Nama : Nurhayati

No.BP : 1510411024

10. Jelaskan metode SCF (self confidence field) pada perhitungan ab initio ?

Salah satu penyelesaian persamaan Schrödinger dengan metode ab initio yaitu

perhitungan Hartree-Fock (HF). Hartree dan Fock mengembangkan mekanika
kuantum modern dan merupakan pioner dari perhitungan struktur elektronik atom (ab
initio). Hartree dengan menggunakan metode variasi mengembangkan metode self-
consistent field(SCF) yang menjadi bagian penting dalam program pemodelan
molekul, sehingga disebut HF-SCF. Metode ab initio HF-SCF (Hartree Fock-Self
Consistent Field ) telah dapat dipakai pada molekul yang lebih besar dari molekul
hidrogen (Quinn, 2001). Pada studi mekanika kuantum ab initio pada molekul
berlaku Hamiltonian, (2.1) dengan k dan l menyatakan inti, i dan j menyatakan
elektron. Persamaan 2.1 menyatakan 5 suku, suku pertama adalah operator energi
kinetik inti, suku ke-2 operator energi kinetik elektron, suku ke-3 potensial energi
tolakan antarinti, suku ke-4 energi potensial tarikan antara elektron dan inti, dan suku
ke-5 adalah energi potensial tolakan antar elektron.
11. Jelaskan basics ( basic-set ) ?
Basis set dalam ilmu kimia adalah kumpulan fungsi matematika yang digunakan
untuk menyusun gugus orbit suatu molekul. Kumpulan fungsi-fungsi matematika
yang ada disusun dalam kombinasi linier dengan menyertakan nilai koefisien di
dalamnya. Fungsi yang digunakan umumnya adalah gugus-gugus orbit atom
penyusun molekul tersebut. Semakin tinggi basis set yang digunakan akan
memberikan hasil perhitungan yang lebih akurat. Perbedaan antara basis set dengan
basis fungsi :
Basis fungsi : fungsi matematika yang didesain untuk memberikan fleksibilitas yang
maksimal pada orbital molekul, basis fungsi ini yang dikenal misalnya GTO & STO
Basis set : serangkaian fungsi matematika yang digunakan untuk menyusun gugus
orbit suatu molekul mislanya basis set STO-3G pada molekul H2, basis set 6-31G .
12. Jelaskan pendekatan Bohn Oppenheimer , Orbital , LCAO ?
Hampiran Born-Oppenheimer
Hampiran Born-Oppenheimer menganggap bahwa inti yang lebih berat dari
elektron bergerak relatif lambat dan dapat dianggap diam pada saat elektron bergerak
mengelilinginya. Hampiran ini cukup baik untuk molekul keadaan dasar.
Perhitungan ini membuktikan bahwa inti di dalam H2ᶧ hanya bergerak 1 pm,
sedangkan elektron bergerak dengan kecepatan1000 pm.
Hampiran Orbital Molekul
Fungsi gelombang satu elektron yang diperoleh dari penyelesaian persamaan
schrodinger disebut orbital molekul. Orbital molekul Ѱ, melalui nilai Ѱ²,
menunjukkan distribusi elektron di dalam molekul. Orbital molekul serupa dengan
orbital atom, tetapi menyebar diseluruh molekul itu.
LCAO (Linear Combination Atom Orbital)
Fungsi gelombang elektron pada atom disebut orbital atom. Molekul merupakan
kombinasi dari beberapa atom, sehingga fungsi gelombangnya adalah kombinasi dari
fungsi gelombang beberapa atom, hal ini disebut dengan Linear Combination Atom
Orbital. Berikut ini fungsi gelombang untuk 2 orbital atom:

dimana, N adalah faktor normalisasi

13. Jelaskan MM ,MM/QM, MM+, NDDO, CNDO, MNDO, AM, PM3 ?

Mekanika Molekular/MM
Metoda yang dikenal dengan mekanika molekular menyediakan pernyataan aljabar
yang sederhana untuk energi total senyawa, tanpa harus menghitung fungsi
gelombang atau kerapatan elektron total. Dalam metoda mekanika molekukar, data
base senyawa yang digunakan dalam metoda parameterisasi merupakan hal yang
krusial berkaitan dengan kesuksesan perhitungan. Himpunan parameter dan fungsi
matematika dinamakan medan gaya (Force-Field).

