina moleculară.
Primele simptome ale distrofiei apar, în general, la vîrste cuprinse între 3 şi 5 ani.Unul dintre cele mai
caracteristice simptoame este hipertrofia diferitor grupuri de muşchi: gastrocnemieni, deltoizi, fesieri. În special,
tipice sunt pseudohipertrofiile muşchilor gastrocnemieni (“pulpa gnomului”). Pseudohipertrofia fiind (conform
DEX) creşterea în volum a unei formaţiuni anatomice, fara hipertrofiere tisulară propriu-zisă, de ex. în cazul
muşchilor (p. musculară), prin infiltrarea adipoasă a acestora.
Pseudohipertrofiile muşchilor gastrocnemieni se dezvoltă precoce şi pe măsura progresării, au tendinţa spre
micşorare. Pseudohipertrofiile produc o impresie falsă de sănătate fizică [67].
Iniţial, atrofiile musculare se localizează în muşchii centurii pelviene, în sectoarele proximale ale membrelor
posterioare, iar ulterior se observă expansiunea lor în direcţie ascendentă spre centura scapulară, muşchii spinali,
zonele proximale ale membrelor superioare [67], [81].
Ridicarea din poziţia orizontală sau de pe scaun provoacă mari dificultăţi. Ridicându-se, bolnavii folosesc
metode ajutătoare (“căţărarea pe sine însuşi”, ”căţărarea în scară”). W.Gowers (1879) a descris o metodă deosebită,
utilizată de bolnavii cu DMP Duchenne în timpul ridicării, denumită ulterior “metoda lui Gowers” [12]. La
examinarea neurologică, chiar din faza timpurie a maladiei, se depistează diminuarea sau lipsa reflexelor rotuliene,
iar mai târziu şi a celor biceptale şi triceptale. Reflexele ahiliene, însă, se păstrează pentru o perioadă îndelungată
[9].
În stadiile timpurii ale maladiei, la bolnavii cu forma de îmbolnăvire DMP Duchenne, cele mai tipice
dereglări osteoarticulare sunt: scolioza, lordoza lombară, aplatizarea şi deformările cutiei toracice(“torace în
carenă”, “torace plat”). Pe măsură ce procesul miodistrofic progresează, se dezvoltă deformarea ecvinică a tălpilor
şi a contracturii în articulaţiile mari [12]. Investigaţiile din ultimii ani denotă că una din problemele serioase ce
apar la bolnavii cu DMP Duchenne este afectarea inimii. Prin cercetările efectuate de D.Adzija şi colab. în 1994,
s-a stabilit că în procesul patologic al DMP Duchenne, sistemul cardiovascular e implicat frecvent şi de timpuriu
[42].
Circa 73% bolnavi manifestă diverse patologii cardiace. Cauza patologiei vasculare constă în insuficienţa,
genetic determinată, a distrofinei în cardiomiocite [66]. La vârsta de 12 ani, cei mai mulţi pacienţi sunt imobilizaţi
în scaun cu rotile. Contracturile musculare devin fixe şi se dezvoltă adesea o scolioză progresivă, care poate fi
asociată cu un disconfort considerabil. Disformitatea toracică asociată cu scolioză perturbă funcţia pulmonară deja
diminuată de debilitatea musculară. În jurul vârstei de 16-18 ani, pacienţii sunt predispuşi la infecţii pulmonare
serioase, uneori fatale. Alte cauze de deces includ aspiraţia de alimente şi dilataţia gastrică acută [63].
Afectarea intelectului în distrofia Duchenne este frecventă; coeficientul de inteligenţă este cu aproximativ o
deviaţie standard sub medie. Deteriorarea funcţiilor intelectuale pare a fi neprogresivă şi afectează mai mult
capacitatea verbală decât performanţa intelectuală. Coeficientul de inteligenţă al pacienţilor cu boală Duchenne
este mai scăzut decât al copiilor cu boli cronice şi invalidante comparabile, indicând că intelectul subliminar în
distrofia Duchenne nu este numai reflectarea limitării fizice [70]. Nu s-a stabilit încă ce stă la baza acestei
perturbări a intelectului în distrofia Duchenne [42].
