Sayyidah Ayatullah Assharrima

Beta 2018
040111818123247
Metabolisme protein (Asam Amino esensial dan nonesensial)

Jalur katabolisme asam amino, biasanya hanya 10% hingga 15% manusia produksi energi tubuh;
jalur ini hampir tidak aktif seperti glikolisis dan oksidasi asam lemak. Aliran melalui rute
katabolik ini juga sangat bervariasi, tergantung pada keseimbangan antara persyaratan untuk
biosintesis, proses dan ketersediaan asam amino tertentu. 20 jalur katabolik bertemu membentuk
hanya enam produk utama, yang semuanya masuk siklus asam sitrat.
Gambar secara sederhananya

Dari sini kerangka karbonnya dialihkan ke glukoneogenesis atau ketogenesis atau sepenuhnya
teroksidasi menjadi CO2 dan H2O. Semua atau sebagian kerangka karbon dari tujuh amino asam
pada akhirnya dipecah menjadi asetil-KoA. Lima asam amino dikonversi menjadi -ketoglutarate,
empat menjadi suksinil-KoA, dua menjadi fumarat, dan dua menjadi oksaloasetat.
Bagian atau semua dari enam asam amino dikonversi menjadi piruvat, yang dapat dikonversi
menjadi asetil-KoA atau oksaloasetat. Jalur individu untuk 20 asam amino dalam diagram alir,
masing-masing memimpin ke titik masuk tertentu ke dalam siklus asam sitrat. Dalam diagram ini
atom karbon yang masuk ke siklus asam sitrat ditunjukkan dalam warna. Perhatikan bahwa
beberapa amino asam muncul lebih dari sekali, mencerminkan nasib yang berbeda untuk
berbagai bagian kerangka karbonnya.
Beberapa Asam Amino Dikonversi menjadi Glukosa, Lainnya ke Badan Ketone
Tujuh asam amino yang terdegradasi seluruhnya atau dalam bagian dari asetoasetil-KoA dan /
atau asetil-KoA — fenilalanin, tirosin, isoleusin, leusin, triptofan, treonin, dan lisin — dapat
menghasilkan tubuh keton di hati, dimana acetoacetyl-CoA dikonversi menjadi acetoacetate dan
kemudian ke aseton dan -hidroksibutirat. Ini adalah asam amino ketogenik.
Kemampuan mereka untuk membentuk badan keton sangat jelas pada diabetes mellitus yang
tidak terkontrol, di mana hati menghasilkan sejumlah besar tubuh keton dari kedua lemak asam
dan asam amino ketogenik. Asam amino yang terdegradasi menjadi piruvat, α-ketoglutarate,
succinyl-CoA, fumarate, dan oxaloacetate dapat dikonversi menjadi glukosa dan glikogen.
Mereka adalah asam amino glukogenik.
Katabolisme asam amino sangat penting untuk kelangsungan hidup hewan dengan diet protein
tinggi atau selama kelaparan. Leusin adalah amino yang bersifat ketogenik eksklusif asam yang
sangat umum dalam protein. Degradasinya membuat kontribusi besar untuk ketosis di bawah
kelaparan kondisi.

