BIOQUIMICA DE MACROMOLECULAS

Monografía:

"Aspectos Estructurales de la Interacción

Metal-Proteína"

Nombre: Patricia A. Garavaglia

Legajo: 2892

Fecha: 1° Cuatrimestre 2001

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Introducción

Los metales forman parte de la estructura de una gran variedad de

proteínas. Su unión estabiliza la conformación proteica requerida para

cumplir con determinadas funciones como procesos catalíticos, transporte,

reacciones redox, inducción de la expresión génica por factores

transcripcionales, etc. En el organismo pueden actuar como tóxicos o formar

parte de procesos bioquímicos. Los más comunes presentes en los

organismo vivos son: Na+, Ca+, K+, Mg+2, Zn+2, Cu+2, Fe+2, Fe+3 y Ni+2.

Los principales grupos aminoácidos de unión a M en las proteínas son:

*Carboxilos (Asp, Glu) *Imidazol (Hys)

*Indol (Trp) *Tiol (Cys)

*Tioéter (Met) *Hidroxilo (Ser, Thr, Tyr)

Desarrollo

La interacción metal-proteína normalmente se estudia como una

interacción metal-ligando (M+n-nL-), donde los puntos principales a tener en

cuenta son:

1-Polarización de M y L: M actúa como ácido aceptando un par de ē, es de

pequeño tamaño y muy polarizable por los distintos L a los que está unido.

2-Nº de Coordinación: Este número varía según el tamaño de M en forma

directamente proporcional determinando un arreglo espacial, en el cual se

busca minimizar la repulsión entre M-L. Normalmente es 6 y es posible

obtenerlo exactamente por estudios de dispersión de rayos X sobre la

estructura cristalina de la proteína unida a M.

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3-Estereoquímica del arreglo: A partir del estudio de cristalografía de

rayos X sobre moléculas pequeñas, hay una gran información disponible en

Bancos de Datos sobre las distancias de enlaces M-O, M-N y M-S.

4-Competición y Selección de los metales: Ciertos M se complejan con

mayor facilidad obteniendo formaciones M-L más estables. En las enzimas

los M no se comportan exactamente de la misma forma, pero siguen ciertas

reglas generales, cuando una cadena polipeptídica se pliega ciertos grupos

funcionales forman parte del sitio de unión a M con preferencia sobre otros:

Grupos carboxilatos> Imidazol> Grupos que contienen S

a- Unión al grupo carboxilato: M se une entre ambos O sobre el plano del

carboxilato en dos posibles direcciones: anti y syn en preferencia.

b- Unión al grupo imidazol: Es un excelente donor de ē a pH fisiológico. Se

encuentra en una amplia variedad de enzimas y pueden unirse a él uno o

dos M. La rotación alrededor del enlace M-N(imidazol) se encuentra limitada

por el requerimiento estérico del resto del residuo; sin embargo, tiene cierta

flexibilidad que parece ser la razón por la cual se encuentra con alta

probabilidad en los dominios de unión a M de las proteínas.

c- Unión a los grupos que contienen S: Ciertos M se unen al S con

preferencia respecto al O formando enlaces fuertes.

A partir de información obtenida del Protein Data Bank se puede

conocer la estereoquímica de la unión M-L en varias proteínas para ciertos M

como Cu, Fe, Mn, Zn, Mg, Ca:

•Cu: es el M más abundante en humanos. Se encuentra en una gran

diversidad de proteínas con distintas funciones como transportador de O 2,

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transportador de ē, sistemas redox, etc. Se ha clasificado según sus

propiedades espectroscópicas como Tipo I, II y III.

•Fe: se une a átomos de S estableciendo arreglos espaciales tetraédricos y

cúbicos. También puede unirse a grupos pirrólicos por medio del N

formando parte de estructuras complejas como en el caso de la hemoglobina.

Además puede actuar como importante inhibidor del Zn.

•Zn: se une a grupos imidazol y carboxilatos al mismo tiempo. Suele

competir por los sitios de unión a Cu+2, Ca+2, Mn+2 y sirve como estabilizador

de la carga negativa formada durante las reacciones de catálisis. Una

propiedad importante es la formación de Zinc fingers (estructura secundaria

asociada con el proceso de detoxificación de ciertas enzimas donde M tóxicos

como el Cd son reemplazados por el Zn).

•Mn: actúa en enzimas con funciones catalíticas estabilizando su estructura.

•Mg: interviene como cofactor en reacciones donde actuan enzimas acopla-

das a ATP. También puede reemplazar iones de Ca+2.

•Ca: se han identificado dos tipos de proteínas de unión a Ca+2: de unión

reversible (normalmente modulando la acción de otras enzimas) y de unión a

varios átomos de O de distintas regiones de la proteína, estabilizándola.

Conclusiones

Se puede determinar que la distancia del enlace M-L es más grande

cuanto mayor es el tamaño y el número de coordinación de L. Además,

teniendo en cuenta estos aspectos, es posible determinar un arreglo espacial

para la molécula, la cual puede ser asimétrica y variar al cambiar uno de los

ligandos, modificando totalmente las propiedades del enlace.

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Referencias

1-"Advances in Protein Chemistry. Volume 42. Metalloproteins: Structural

Aspects"; Anfinsen C. B., Richards Frederic M., Edsall John T., Eisenberg

David S.; 1991.

2-"Metals and cellular signaling in mammalian cells"; Cell Molecular Biology

(Noisy-le-grand); 2000 Mar, 46(2):367-381.

3-"Metal transfer as a mechanism for metallothionein-mediated metal

detoxification"; Cell Molecular Biology (Noisy-le-grand); 2000 Mar, 46(2):393-

405.

4-"Factors influencing susceptibility to metals"; Environ. Health Perspect;

1997 Jun, 105 Suppl 4:817-822.

5-"Physiological and toxicological changes in the skin resulting from the action

and interaction of metal ions"; Crit. Rev. Toxicol.; 1995, 25(5):397-462.

6-"Competitive interaction of iron and zinc in the diet: consequences for human

nutrition"; Journal Nutr.; 1986 Jun, 116(6):927-935.