Bab I, V, Daftar Pustaka
Bab I, V, Daftar Pustaka
Skripsi
untuk memenuhi sebagian persyaratan
mencapai derajat Sarjana S-1
Program Studi Teknik Informatika
Diajukan Oleh
Nafiatun Sholihah
09651001
Skripsiffugas Akhir dengan judul Pe.golahan Cltra N4ikroskopis Untuk l\4engh tung Sel Kurkumin
Pada C ira Nanopartikel
TIM MUNAQASYAH
Ketua Sidang
n0rl
=S,{siAt
.n"*JlC
".r."'
NIP. 19820511 2A06A4 2 002
Penguji I
6Fii{:{"\
t) Utl
:'-l: H ji,
1 002
14.A, ph.D
tri6r untvohor rrton r,r"ged sunqn (ottoso gg Flt-ulltsr-ata-o5-olt/Ro
,klalaht dldihtuw h
NIM
JuddSkiAti :rmgolalqCitrMil@skopisUnl*MlrghiIulgSeJKwkMin
Paab Citr Ndop€nikel
Dage ili kMi ndghrn! agr sktipsi4Es al:hn Sau<l@ teebur dj alls dlpgt
sg@ diFuraqsya$d, A&s pernrtimtr k ni ucadrn terim k sii,
WBsaltM alai,M v. eh
Nim 09651001
NlM:09651001
MOTTO
v
HALAMAN PERSEMBAHAN
1. Ibuku Ir. Sundari, M.P. dan Bapakku Drs. H. Geyol Sugiyanta, M.Si. yang
vi
KATA PENGANTAR
Segala puji bagi Allah SWT, shalawat dan salam semoga tercurah kepada
akhir jaman. Syukur Alhamdulillah atas anugerah dan karunia-Nya hingga penulis
diberi kemampuan untuk dapat menyelesaikan skripsi / tugas akhir yang berjudul :
Pembuatan dan penyusunan proyek akhir ini diajukan sebagai syarat untuk
Kalijaga, Yogyakarta.
Saya menyadari bahwa apa yang saya lakukan dalam penyusunan laporan
proyek akhir ini masih terlalu jauh dari kata sempurna. Oleh karena itu, saya
sangat mengharap kritik dan saran yang berguna dalam penyempurnaan sistem ini
dimasa yang akan datang. Semoga apa yang telah saya lakukan ini dapat
arahan, dan bantuan dari berbagai pihak. Pada kesempatan ini penulis ingin
1. Bapak Prof. Drs. H. Akh. Minhaji, M.A., Ph.D., selaku Dekan Fakultas
2. Bapak Agus Mulyanto, S.Si., M.Kom., selaku Ketua Program Studi Teknik
Informatika.
vii
3. Ibu Shofwatul Uyun M.Kom., selaku dosen pembimbing akademik serta
dosen pembimbing tugas akhir yang telah banyak memberi dukungan serta
4. Bapak dan Ibu Dosen Program Studi Teknik Informatika yang senantiasa
5. Bapak, Ibu, Suami dan adik-adik yang selalu setia memberikan dukungan
dan doa pada penulis, serta menjadi sumber motivasi dan inspirasi.
Sigit, Anas, Wahyu R, Wahyu S, Nugroho, Ficky, Ari, Agung, Izza yang
Penulis
viii
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL......................................................................................... i
HALAMAN PENGESAHAN SKRIPSI / TUGAS AKHIR ............................. ii
SURAT PERSETUJUAN SKRIPSI .................................................................. iii
PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI ........................................................... iv
MOTTO ............................................................................................................ v
HALAMAN PERSEMBAHAN ....................................................................... vi
KATA PENGANTAR ...................................................................................... vii
DAFTAR ISI ..................................................................................................... ix
DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ xii
DAFTAR TABEL ............................................................................................. xiii
ABSTRAK ......................................................................................................... xiv
BAB I PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang .............................................................................................. 1
1.2 Rumusan Masalah .......................................................................................... 2
1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................................... 3
1.4 Batasan Masalah............................................................................................. 3
1.5 Keaslian Penelitian ......................................................................................... 4
1.6 Sistematika Penulisan .................................................................................... 4
ix
2.2.6 Grayscale ........................................................................................... 22
2.2.7 Kontras ................................................................................................ 24
2.2.8 Segmentasi .......................................................................................... 26
2.2.9 Operasi Ambang batas (Thresholding) ............................................... 27
2.2.10 Operasi Morfologi ............................................................................. 30
2.2.10.1 Structuring Element .............................................................. 32
2.2.10.2 Dilasi..................................................................................... 33
2.2.10.3 Erosi ...................................................................................... 35
2.2.10.4 Opening ................................................................................ 36
2.2.10.5 Closing .................................................................................. 37
2.2.10.6 Transformasi Top-Hat ......................................................... 37