Pentru diagnosticare şi consultaţia medico-genetică, o mare importanţă o are depistarea precoce a maladiei.
Metoda cea mai optimă pentru investigaţiile screening este determinarea creatininfosfochinazei în serul sangvin. În
majoritatea publicaţiilor se indică faptul că, deja în primele 2-5 zile de viaţă a bolnavilor, activitatea acesteia în
sânge e ridicată de 50-100 ori faţă de normă [13].
Pe măsura progresării procesului miodistrofic, există tendinţa spre micşorarea activităţii
creatininfosfochinazei. După datele lui Y.Arai şi coaut. (1995), tomografia computerizată a muşchilor scheletici
indică zonele cu densitate scăzută în muşchii scheletici, semnele de atrofie musculară, micşorarea densităţii şi a
volumului ţesutului muscular pe măsura progresării procesului miodistrofic [26].
1.1.7 Metoda SALT-OUT modificată de extragere a ADN-ului.
1. Din eprubeta cu EDTA în care a fost colectat, sîngele este transferat în eprubetă sterilă de 15 ml (eprubetă de
lucru) [79].
2. Se adaugă soluţie tampon Erylysis (Erylysis-Buffer) până la 15 ml, se agită uşor.
3. Probele se lasă în stativ şi periodic se agită uşor până se observă o schimbare a culorii (culoare roşie metalică)
4. Se centrifughează timp de 10 minute la 4500r/min
5. Se aruncă supernatantul, dar se păstrează „granula” (acestea sunt celulele albe din sînge)
6. Se adaugă din nou pînă la 15 ml soluţie tampon Erylysis şi se resuspendează ’’granula’’ de pe fundul eprubetei.
7. Probele se lasă în stativ 10 minute, aproximativ la fiecare 2 min se agită uşor
8. Se centrifughează timp de 10 min la 4500r/min
9. Se varsă supernatantul dar se păstreză „granula”
10. Se adaugă din nou soluţie tampon Erylysis pînă la volumul de 15 ml şi uşor se resuspendă „granula” de pe
fundul eprubetei.
11. Probele se lasă timp de 10 minute în stativ, la fiecare 2 min se agită uşor.
12. Se centrifughează timp de 10 min la 4500 r/min
13. Se varsă supernatantul şi se păstreză „granula”
14. Se adaugă: 1 ml proteinaza K buffer, se dezbate „granula” , 50 μl SDS (20%), 5 μl proteinaza K (25mg/ml)
15. Se vortexează 15-20sec.
16. Probele se incubează la 37oC peste noapte
17. Se adaugă 300 μl NaCl 5M, se agită vortexează 15 sec.
18. Se centrifughează 10 min la 4500 r/min.
19. Se transferă supernatantul într-un tub nou de 15 ml.
20. Se adaugă 4 ml de etanol 96%, se agită uşor imediat prin răsturnarea uşoară a eprubetei.
21. ADN-ul alb ”se pescuieşte” cu pipeta şi se transferă într-un tub de 2 ml. În timpul acestei etape se
transferă cît mai puţin etanol.
22. În tubul cu ADN se adaugă 1ml etanol 70%, se centrifughează la 14.000 r/min, se decantează cît mai
mult etanol posibil. ADN-ul se usucă aproximativ 15 min.
23. Se dizolvă ADN-ul în 200 μl soluţie tampon TE (TE-Buffer), se dizolvă peste noapte, iar apoi se lasă
în frigider la 4oC cîteva zile. Apoi ADN-ul este depozitat în cutii special destinate pentru păstrarea ADN [75].
Compoziţia bufferilor utilizaţi în extragerea ADN
Denumirea Buferului: Reactivul Utilizat Concentraţia Cantitatea