Enam Asam Amino Degradasi ke Piruvat

Kerangka karbon dari enam asam amino dikonversi dalam keseluruhan atau sebagian ke piruvat.
Piruvat kemudian bisa dikonversi menjadi asetil-KoA (prekursor badan keton) atau oksaloasetat
(prekursor untuk glukoneogenesis). Jadi asam amino yang dikatabolisme menjadi piruvat
keduanya bersifat ketogenik dan glukogenik. Enam adalah alanin, triptofan, sistein, serin, glisin,
dan treonin. Alanine menghasilkan piruvat langsung pada transaminasi dengan α -ketoglutarate,
dan rantai samping tryptophan adalah dibelah untuk menghasilkan alanin dan karenanya piruvat.
Sistein adalah dikonversi menjadi piruvat dalam dua langkah; satu menghapus atom sulfur, yang
lainnya adalah transaminasi. Serine adalah dikonversi menjadi piruvat oleh serine dehydratase.
Keduanya -hidroksil dan gugus -amino-serin dihilangkan dalam reaksi tergantung-fosfat
piridoksal tunggal ini. Glycine terdegradasi melalui tiga jalur, hanya satu yang mengarah ke
piruvat. Glycine dikonversi menjadi serine oleh penambahan enzimatik kelompok hidroksimetil.
Reaksi ini, dikatalisasi oleh serine hydroxymethyl transferase, membutuhkan koenzim
tetrahidrofolat dan piridoksal fosfat. Serin dikonversi menjadi piruvat seperti dijelaskan di atas.
Di jalur kedua, yang dominan pada hewan, glisin mengalami pembelahan oksidatif menjadi
CO2, NH4, dan kelompok metilen (OCH2O). Ini sudah siap reaksi reversibel, dikatalisis oleh
pembelahan glisin Enzim (juga disebut glisin sintase), juga membutuhkan tetrahidrofolat, yang
menerima gugus metilen. Di jalur pembelahan oksidatif ini dua atom karbon dari glisin tidak
memasuki siklus asam sitrat. Satu karbon hilang sebagai CO2 dan yang lainnya menjadi
kelompok metilen dari N5, N10-methylenetetrahydrofolate, sebuah onecarbon donor kelompok
dalam jalur biosintetik tertentu. Jalur kedua untuk degradasi glisin ini muncul menjadi kritis pada
mamalia. Manusia dengan serius cacat dalam aktivitas enzim pembelahan glisin menderita dari
kondisi yang dikenal sebagai hiperglikemia nonketotik. Kondisi ini ditandai dengan peningkatan
kada serum glisin, menyebabkan defisiensi mental yang parah dan kematian di masa kanak-
kanak. Pada tingkat tinggi, glisin adalah neurotransmitter penghambat, mungkin menjelaskan
efek neurologis penyakit. Banyak cacat genetik metabolisme asam amino telah diidentifikasi
pada manusia. Di jalur ketiga dan terakhir dari degradasi glisin, molekul glisin achiral adalah
substrat untuk enzim D-asam amino oksidase. Glisin dikonversi untuk glioksilat, substrat
alternatif untuk laktat hati

Tujuh Asam Amino Degradasi menjadi Asetil-KoA

Bagian kerangka karbon dari tujuh asam amino—triptofan, lisin, fenilalanin, tirosin, leusin,
isoleusin, dan treonin — menghasilkan asetil-KoA dan / atau acetoacetyl-CoA, yang terakhir
dikonversi menjadi asetil-CoA. Beberapa langkah terakhir dalam degradatif jalur untuk
menyerupai leusin, lisin, dan triptofan langkah-langkah dalam oksidasi asam lemak. Threonine
menghasilkan beberapa asetil-KoA melalui jalur minor. Jalur degradatif dari dua dari tujuh ini
asam amino pantas disebutkan secara khusus. Kerusakan triptofan adalah yang paling kompleks
dari semua jalur amino katabolisme asam dalam jaringan hewan; porsi triptofan (empat
karbonnya) menghasilkan asetil-KoA melalui asetoasetil-CoA. Beberapa perantara dalam
katabolisme triptofan adalah prekursor untuk sintesis biomolekul lainnya, termasuk nikotinat,
prekursor NAD dan NADP pada hewan; serotonin, suatu neurotransmitter di vertebrata; dan
indoleasetat, faktor pertumbuhan pada tanaman. Rincian fenilalanin patut diperhatikan karena
cacat genetik pada enzim jalur ini menyebabkan beberapa penyakit manusia yang dapat
diwariskan. Fenilalanin dan oksidasinya produk tirosin (keduanya dengan sembilan karbon)
terdegradasi menjadi dua fragmen, yang keduanya bisa masuk ke sitrat siklus asam: empat dari
sembilan atom karbon menghasilkan asetoasetat bebas, yang dikonversi menjadi asetoasetil-KoA
dan dengan demikian asetil-KoA, dan fragmen empat karbon kedua adalah pulih sebagai
fumarat. Delapan dari sembilan karbon kedua asam amino ini memasuki siklus asam sitrat;
karbon yang tersisa hilang sebagai CO2. Fenilalanin, setelah hidroksilasi menjadi tirosin, juga
merupakan prekursor dopamin, neurotransmitter, dan norepinefrin dan epinefrin, hormon yang
disekresi oleh adrenal medula. Melanin, pigmen hitam kulit dan rambut, juga berasal dari tirosin
Lima Asam Amino Dikonversi menjadi α-Ketoglutarate