2.2.11 Connected Component Analisys ....................................................... 38
2.2.12 Matlab 7.1 ......................................................................................... 39
x
4.2.1 Hasil Grayscalling ............................................................................. 53
4.2.2 Hasil Kontras I ................................................................................... 54
4.2.3 Hasil Segmentasi ................................................................................ 56
4.2.4 Hasil Kontras II .................................................................................. 57
4.2.5 Hasil Thresholding ............................................................................. 58
4.3 Pengolahan (Processing)............................................................................... 58
4.4 Analisis (Analizing)....................................................................................... 59
4.4.1 Hasil Labeling dan Counting .............................................................. 59
4.4.2 Testing ................................................................................................ 60
4.5 Pembahasan ................................................................................................... 63
BAB V PENUTUP
5.1 Kesimpulan ................................................................................................... 64
5.2 Saran .............................................................................................................. 64
xi
DAFTAR GAMBAR
Gambar 2.1 Gambar digital yg dihasilkan code tape oleh printer telegraf ...... 12
Gambar 2.2 Gambar digital dgn 15 level keabuan ditransmisikan tahun 1929 13
Gambar 2.3 Citra Analog dan Citra Digital ..................................................... 16
Gambar 2.4 Intensitas grayscale ...................................................................... 22
Gambar 2.5 Citra grayscale yang dirubah menjadi nilai matrik ...................... 23
Gambar 2.6 Hasil konversi citra berwarna menjadi citra grayscale ................ 24
Gambar 2.7 Kontras pada beberapa citra ......................................................... 26
Gambar 2.8 Hasil Penerapan Threshold Tunggal ............................................ 28
Gambar 2.9 Hasil Penerapan Threshold Ganda ............................................... 29
Gambar 2.10 Contoh Citra Hasil Penerapan Mathematical Morfology ............. 31
Gambar 2.11 Contoh-contoh Structuring Element............................................. 33
Gambar 2.12 Teknik analisis piksel tetangga .................................................... 38
Gambar 3.1 Diagram Blok Alur Penelitian ...................................................... 42
Gambar 3.2 Diagram Alir Proses Pengolahan Citra ........................................ 43
Gambar 4.1 Citra Grayscalling ........................................................................ 54
Gambar 4.2 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.7............................ 54
Gambar 4.3 Histogram Citra Kontras dengan nilai high_in = 0.7 ................... 55
Gambar 4.4 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.9............................ 55
Gambar 4.5 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.5............................ 56
Gambar 4.6 Citra Hasil Transformasi Top-Hat................................................ 57
Gambar 4.7 Citra Hasil Kontras Kedua ........................................................... 57
Gambar 4.8 Citra Hasil Threshold ................................................................... 58
Gambar 4.9 Citra Hasil Morfologi ................................................................... 58
Gambar 4.10 Citra Hasil Labeling ..................................................................... 59
Gambar 4.11 Citra Hasil Counting..................................................................... 60
Gambar 4.12 Prototype Pengolahan Citra Mikroskopis .................................... 61
xii
DAFTAR TABEL
xiii
Pengolahan Citra Mikroskopis Untuk Menghitung Sel Kurkumin
Pada Citra Nanopartikel
Nafiatun Sholihah
NIM. 09651001
ABSTRAKSI
xiv
BAB I
PENDAHULUAN
serta energi metabolis. Namun sebelumnya harus dipilih formula yang paling baik
total 12 sampel sudah dipilih 3 sampel yang akan diteliti lebih lanjut. Ketiga
yang paling baik. Cara menentukan formula yang paling baik salah satunya
sebagai sampel yang paling baik karena formula tersebut dapat mengikat sel
menggunakan mikroskop elektron tranmisi (TEM), dan dengan mikroskop ini sel-
sel kurkumin dapat terlihat. Jumlah sel kurkumin dapat dihitung dengan cara
konvensional. Tetapi bila sel kurkumin yang dihitung cukup banyak akan
1
2
pada sel kurkumin sangat dipengaruhi oleh tingkat ketelitian dan kelelahan mata
atau pun sedikit serta banyaknya sel kurkumin, hal inilah yang mengakibatkan
digital. Disisi lain kebutuhan akan kemudahan, kepraktisan serta keakuratan pada
masa sekarang ini sudah menjadi sesuatu yang dianggap sebagai kebutuhan.
contoh analisa pada citra adalah dengan menghitung objek yang ada pada suatu
citra, seperti menghitung jumlah sel kurkumin pada citra nanopartikel. Dengan
mengetahui jumlah sel kurkumin maka formula yang paling baik dapat diketahui.
