Metabolisme Nukleotida

Purin Pirimidin

Dr.Nira Mediati P., SpM

Lab Biokimia Biomolekuler
Subyek

• Apakah purin dan pirimidin ?

(nukleosida, nukleotida,
polinukleotida)

• Biosintesa purin pirimidin

• Katabolisme purin pirimidin

• Aspek klinis metabolisme purin

pirimidin
PENDAHULUAN

■ Nukleotida purin dan pirimidin

adalah senyawa heterosiklis yang
sangat penting dalam tubuh.
 sebagai unsur pembangun untuk
asam nukleat ( DNA, RNA )
Struktur kimia

PURIN PIRIMIDIN
BASA PIRIMIDIN : C4H4N2

• Senyawa organik heterosiklik aromatik dengan 4

atom C dan 2 atom N di posisi 1 dan 3
Contoh basa Pirimidin
BASA PURIN : C5H4N4

• Senyawa organik aromatik heterosiklik yang

terdiri dari cincin pirimidin dan cincin
imidazole
Contoh basa Purin
Nukleosida, nukleotida dan asam nukleat
Nukleosida dan nukleotida merupakan
derivat dari
basa purin dan pirimidin :

 Sebagai unsur pembangun untuk asam nukleat

(DNA dan RNA)
 Berfungsi dalam melaksanakan reaksi esensial
dalam metabolisme
■ FUNGSI BIOKIMIAWI :
• REAKSI PEMINDAHAN FOSFAT PADA ATP
dan
TRIFOSFAT LAINNYA ( UDP-GLUKOSA,
UDP-
GALAKTOSA )
• SEBAGAI KOENZIM : NAD, FAD, dsb
• BERBAGAI SENYAWA ANALOGNYA DIBUAT
SECARA SINTETIK  UNTUK TERAPI
1 . NUKLEOSIDA

• Basa PURIN/PIRIMIDIN + Gula PENTOSA

(RIBOSA atau DEOKSIRIBOSA)
dengan ikatan β-N-Glikosida pada N9 atau N1

NUKLEOSIDA

- Adenin + D-ribosa, ikatan pada N9 = Adenosin

- Guanin + D-ribosa, ikatan pada N9 = Guanosin

- Sitosin + D-ribosa, ikatan pada N1 = Sitidin

- Urasil + D-ribosa, ikatan pada N1 = Uridin
Ribonukleosida
2. NUKLEOTIDA =
nukleosida terfosforilasi
NUKLEOSIDA + gugus FOSFAT

adenosin
guanosin
sitidin
uridin
• □ ADENOSIN MONO FOSFAT = AMP = AS. ADENILAT
= ADENIN + RIBOSA + FOSFAT
= ADENOSIN + FOSFAT
• □ TIMIDIN MONO FOSFAT = TMP = AS. TIMIDILAT
= TIMIN + 2-DEOKSIRIBOSA + FOSFAT
= TIMIDIN + FOSFAT
• □ URIDIN MONO FOSFAT = UMP = AS. URIDILAT
= URASIL + RIBOSA + FOSFAT
= URIDIN + FOSFAT
 NH2 NH2
N N

N N

N N 9 N N 9
O O
O O 5’
O O 5’ 1’ 1’
P
P
O O
O O
OH OH OH H

AMP dAMP
( Asam adenilat ) ( Asam 2’deoksi- adenilat )
 O
O

HN HN CH3

O O
N 1 N 1
5’ O O O O
O O 5’
1’ P
P 1’
O O O O
OH OH OH H

UMP TMP
( Asam Uridilat ) ( Asam Timidilat )
 NUKLEOSIDA NUKLEOTIDA
BASA ( BASA + RIBOSA / ( BASA + RIBOSA /
DEOKSIRIBOSA ) DEOKSIRIBOSA +
FOSFAT )
ADENIN ADENOSIN AMP, ADP, ATP
A A
GUANIN GUANOSIN GMP, GDP. GTP
G G
SITOSIN SITIDIN CMP, CDP, CTP
C C
URASIL URIDIN UMP. UDP, UTP
U U
TIMIN TIMIDIN TMP, TDP, TTP
T T
 POLINUKLEOTIDA = ASAM NUKLEAT

☻ ASAM ORGANIK YANG ADA DIDALAM INTI SEL / NUKLEUS ,

BERGABUNG DENGAN PROTEIN  NUKLEOPROTEIN.