Kerangka karbon dari lima asam amino (prolin, glutamat, glutamin, arginin, dan histidin) masuk
ke siklus asam sitrat sebagai α-ketoglutarate. Prolin, glutamat, dan glutamin memiliki kerangka
lima karbon. Struktur siklik prolin dibuka oleh oksidasi dari karbon yang paling jauh dari gugus
karboksil ke buat basis Schiff, lalu hidrolisis basis Schiff ke semialdehyde linier, glutamat -
semialdehyde. Zat antara ini selanjutnya dioksidasi pada karbon yang sama untuk menghasilkan
glutamat. Aksi glutaminase, atau salah satu dari beberapa reaksi enzim di mana glutamin
menyumbangkan nitrogen amida ke akseptor, mengubah glutamin untuk glutamat. Transaminasi
atau deaminasi glutamat menghasilkan -ketoglutarate. Arginin dan histidin mengandung lima
karbon yang berdekatan dan karbon keenam yang dilekatkan melalui nitrogen atom. Konversi
katabolik dari asam amino ini menjadi Oleh karena itu glutamat sedikit lebih kompleks daripada
glutamat jalur dari prolin atau glutamin. Arginin adalah dikonversi menjadi kerangka lima
karbon ornithine di siklus urea dan ornithine ditransaminasi untuk glutamat -semialdehyde.
Konversi histidin untuk glutamat lima karbon terjadi dalam multistep jalan; karbon tambahan
dihilangkan dalam langkah yang digunakan
tetrahidrofolat sebagai kofaktor.

Empat Asam Amino Dikonversi menjadi Succinyl-CoA

Kerangka karbon metionin, isoleusin, treonin, dan valine terdegradasi oleh jalur yang
menghasilkan suksinil- CoA (Gbr. 18-27), zat antara asam sitrat siklus. Metionin
menyumbangkan gugus metilnya ke salah satu beberapa kemungkinan akseptor melalui S-
adenosylmethionine, dan tiga dari empat atom karbon yang tersisa dikonversi ke propionate dari
propionyl-CoA, sebuah prekursor dari suksinil-CoA. Isoleusin mengalami transaminasi, diikuti
oleh dekarboksilasi oksidatif yang dihasilkan - asam keto. Kerangka lima karbon yang tersisa
lebih jauh dioksidasi menjadi asetil-KoA dan propionil-KoA. Valine mengalami transaminasi
dan dekarboksilasi, kemudian seri reaksi oksidasi yang mengubah sisa empat karbon ke
propionil-CoA. Beberapa bagian valin dan jalur degradatif isoleusin erat langkah paralel di
degradasi asam lemak. Dalam jaringan manusia, threonine juga dikonversi dalam dua langkah
menjadi propionyl- CoA. Mekanisme langkah pertama adalah analog untuk itu dikatalisis oleh
serine dehydratase, dan serine dan treonin dehidratase mungkin sebenarnya sama enzim.
Propionyl-CoA berasal dari tiga amino ini asam dikonversi menjadi suksinil-CoA.