QM/MM :
Sebuah sistem molekul dikembangkan suatu metoda hibridisasi yang dikenal dengan
nama QM/MM, yaitu bagian yang penting dari sistem yang dikaji dihitung dengan
metoda QM, sedangkan bagian sistem yang tidak harus dijelaskan secara detail
dihitung dengan metoda MM.

MM+ :
Pada metode semiempiris yang terkenal sekarang (MNDO, AM1, PM3), pendekatan
ZDO hanya diterapkan pada fungsi basis pada atom yang berbeda. Ini dinamakan
pendekatan NDDO (neglect of diatomic differential overlap).

Complete Neglect Of Differential Overlap (CNDO) / ZDO (Zero Differential

Overlap).
Complete Neglect of Differential Overlap (CNDO) adalah metode yang lebih spesifik
dalam kimia kuantum semi-empiris. Metode ini menggunakan dua pendekatan, yaitu
core approximation dan zero-differential overlap. Metode CNDO ini merupakan
metode untuk menghitung energi elektronik dan orbital molekul.CNDO tidak
melibatkan pengetahuan tentang ikatan kimiamelainkan menggunakan pengetahuan
tentang kuantum fungsi gelombang. CNDO dapat digunakan untuk kedua shell
tertutupmolekul, dimana elektron sepenuhnya dipasangkan dalam orbital molekul dan
molekul shell terbuka, yang radikal dengan elektron tidak berpasangan.

Neglect Of Diatomic Differential Overlap (NDDO, POPLE 1965)

Bentuk dari integral INDO memungkinkan untuk mem-bedakan orbital s dan p pada
atom pusat tetapi tidak memper-timbangkan perbedaan orientasi dari orbital p pada
pusat atom tetangganya. Dengan INDO, semua rotamer mempunyai energi yang
sangat mirip. Untuk meningkatkan kemampuan metode ini, NDDO memperlakukan
semua integral dalam bentuk <mn|ls> m, n Î A dan l,s Î B tetapi tidak mempunyai
kesamaan pada n dan l tidak mempunyai kesamaan dengan s. Dengan kata lain
interaksi s, px, py dan pz diperhitungkan pada setiap fragmendiatomik, tetapi awan
muatan individual yang dimasukkan pada atom berbeda, ditiadakan.
Modified Neglect Of Diatomic Overlap (MNDO)
Modified Neglect of Differential Overlap (MNDO) adalah metode kimia
kuantum semi-empiris untuk perhitungan struktur elektronik molekul dalam kimia
komputasi. Secara eksplisit juga menambahkan efek korelasi meskipun urutan
kedua teori perturbasi dengan dipasang parameter untuk percobaan dari perhitungan
berkorelasi.

AUSTIN MODEL 1 (AM1)

AM1 merupakan upaya untuk meningkatkan model MNDO dengan mengurangi
tolakan atom pada jarak pemisahan dekat. Kompleksitas masalah parameterisasi di
AM1 yaitu meningkatnya parameter per atom dari 7 di MNDO menjadi 13-16 per
atom di AM1. Hasil perhitungan AM1 kadang-kadang digunakan sebagai titik awal
untuk parameterizations dari forcefields dalam pemodelan molekul. Pengembangan
AM1 adalah SemiChem Austin Model 1(SAM1), yang diimplementasikan dalam
program AMPAC dan yang secara eksplisit memperlakukan d-orbital.

PARAMETERIZED MODEL 3 (PM3)

