UNIVERSIDAD NACIONAL AGRARIA DE LA SELVA

FACULTAD DE RECURSOS NATURALES

RENOVABLES

DEPARTAMENTO ACADEMICO DE
CIENCIAS AMBIENTALES

INGENIERIA AMBIENTAL

MECANISMO BIOQUIMICO DE LA BIORREMEDIACION EN

BACTERIAS

DOCENTE : Blgo: BOBADILLA ALVARES Miguel Constante.

CURSO : Bioquímica Ambiental

AUTORES : NAVARRO NAVARRO, Joselyn

OLIVERA BARBOZA, Luzbelith
OLIVERA GABANCHO, Franchesca G.
RUBIO ZARATE, Filena
SANCHEZ SANTOS, Julissa

FECHA DE ENTREGA: 06/07/16

TINGO MARÍA- PERÚ

2016
 I. MARCO TEORICO

1.1. BIORREMEDIACIÓN

La biorremediacion se refiere al uso de sistemas biológicos y a la

adición de materiales a ambientes contaminados para producir una
aceleración del proceso natural de biodegradación intrínseca de la polución de
aire o de los sistemas acuáticos y terrestres. Los sistemas biológicos utilizados
son microorganismos y plantas.
La biorremediación es una tecnología que utiliza el potencial
metabólico de los microorganismos (fundamentalmente bacterias, pero también
hongos y levaduras) para transformar contaminantes orgánicos en compuestos
más simples poco o nada contaminantes, y, por tanto, se puede utilizar para
limpiar terrenos o aguas contaminadas (Glazer y Nikaido, 2009).
Su ámbito de aplicabilidad es muy amplio, pudiendo considerarse como objeto
cada uno de los estados de la materia (Atlas y Unterman, 2010):
 Sólido: con aplicaciones sobre medios contaminados como suelos o
sedimentos, o bien directamente en lodos, residuos, etc.
 Líquido: aguas superficiales y subterráneas, aguas residuales.
 Gases: emisiones industriales, así como productos derivados del
tratamiento de aguas o suelos.
Fig1: Parámetros implicados en la biorremediación (modificada de Walter
y Crawford, 2010).

1.2. La biorremediacion puede ser aplicada mediante dos técnicas

1.2.1. Biorremediacion in-situ:

Se intenta acelerar el proceso en el mismo ambiente

modificando las condiciones ambientales o por inoculación microbiana, se está
convirtiendo en un alternativa cada vez más popular porque es más barata que
otros métodos de limpieza. Se trata de acelerar los procesos degradadores
naturales de biodegradación mediante el suministro de oxígeno y nutrientes a
la pluma contaminante durante un periodo prolongado. (2)

1.2.2. Biorremediacion ex-situ:

Consiste en extraer el contaminante y degradarlo en otro sitio

en condiciones controladas de laboratorio. Evidentemente la mayoría de veces
no se puede hacer a parte que es un proceso caro. (2)

1.3. PROCESOS DE LA BIORREMEDIACION

Los procesos mediante los cuales funciona la biorremediacion se

pueden dividir en 4 grupos (degradación enzimática, biorremediacion animal,
remediación microbiana y fitorremediacion) de acuerdo al organismo que
efectúe la degradación del compuesto xenobioticos en los siguientes tipos:

1.3.1. Degradación enzimática:

La degradación enzimática consiste en la utilización de

enzimas en el sitio contaminado con el fin de degradar las sustancias nocivas.
Dichas enzimas son previamente producidas por bacterias transformadoras
genéticamente con el gen que codifica para cada enzima en particular. Esta
aplicación de la biotecnología lleva décadas en el mercado y hoy en dua las
compañías biotecnológicas ofrecen las enzimas y también los microorganismos
genéticamente modificados. (2)
 1.3.2. biorremediacion animal:

Existen animales que actúan como agentes descontaminantes,

ya que pueden desarrollarse en medios con fuerte toxicidad y poseen en su
interior microorganismos capaces de retener metales pesados.(2)

1.4. BACTERIAS

Son microorganismos unicelulares de tamaño diminuto entre (0.5 y

5um, por lo general). Las bacterias son procariotas y, por lo tanto, no tienen
núcleo ni orgánulos internos. Generalmente poseen una pared celular
compuesta de peptidoglucanos. Muchas bacterias disponen de flagelos o de
otros sistemas de desplazamiento y son móviles. (2)

1.4.1. biorremediacion bacteriana:

Se refiere al uso de microorganismos directamente en el foco

de contaminación. Estos microorganismos pueden ya existir en ese sitio o
pueden ser originarios de otros ecosistemas en cuyo caso deben ser
inoculados en el sitio contaminado (inoculación). (2)

En el primer caso, muchas veces suelen administrarse más

nutrientes (adición de nutrientes) al medio con el fin de acelerar el proceso de
biodegradación. Otra posibilidad es la de introducir sepas modificadas por
técnicas de ingeniería genética, a las cuales se les introdujo el gen que codifica
para una o más enzimas detoxificadoras (uso de microorganismos modificados
genéticamente. Tradicionalmente, se ha visto a las bacterias como organismos
dañinos para la vida, puesto que tradicionalmente se han considerado como
causantes de enfermedades o incluso de muertes. La biorremediacion
bacteriana ya sea mediante el uso de cepas nativas, mediante el mecanismo
de la bioaumentacion o el diseño de cepas modificadas genéticamente se ha
convertido en una nueva alternativa para atacar de manera directa muchos de
los problemas que presentan la contaminación de agua y suelos causadas por
diferentes contaminantes. De manera especial por la presencia de fertilizantes,
pesticidas y herbicidas que son de uso común en el campo, además de los
derrames de hidrocarburos durante su extracción, transporte o después de su
utilización. (2)

La capacidad mostrada por aislados bacterianos acumulado,

degradando o transformado diversos contaminantes a otros de menor
nocividad y por lo mismo de menor impacto al ambiente, es lo que ha
incentivado a distintas instituciones de investigación en la formación de equipos
de investigadores, inter y multidisciplinarios para el diseño y aplicación de
nuevas tecnologías. (2)

1.5. FITORREMEDIACION

La fitorremediacion es una tecnología naciente que sirve para

explorar las capacidades metabólicas proporcionando un medio barato, simple
y seguro para paliar áreas contaminadas y/o aguas de desecho.(2)

La fitorremediacion podría ser definida como el conjunto de métodos

para degradar, asimilar, metabolizar o detoxificar metales pesados,
compuestos orgánicos, radioactivos y petroderivados por medio de la utilización
de plantas (terrestres, acuáticas, leñosas, etc.) y los cultivos “in vivo” derivados
de ellas, que tengan la capacidad fisiológica y bioquímica para absorber,
remover, contener, retener degradar o transformar dichas sustancias a formas
menos toxicas. (2)

Esta definición incluye cualquier proceso biológico, químico o físico,

inducido por las plantas, que ayude en la absorción, secuestro, degradación y
metabolización de los contaminantes, ya sea por las plantas mismas o por los
microorganismos que se desarrollan en la rizosfera. (2)

1.5.1. Tipos de fitorremediacion

Entre las diversas categorías de la fitorremediacion se destacan:

 La Fito extracción
 La rizofiltracciòn
 La Fito estabilización
 La Fito estimulación
 La Fito volatilización
 La Fito degradación
 II. OBJETIVOS

2.1. General

 Conocer el mecanismo de degradación de contaminantes ambientales

aprovechando el potencial del metabolismo de plantas y bacterias para
cumplir dicha función degradadora.

2.2. Específicos

 Determinar la importancia ambiental del proceso de biorremediación

con plantas y bacterias.
 Establecer un adecuado uso de las técnicas de biorremediación con
plantas y bacterias.
 Determinar ventajas entre el uso de tecnologías convencionales o el
empleo de biorremediación para remediar ecosistemas alterados.

III. Justificación del trabajo

Este presente trabajo se realizó con el propósito de brindar

información adecuada sobre la biorremediación utilizando plantas o bacterias,
y su especial importancia en nuestras vidas como seres humanos y más aún
como profesionales dedicados a la conservación del medio ambiente.
 IV. CONCEPTOS DE ASPECTO ESPECÍFICO

4.1. Como se producen los microorganismos

Las bacterias son organismos procariotas que tienen la ventaja de

desarrollarse fácilmente en medios pobres en nutrientes, además detectan
rápidamente las sustancias nutritivas. (21)

4.2. Como atacan los microorganismos

La capacidad de degradar una determinada sustancia depende de

los biocatalizadores (enzimas) de que disponga el microorganismo, por el
hecho de que la capacidad enzimática de la célula esta codificada con su DNA,
pero está activa, solo la parte que ha activado el entorno. Por eso, para una
degradación completa de un contaminante se necesita la participación de
diversos tipos de microorganismos a lo que se suele denominar “consorcio”,
con esto todos podrán disponer de enzimas útiles para la degradación. (21)

Para llevar a cabo la biodegradación, es necesario un pre-estudio de

los diferentes aspectos microbiológicos de las poblaciones implicadas, estos
estudios pueden ser de:

 Su bioquímica, para ver si se pueden mejorar las rutas metabólicas.

 Características fisiológicas.
 Ecología de las especies, para determinar las condiciones óptimas.
 Su genética.

4.3. Como se lleva a cabo la biodegradación:

1° Contacto microorganismo-sustrato: es necesario para que se

produzca la biorremediacion. El contacto puede generar el paso a través de la
membrana de las moléculas del sustrato; o tambien liberar enzimas
exocelulares para degradar el sustrato generando metabolito posibles de
penetrar en el organismo. (21)
 2° Paso a través de la membrana: Las paredes celulares son
rígidas e hidrofóbicas, por lo tanto las sustancias deben estar en disolución,
para que sea posible su entrada a la célula, además que las bacterias no tienen
boca. (21)

3° Rutas metabólicas: El metabolismo consiste en series complejas

de reacciones bioquímicas acopladas que llevan por un lado a la síntesis de
biomasa o nuevo material celular (anabolismo) y por otro a la mineralización
(conversión en CO2 y agua) del sustrato, con producción de la energía (ATP) y
el poder reductor (NAPDH) que son necesarios para la síntesis mencionada
(catabolismo). Por tanto, una parte del sustrato se mineraliza y otra se
biotransforma (lo que a veces incluye la transformación en materias húmicas
persistentes en el tiempo). (21)
En ocasiones se han propuesto coeficientes de rendimiento
(biomasa celular producida por unidad de masa de sustrato consumido) de
hasta 0,5 (para bacterias aerobias), pero en realidad el rendimiento depende
del sustrato, de qué microorganismos participen y de las condiciones
ambientales. Frecuentemente es menor de 0,1 y, además, interesa que la
mineralización sea máxima una vez que se alcanza un nivel de biomasa celular
suficiente para el proceso de biorremediacion. (21)

No siempre el catabolismo produce la mineralización, sino que se

detiene la degradación en algún metabolito intermedio. Es posible que estos
metabolitos, que se acumularán en el medio si no hay otro organismo con la
capacidad de degradarlos, resulten tóxicos o nocivos, incluso más que el
contaminante original, por lo que será necesario evaluar este aspecto. Las
rutas metabólicas son diferentes según las estructuras químicas de los
sustratos y según los enzimas de que disponga cada célula. (21)

4° crecimiento de la población microbiana: Las bacterias se

reproducen asexualmente en condiciones óptimas una célula se puede
duplicar entre los 15 y 20 minutos, si no son las condiciones adecuadas puede
demorar semanas.(21)
Existen cuatro fases en el crecimiento:
- latencia: sintetiza enzimas para degradar al sustrato donde se halla.
- crecimiento exponencial
- fase estacionaria
- fase de senescencia: hay factores (pH, temperatura, humedad, predacion,
etc.) que limitan la capacidad de crecimiento y la población disminuye.

5° cambios genéticos: Con la capacidad de adaptación, pueden

modificar el material genético que se encuentra en los plásmidos y proporcionar
a la célula una nueva capacidad metabólica. (21)

6° las bacterias: Aunque cumplen un papel muy importante en la

degradación de suelos e hidrocarburos, el campo en el que más y mejor se
desenvuelven es en el caso de las aguas. Así, como ya se ha mencionado, lo
habitual es la cooperación de un número amplio de especies asociadas en lo
que se denomina un consorcio. Hay que señalar que la capacidad degradativa
de un consorcio resulta superior a lo que sería previsible a partir de los perfiles
enzimáticos individuales de sus componentes. A ello contribuyen diversos
factores: unos organismos pueden suministrar factores de crecimiento
específicos a otros, pueden consumir productos que les resulten tóxicos a los
otros, puede darse co- metabolismo, etc. (21)

7° co-metabolismo y sintrofia: Es la cooperación microbiana o

actividad conectada de diferentes microorganismos sobre un mismo sustrato,
de forma que combinando sus actividades metabólicas consiguen su
degradación. (21)
 V. ESTUDIO DE CASOS

5.1. CASO III.

BACTERIAS DE YUCA ELIMINAN CIANURO DE RÍOS

CONTAMINADOS POR MINERÍA

Esta alternativa es eficaz y más accesible que otros procedimientos

químicos de limpieza de aguas residuales, señalan expertos colombianos.
Investigadores colombianos han identificado hasta seis grupos de bacterias en
las plantas de procesamiento de yuca, un tubérculo que crece en tierra tropical,
capaces de eliminar el cianuro de los ríos contaminados por la minería aurífera.
(17)

Esta alternativa es eficaz y más accesible que otros procedimientos

químicos de limpieza de aguas residuales, pues los microorganismos que
degradan el cianuro aparecen durante la fermentación del almidón de la yuca,
también conocida como mandioca o casava, que sirve de materia prima para la
panadería.(2)

"La idea de la aplicación biotecnológica es poder llevar este tipo de

bacterias a sitios donde se hace minería, educar al minero para que haya un
paso de descontaminación de sus aguas residuales" y evitar así que el cianuro
llegue a los ríos, explicó a Colombia, agencia operada por Efe, el bioquímico
Joel Panay, líder del equipo de investigadores de la Universidad Icesi de Cali.

Colombia, al igual que otros países de Suramérica, tiene

importantes minas de oro y esta actividad está originando un gran impacto
medioambiental por la contaminación de los caudales. (16)

La razón es que el cianuro se utiliza para separar el oro del resto de

elementos extraídos en los ríos, por ser de los pocos reactivos químicos que
disuelven el preciado metal en el agua, pero cuando esas aguas residuales
donde se ha hecho la mezcla llegan a los ríos dejan una estela tóxica.(20)

El objetivo del equipo de Panay es dotar a los mineros de tanques

con las bacterias extraídas en las plantas de procesamiento de yuca para que
ellos mismos puedan contribuir a la descontaminación de las aguas residuales
antes de que estas vayan a parar a los torrentes.

Este desarrollo científico nació del proyecto "Biorremediación con

bacterias degradadoras de contaminantes" que Panay presentó a sus alumnos
en el laboratorio y que la estudiante Catalina Mosquera se apropió para
aplicarla a la minería, en una zona donde esa actividad funciona como base de
la economía de muchas comunidades.(14)

La idea inicial fue identificar esas bacterias en un afluente minero,

pero la inseguridad para llegar a esas zonas, dominadas por grupos ilegales y
delincuentes, obligó a los investigadores a buscar una alternativa.(19)

Fue así como optaron por acudir a una planta de procesamiento de

yuca, ya que este tubérculo, también conocido como mandioca o pan de tierra
caliente, contiene por naturaleza índices de cianuro.(1)

"Los microorganismos se adaptan a este tipo de compuestos

cuando están en presencia de él en el ambiente, por eso se pensó que yendo a
una "rallandería" (planta) de yuca podíamos encontrar microorganismos que al
estar expuestos al cianuro, que viene presente en la yuca en ese proceso de
extracción de almidón, fuesen capaces de degradarlo", explicó.(18)

En la rallandería La Agustina, ubicada en el departamento del Cauca

(suroeste), los investigadores tomaron muestras, las cultivaron y trabajaron en
el laboratorio hasta lograr identificar seis grupos de bacterias con distintas
capacidades para eliminar el cianuro.(2)
 "Tenemos un electrodo sensible al cianuro, el cual nos permite medir
la concentración. Nos dimos cuenta de que al cabo de diez días el cianuro que
había en ese medio líquido se reducía a cero y definitivamente lo estaban
incorporando en su metabolismo", explicó el químico. (2)

En Colombia es frecuente encontrar cultivos de yuca, una de las

mayores fuentes de calorías en la dieta de las zonas tropicales, ahora
convertida en una solución a graves problemas medioambientales en todo el
país y en concreto en el Valle del Cauca, departamento del que Cali es capital.
(17)

Es el caso del río Dagua, en la localidad vallecaucana de Zaragoza,

muy contaminado y además plagado de dragas y grandes excavadoras con las
que se practica la minería ilegal. (1)

Y aunque estos investigadores admiten que hacen faltan unas fases

trabajo para la aplicación extensiva de este desarrollo, confían que, con el
apoyo del Gobierno y del mismo sector, contribuirán a promover una minería
limpia y por tanto a solucionar un grave problema medioambiental. (1)
 VI. CONCLUSIONES

 La contaminación ambiental por la presencia de agentes tóxicos

como hidrocarburos, plaguicidas, metales pesados y otras sustancias
constituye un problema ambiental de primer orden. El panorama
actual no es tan desalentador ya que se cuenta con novedosas
técnicas para la recuperación de suelos degradados por
contaminación química. El uso de los microorganismos (bacterias y
algas) constituye una estrategia potencialmente viable.
 La fitorremediacion constituye una alternativa eficaz y económica
para realizar procesos de descontaminación de metales pesados en
biosólidos,
Sin causar deterioro en los suelos en los que son aplicados,
disminuyendo la contaminación no solo del suelo, sino también del
agua y de los que a
Partir del suelo, puedan llegar a cualquier organismo vivo.
 VII. REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

1. LAURA MARTINEZ. (2013). descubren una especie de planta que se

alimenta de níquel. 29/06/16, de ecología-plantas-tecnología Sitio web:
http://www.muyinteresante.es/naturaleza/articulo/descubren-una-
especie-de-planta-que-se-alimenta-de-niquel-231399896198.

2. Martha Cecilia Rincón Lizcano. (2010). estudio de la biorremediacion

como una alternativa en la mitigación de la contaminación ambiental..
monografía para obtener al título de especialista en química ambiental,
1, 1-136.

3. Atlas R, Bertha R. Ecología microbiana y microbiología ambiental. Ed.

Addison Wesley. Madrid. 2009. 561p.
4. Restrepo R. Derrame de hidrocarburos. Impacto en los ecosistemas
tropicales. ECOPETROL Instituto Colombiano de Petróleo. 2009.
5. Fátima B, Flavio A, Oliveira C, Benedicta O, William T. Biorremediación
of soil contaminated by diesel oil. Brazilian Journal Microbiology.
2003;34.
6. Blaz S, Imahne I, Gorazd A, James T. Nitroux oxide reductase gene
fragments differ between native and cultivated Michigan soils. Applied
and Environmental Microbiology.2004; 70(1): 301-309.
7. CËbron A, Berthe T, Garnier J. Nitrification and Nitrifying Bacteria in the lower
Seine river and estuary (France). Applied and Environmental Microbiology.
2003; 69(12): 7091-7100
8. Ebru C. Isolation and characterization of aerobic denitrifiers from agricultural
soil. 2004; 29: 9 -14.
9. Maroto A, Rogel J. AplicaciÛn de sistemas de biorremediacion de suelos
y aguas contaminadas por hidrocarburos. Geocisa. División de
protección ambiental de suelos. En: http://
www.igme.es/internet/web_aguas/igme/publica/ con_recu_acuiferos/0.28
pdf
10. Cunningham C, Philp J. Comparison of Bioaugmentation and
Bioestimulation in ex situ treatment of Diesel Contaminated Soil. Land
Contamination and Reclamation. 2000; 8 (4): 261- 269.
11. Torres R. El papel de los microorganismos en la biodegradación de
compuestos tóxicos. Ecosistemas. 2008
http://www.aeet.org/ecosistemas/032/informe1.html.
12. Erikson M, Sodersten E, Zhongtang Y, Dalhammar G, Mohn W.
Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons at low temperature
under aerobic and nitrate-reducing. Appl Environ Microbiol. 2012.
13. Hideki K, Katsuyuki U, Hisako H, Horikoshi K. Novel toluene elimination
system in a toluene-tolerant microorganism. Journal of Bacteriology.
2010.
14. De Lorenzo V. BiorremediaciÛn: De la placa de petri al medio ambiente.
Centro Nacional de BiotecnologÌa.2009. En: www.bioprest.net
15. Christopher W. Kaplan R, Christopher L. Bacterial succession in a
petroleum land treatment unit. Appl Environ Microbiol. 2012.
16. Nannipieri P, Ascher J, Ceccherini M, Landi L, Pietramellara M, Renella
G. Microbial diversity and soil functions. 2001. European Journal Soil
Science. 2011.
17. De Boer W, Verheggen P, Gunnewick K, Kowalchuk G, and Veen J.
Microbial Community Composition Affects Soil Fungistasis. Applied and
Environmental Microbiology. 2013.
18. Jizhong Z, Beicheng X, David T, Wu L, Terry M, Robert Neill, Anthony P,
and James M. Spatial and resource Factors Influencing High Microbial
Diversity in soil. Environmental Sciences División. Center for Microbial
Ecology, Michigan State University, Michigan. 2012.
19. LÛpez J, García O, Grima J, Ballesteros J, Pérez. Técnicas de
biorrecuperacion in situ en acuíferos contaminados por metales
pesados. 2014.
20. Breve presentación sobre biorremediación, en castellano:
http://universidaddesantiago.cl/ima/bioremed.htm.
21. Aplicaciones de la biorremediación (caso del desastre del Prestige en la
costa de Galicia)
http://www.belt.es/noticias/2003/febrero/24_28/28/prestige.htm.
VIII. ANEXOS

Figura 1: principales microorganismos degradadores de petróleo.

Figura 2: microorganismos fermentadores de la yuca.

Figura 3: biorremediacion con bacterias frente a un derrame de petróleo.

Figura 4: procesos de una descontaminación de suelos.