Asam Amino Bercabang Berantai Tidak Terdegradasi di Hati

Meskipun banyak katabolisme dari asam amino dibutuhkan Tempatkan di hati, tiga asam amino
dengan bercabang rantai samping (leusin, isoleusin, dan valin) teroksidasi sebagai bahan bakar
terutama di otot, adiposa, ginjal, dan otak tisu. Jaringan ekstrahepatik ini mengandung
aminotransferase, absen di hati, yang bekerja pada ketiganya asam amino rantai cabang untuk
menghasilkan yang sesuai -keto asam. Rantai bercabang -keto acid dehydrogenase complex
kemudian dikatalisasi dekarboksilasi oksidatif dari ketiga asam -keto, dalam setiap kasus
melepaskan gugus karboksil sebagai CO2 dan memproduksi turunan asil-CoA. Oksidasi piruvat
menjadi asetil-KoA oleh kompleks piruvat dehidrogenase dan oksidasi -ketoglutarate menjadi
succinyl-CoA oleh -ketoglutarate dehydrogenase kompleks. Faktanya, ketiga kompleks enzim
tersebut serupa dalam struktur dan berbagi dasarnya sama mekanisme reaksi. Lima kofaktor
(tiamin pirofosfat, FAD, NAD, lipoate, dan coenzyme A) berpartisipasi, dan tiga protein di setiap
kompleks mengkatalisasi reaksi homolog.
1. Asparagine dan Aspartate Terdegradasi untuk Oxaloacetate Kerangka karbon asparagin
dan aspartat akhirnya memasuki siklus asam sitrat sebagai oksaloasetat. Enzim
asparaginase mengkatalisis hidrolisis asparagine ke aspartate, yang mengalami
transaminasi dengan α-ketoglutarate untuk menghasilkan glutamat dan oksaloasetat
2. Bagian-bagian yang terdegradasi menjadi asetil-KoA adalah sepenuhnya teroksidasi
menjadi karbon dioksida dan air, dengan generasi ATP oleh fosforilasi oksidatif. Seperti
halnya karbohidrat dan lemak, itu hasil degradasi asam amino pada akhirnya di generasi
mengurangi setara (NADH dan FADH2) melalui aksi siklus asam sitrat.
3. Setelah penghapusan gugus amino, kerangka karbon dari asam amino mengalami
oksidasi menjadi senyawa yang bisa masuk siklus asam sitrat untuk oksidasi menjadi
CO2 dan H2O. Reaksi dari jalur ini membutuhkan a jumlah kofaktor, termasuk
 tetrahidrofolat dan S-adenosylmethionine dalam satu karbon reaksi transfer dan
tetrahidrobiopterin dalam oksidasi fenilalanin oleh fenilalanin hidroksilase.
4. Tergantung pada produk akhir degradatif, beberapa asam amino dapat dikonversi menjadi
keton tubuh, sebagian menjadi glukosa, dan sebagian untuk keduanya. Jadi degradasi
asam amino diintegrasikan ke dalam metabolisme perantara dan bisa sangat penting
untuk bertahan hidup dalam kondisi di mana asam amino adalah sumber energi
metabolisme yang signifikan.
5. Kerangka karbon asam amino masuk ke dalam siklus asam sitrat melalui lima zat antara:
asetil-KoA, -ketoglutarat, suksinil-KoA, fumarate, dan oxaloacetate. Beberapa juga
terdegradasi ke piruvat, yang dapat dikonversi baik asetil-KoA atau oksaloasetat.
6. Asam amino yang menghasilkan piruvat adalah alanin, sistein, glisin, serin, treonin, dan
tryptophan. Leusin, lisin, fenilalanin, dan tryptophan menghasilkan asetil-CoA melalui
asetoasetil-KoA. Isoleusin, leusin, treonin, dan tryptophan juga membentuk asetil-KoA
secara langsung.
7. Arginin, glutamat, glutamin, histidin, dan prolin menghasilkan -ketoglutarate; isoleusin,
metionin, treonin, dan valin menghasilkan suksinil-CoA; empat atom karbon dari
fenilalanin dan Asam amino yang menghasilkan piruvat adalah alanin, sistein, glisin,
serin, treonin, dan tryptophan. Leusin, lisin, fenilalanin, dan tryptophan menghasilkan
asetil-CoA melalui acetoacetyl-CoA. Isoleusin, leusin, treonin, dan tryptophan juga
membentuk asetil-KoA secara langsung.
8. Arginin, glutamat, glutamin, histidin, dan prolin menghasilkan α-ketoglutarate; isoleusin,
metionin, treonin, dan valin menghasilkan suksinil-CoA; empat atom karbon dari
fenilalanin dan tirosin memunculkan fumarate; dan asparagin dan aspartat menghasilkan
oksaloasetat.
9. Asam amino rantai cabang (isoleusin, leusin, dan valin), tidak seperti asam amino
lainnya, hanya terdegradasi melalui jaringan ekstrahepatik.
10. Sejumlah penyakit manusia yang serius dapat terjadi ditelusuri ke cacat genetik pada
enzim katabolisme asam amino.
Biosintesis asam amino: tinjauan umum Asam amino proteinogenik dapat dibagi menjadi lima
bagian sehubungan dengan biosintesis nya. Anggota setiap bagian berasal dari prekursor umum,
yang semuanya diproduksi di siklus asam tricarboxylic atau metabolisme katabolik karbohidrat.
Tumbuhan dan mikroorganisme dapat disintesis semua asam amino dari awal, tetapi selama
evolusi, mamalia telah kehilangan kemampuan untuk mensintesis sekitar setengah dari 20
protein asam proteinogenik. Oleh karena itu asam amino esensial harus disediakan dalam
makanan. Sebagai contoh, metabolisme hewan tidak lagi mampu melakukan sintesis de-novo
dari asam amino aromatik (tirosin hanya tidak esensial) karena bisa dibentuk fromphenylalanine
ketika persediaan yang memadai tersedia). Asam amino rantai cabang (valin, leusin, isoleusin,
dan treonin) sebagai serta metionin dan lisin, juga milik asam amino esensial. Pasokan asam
amino ini dalam makanan tampaknya menjadi penting setidaknya selama pertumbuhan. Nilai
gizi protein sangat tergantung pada esensi kandungan asam aminonya. Protein nabati yang dari
sereal rendah lisin dan metionin, sedangkan protein hewani mengandung semua asam amino
dalam proporsi seimbang. Namun, sebagaimana disebutkan sebelumnya, ada juga tanaman yang
memberikan nilai tinggi protein. Ini termasuk kacang kedelai, salah satunya tanaman yang
disuplai dengan NH3 secara simbiotik Pemecah N2.
Asam amino non-esensial adalah asam amino yang muncul dengan transaminasi dari asam 2-
okso di metabolisme perantara. Ini milik untuk keluarga glutamat (Glu, Gln, Pro, Arg, berasal
dari 2-oxoglutarate), keluarga aspartat (hanya Asp dan Asn dalam grup ini, yang diturunkan dari
oksaloasetat), dan alanin, yang dapat dibentuk dengan transaminasi dari piruvat. Asam amino
dalam keluarga serin (Ser, Gly, Cys) dan histidine, yang muncul dari zat antara glikolisis, juga
bisa disintesis oleh tubuh manusia.
SIKLUS UREA