☻ MACAMNYA :
DNA = ASAM DEOKSI RIBO NUKLEAT
RNA = ASAM RIBO NUKLEAT

☻ RANGKAIAN dari BANYAK NUKLEOTIDA, DIHUBUNGKAN

DENGAN IKATAN DIESTER FOSFAT  POLIMER
NUKLEOTIDA
DNA
 METABOLISME
NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN :
 KONSUMSI NUKLEOTIDA KEBANYAKAN BERUPA
NUKLEOPROTEIN.

PENCERNAAN NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN

■ NUKLEOTIDA PURIN dan PIRIMIDIN DIPECAH
OLEH ENZIM-ENZIM DALAM Tr. DIGESTIVUS.
■ HASIL AKHIRNYA :
o ASAM URAT
o CO2, NH3 dan ASAM β- ISOBUTIRAT
 NUKLEOPROTEIN dari MAKANAN
ENZIM PROTEOLITIK , DNAase, RNAase

POLINUKLEOTIDA ( = ASAM NUKLEAT) + PROTEIN

POLINUKLEOTIDASE

( MONO ) NUKLEOTIDA

NUKLEOTIDASE & FOSFATASE

NUKLEOSIDA + FOSFAT
NUKLEOSIDASE

PURIN dan PIRIMIDIN + PENTOSA

( RIBOSA / DEOKSIRIBOSA )

ASAM URAT CO2 + NH3 + ASAM-β-ISOBUTIRAT

BIOSINTESIS PURIN
SUMBER ATOM-ATOM PURIN :
REAKSI SINTESIS PURIN :

1. PEMBENTUKAN FOSFORIBOSIL PIRO FOSFAT = PRPP

ATP AMP
RIBOSA-5-P 5-FOSFORIBOSIL-1-PIRO FOSFAT
PRPP - SINTASE ( PRPP )
PRPP JUGA PRAZAT UNTUK PIRIMIDIN, NAD dan NADP

2. PEMBENTUKAN 5-FOSFO- β –RIBOSILAMIN :

GLUTAMIN GLUTAMAT
H20 PPi
PRPP 5-FOSFO- β -RIBOSIL AMIN
PRPP-GLUTAMIN AMIDO TRANSFERASE
ATP AMP
3. 5-FOSFO-β-RIBOSILAMIN + GLISIN GLISIN AMIDA
GAR-SINTASE RIBOSIL-5-FOSFAT
( GAR )
 Metenil-tetra
hidro folat Tetra hidro folat
4. GLISIN AMIDA RIBO- FORMIL GLISIN AMI-
DA RIBOSIL FOSFAT
SIL-5-FOSFAT (GAR) GAR FORMIL TRANS-FERASE
( FGAR )
GLUTAMIN
GLUTAMAT
FORMIL GLISIN AMI
5. FORMIL GLISIN AMIDA
RIBOSIL FOSFAT (FGAR) DIN RIBOSIL FOSFAT
ATP ADP

H2O
6. FORMIL GLISIN AMIDIN AMINO IMIDAZOL
RIBOSIL FOSFAT RIBOSIL-5-FOSFAT
ATP ADP

CO2
7. AMINO IMIDAZOL AMINO IMIDAZOL KARBOKSIAMIDA
RIBOSIL-5 P
RIBOSIL-5-FOSFAT
 H2O AMINO IMIDAZOL
8. AMINO IMIDAZOL
SUKSINIL KARBOKSI
KARBOKSIAMIDARIBOSIL-5 P
ASPARTAT
RIBOSIL-5-P

9. AMINO IMIDAZOL SUKSI- AMINO IMIDAZOL KARBOK

SIAMIDA RIBOSIL-5-P
NIL KARBOKSI RIBOSIL-5-P
FUMARAT
N10Formil tetra Tetra hidro
hidro folat folat
10. AMINO IMIDAZOL KARBOK FORMIMIDO IMIDAZOL
KARBOKSIAMIDA
SIAMIDA RIBOSIL-5-P
RIBOSIL-5-P

