Nomor 1.
Selective Breeding
• Dengan memutus ikatan hidrogen:
– Pemanasan
– Penambahan asam atau basa
– Enzymatis
• Melting temperature (Tm) adalah
temperature ketika setengah dari
DNA untai ganda terdenaturasi
menjadi untai tunggal
• DNA untai ganda yang
terdenaturasi menjadi untai
tunggal akan kembali menjadi untai
ganda ketika kondisi lingkungan
kembali normal
2. DNA dapat dipotong dan disambung
• DNA dipotong secara enzimatis oleh
enzim restriksi endonuklease
– Restriction site punya sekuens
yang sangat spesifik
– Ujung lancip (sticky end)
– Ujung tumpul (blunt end)
• Potongan DNA dapat disambung
dengan enzim ligase
– Jika berujung lancip maka harus
komplement
3. Kode genetik adalah relasi antara
sekuen DNA dan protein terkait
• Bersifat triplet: satu asam amino
dikode oleh 3 nukelotida
• Mutasi titik (point mutation):
berubahnya satu pasang basa
– Faktor penyebab: 1) modifikasi
kimia (dg mutagen), 2) malfungsi
saat replikasi
– Dua tipe mutasi titik:
• Paling sering adalah Transisi.
Substitusi satu pirimidin oleh
lainnya atau satu purin oleh lainnya
• Transversi: purin tersubstitusi
pirimidin atau kebalikannya
• Jenis mutasi lain: Insersi
– Transposable elements: sekuens DNA
yang dapat berpindah
– Terkadang diiringi deletion (hilangnya
sekuens DNA tertentu
Struktur untai ganda
•Dua rantai polinukleotida terpilin pada
sumbu yang sama, yang masing-
masing berlawanan arah, antiparalel
•Purin dan pirimidin ada di dalam dan
gula-fosfat di sebelah luar
•Diameter heliks 20 A, jarak antar
nukleotida 3,4 A dengan sudut rotasi
36°C setiap turn terdiri atas 10
nukleotida
•Dua untai DNA terhubung oleh ikatan •
hidrogen
sirip, pola sisik, bentuk tubuh, bentuk
suatu program breeding yang mencoba untuk
memperbaiki nilai pemuliabiakan (breeding •
value) dari suatu populasi dengan melakukan •
seleksi dan perkawinan hanya pada ikan-ikan
yang terbaik
• Hasil yang akan diperoleh adalah induk yang
terseleksi yang mempunyai karakteristik
lebih baik dari populasi sebelumnya
Heritabilitas dalam arti luas hanya dapat
menjelaskan berapa bagian dari keragaman
fenotipik yang disebabkan oleh pengaruh
genetik dan berapa bagian pengaruh faktor
lingkungan, namun tidak dapat menjelaskan
proporsi keragaman fenotipik pada tetua yang
dapat diwariskan pada turunannya
Heritabilitas dalam arti sempit yaitu
perbandingan antara ragam genetik additif •
dengan ragam fenotipik
• Nilai h2 dibedakan atas 3 kategori yaitu
kecil, sedang, besar
• Kecil (rendah) : 0-0,2 • Berat rata-rata populasi berikutnya (F1 =
• Sedang : 0,2-0,4 keturunan pertama hasil persilangan dari
Besar (tinggi) : > 0,4 induk-induk ikan lele terseleksi) menjadi :
Semakin tinggi nilai h2 dapat diartikan bahwa
keragaman sifat produksi lebih banyak
dipengaruhi oleh perbedaan genotipe ternak
dalam populasi, dan hanya sedikit pengaruh
keragaman lingkungan
• nilai h2 dalam arti sempit dapat
didefinisikan sebagai persentase
keunggulan tetua yang diwariskan pada
anaknya
• Cara yang paling teliti untuk menentukan
h2 suatu sifat adalah dengan melakukan
percobaan seleksi untuk beberapa generasi
dan menentukan kemajuan yang
diperolehnya, yang dibandingkan dengan
jumlah keunggulan dari tetua terpilih
dalam semua generasi dari percobaan
seleksi
• Semakin tinggi nilai heritabilitas, maka
semakin besar respon seleksi yang kita
inginkan
• R = S.h2
• h2 = R/ S
seleksi adalah program breeding yang
memanfaatkan keragaman fenotip yang
diteruskan dari orang tua kepada
keturunannya
Seleksi fenotip kualitatif adalah seleksi ikan
berdasarkan sifat kualitatif (warna tubuh, tipe
punggung, dsb.) yang diinginkan
Seleksi fenotip kuantitatif adalah seleksi
terhadap penampakan ikan atau sifat yang
dapat diukur, dikendalikan oleh banyak
pasang gen dan dipengaruhi oleh lingkungan
• Tahap pertama : memperoleh nilai h2
pertumbuhan (dalam hal ini nilainya telah
diketahui untuk ikan lele sebesar 0,50)
• Tahap kedua : menghitung diferensial atau
perbedaan seleksi, sebagai berikut :
S = (berat rata-rata terseleksi induk betina
+ berat rata-rata terseleksi induk jantan)/2
– rata-rata populasi
S = 604 g + 692 g – 454 g
2
S = 194 g
Tahap ketiga : menghitung respon seleksi
R = Sh2
R = (194g) (0,50)
R = 97 g
F1 = berat rata-rata populasi + respon
seleksi
F1 = 454 g + 97 g
F1 = 551 g
• Seorang petani ikan mas memiliki induk dengan
berat rata rata = 480 gram, dengan nilai SD= 60
gram. Petani tersebut menyeleksi induk jantan
dan betina. Rataan berat induk terseleksi adalah
640 gram. Nilai h2 ikan mas 0.1 .
• Berapa nilai peningkatan berat pada generasi F.1
menghitung nilai Selection differential (S)
S : Avg Berat induk terseleksi - Avg Wt
populasi
= 640- 480 = 150 gram
Menghitung Respon seleksi
• R = S. h2
• R = 150 * 0.1
• = 15 gram
respon seleksi pada generasi F.1 adalah
15 gram
agar populasi tersebut dapat mencapai
nilai rata2 640 gram diperlukan program
breeding sebanyak
• Intensitas seleksi = I = S / SD
• = 150 / 60 = 2.5