Siklus urea
Asam amino terutama diuraikan di dalam hati. Amonia dilepaskan baik secara langsung atau
secara tidak langsung dalam proses siklus urea. Ammonia (NH3) adalah basa yang relatif kuat,
dan pada nilai pH fisiologis itu terutama hadir dalam bentuk ion amonium NH4+. NH3 dan
NH4+ beracun, dan pada konsentrasi yang lebih tinggi menyebabkan kerusakan otak khususnya.
Amoniak karenanya harus secara efektif dinonaktifkan dan diekskresikan. Ini bisa dilakukan
dengan berbagai cara. Hewan air dapat mengeluarkan NH4+ langsung. Sebagai contoh, ikan
mengeluarkan NH4+ melalui insang (amonotelic binatang). Vertebrata darat, termasuk manusia,
hampir tidak mengeluarkan NH3, dan sebagai gantinya, kebanyakan amonia diubah menjadi urea
sebelumnya ekskresi (hewan ureotelik). Burung dan reptil, sebaliknya, bentuk asam urat, yaitu
terutama diekskresikan sebagai padatan untuk menghemat air (hewan uricotelic). Alasan untuk
efek neurotoksik amonia belum dijelaskan kemungkinan dapat mengganggu metabolisme
glutamat dan prekursor glutamin di otak.

A. Siklus urea
Urea (H2N-CO-NH2) adalah diamida asam karbonat. Berbeda dengan ammonia yang netral dan
karenanya relatif tidak beracun. Elektron bebas pasangan dari dua atom nitrogen terdelokalisasi
seluruh strukturnya, dan karenanya tidak lagi dapat mengikat proton. Sebagian kecil, molekul
yang tidak bermuatan, urea mampu melintasi biologis membran dengan mudah. Selain itu,
memang mudah diangkut dalam darah dan diekskresikan dalam urin. Urea diproduksi hanya di
hati, dalam siklus urutan reaksi (siklus urea) itu dimulai di mitokondria dan berlanjut di
sitoplasma. Dua atom nitrogen yang berasal dari NH4+ (yang kedua sebelumnya telah
dimasukkan ke dalam aspartat). Grup keto berasal dari hidrogen karbonat (HCO3 -), atau CO2
yang ada dalam kesetimbangan dengan HCO3 -.
1] Pada langkah pertama, karbamoil fosfat terbentuk dalam mitokondria dari hidrogen karbonat
(HCO3 -) dan NH4 +, dengan dua ATP molekul yang digunakan. Di kompleks ini, residu
karbamoil (–O – CO – NH2) berada pada potensi kimia yang tinggi. Di mitokondria hati, enzim
[1] dibuat sekitar 20% dari protein matriks.

2] Pada langkah selanjutnya, residu karbamoil dipindahkan ke asam amino non-proteinogenik

ornithine, mengubahnya menjadi citrulline, yang juga non-proteinogenik. Ini adalah masuk ke
sitoplasma melalui transporter.

3] Kelompok NH2 kedua dari urea kemudian disediakan oleh aspartat, yang bergabung dengan
citrulline menjadi argininosuccinate. ATP dipecah menjadi AMP dan difosfat (PPi) untuk reaksi
endergonik ini. Untuk menggeser kesetimbangan reaksi ke sisi produk, difosfat dihilangkan dari
kesetimbangan dengan hidrolisis.

4] Pembelahan fumarate dari argininosuccinate mengarah ke asam amino proteinogenik arginin,

yang disintesis dengan cara ini dalam metabolisme hewan.
5] Pada langkah terakhir, isourea dilepaskan dari kelompok guanidinium arginin oleh hidrolisis
(tidak diperlihatkan), dan segera disusun kembali menjadi urea. Selain itu, ornithine diregenerasi
dan kembali melalui ornithine transporter ke dalam mitokondria, di mana itu tersedia untuk
siklus sekali lagi. Fumarat yang diproduksi pada langkah [4] dikonversi via malate ke
oxaloacetate [6, 7], dari yang aspartat dibentuk lagi oleh transaminasi [9]. Glutamat diperlukan
untuk reaksi [9] berasal dari dehidrogenase glutamat Reaksi [8], yang memperbaiki yang kedua
NH4+ dalam ikatan organik. Reaksi [6] dan [7] juga terjadi pada siklus asam trikarboksilat.
Namun, dalam formasi urea ditempatkan di sitoplasma, mana yang sesuai isoenzim tersedia.
Laju pembentukan urea terutama dikendalikan oleh reaksi [1]. N-asetil glutamat, sebagai efektor
alosterik, mengaktifkan karbamoilfosfat synthase. Pada gilirannya, konsentrasi asetil glutamat
tergantung pada arginin dan Level ATP, serta faktor lainnya.

Daftar Pustaka

Berg JM, Tymoczko JL., Stryer L. (2002). Biochemistry 5th Edition. New York: W. H.
Freeman and Company.

Koolman, J. and K.H. Roehm, 2005. Color Atlas of Biochemistry 2nd Edition. Germany:
Appl, Wemding.

Nelson, D.L. and Cox, M.M. (2005). Lehninger Principles of Biochemistry Fourth Edition.
USA: University of Wisconsin Press.

Rodwell, Victor W., dkk. 2017. Harper’s Illustrated Biochemistry 30th Edition:
Biokimia Harper. Alih bahasa, Lilian Roma Manurung. Jakarta: EGC.