11 FORMIMIDO IMIDAZOL INOSIN MONO

FOSFAT ( IMP )
KARBOKSIAMIDA RIBOSIL-5-P

SELANJUTNYA IMP DIUBAH MENJADI AMP dan GMP

 ADENILO SUKSINASE
AMPS-SINTASE
IMP ADENILO SUKSINAT AMP
12 13 (ADENOSIN
NAD+ ( AMPS )
MONO
H2O PHOSPHAT )
IMP-DEHIDROGENASE
NADH
14 GLUTAMAT
H+
GLUTAMIN
XANTOSIN MONO FOSFAT GUANOSIN MONO
PHOSPHAT ( G M P )
( XMP ) ATP 15

SENYAWA / OBAT YANG DAPAT MENGHAMBAT SINTESIS PURIN :

. ANTI FOLAT REAKSI 4 ( TETRA HIDRO FOLAT )
. AZASERIN REAKSI 5
. DIAZANORLEUSIN REAKSI 2
. 6-MERKAPTOPURIN REAKSI 13 & 14
. ASAM MIKOFENOLAT REAKSI 14
BIOSINTESIS PURIN :
PERUBAHAN IMP ke AMP dan GMP :
KATABOLISME PURIN :
HASIL AKHIR KATABOLISME PURIN ADALAH ASAM URAT.
± 99 % ASAM URAT MERUPAKAN HASIL PEMECAHAN OLEH
ENZIM NUKLEOSIDA PURIN FOSFORILASE .
REAKSINYA :
ADENOSIN GUANOSIN
PURIN -
ADENOSIN NUKLEOSIDA -
DEAMINASE FOSFORILASE

INOSIN GUANIN
GUANASE
PURIN NUKLEOSIDA
OKSIDASE

HIPOXANTIN XANTIN
XANTIN OKSIDASE XANTIN -
OKSIDASE

ASAM URAT
BIOSINTESIS PIRIMIDIN

PADA BIOSINTESIS PURIN dan PIRIMIDIN TERDAPAT BEBERAPA PRECURSOR

YANG SAMA, YAITU PRPP, GLUTAMIN,CO2 & ASPARTAT

REAKSINYA :

KARBAMOIL-P SINTASE II
1. CO2 + GLUTAMIN + ATP KARBAMOIL-P
ASPARTAT TRANSKARBAMOILASE
2. KARBAMOIL-P + ASPARTAT KARBAMOIL-ASPARTAT

3. KARBAMOIL-ASPARTAT DEHIDRO OROTASE AS. DEHIDRO OROTAT

( DHOA )
DEHIDROGENASE
4. AS. DEHIDRO OROTAT + NAD+ ASAM OROTAT
 OROTAT FOSFO RIBOSIL TRANSFERASE
5. ASAM OROTAT + PRPP OROTIDIN MONOFOSFAT
( OMP )
CO2
6. OROTIDIN MONOFOSFAT URIDIN MONOFOSFAT ( UMP )
OROTIDILAT DEKARBOKSILASE

ATP ADP ATP ADP GLUTAMIN

7. UMP UDP UTP CTP
CTP SINTASE
NADPH + H+ REDUKTASE

NADP+
H2O Pi Metilen H4folat Folat

dUDP dUMP TMP

TIMIDILAT SINTASE
KATABOLISME PIRIMIDIN :
HASIL AKHIRNYA adalah CO2, NH3 dan ASAM β- AMINO BUTIRAT, YANG
MUDAH LARUT.

SITOSIN TIMIN

NH3

URASIL DIHIDROTIMIN
NADPH + H+
NADP+
DIHIDROURASIL β-URIDOISOBUTIRAT

H2O
ASAM UREIDOPROPIONAT
H2O
ALANIN
β- AMINO BUTIRAT

CO2 + NH3
KELAINAN METABOLISME PURIN :

KATABOLISME NUKLEOSIDA PURIN (ADENOSIN dan GUANOSIN)

PRODUK AKHIRNYA : ASAM URAT URINE

• ASAM URAT : ASAM LEMAH & SUKAR LARUT dalam AIR;

• DALAM CAIRAN TUBUH DAPAT BERUPA GARAM ( Na URAT ).
• GARAM Na URAT BERSIFAT LEBIH LARUT DARI PADA
ASAM URAT, YANG JUGA DIBUANG MELALUI URINE.
KRISTALISASI GARAM Na URAT DAPAT TERJADI DI :
• GINJAL   BATU
• JARINGAN LUNAK & PERSENDIAN  ENDAPAN 
TOFUS   INFLAMASI AKUT / KRONIS :
ARTHRITIS GOUT AKUT dan ARTHRITIS GOUT KRONIS

HIPERURISEMIA = KADAR ASAM URAT SERUM MELEBIHI

BATAS NORMAL ( lebih dari 6,5 – 7,0 mg/dl )
 TABEL : KELAINAN BAWAAN PADA METABOLISME PURIN
KELAINAN ENZIM YANG KARAKTERISTIK POLA PE-
KLINIS CACAT KELAINAN KLINIS WARISAN
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -
SEKRESI PURIN TERKAIT X
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -
SEKRESI PURIN TERKAIT X
GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER KEMUNGKIN-
SEKRESI PURIN AN RSESIF X

GOUT PRPP SINTASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -

SEKRESI PURIN TERKAIT X

SINDROM LESCH - HGPRT-ASE OVER PRODUKSI & OVER RESESIF -

NYHAN SEKRESI PURIN ; SELF TERKAIT X
MUTA-TION
DEFISIENSI IMUN ADENOSIN DE- IMUNO DOFISIENSI KOMBI- RESESIF -
AMINASE NASI ( SEL T & B ) AUTOSOMAL
NEFROLITIASIS ADENIN FOSFO NEFROLITIASIS 2,8-DEHI – RESESIF -
RIBOSILTRANSF DROKSI ADENIN AUTOSOMAL
XANTINURIA XANTIN OKSI- NEFROLITIASIS XANTIN, RESESIF -
DASE HIPOXANTIN AUTOSOMAL
KELAINAN METABOLISME PIRIMIDIN :

▪ HASIL METABOLISME PIRIMIDIN : CO2, NH3 dan asam β isobutirat

BERSIFAT SANGAT LARUT DALAM AIR

▪ OVER PRODUKSI KATABOLIT PIRIMIDIN JARANG MENIMBULKAN

KELAINAN KLINIS

ASIDURIA ASAM OROTAT TIPE I :

-. DEFISIENSI OROTAT FOSFORIBOSILTRANSFERASE dan atau
OROTIDILAT DECARBOXILASE

ASIDURIA ASAM OROTAT TIPE II :

-. DEFISIENSI OROTIDILAT DEKARBOKSILASE
-. LEBIH RINGAN DIBANDING DENGAN TIPE I
-. DAPAT DIATASI DENGAN PEMBERIAN URIDIN ORAL
NUKLEOTIDA ALAMIAH :

NUKLEOTIDA BEBAS  TIDAK TERIKAT DENGAN ASAM NUKLEAT; BANYAK TERDAPAT

DIJARINGAN TUBUH, a.l. :

DERIVAT ADENOSIN :
- ADP = ADENOSIN DIFOSFAT
- ATP = ADENOSIN TRIFOSFAT
- c AMP = 31-51–ADENOSIN MONOFOSFAT
ATP cAMP AMP
ADENILAT SIKLASE FOSFO DIESTERASE
- S-ADENOSIN METIONIN  SEBAGAI DONOR METIL

DERIVAT URASIL :
- URIDIN DIFOSFOGLUKOSA ( UDP-GLUKOSA )
- URIDIN DIFOSFOGLUKORONAT ( UDP-GLUKORONAT)
- UTP
DERIVAT VITAMIN :
- FLAVIN DINUKLEOTIDA = FAD
- NIKOTINAMID ADENIN DINUKLEOTIDA = NAD
- NIKOTINAMID ADENIN DINUKLEOTIDA FOSFAT = NADP

DERIVAT GUANIN : GDP, GTP, GMP.

DERIVAT SINTETIK :
* 5-YODO-2’-DEOKSI URIDIN
* 5-FLUORO MURASIL
* 6-MERKAPTO PURIN
* 6-TIOGUANIN
* AZAURIDIN
* AZAGUANIN
* 4- HIDROKSI PIRAZOL PIRIMIDIN
( ALLOPURINOL )  xanthine oxidase
inhibitor
 SH O
SH
N N N
N N N
N
H2N N H2N N
N N N
N H H
H
6-MERKAPTOPURIN 6- TIOGUANIN 8-AZAGUANIN

O
OH
F
HN N
N
O
N N
N H
H

5-FLUOROURASIL ALLOPURINOL
Sumber makanan yang mengandung purin
Ekstrak Daging / Kaldu
Daging Bebek
Ayam
Udang
Tahu
Tempe
Asparagus
Bayam
Daun Singkong
Kangkung
Daun dan Biji Melinjo