Dari penelitian ini dapat diambil perumusan masalah, antara lain sebagai
berikut :
a. Metode pengolahan citra digital apa sajakah yang tepat dan optimal
a. Mencari metode pengolahan citra digital yang tepat dan optimal untuk
Hal-hal yang akan dilakukan dalam dalam penelitian ini dibatasi pada
1. Citra yang akan diolah adalah hasil pemotretan sel kurkumin dengan
versi 7.1.
4
seperti ini pernah dilakukan sebelumnya tetapi perbedaannya terdapat pada studi
kasus yang diteliti, proses penghitungan dan data-data lainnya dalam penelitian
penghitungan sel darah merah. Citra sel darah merah tersebut berasal dari citra
Laporan penelitian tugas akhir ini disusun secara sistematis dibagi dalam
beberapa bab. Penyusunan laporan tugas akhir ini memiliki urutan, yang dimulai
BAB I. PENDAHULUAN
penulisan.
Bagian ini berisi tentang uraian rinci tentang alat dan bahan penelitian.
langkah yang harus dilalui untuk mencapai tujuan dan simpulan akhir
penelitian.
Bab ini memuat hasil penelitian dan pembahasan yang sifatnya terpadu
BAB V. PENUTUP
PENUTUP
5.1 KESIMPULAN
berikut :
a. Metode pengolahan citra mikroskopis yang tepat dan optimal adalah dengan
5.2 SARAN
Element.
64
65
Anggreani, Arie dan Darma Putra, 2010, Sistem Pengenalan Kondisi Sel Darah
Merah Pada Citra Mikroskopis, Universitas Udayana Teknologi Elektro
Vol.9 No.2.
Basuki, Achmad, dkk, 2005, Pengolahan Citra Menggunakan Visual Basic, Graha
Ilmu, Yogyakarta.
Erdiyanto, Ardy, 2012, Rancang Bangun Aplikasi Pencacah Sel Darah Merah
Berbasis PCD, Amikom, Yogyakarta.
Hartadi, D., Sumardi dan R.R. Isnanto, 2004, Simulasi Penghitungan Jumlah Sel
Darah Merah, Transmisi, Vol. 8, No. 2.
Ibrahim, Danny, dkk. 2011. Pengaturan Kecerahan Dan Kontras Citra Secara
Automatis Dengan Teknik Pemodelan Histogram. Undergraduate thesis,
Jurusan Teknik Elektro Fakultas Teknik.
66
67
Sutoyo, T.,dkk., 2009, Teori Pengolahan Citra Digital, Penerbit Andi, Yogyakarta.
Usman, K., 2008, Perhitungan Sel Darah Merah Bertumpuk Berbasis Pengolahan
Citra Digital Dengan Operasi Morfologi, semnasIF UPN ”Veteran”,
Yogyakarta.
NIP : 19550E1219.1032001
IahdeFu$iord :f*torK€rda
: F.hrbl Agdhdslli, Uriv. Mat BuM YL
: Mfirlb Slolit{h
NIM
Phdi/Sddid : T.lnfortrdih /vm
: sai$ d& T.holosi tIN S@Kdij.ga
B€@bd.r tel.h tukhJo! radilie u!r!L Tls,3 A*.!ir / Ski!3i dogo dd!
cia. hltuio il&i Frelitid ey&
It€nild& tudr.t @g{ ili dibud utut dipdguDle s.!6g.i@@dirys,
Identitas Diri
Nama : Nafiatun Sholihah
Tempat/ Tanggal Lahir : Sleman, 6 Desember 1990
Kewarganegaraan : Indonesia
Agama : Islam
Jenis Kelamin : Perempuan
Status Perkawinan : Menikah
Golongan Darah : AB
Alamat : Sorolaten Sidokarto Godean Sleman Yogyakarta 55564
Hobi : Mengaji
Email : pink_teav@yahoo.co.id
chibi.sepinx@gmail.com
Blog : http://asfins-manshurin.blogspot.com/
No. HP : 085743439419 / 02743283304
Pendidikan
Tahun Jenjang Pendidikan
1996-2002 SDN Semarangan IV
2002-2005 SMPN 1 Godean Sleman
2005-2009 SMK N 2 Depok [STM Pembangunan Yogyakarta]
Jurusan T.E.Audio Video
2009-2013 S1 Jurusan T.Informatika
UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta