Anda di halaman 1dari 6

TUGAS BIOTEKNOLOGI

DRUG DISCOVERY BY BIOTECHNOLOGY


“From Discovery to Production: Biotechnology of Marine Fungi for
the Production of New Antibiotics”

OLEH

NUR ELIDA
1511012033

FAKULTAS FARMASI
UNIVERSITAS ANDALAS
2019
A. Pendahuluan
Penggunaan antibiotik secara luas, telah menghasilkan pengembangan
resistensi. Lebih dari setengah dari semua antibiotik diproduksi oleh actinomycetes,
10% -15% oleh bakteri non-filamen dan sekitar 20% oleh jamur berfilamen. Namun,
ini mungkin hanya mewakili sebagian kecil dari senyawa bioaktif mikroba, dalam hal
ini ekosistem laut hampir tidak tersentuh walaupun mikroorganisme laut dapat
mengakumulasi produk alami bioaktif yang unik secara structural yang tidak
ditemukan di mitra terestrial.
Jamur berfilamen terkenal karena kemampuannya menghasilkan produk alami
antibiotik. Studi terbaru menunjukkan potensi antimikroba dengan kemodiversitas luas
dari jamur laut. Pengembangan produk alami tersebut menjadi senyawa yang
membutuhkan pasokan berkelanjutan. Bioteknologi kelautan dapat secara signifikan
berkontribusi pada produksi antibiotik baru di berbagai tingkat rantai proses termasuk
penemuan, produksi, pemrosesan dan pengembangan. Namun, jumlah proses
bioteknologi yang dideskripsikan untuk produksi skala besar dari jamur laut jauh dari
jumlah antibiotik alami yang baru ditemukan.
Metode dan teknologi yang diterapkan dalam bioteknologi jamur laut sebagian
besar berasal dari proses terestrial analog dan jarang mencerminkan tuntutan spesifik
jamur laut. Dari ratusan senyawa bioaktif yang dilaporkan dari jamur laut, hanya
beberapa yang mencapai komersialisasi. Kurangnya transfer dari tahap penemuan ke
rantai proses bioteknologi yang tepat telah membatasi, setidaknya sebagian
ketersediaan jumlah senyawa yang cukup baik untuk uji klinis atau untuk
pengembangan timbal tahap awal seperti modifikasi oleh bahan kimia.
Pendekatan bioteknologi pada langkah berbeda dari rantai proses untuk
mengembangkan antibiotik dari jamur laut

B. Peran bioteknologi dalam penemuan obat baru


Untuk penemuan produk antibakteri, biasanya spesies tertentu dipilih, lalu
diekstraksi, disaring untuk aktivitas antibakteri, kemudian diisolasi dan akhirnya
produk alami diperoleh dalam bentuk yang sangat murni. Jenis penemuan produk alami
ini lambat, tidak efisien. Kemajuan terbaru dalam dereplikasi dan metode analisis
lainnya telah menghasilkan penemuan produk alami yang lebih efisien. Bioteknologi
juga dapat berkontribusi pada penemuan metabolit dari jamur laut yang lebih cepat
dengan sejumlah pendekatan dan mengatasi pendekatan acak seperti OSMAC:
1. Miniaturisasi yang dikontrol untuk meningkatkan throughput penyaringan.
Budidaya dalam sistem fermentasi skala kecil (rentang mL), misalnya, pelat
mikrotiter, telah terbukti layak untuk jamur laut dan digunakan dalam skrining
untuk antibiotik jamur berfilamen. Pengembangan proses yang terkendali sebagai
pendekatan bioteknologi dimungkinkan dalam sistem fermentasi miniatur khusus
seperti "System Duetz" atau "BioLector".
2. Stimulasi yang ditargetkan pada strain untuk memperluas chemodiversity.
Pendekatan yang lebih strategis akan mencakup fermentasi campuran berdasarkan
pengetahuan genetik dan ekologi yang digunakan dalam bioteknologi makanan
untuk meningkatkan produksi enzim. Potensi penuh dari pendekatan semacam itu
berbasis ekologis atau genetic bioteknologi perlu dibuktikan di masa depan.
3. Strain karakterisasi menggunakan teknik 'omics'.
Pengetahuan yang komprehensif dari genom hingga tingkat metabolisme
berkontribusi pada pemahaman umum tentang potensi jamur dalam penemuan
obat tetapi juga untuk strategi optimasi yang konkret untuk proses bioteknologi.
Terutama analisisnya pada tingkat proteome (proteomik). Transkriptomik,
proteomik, dan secretomics dapat diterapkan untuk menjelaskan keadaan
metabolisme sel pada semua tingkatan regulasi gen dan untuk menunjukkan
regulasi pada DNA, RNA, dan tingkat protein. Sampai sekarang, tidak ada contoh
seperti itu tersedia untuk produksi antibiotik oleh jamur laut, tetapi pendekatan ini
dianggap sebagai satu dari arahan utama untuk penelitian masa depan.

C. Peran Bioteknologi dalam Produksi


Produksi produk alami dalam jumlah yang cukup sangat penting untuk
pengembangan obat dan dapat dicapai dengan sejumlah pendekatan bioteknologi.
Sebagian besar publikasi yang mengacu pada bioteknologi antibiotik jamur laut telah
berkontribusi pada bagian rantai produksi.
Hal ini mencakup mencakup
(i) proses fermentasi penuh menggunakan produsen alami;
(ii) pendekatan semi-sintetik (mis., fermentasi untuk menghasilkan molekul
prekursor atau memodifikasi produk sintetis dengan cara biokonversi), dan
(iii) produksi heterolog dalam inang yang dimodifikasi secara genetik.

D. Peran Bioteknologi dalam Downstream Process


Proses Downstream (DSP) terdiri dari beberapa langkah termasuk pemisahan,
gangguan sel, penangkapan, dan langkah konsentrasi, serta ekstraksi, pemurnian,
pemolesan, dan formulasi. DSP merupakan bagian utama kedua dalam proses produksi
selain pemrosesan upstream (USP). Sayangnya, hanya beberapa contoh yang telah
dilaporkan yang berfokus pada bagian DSP dalam bioteknologi jamur laut, seperti
perawatan enzimatik, sebagai bagian dari pemurnian dalam produksi sefalosporin.
Hanya prosedur yang efisien dan dipahami dengan baik yang akan menghasilkan bahan
yang cukup.

E. Peran Bioteknologi dalam Pengembangan Lead Compound


Metode bioteknologi juga dapat diterapkan pada tahap akhir dari proses
penemuan, seperti pengembangan lead compound. Secara umum, pengembangan lead
compound melibatkan kimia obat untuk menghasilkan turunan dengan sifat yang lebih
baik (mis., Ketersediaan hayati dan metabolisasi yang lebih baik) dan untuk
memungkinkan studi SAR. Selama pengembangan lead compound, mode studi
tindakan membantu untuk memahami dan meningkatkan aplikasi terapeutik. Meskipun
bukan bioteknologi dalam arti yang ketat,
Salah satu contoh tersebut diwakili oleh Calcarides makrosiklik yang terjadi
secara alami dan poliester linier dari Calcarisporium sp laut. Semua Calcarides
makrosiklik menghambat S. Epidermidis dan X. Campestris, sedangkan poliester linier
yang sangat terkait, tidak menunjukkan aktivitas apa pun di bawah MIC 100 MM.
Jumlah turunan yang dihasilkan oleh jamur laut dapat terjadi karena pergaulan bebas
dari enzim dan / atau relevansi ekologis. Dengan demikian, turunan biologis dapat
diperoleh dengan konversi biologis melalui perlakuan enzim dalam proses
bioteknologi. Ini berhasil ditunjukkan untuk generasi turunan corollosporin oleh
aminasi yang dikatalisis oleh laccase. Demikian juga, produk fermentasi asli
Sefalosporin C dalam produksi sefalosporin secara enzimatik diubah menjadi asam
sefalosporanat 7-amino, untuk sintesis produk semi-sintetik yang lebih aktif.

Proses bioteknologi skala industri harus layak dari perspektif ilmiah, teknis, dan
ekonomi. Kelayakan ini harus ditunjukkan melalui pengembangan konsep proses
berdasarkan fermentasi termasuk rekayasa metabolik, pemurnian, desain molekul, dan
data sintesis. Berikut faktor-faktor untuk pembentukan proses bioteknologi yang lebih
efisien dan beragam untuk senyawa antibiotik yang menarik:
1. Penggunaan jamur laut. Keanekaragaman hayati jamur berfilamen dari
sumber laut sebagian besar belum dimanfaatkan. Proyek harus memperluas
pengetahuan tentang keanekaragaman hayati dan chemodiversity dari
organisme unik ini.
2. Inovasi dalam teknologi. Ada persyaratan yang jelas untuk "Next Generation
Biotechnology", yang mencakup pendekatan metodologis baru dan
pemahaman tentang proses biologis dan teknologi yang mendasarinya.
3. Transdisipliner. Pendekatan transdisipliner dan integratif dari proyek-proyek
pembangunan harus mencakup mitra penelitian dan pengembangan yang
terdiri dari semua tahap jalur penemuan obat awal, mengintegrasikan
akademisi, UKM, dan industri. Dengan demikian, kesenjangan penting dalam
pengetahuan jamur laut yang relevan untuk produksi senyawa bioaktif harus
ditangani secara aktif dan dibuat relevan dengan jalur pipa penemuan obat
farmasi.
4. Menjembatani kesenjangan inovasi. Para peneliti dapat mempromosikan
inovasi secara langsung dengan mempekerjakan teknik baru yang
mempromosikan biosintesis / produksi metabolit baru dalam program
penemuan obat tahap awal (temuan timbal) dan dengan memperkaya
kumpulan metabolit yang tersedia untuk program skrining.