Parameterized Nomor Model 3 (PM3) adalah metode semi-empiris untuk
perhintungan kuantum struktur molekul elektronik dalam kimia komputasi . Hal ini
didasarkan pada pendekatan integral Neglect of Differential Diatomic Overlap.
Metode PM3 menggunakan formalisme dan persamaan yang sama dengan
metode AM1. Perbedaannya adalah: 1) PM3 menggunakan dua fungsi Gaussian
untuk fungsi tolakan inti, bukan jumlah variabel yang digunakan oleh AM1 (yang
menggunakan antara satu dan empat Gaussians per elemen), 2) nilai-nilai numerik
dari parameter yang berbeda. Perbedaan lainnya terletak pada filsafat dan metodologi
yang digunakan selama parameterisasi ini: bahwa AM1 mengambil beberapa nilai
parameter dari pengukuran spectroscopical, PM3 menggunakannya sebagai nilai-nilai
optimizable.
14. Jelaskan pada jurnal masing” tentang DFT metoda dan hasilnya ?
Judul:
Determination of corrosion inhibition effects of amino acids: Quantum chemical and
molecular dynamic simulation study
Tujuan Penelitian :
Menyelidiki efektivitas beberapa asam amino seperti alanin, metionin, asparagin,
aspartat, lisin, arginin dan histidin menggunakan perhitungan kimia kuantum dan
dinamika molekul pendekatan simulasi untuk ditentukan penghambat korosi terbaik
di antara mereka.
Metode yang digunakan:
Metode yang digunakan dalam penelitian kimia komputasi ini yaitu metoda DFT.
Untuk menghitung fase gas menggunakan metoda HF dan DFT/B3LYP dengan
LANL2DZ, 6-31++G(d,p),CEP-316 basis sets. Metoda dan basis sets
(B3LYP/LANL2DZ, B3LYP/6-31++G(d,p), B3LYP/CEP-31G) juga di aplikasikan
dalam fase air, asam asetat dan asam format.
Hasil:
Hasil yang diperoleh dari semua tahap dibandingkan dengan data eksperimen yang
diberikan untuk beberapa asam amino dan didapatkan bahwa arginin adalah yang
inhibitor korosi terbaik di antara tujuh asam amino tersebut. Urutan inhibitor korosi
terbaik yaitu :
Arg>Met>Lys>His>Asn>Asp>Ala
Ini disebabkan karena arginin, lisin dan histidin mengandung lebih elektron untuk
disumbangkan dibandingkan dengan asam amino lainnya. Dan juga metionin sebagai
inhibitor korosi yang baik karena atom sulfur dalam strukturnya. Metionin mudah
memberikan elektron untuk logam.

E HOMO adalah parameter kimia kuantum yang terkait erat dengan kemampuan
molekul menyumbangkan electron . Tingkat energi HOMO yang lebih tinggi berarti
bahwa molekul dengan mudah memberikan elektron ke orbital kosong dari atom
logam.
15. Jelaskan matrix (determinan matrik ) ?

Determinan matriks merepresentasikan suatu bilangan tunggal. Determinan

diperoleh dengan mengalikan dan menjumlahkan elemen-elemen matriks dengan cara
yang khusus. Suatu Matriks mempunyai determinan jika dan hanya jika matriks
tersebut adalah matriks persegi.. Determinan matriks A bisa ditulis det(A) atau |A|.
Determinan matriks 2×2

Misalkan matriks A=
det(A) = |A| = a×d−b×c
Invers suatu matriks dilambangkan , melambangkan invers dari matriks A. Secara
umum hanya matriks persegi yang mempunyai invers. Berikut penjelasannya tentang
invers.

16. Jelaskan tentang metoda Huckel ?

Metode Extended Huckel adalah metode kimia kuantum semiempirik, yang
digunakan untuk menentukan orbital molekul , tetapi kurang bagus digunakan dalam
menentukan geometri struktur dari sebuah molekul organik.Namun metode ini dapat
menentukan energi relatif konfigurasi geometris yang berbeda. Metode Extended
Huckel ini hanya mempertimbangkan elektron valensi

Menurut teorinya, orbital π diperlakukan secara terpisah dari orbital σ. Semua integral
Coulomb α untuk orbital atom yang berkontribusi pada orbital π dianggap sama.
Misalnya, pada etena ikatan σ sudah dipastikan dan hanya terpusat pada penemuan
energi ikatan π. Orbital π dinyatakan sebagai LCAO untuk orbital C2p yang tegak

lurus terhadap bidang molekul. Misalnya pada etena dituliskan:

Keterangan:A: orbital C2p pada atom A dan B: orbital C2p pada atom B.
Koefisien optimum dan enegi diperoleh dengan prinsip variasi, melalui komputasi
modern semua resonance integral dan overlap integral akan dimasukkan, tetapi
dengan diagram tingkat energi orbital molekul dapat dihasilkan lebih mudah dengan
mengikuti aproksimasi Hückel:
1. Semua overlap integral di atur sama dengan 0
2. Semua resonance integral between non-neighbours diatur sama dengan 0
3. Semua sisa resonance integral diatur sama dengan β
Pendekatan Hückel untuk etena:
Akar dari persamaan hasil det
E±=α±β